MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_005835	GGA	2	6	662617	662622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198986
17503	NC_005835	GGC	2	6	662654	662659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198986
17504	NC_005835	ACC	2	6	662664	662669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198986
17505	NC_005835	CGG	2	6	662686	662691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198986
17506	NC_005835	GGT	2	6	662722	662727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198986
17507	NC_005835	CGG	2	6	662735	662740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198986
17508	NC_005835	GAG	2	6	662762	662767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198986
17509	NC_005835	GGC	2	6	662768	662773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198986
17510	NC_005835	GAG	2	6	662870	662875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198986
17511	NC_005835	CGA	3	9	662878	662886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198986
17512	NC_005835	GCG	2	6	662898	662903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198986
17513	NC_005835	CTT	2	6	662923	662928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198987
17514	NC_005835	CCT	2	6	662935	662940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198987
17515	NC_005835	GAG	2	6	662951	662956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17516	NC_005835	AGG	2	6	662964	662969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17517	NC_005835	AG	3	6	662979	662984	50 %	0 %	50 %	0 %	46198987
17518	NC_005835	GAG	2	6	662996	663001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17519	NC_005835	AGGCCC	2	12	663024	663035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198987
17520	NC_005835	GCC	2	6	663036	663041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198987
17521	NC_005835	AGG	2	6	663066	663071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17522	NC_005835	TCG	2	6	663078	663083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198987
17523	NC_005835	CCT	2	6	663094	663099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198987
17524	NC_005835	GCG	2	6	663113	663118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198987
17525	NC_005835	C	6	6	663194	663199	0 %	0 %	0 %	100 %	46198987
17526	NC_005835	GTG	2	6	663374	663379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198987
17527	NC_005835	TCCAGG	2	12	663405	663416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198987
17528	NC_005835	GGC	2	6	663477	663482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198987
17529	NC_005835	GGA	2	6	663535	663540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17530	NC_005835	CTC	2	6	663557	663562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198987
17531	NC_005835	TTGTGG	2	12	663630	663641	0 %	50 %	50 %	0 %	46198987
17532	NC_005835	C	6	6	663692	663697	0 %	0 %	0 %	100 %	46198987
17533	NC_005835	GAG	2	6	663701	663706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17534	NC_005835	CCGCC	2	10	663790	663799	0 %	0 %	20 %	80 %	46198987
17535	NC_005835	GTG	2	6	663801	663806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198987
17536	NC_005835	GGA	2	6	663811	663816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17537	NC_005835	A	6	6	663851	663856	100 %	0 %	0 %	0 %	46198987
17538	NC_005835	GCG	3	9	663884	663892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198987
17539	NC_005835	CCT	2	6	663952	663957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198987
17540	NC_005835	GTCCA	2	10	664014	664023	20 %	20 %	20 %	40 %	46198987
17541	NC_005835	TGG	2	6	664051	664056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198987
17542	NC_005835	CTT	2	6	664100	664105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198987
17543	NC_005835	GAG	2	6	664106	664111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17544	NC_005835	TCC	2	6	664153	664158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198987
17545	NC_005835	AGG	2	6	664170	664175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198987
17546	NC_005835	CGGCCA	2	12	664222	664233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198987
17547	NC_005835	CCT	3	9	664234	664242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198987
17548	NC_005835	G	7	7	664260	664266	0 %	0 %	100 %	0 %	46198987
17549	NC_005835	CCA	2	6	664345	664350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198987
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17552	NC_005835	ACC	2	6	664555	664560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198988
17553	NC_005835	CCA	2	6	664601	664606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198988
17554	NC_005835	CTC	2	6	664638	664643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198988
17555	NC_005835	TCC	2	6	664669	664674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198988
17556	NC_005835	GCC	2	6	664717	664722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198988
17557	NC_005835	GTC	2	6	664734	664739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198988
17558	NC_005835	GTC	2	6	664743	664748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198988
17559	NC_005835	TGG	2	6	664778	664783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198988
17560	NC_005835	CCT	2	6	664784	664789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198988
17561	NC_005835	GCGCTC	3	18	664794	664811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198988
17562	NC_005835	GCT	2	6	664814	664819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198988
17563	NC_005835	CG	3	6	664859	664864	0 %	0 %	50 %	50 %	46198988
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17569	NC_005835	CGGG	2	8	665174	665181	0 %	0 %	75 %	25 %	46198989
17570	NC_005835	CAC	2	6	665196	665201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198989
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17588	NC_005835	AGGACC	2	12	665764	665775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198991
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17592	NC_005835	G	7	7	665852	665858	0 %	0 %	100 %	0 %	46198991
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17603	NC_005835	CAC	2	6	666133	666138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198992
17604	NC_005835	CCA	2	6	666201	666206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198992
17605	NC_005835	TGA	2	6	666255	666260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198992
17606	NC_005835	GGA	2	6	666268	666273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198992
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17611	NC_005835	CGT	2	6	666453	666458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198992
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17613	NC_005835	GAT	2	6	666550	666555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198992
17614	NC_005835	GC	3	6	666568	666573	0 %	0 %	50 %	50 %	46198992
17615	NC_005835	AGGT	2	8	666605	666612	25 %	25 %	50 %	0 %	46198992
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17620	NC_005835	GCTCC	2	10	666807	666816	0 %	20 %	20 %	60 %	46198992
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17988	NC_005835	C	6	6	680098	680103	0 %	0 %	0 %	100 %	46199004
17989	NC_005835	GCGTCG	2	12	680135	680146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46199004
17990	NC_005835	AGGGCG	2	12	680153	680164	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46199004
17991	NC_005835	AGGACC	2	12	680237	680248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46199004
17992	NC_005835	GGA	2	6	680274	680279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
17993	NC_005835	C	7	7	680301	680307	0 %	0 %	0 %	100 %	46199004
17994	NC_005835	C	10	10	680317	680326	0 %	0 %	0 %	100 %	46199004
17995	NC_005835	AGGAG	2	10	680334	680343	40 %	0 %	60 %	0 %	46199004
17996	NC_005835	CCT	2	6	680355	680360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199004
17997	NC_005835	GAG	2	6	680411	680416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
17998	NC_005835	ACC	3	9	680420	680428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199004
17999	NC_005835	GCG	2	6	680447	680452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199004
18000	NC_005835	CCA	2	6	680457	680462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199004

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