MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_005835	CCT	2	6	623094	623099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198944
16502	NC_005835	GAAGG	2	10	623173	623182	40 %	0 %	60 %	0 %	46198944
16503	NC_005835	C	6	6	623237	623242	0 %	0 %	0 %	100 %	46198944
16504	NC_005835	CCA	3	9	623247	623255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198944
16505	NC_005835	TCC	2	6	623261	623266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198944
16506	NC_005835	CCT	3	9	623307	623315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198944
16507	NC_005835	TCG	2	6	623400	623405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198944
16508	NC_005835	ACC	3	9	623411	623419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198944
16509	NC_005835	GC	3	6	623456	623461	0 %	0 %	50 %	50 %	46198944
16510	NC_005835	CGC	2	6	623485	623490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198944
16511	NC_005835	C	6	6	623502	623507	0 %	0 %	0 %	100 %	46198944
16512	NC_005835	CT	3	6	623567	623572	0 %	50 %	0 %	50 %	46198944
16513	NC_005835	CCT	2	6	623682	623687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198944
16514	NC_005835	AAGC	2	8	623693	623700	50 %	0 %	25 %	25 %	46198945
16515	NC_005835	CTC	2	6	623725	623730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16516	NC_005835	CCT	2	6	623754	623759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16517	NC_005835	GGAACC	2	12	623786	623797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198945
16518	NC_005835	TTC	2	6	623806	623811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198945
16519	NC_005835	GCC	2	6	623812	623817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16520	NC_005835	ACC	2	6	623858	623863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198945
16521	NC_005835	CTC	2	6	623869	623874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16522	NC_005835	CCT	2	6	623922	623927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16523	NC_005835	AGG	2	6	623930	623935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16524	NC_005835	GAC	2	6	623974	623979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198945
16525	NC_005835	GAG	2	6	624013	624018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16526	NC_005835	GGC	2	6	624051	624056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198945
16527	NC_005835	CCGGG	2	10	624145	624154	0 %	0 %	60 %	40 %	46198945
16528	NC_005835	TGC	2	6	624206	624211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198945
16529	NC_005835	GAG	2	6	624214	624219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16530	NC_005835	GCGG	2	8	624270	624277	0 %	0 %	75 %	25 %	46198945
16531	NC_005835	GCC	2	6	624308	624313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16532	NC_005835	AGG	2	6	624314	624319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16533	NC_005835	CTC	2	6	624331	624336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16534	NC_005835	GTG	2	6	624337	624342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198945
16535	NC_005835	GAG	2	6	624343	624348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16536	NC_005835	CGC	2	6	624379	624384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16537	NC_005835	GAG	2	6	624403	624408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16538	NC_005835	C	7	7	624424	624430	0 %	0 %	0 %	100 %	46198945
16539	NC_005835	TGG	2	6	624443	624448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198945
16540	NC_005835	TGG	2	6	624455	624460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198945
16541	NC_005835	GCCC	2	8	624467	624474	0 %	0 %	25 %	75 %	46198945
16542	NC_005835	C	7	7	624486	624492	0 %	0 %	0 %	100 %	46198945
16543	NC_005835	CTC	2	6	624538	624543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16544	NC_005835	TCC	2	6	624557	624562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16545	NC_005835	ACC	2	6	624566	624571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198945
16546	NC_005835	CGC	2	6	624585	624590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16547	NC_005835	GGC	2	6	624609	624614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198945
16548	NC_005835	GAG	2	6	624622	624627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16549	NC_005835	GGA	2	6	624630	624635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16550	NC_005835	GAG	2	6	624664	624669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16551	NC_005835	CGG	2	6	624695	624700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198945
16552	NC_005835	TCC	2	6	624725	624730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16553	NC_005835	GGGCC	2	10	624735	624744	0 %	0 %	60 %	40 %	46198945
16554	NC_005835	CCTTCC	2	12	624807	624818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16555	NC_005835	GGC	2	6	624865	624870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198945
16556	NC_005835	CCA	2	6	624912	624917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198945
16557	NC_005835	AGG	2	6	624950	624955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16558	NC_005835	TGG	2	6	624956	624961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198945
16559	NC_005835	CTT	2	6	624975	624980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198945
16560	NC_005835	GAG	2	6	624994	624999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16561	NC_005835	C	6	6	625004	625009	0 %	0 %	0 %	100 %	46198945
16562	NC_005835	CCT	2	6	625017	625022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16563	NC_005835	GGGGA	2	10	625030	625039	20 %	0 %	80 %	0 %	46198945
16564	NC_005835	CCG	2	6	625041	625046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16565	NC_005835	CCT	3	9	625047	625055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16566	NC_005835	ACC	2	6	625109	625114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198945
16567	NC_005835	CTC	2	6	625129	625134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16568	NC_005835	CGC	2	6	625149	625154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16569	NC_005835	GCC	3	9	625261	625269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16570	NC_005835	CCGGG	2	10	625272	625281	0 %	0 %	60 %	40 %	46198945
16571	NC_005835	G	7	7	625279	625285	0 %	0 %	100 %	0 %	46198945
16572	NC_005835	CTC	2	6	625348	625353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16573	NC_005835	AGG	2	6	625370	625375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198945
16574	NC_005835	AAG	3	9	625378	625386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198945
16575	NC_005835	GAC	2	6	625417	625422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198945
16576	NC_005835	TCC	2	6	625433	625438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198945
16577	NC_005835	GCC	2	6	625472	625477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198945
16578	NC_005835	ACG	2	6	625478	625483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198945
16579	NC_005835	GAGGG	2	10	625502	625511	20 %	0 %	80 %	0 %	46198945
16580	NC_005835	CCT	2	6	625521	625526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198946
16581	NC_005835	CCCG	2	8	625554	625561	0 %	0 %	25 %	75 %	46198946
16582	NC_005835	GC	3	6	625562	625567	0 %	0 %	50 %	50 %	46198946
16583	NC_005835	C	6	6	625596	625601	0 %	0 %	0 %	100 %	46198946
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16586	NC_005835	GTC	2	6	625681	625686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198946
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16588	NC_005835	TCC	2	6	625781	625786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198946
16589	NC_005835	CTC	2	6	625792	625797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198946
16590	NC_005835	CCT	2	6	625902	625907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198946
16591	NC_005835	GGA	2	6	625911	625916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16592	NC_005835	TCC	2	6	625937	625942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198946
16593	NC_005835	GAGGGG	2	12	626077	626088	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198946
16594	NC_005835	AGG	2	6	626099	626104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16595	NC_005835	CGG	2	6	626142	626147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198946
16596	NC_005835	GGC	2	6	626159	626164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198946
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16598	NC_005835	GAG	2	6	626284	626289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16599	NC_005835	CCCGGG	2	12	626295	626306	0 %	0 %	50 %	50 %	46198946
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16602	NC_005835	CGT	2	6	626460	626465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198946
16603	NC_005835	GAC	2	6	626467	626472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198946
16604	NC_005835	CAC	2	6	626473	626478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198946
16605	NC_005835	GGC	2	6	626497	626502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198946
16606	NC_005835	GAG	2	6	626512	626517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16607	NC_005835	GCTC	2	8	626544	626551	0 %	25 %	25 %	50 %	46198946
16608	NC_005835	AGG	2	6	626588	626593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16609	NC_005835	GAG	4	12	626626	626637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16610	NC_005835	GGCCCG	2	12	626650	626661	0 %	0 %	50 %	50 %	46198946
16611	NC_005835	G	6	6	626661	626666	0 %	0 %	100 %	0 %	46198946
16612	NC_005835	GAAA	2	8	626675	626682	75 %	0 %	25 %	0 %	46198946
16613	NC_005835	GGA	2	6	626799	626804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
16614	NC_005835	CCT	2	6	626808	626813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198946
16615	NC_005835	GAG	2	6	626860	626865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
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16621	NC_005835	GAG	2	6	627085	627090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198946
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