MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_005835	ACCG	2	8	508632	508639	25 %	0 %	25 %	50 %	46198834
13502	NC_005835	TCT	2	6	508678	508683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198834
13503	NC_005835	AGG	2	6	508689	508694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198834
13504	NC_005835	G	6	6	508693	508698	0 %	0 %	100 %	0 %	46198834
13505	NC_005835	CGCC	2	8	508706	508713	0 %	0 %	25 %	75 %	46198834
13506	NC_005835	GGC	2	6	508727	508732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198834
13507	NC_005835	GTGG	2	8	508742	508749	0 %	25 %	75 %	0 %	46198834
13508	NC_005835	GCTG	2	8	508783	508790	0 %	25 %	50 %	25 %	46198834
13509	NC_005835	GCT	2	6	508869	508874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198834
13510	NC_005835	CCT	2	6	508916	508921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198834
13511	NC_005835	GGC	2	6	508924	508929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198834
13512	NC_005835	ATG	2	6	508950	508955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198834
13513	NC_005835	AGG	2	6	508963	508968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198834
13514	NC_005835	G	6	6	508982	508987	0 %	0 %	100 %	0 %	46198834
13515	NC_005835	CCGC	2	8	509086	509093	0 %	0 %	25 %	75 %	46198834
13516	NC_005835	AGGG	2	8	509101	509108	25 %	0 %	75 %	0 %	46198834
13517	NC_005835	TCC	2	6	509119	509124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198834
13518	NC_005835	AGGC	2	8	509127	509134	25 %	0 %	50 %	25 %	46198834
13519	NC_005835	CCT	2	6	509141	509146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198834
13520	NC_005835	GGGAAA	2	12	509179	509190	50 %	0 %	50 %	0 %	46198834
13521	NC_005835	TCGC	2	8	509222	509229	0 %	25 %	25 %	50 %	46198835
13522	NC_005835	TCG	2	6	509231	509236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198835
13523	NC_005835	CCG	2	6	509268	509273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198835
13524	NC_005835	CTC	2	6	509323	509328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198835
13525	NC_005835	CGG	2	6	509377	509382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198835
13526	NC_005835	TCC	2	6	509405	509410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198835
13527	NC_005835	CCA	2	6	509442	509447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198835
13528	NC_005835	GAAGAG	2	12	509509	509520	50 %	0 %	50 %	0 %	46198835
13529	NC_005835	TCC	2	6	509547	509552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198835
13530	NC_005835	TCC	3	9	509663	509671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198835
13531	NC_005835	GCC	2	6	509727	509732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198835
13532	NC_005835	TGA	2	6	509739	509744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198835
13533	NC_005835	AGGGG	2	10	509767	509776	20 %	0 %	80 %	0 %	46198835
13534	NC_005835	G	6	6	509784	509789	0 %	0 %	100 %	0 %	46198835
13535	NC_005835	AGG	2	6	509798	509803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198835
13536	NC_005835	ACC	2	6	509894	509899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198835
13537	NC_005835	TTG	2	6	510032	510037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198835
13538	NC_005835	G	6	6	510072	510077	0 %	0 %	100 %	0 %	46198835
13539	NC_005835	GGAGG	2	10	510121	510130	20 %	0 %	80 %	0 %	46198835
13540	NC_005835	CTG	2	6	510136	510141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198835
13541	NC_005835	CTC	2	6	510187	510192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198835
13542	NC_005835	CCG	2	6	510247	510252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198835
13543	NC_005835	AGG	3	9	510263	510271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198835
13544	NC_005835	GTTGGG	2	12	510292	510303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198835
13545	NC_005835	GCCCG	2	10	510376	510385	0 %	0 %	40 %	60 %	46198836
13546	NC_005835	AGGT	2	8	510435	510442	25 %	25 %	50 %	0 %	46198836
13547	NC_005835	GAG	2	6	510443	510448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198836
13548	NC_005835	AGA	2	6	510538	510543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198836
13549	NC_005835	GGT	2	6	510557	510562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198836
13550	NC_005835	GCGG	2	8	510644	510651	0 %	0 %	75 %	25 %	46198836
13551	NC_005835	GTC	2	6	510662	510667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198836
13552	NC_005835	GAA	2	6	510677	510682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198836
13553	NC_005835	TCC	2	6	510705	510710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198836
13554	NC_005835	AGG	2	6	510726	510731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198836
13555	NC_005835	GGT	2	6	510827	510832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198836
13556	NC_005835	GGC	2	6	510862	510867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198836
13557	NC_005835	GC	3	6	510902	510907	0 %	0 %	50 %	50 %	46198836
13558	NC_005835	CAG	2	6	510914	510919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198836
13559	NC_005835	GCCTTA	2	12	510930	510941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46198836
13560	NC_005835	GTC	3	9	510950	510958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198836
13561	NC_005835	GAGCCA	2	12	510962	510973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198836
13562	NC_005835	C	6	6	511016	511021	0 %	0 %	0 %	100 %	46198836
13563	NC_005835	GGA	2	6	511048	511053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198836
13564	NC_005835	CTT	2	6	511072	511077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198836
13565	NC_005835	CCA	3	9	511114	511122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198836
13566	NC_005835	G	6	6	511134	511139	0 %	0 %	100 %	0 %	46198836
13567	NC_005835	TGT	2	6	511277	511282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198837
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13569	NC_005835	CCT	2	6	511337	511342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13570	NC_005835	TCC	2	6	511372	511377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13571	NC_005835	GTA	2	6	511389	511394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198837
13572	NC_005835	TCC	2	6	511403	511408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13573	NC_005835	CCT	2	6	511535	511540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13574	NC_005835	GGAG	2	8	511577	511584	25 %	0 %	75 %	0 %	46198837
13575	NC_005835	AGGGG	2	10	511589	511598	20 %	0 %	80 %	0 %	46198837
13576	NC_005835	GAA	2	6	511614	511619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198837
13577	NC_005835	GC	3	6	511647	511652	0 %	0 %	50 %	50 %	46198837
13578	NC_005835	CCT	2	6	511673	511678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13579	NC_005835	GGA	3	9	511691	511699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198837
13580	NC_005835	CCT	2	6	511748	511753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13581	NC_005835	TCT	3	9	511927	511935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198837
13582	NC_005835	CGGAGG	2	12	511939	511950	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198837
13583	NC_005835	TTC	2	6	511992	511997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198837
13584	NC_005835	AGGGG	2	10	512051	512060	20 %	0 %	80 %	0 %	46198837
13585	NC_005835	CCT	2	6	512063	512068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198837
13586	NC_005835	CCA	2	6	512075	512080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198837
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13588	NC_005835	TCG	2	6	512209	512214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198837
13589	NC_005835	CCA	3	9	512246	512254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198837
13590	NC_005835	GCG	3	9	512269	512277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198837
13591	NC_005835	TCCT	2	8	512339	512346	0 %	50 %	0 %	50 %	46198837
13592	NC_005835	GCG	2	6	512367	512372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198838
13593	NC_005835	GGC	2	6	512381	512386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198838
13594	NC_005835	AGGG	2	8	512482	512489	25 %	0 %	75 %	0 %	46198838
13595	NC_005835	GTG	2	6	512544	512549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198838
13596	NC_005835	AGC	2	6	512616	512621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198838
13597	NC_005835	TCC	2	6	512655	512660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198838
13598	NC_005835	CGC	2	6	512702	512707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198838
13599	NC_005835	GAG	2	6	512744	512749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198838
13600	NC_005835	GAG	2	6	512780	512785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198838
13601	NC_005835	GGT	2	6	512794	512799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198838
13602	NC_005835	TCT	2	6	512800	512805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198838
13603	NC_005835	CGGG	2	8	512817	512824	0 %	0 %	75 %	25 %	46198838
13604	NC_005835	CGG	2	6	512833	512838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198838
13605	NC_005835	CCT	2	6	512869	512874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198838
13606	NC_005835	GGC	2	6	512889	512894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198838
13607	NC_005835	GCC	2	6	512970	512975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198838
13608	NC_005835	GCCCGC	2	12	512997	513008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198838
13609	NC_005835	GGA	2	6	513025	513030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198838
13610	NC_005835	C	7	7	513059	513065	0 %	0 %	0 %	100 %	46198838
13611	NC_005835	AGA	2	6	513073	513078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198838
13612	NC_005835	GAA	2	6	513125	513130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198838
13613	NC_005835	GCG	2	6	513131	513136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198838
13614	NC_005835	CCA	2	6	513163	513168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198838
13615	NC_005835	CGC	2	6	513227	513232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198838
13616	NC_005835	CCTCGG	2	12	513262	513273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198838
13617	NC_005835	GGC	2	6	513278	513283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198838
13618	NC_005835	TCG	2	6	513467	513472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198839
13619	NC_005835	GGA	2	6	513473	513478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198839
13620	NC_005835	GGA	2	6	513483	513488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198839
13621	NC_005835	GCGG	2	8	513628	513635	0 %	0 %	75 %	25 %	46198839
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13623	NC_005835	TCC	2	6	513755	513760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198839
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13744	NC_005835	AGGCC	2	10	518170	518179	20 %	0 %	40 %	40 %	46198842
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13982	NC_005835	CCTCGG	2	12	528317	528328	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198851
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13990	NC_005835	TCC	2	6	528607	528612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198851
13991	NC_005835	CGC	2	6	528690	528695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198851
13992	NC_005835	CTC	2	6	528696	528701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198851
13993	NC_005835	CTC	2	6	528717	528722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198851
13994	NC_005835	AAG	2	6	528742	528747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198851
13995	NC_005835	CTGC	2	8	528761	528768	0 %	25 %	25 %	50 %	46198851
13996	NC_005835	GGA	2	6	528770	528775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198851
13997	NC_005835	GCC	2	6	528790	528795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198851
13998	NC_005835	CGG	2	6	528837	528842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198851
13999	NC_005835	G	7	7	528861	528867	0 %	0 %	100 %	0 %	46198851
14000	NC_005835	GGAG	2	8	528890	528897	25 %	0 %	75 %	0 %	46198851

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