MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_005835	GATG	2	8	489476	489483	25 %	25 %	50 %	0 %	46198812
13002	NC_005835	TTG	2	6	489547	489552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198812
13003	NC_005835	GGA	2	6	489653	489658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198812
13004	NC_005835	C	6	6	489663	489668	0 %	0 %	0 %	100 %	46198812
13005	NC_005835	TCC	2	6	489697	489702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198812
13006	NC_005835	GAG	2	6	489714	489719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198812
13007	NC_005835	GGA	2	6	489755	489760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198812
13008	NC_005835	CGC	2	6	489804	489809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198812
13009	NC_005835	CCT	2	6	489818	489823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198812
13010	NC_005835	CCG	2	6	489857	489862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198812
13011	NC_005835	GGC	2	6	489897	489902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198812
13012	NC_005835	CCT	2	6	489932	489937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198812
13013	NC_005835	TCC	2	6	489994	489999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198812
13014	NC_005835	GCC	2	6	490000	490005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198812
13015	NC_005835	CGG	2	6	490061	490066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198812
13016	NC_005835	CAC	2	6	490074	490079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198812
13017	NC_005835	GGC	2	6	490094	490099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198812
13018	NC_005835	CTG	2	6	490113	490118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198812
13019	NC_005835	GAC	3	9	490143	490151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198812
13020	NC_005835	CAC	2	6	490169	490174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198813
13021	NC_005835	AGG	2	6	490203	490208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13022	NC_005835	GGA	2	6	490243	490248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13023	NC_005835	GAG	3	9	490325	490333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13024	NC_005835	ACC	2	6	490395	490400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198813
13025	NC_005835	C	6	6	490425	490430	0 %	0 %	0 %	100 %	46198813
13026	NC_005835	GCCC	2	8	490491	490498	0 %	0 %	25 %	75 %	46198813
13027	NC_005835	CCA	2	6	490534	490539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198813
13028	NC_005835	GAG	3	9	490589	490597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13029	NC_005835	GAG	2	6	490697	490702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13030	NC_005835	AGG	2	6	490800	490805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13031	NC_005835	G	6	6	490804	490809	0 %	0 %	100 %	0 %	46198813
13032	NC_005835	CTC	2	6	490827	490832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198813
13033	NC_005835	AGG	2	6	490878	490883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13034	NC_005835	GGA	2	6	490888	490893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13035	NC_005835	C	7	7	490905	490911	0 %	0 %	0 %	100 %	46198813
13036	NC_005835	GAG	4	12	490919	490930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198813
13037	NC_005835	GGT	2	6	490969	490974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198813
13038	NC_005835	CTT	2	6	491042	491047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198814
13039	NC_005835	TCG	2	6	491079	491084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198814
13040	NC_005835	TCT	2	6	491089	491094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198814
13041	NC_005835	TCCGCC	2	12	491100	491111	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198814
13042	NC_005835	CTT	2	6	491153	491158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198814
13043	NC_005835	CGG	2	6	491178	491183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198814
13044	NC_005835	CTC	2	6	491207	491212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198814
13045	NC_005835	CCGC	2	8	491227	491234	0 %	0 %	25 %	75 %	46198814
13046	NC_005835	TCC	2	6	491253	491258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198814
13047	NC_005835	TTG	2	6	491295	491300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46198814
13048	NC_005835	ACC	2	6	491376	491381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198814
13049	NC_005835	GTA	2	6	491441	491446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198814
13050	NC_005835	AGG	3	9	491463	491471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198814
13051	NC_005835	ATA	2	6	491625	491630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46198815
13052	NC_005835	CCA	2	6	491632	491637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198815
13053	NC_005835	GGT	2	6	491705	491710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198815
13054	NC_005835	AGGT	2	8	491745	491752	25 %	25 %	50 %	0 %	46198815
13055	NC_005835	GTC	2	6	491792	491797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198815
13056	NC_005835	ACC	2	6	491835	491840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198815
13057	NC_005835	GCG	3	9	491868	491876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198815
13058	NC_005835	GAA	2	6	491888	491893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198815
13059	NC_005835	C	6	6	491906	491911	0 %	0 %	0 %	100 %	46198815
13060	NC_005835	GCG	2	6	491957	491962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198815
13061	NC_005835	GAGGGC	2	12	492044	492055	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198815
13062	NC_005835	ATG	2	6	492060	492065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198815
13063	NC_005835	CGG	2	6	492088	492093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198815
13064	NC_005835	GGCG	2	8	492118	492125	0 %	0 %	75 %	25 %	46198815
13065	NC_005835	GCCC	2	8	492140	492147	0 %	0 %	25 %	75 %	46198815
13066	NC_005835	GGC	2	6	492182	492187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198815
13067	NC_005835	CTG	2	6	492415	492420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198816
13068	NC_005835	ACCTTG	2	12	492434	492445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46198816
13069	NC_005835	GCT	2	6	492462	492467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198816
13070	NC_005835	CAG	2	6	492469	492474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198816
13071	NC_005835	ACC	2	6	492476	492481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198816
13072	NC_005835	TCC	2	6	492482	492487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198816
13073	NC_005835	CTT	2	6	492493	492498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198816
13074	NC_005835	GGC	2	6	492501	492506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198816
13075	NC_005835	TCT	2	6	492516	492521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198816
13076	NC_005835	CTG	2	6	492529	492534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198816
13077	NC_005835	GGC	2	6	492553	492558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198816
13078	NC_005835	CTC	2	6	492589	492594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198816
13079	NC_005835	CGG	2	6	492609	492614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198816
13080	NC_005835	TCA	2	6	492630	492635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198816
13081	NC_005835	CCA	2	6	492717	492722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198816
13082	NC_005835	TGG	2	6	492743	492748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198816
13083	NC_005835	GAT	2	6	492760	492765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198816
13084	NC_005835	CTT	2	6	492790	492795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198816
13085	NC_005835	GGC	2	6	492796	492801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198816
13086	NC_005835	C	6	6	492810	492815	0 %	0 %	0 %	100 %	46198816
13087	NC_005835	GGA	2	6	492822	492827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198816
13088	NC_005835	CAT	2	6	492883	492888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198816
13089	NC_005835	CTT	2	6	492913	492918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198816
13090	NC_005835	GCTTCC	2	12	492976	492987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46198817
13091	NC_005835	AGG	2	6	493001	493006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198817
13092	NC_005835	CCA	2	6	493016	493021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198817
13093	NC_005835	CCCCG	2	10	493022	493031	0 %	0 %	20 %	80 %	46198817
13094	NC_005835	GAT	2	6	493038	493043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198817
13095	NC_005835	TGGA	2	8	493072	493079	25 %	25 %	50 %	0 %	46198817
13096	NC_005835	CGT	3	9	493088	493096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198817
13097	NC_005835	GAT	2	6	493104	493109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198817
13098	NC_005835	CCA	2	6	493115	493120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198817
13099	NC_005835	GGTCGG	2	12	493121	493132	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46198817
13100	NC_005835	CCT	2	6	493196	493201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198817
13101	NC_005835	ACG	2	6	493213	493218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198817
13102	NC_005835	AGG	2	6	493243	493248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198817
13103	NC_005835	CTT	2	6	493308	493313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198817
13104	NC_005835	CTC	2	6	493320	493325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198817
13105	NC_005835	CTC	2	6	493356	493361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198817
13106	NC_005835	GCC	2	6	493407	493412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198817
13107	NC_005835	CAGC	2	8	493413	493420	25 %	0 %	25 %	50 %	46198817
13108	NC_005835	CTT	2	6	493482	493487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198817
13109	NC_005835	CGC	2	6	493511	493516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198817
13110	NC_005835	CTC	2	6	493557	493562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198817
13111	NC_005835	TCT	2	6	493568	493573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198817
13112	NC_005835	ATG	2	6	493582	493587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198817
13113	NC_005835	TCCGC	2	10	493598	493607	0 %	20 %	20 %	60 %	46198817
13114	NC_005835	CCT	2	6	494019	494024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198818
13115	NC_005835	CCT	3	9	494049	494057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198818
13116	NC_005835	CGG	2	6	494100	494105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198818
13117	NC_005835	GGA	4	12	494106	494117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198818
13118	NC_005835	AGGCG	2	10	494130	494139	20 %	0 %	60 %	20 %	46198818
13119	NC_005835	GGT	2	6	494169	494174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198818
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13121	NC_005835	GGCCCC	2	12	494205	494216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198818
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13491	NC_005835	GCCCCA	2	12	508353	508364	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198833
13492	NC_005835	AGC	2	6	508388	508393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198833
13493	NC_005835	AGG	2	6	508424	508429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198833
13494	NC_005835	CAC	2	6	508432	508437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198833
13495	NC_005835	CGC	2	6	508472	508477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198833
13496	NC_005835	GGA	2	6	508482	508487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198833
13497	NC_005835	GTG	2	6	508524	508529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198834
13498	NC_005835	CCCG	2	8	508533	508540	0 %	0 %	25 %	75 %	46198834
13499	NC_005835	GAG	2	6	508545	508550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198834
13500	NC_005835	GTG	2	6	508614	508619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198834

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