MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_005835	TCC	2	6	434915	434920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198754
11503	NC_005835	CCTCG	2	10	434973	434982	0 %	20 %	20 %	60 %	46198754
11504	NC_005835	CCT	2	6	435005	435010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11505	NC_005835	GGA	2	6	435011	435016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11506	NC_005835	CTC	2	6	435036	435041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11507	NC_005835	CGC	2	6	435072	435077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198755
11508	NC_005835	GAG	2	6	435201	435206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11509	NC_005835	CCT	2	6	435248	435253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11510	NC_005835	CCG	2	6	435254	435259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198755
11511	NC_005835	AGG	2	6	435286	435291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11512	NC_005835	AGG	2	6	435304	435309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11513	NC_005835	CTC	2	6	435321	435326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11514	NC_005835	CCT	2	6	435332	435337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11515	NC_005835	CCT	2	6	435344	435349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11516	NC_005835	CCA	3	9	435356	435364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198755
11517	NC_005835	C	6	6	435418	435423	0 %	0 %	0 %	100 %	46198755
11518	NC_005835	GCC	2	6	435424	435429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198755
11519	NC_005835	GAG	2	6	435438	435443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11520	NC_005835	CCA	2	6	435464	435469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198755
11521	NC_005835	GAG	2	6	435489	435494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11522	NC_005835	TCG	2	6	435526	435531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198755
11523	NC_005835	C	7	7	435709	435715	0 %	0 %	0 %	100 %	46198755
11524	NC_005835	GAG	2	6	435727	435732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198755
11525	NC_005835	CCA	2	6	435747	435752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198755
11526	NC_005835	CCCA	2	8	435875	435882	25 %	0 %	0 %	75 %	46198755
11527	NC_005835	CCT	2	6	435969	435974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198755
11528	NC_005835	GCG	2	6	436078	436083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198756
11529	NC_005835	CCA	2	6	436103	436108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198756
11530	NC_005835	GGC	2	6	436109	436114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198756
11531	NC_005835	CTCGTG	2	12	436140	436151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198756
11532	NC_005835	GCT	2	6	436154	436159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198756
11533	NC_005835	GCG	2	6	436162	436167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198756
11534	NC_005835	GGGT	2	8	436192	436199	0 %	25 %	75 %	0 %	46198756
11535	NC_005835	CCG	2	6	436271	436276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198756
11536	NC_005835	CGG	2	6	436331	436336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198756
11537	NC_005835	GAG	2	6	436476	436481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198756
11538	NC_005835	AGGCCC	2	12	436663	436674	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198756
11539	NC_005835	C	7	7	436711	436717	0 %	0 %	0 %	100 %	46198756
11540	NC_005835	GGC	2	6	436752	436757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198756
11541	NC_005835	CGC	2	6	436797	436802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198756
11542	NC_005835	GCC	2	6	436815	436820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198756
11543	NC_005835	C	6	6	436819	436824	0 %	0 %	0 %	100 %	46198756
11544	NC_005835	CCA	2	6	436979	436984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198756
11545	NC_005835	GGT	2	6	436986	436991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198756
11546	NC_005835	GAC	2	6	437043	437048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198756
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11548	NC_005835	TCA	2	6	437081	437086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198756
11549	NC_005835	GAGG	2	8	437244	437251	25 %	0 %	75 %	0 %	46198757
11550	NC_005835	G	6	6	437303	437308	0 %	0 %	100 %	0 %	46198757
11551	NC_005835	GAG	2	6	437324	437329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198757
11552	NC_005835	GTG	3	9	437399	437407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198757
11553	NC_005835	GAA	2	6	437423	437428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198757
11554	NC_005835	AAAG	2	8	437480	437487	75 %	0 %	25 %	0 %	46198757
11555	NC_005835	CCG	3	9	437491	437499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198757
11556	NC_005835	TCC	2	6	437505	437510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198757
11557	NC_005835	GTGGAG	2	12	437513	437524	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46198757
11558	NC_005835	GAG	2	6	437531	437536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198757
11559	NC_005835	G	6	6	437543	437548	0 %	0 %	100 %	0 %	46198757
11560	NC_005835	G	6	6	437551	437556	0 %	0 %	100 %	0 %	46198757
11561	NC_005835	AGG	3	9	437787	437795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198757
11562	NC_005835	AGG	2	6	437815	437820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198757
11563	NC_005835	GAA	2	6	437851	437856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198757
11564	NC_005835	AGG	2	6	437862	437867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198757
11565	NC_005835	CCCT	2	8	437872	437879	0 %	25 %	0 %	75 %	46198757
11566	NC_005835	GCGGG	2	10	437897	437906	0 %	0 %	80 %	20 %	46198757
11567	NC_005835	AGG	2	6	437928	437933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198757
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11569	NC_005835	GGC	2	6	437951	437956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198757
11570	NC_005835	GA	3	6	437985	437990	50 %	0 %	50 %	0 %	46198757
11571	NC_005835	GCC	2	6	437992	437997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198757
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11573	NC_005835	C	6	6	438085	438090	0 %	0 %	0 %	100 %	46198758
11574	NC_005835	GCG	2	6	438155	438160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198758
11575	NC_005835	TCT	2	6	438288	438293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198758
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11577	NC_005835	GGT	2	6	438351	438356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198758
11578	NC_005835	CGC	2	6	438388	438393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198758
11579	NC_005835	TCG	2	6	438431	438436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198758
11580	NC_005835	CCT	2	6	438450	438455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198758
11581	NC_005835	ATC	2	6	438485	438490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198758
11582	NC_005835	GGGTC	2	10	438522	438531	0 %	20 %	60 %	20 %	46198758
11583	NC_005835	CTC	2	6	438687	438692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198759
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11587	NC_005835	CCG	2	6	438798	438803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198759
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11589	NC_005835	CCACCT	2	12	438920	438931	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46198759
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11592	NC_005835	CGT	2	6	439028	439033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198759
11593	NC_005835	C	7	7	439053	439059	0 %	0 %	0 %	100 %	46198759
11594	NC_005835	CCG	2	6	439062	439067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198759
11595	NC_005835	CCCGGC	2	12	439080	439091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198759
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11598	NC_005835	GTG	2	6	439138	439143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198759
11599	NC_005835	GAG	2	6	439233	439238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198759
11600	NC_005835	GAG	3	9	439305	439313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198759
11601	NC_005835	GTG	2	6	439371	439376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198759
11602	NC_005835	G	6	6	439379	439384	0 %	0 %	100 %	0 %	46198759
11603	NC_005835	CCGCC	2	10	439487	439496	0 %	0 %	20 %	80 %	46198760
11604	NC_005835	GAT	2	6	439502	439507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198760
11605	NC_005835	TCCTC	2	10	439567	439576	0 %	40 %	0 %	60 %	46198760
11606	NC_005835	C	6	6	439603	439608	0 %	0 %	0 %	100 %	46198760
11607	NC_005835	GTC	2	6	439712	439717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198760
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11609	NC_005835	CTT	2	6	439736	439741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198760
11610	NC_005835	GGC	2	6	439825	439830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198760
11611	NC_005835	CTC	2	6	439856	439861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198760
11612	NC_005835	TGG	2	6	439888	439893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198760
11613	NC_005835	TGG	2	6	439897	439902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198760
11614	NC_005835	GCGGT	2	10	439920	439929	0 %	20 %	60 %	20 %	46198760
11615	NC_005835	CCG	2	6	439948	439953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198760
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11617	NC_005835	CCT	2	6	440035	440040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198760
11618	NC_005835	GGCG	2	8	440071	440078	0 %	0 %	75 %	25 %	46198760
11619	NC_005835	GTG	2	6	440090	440095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198760
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11621	NC_005835	CCAGGT	2	12	440158	440169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198760
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11992	NC_005835	G	6	6	452825	452830	0 %	0 %	100 %	0 %	46198773
11993	NC_005835	TCCGC	2	10	452838	452847	0 %	20 %	20 %	60 %	46198773
11994	NC_005835	GGA	2	6	452853	452858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198773
11995	NC_005835	GGC	2	6	452859	452864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198773
11996	NC_005835	CGT	2	6	452874	452879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198773
11997	NC_005835	CCA	2	6	452889	452894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198773
11998	NC_005835	CCCG	2	8	452895	452902	0 %	0 %	25 %	75 %	46198773
11999	NC_005835	CCA	2	6	452940	452945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198773
12000	NC_005835	CCT	2	6	452955	452960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198773

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