MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_005835	CCG	2	6	244342	244347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198561
6502	NC_005835	C	6	6	244356	244361	0 %	0 %	0 %	100 %	46198561
6503	NC_005835	TTC	2	6	244362	244367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198561
6504	NC_005835	GGA	2	6	244379	244384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6505	NC_005835	CCA	2	6	244399	244404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198561
6506	NC_005835	CAA	2	6	244418	244423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46198561
6507	NC_005835	TGG	2	6	244492	244497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198561
6508	NC_005835	CTC	2	6	244527	244532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198561
6509	NC_005835	AGG	2	6	244534	244539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6510	NC_005835	CTT	2	6	244580	244585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198561
6511	NC_005835	GGGAGG	2	12	244597	244608	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198561
6512	NC_005835	TCT	2	6	244618	244623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198561
6513	NC_005835	GCTTCC	2	12	244651	244662	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	46198561
6514	NC_005835	ACT	2	6	244696	244701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198561
6515	NC_005835	AGG	2	6	244753	244758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561
6516	NC_005835	CGGG	2	8	244764	244771	0 %	0 %	75 %	25 %	46198561
6517	NC_005835	AGGCCC	2	12	244828	244839	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46198561
6518	NC_005835	CAG	2	6	244989	244994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198561
6519	NC_005835	CCA	2	6	245134	245139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198561
6520	NC_005835	CCA	2	6	245153	245158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198561
6521	NC_005835	CCA	2	6	245192	245197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198562
6522	NC_005835	CTT	2	6	245204	245209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198562
6523	NC_005835	AGG	2	6	245250	245255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198562
6524	NC_005835	GA	3	6	245286	245291	50 %	0 %	50 %	0 %	46198562
6525	NC_005835	CGC	2	6	245551	245556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198563
6526	NC_005835	GCCC	2	8	245575	245582	0 %	0 %	25 %	75 %	46198563
6527	NC_005835	CTCC	2	8	245623	245630	0 %	25 %	0 %	75 %	46198563
6528	NC_005835	GGGAG	2	10	245664	245673	20 %	0 %	80 %	0 %	46198563
6529	NC_005835	CTT	2	6	245749	245754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198563
6530	NC_005835	CGCC	2	8	245788	245795	0 %	0 %	25 %	75 %	46198563
6531	NC_005835	CTT	2	6	245842	245847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198563
6532	NC_005835	CTA	2	6	245851	245856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198563
6533	NC_005835	CCT	2	6	245901	245906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6534	NC_005835	C	7	7	245931	245937	0 %	0 %	0 %	100 %	46198563
6535	NC_005835	CTT	2	6	245983	245988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198563
6536	NC_005835	GGA	2	6	245998	246003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198563
6537	NC_005835	GGT	2	6	246028	246033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
6538	NC_005835	CCT	2	6	246064	246069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6539	NC_005835	CTC	3	9	246086	246094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6540	NC_005835	GGAGGG	2	12	246142	246153	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46198563
6541	NC_005835	GGCCC	2	10	246214	246223	0 %	0 %	40 %	60 %	46198563
6542	NC_005835	CGGAGG	2	12	246252	246263	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198563
6543	NC_005835	CTC	2	6	246284	246289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6544	NC_005835	GCGG	2	8	246304	246311	0 %	0 %	75 %	25 %	46198563
6545	NC_005835	CCT	2	6	246331	246336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6546	NC_005835	GCCC	2	8	246359	246366	0 %	0 %	25 %	75 %	46198563
6547	NC_005835	CCT	2	6	246456	246461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6548	NC_005835	G	6	6	246491	246496	0 %	0 %	100 %	0 %	46198563
6549	NC_005835	G	6	6	246561	246566	0 %	0 %	100 %	0 %	46198563
6550	NC_005835	CGGGG	2	10	246594	246603	0 %	0 %	80 %	20 %	46198563
6551	NC_005835	G	6	6	246600	246605	0 %	0 %	100 %	0 %	46198563
6552	NC_005835	TTCC	2	8	246628	246635	0 %	50 %	0 %	50 %	46198563
6553	NC_005835	GAG	2	6	246647	246652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198563
6554	NC_005835	CGT	2	6	246676	246681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198563
6555	NC_005835	GAG	2	6	246710	246715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198563
6556	NC_005835	CCT	3	9	246736	246744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6557	NC_005835	C	6	6	246773	246778	0 %	0 %	0 %	100 %	46198563
6558	NC_005835	CCT	2	6	246798	246803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6559	NC_005835	GCCC	2	8	246807	246814	0 %	0 %	25 %	75 %	46198563
6560	NC_005835	TGG	2	6	246882	246887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
6561	NC_005835	GGT	2	6	246919	246924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
6562	NC_005835	AGG	3	9	246930	246938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198563
6563	NC_005835	CACC	2	8	246958	246965	25 %	0 %	0 %	75 %	46198563
6564	NC_005835	TGG	3	9	246966	246974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198563
6565	NC_005835	GGC	2	6	247036	247041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198563
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6567	NC_005835	CCA	2	6	247072	247077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198563
6568	NC_005835	GCCCC	2	10	247185	247194	0 %	0 %	20 %	80 %	46198563
6569	NC_005835	CTC	2	6	247247	247252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198563
6570	NC_005835	CTCGCC	2	12	247405	247416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198564
6571	NC_005835	CAC	2	6	247455	247460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198564
6572	NC_005835	GAG	2	6	247495	247500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198564
6573	NC_005835	CCG	2	6	247515	247520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198564
6574	NC_005835	GCCCTG	2	12	247525	247536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46198564
6575	NC_005835	CTC	2	6	247585	247590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198564
6576	NC_005835	GCCTCC	2	12	247613	247624	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46198564
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6578	NC_005835	GGGTCC	2	12	247703	247714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46198564
6579	NC_005835	GGA	2	6	247791	247796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198564
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6582	NC_005835	GTG	2	6	247849	247854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198564
6583	NC_005835	CTC	2	6	247876	247881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198564
6584	NC_005835	G	6	6	247911	247916	0 %	0 %	100 %	0 %	46198564
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6588	NC_005835	CCT	2	6	248043	248048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198564
6589	NC_005835	GCC	2	6	248058	248063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198564
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6591	NC_005835	GAA	2	6	248181	248186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198565
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6594	NC_005835	CCG	2	6	248270	248275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198565
6595	NC_005835	GGA	2	6	248292	248297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198565
6596	NC_005835	ACG	2	6	248324	248329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198565
6597	NC_005835	CGG	2	6	248335	248340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198565
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6599	NC_005835	CCT	2	6	248382	248387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198565
6600	NC_005835	GAGACC	2	12	248455	248466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198565
6601	NC_005835	CGA	2	6	248532	248537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46198565
6602	NC_005835	C	6	6	248540	248545	0 %	0 %	0 %	100 %	46198565
6603	NC_005835	CTC	2	6	248557	248562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198565
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6605	NC_005835	GTG	2	6	248581	248586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198565
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6607	NC_005835	CCT	2	6	248674	248679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198566
6608	NC_005835	CTC	2	6	248810	248815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198566
6609	NC_005835	C	7	7	248825	248831	0 %	0 %	0 %	100 %	46198566
6610	NC_005835	C	7	7	248870	248876	0 %	0 %	0 %	100 %	46198566
6611	NC_005835	GCCC	2	8	248894	248901	0 %	0 %	25 %	75 %	46198566
6612	NC_005835	AGG	2	6	248913	248918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198566
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6625	NC_005835	TCC	2	6	249436	249441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198566
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6998	NC_005835	GAG	3	9	263923	263931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198582
6999	NC_005835	AAG	2	6	263962	263967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198582
7000	NC_005835	GAG	2	6	264025	264030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198583

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