MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_005835	GAT	2	6	225488	225493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198546
6002	NC_005835	CTCG	2	8	225506	225513	0 %	25 %	25 %	50 %	46198546
6003	NC_005835	CTC	2	6	225569	225574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6004	NC_005835	AAG	2	6	225576	225581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198546
6005	NC_005835	C	6	6	225587	225592	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6006	NC_005835	GCC	2	6	225627	225632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6007	NC_005835	CTT	2	6	225689	225694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198546
6008	NC_005835	GCC	2	6	225699	225704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6009	NC_005835	GAG	2	6	225713	225718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6010	NC_005835	GCGG	2	8	225719	225726	0 %	0 %	75 %	25 %	46198546
6011	NC_005835	GGC	2	6	225746	225751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198546
6012	NC_005835	GC	3	6	225837	225842	0 %	0 %	50 %	50 %	46198546
6013	NC_005835	CGC	2	6	225863	225868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6014	NC_005835	CCCCTC	2	12	225914	225925	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	46198546
6015	NC_005835	GCACCC	2	12	225949	225960	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46198546
6016	NC_005835	CCG	2	6	225985	225990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198546
6017	NC_005835	GGTC	2	8	226084	226091	0 %	25 %	50 %	25 %	46198546
6018	NC_005835	TCT	2	6	226141	226146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198546
6019	NC_005835	CGG	2	6	226176	226181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198546
6020	NC_005835	C	6	6	226252	226257	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6021	NC_005835	GAG	2	6	226307	226312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6022	NC_005835	G	6	6	226312	226317	0 %	0 %	100 %	0 %	46198546
6023	NC_005835	CTG	2	6	226331	226336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198546
6024	NC_005835	AGG	2	6	226357	226362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6025	NC_005835	C	7	7	226367	226373	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6026	NC_005835	TCC	2	6	226377	226382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6027	NC_005835	AGG	2	6	226383	226388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198546
6028	NC_005835	GAA	2	6	226400	226405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198546
6029	NC_005835	C	6	6	226419	226424	0 %	0 %	0 %	100 %	46198546
6030	NC_005835	TCC	2	6	226470	226475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6031	NC_005835	CCT	4	12	226495	226506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198546
6032	NC_005835	GCCCC	2	10	226521	226530	0 %	0 %	20 %	80 %	46198546
6033	NC_005835	GA	3	6	226536	226541	50 %	0 %	50 %	0 %	46198546
6034	NC_005835	CCT	2	6	226631	226636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198547
6035	NC_005835	CCGC	2	8	226637	226644	0 %	0 %	25 %	75 %	46198547
6036	NC_005835	ATC	2	6	226672	226677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198547
6037	NC_005835	GCCC	2	8	226699	226706	0 %	0 %	25 %	75 %	46198547
6038	NC_005835	GAA	2	6	226857	226862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198547
6039	NC_005835	GAA	2	6	226907	226912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198547
6040	NC_005835	GGC	2	6	226914	226919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198547
6041	NC_005835	CGC	2	6	226953	226958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198547
6042	NC_005835	AGG	2	6	226978	226983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198547
6043	NC_005835	TCC	2	6	227002	227007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198547
6044	NC_005835	GTG	2	6	227019	227024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198547
6045	NC_005835	GGC	2	6	227031	227036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198547
6046	NC_005835	TGG	2	6	227075	227080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198547
6047	NC_005835	GGC	2	6	227109	227114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198547
6048	NC_005835	CTC	2	6	227115	227120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198547
6049	NC_005835	TCG	3	9	227135	227143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46198547
6050	NC_005835	GAG	2	6	227216	227221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6051	NC_005835	GAA	2	6	227273	227278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198548
6052	NC_005835	CCACCT	2	12	227281	227292	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46198548
6053	NC_005835	AGG	2	6	227328	227333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6054	NC_005835	CCA	2	6	227344	227349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198548
6055	NC_005835	GTA	2	6	227363	227368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198548
6056	NC_005835	GCGG	2	8	227468	227475	0 %	0 %	75 %	25 %	46198548
6057	NC_005835	C	6	6	227615	227620	0 %	0 %	0 %	100 %	46198548
6058	NC_005835	GGC	2	6	227621	227626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198548
6059	NC_005835	CGC	2	6	227627	227632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198548
6060	NC_005835	AGA	2	6	227692	227697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198548
6061	NC_005835	GAA	2	6	227702	227707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46198548
6062	NC_005835	GAG	2	6	227720	227725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6063	NC_005835	AGG	4	12	227766	227777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6064	NC_005835	GAG	2	6	227780	227785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6065	NC_005835	AGGGTC	2	12	227790	227801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46198548
6066	NC_005835	GCC	2	6	227866	227871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198548
6067	NC_005835	GCCATG	2	12	227892	227903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198548
6068	NC_005835	CCA	2	6	227914	227919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198548
6069	NC_005835	GAG	2	6	227933	227938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6070	NC_005835	GAG	2	6	227972	227977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198548
6071	NC_005835	C	6	6	227981	227986	0 %	0 %	0 %	100 %	46198548
6072	NC_005835	CCA	2	6	228123	228128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198549
6073	NC_005835	CCT	3	9	228156	228164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198549
6074	NC_005835	GGT	2	6	228277	228282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46198549
6075	NC_005835	AGGA	2	8	228328	228335	50 %	0 %	50 %	0 %	46198549
6076	NC_005835	CGG	2	6	228339	228344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198549
6077	NC_005835	AGG	2	6	228350	228355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198549
6078	NC_005835	CTC	2	6	228556	228561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198550
6079	NC_005835	CTGC	2	8	228627	228634	0 %	25 %	25 %	50 %	46198550
6080	NC_005835	GGC	2	6	228644	228649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
6081	NC_005835	CGG	2	6	228678	228683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
6082	NC_005835	TCT	2	6	228698	228703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198550
6083	NC_005835	GCC	2	6	228768	228773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198550
6084	NC_005835	GGA	2	6	228800	228805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198550
6085	NC_005835	GAG	2	6	228822	228827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198550
6086	NC_005835	CGC	2	6	228846	228851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198550
6087	NC_005835	GCC	2	6	228864	228869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198550
6088	NC_005835	GC	3	6	228930	228935	0 %	0 %	50 %	50 %	46198550
6089	NC_005835	CCT	2	6	228955	228960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198550
6090	NC_005835	GGC	2	6	228998	229003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
6091	NC_005835	ACT	2	6	229012	229017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46198550
6092	NC_005835	ACAACC	2	12	229018	229029	50 %	0 %	0 %	50 %	46198550
6093	NC_005835	ACC	2	6	229065	229070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198550
6094	NC_005835	AGG	2	6	229168	229173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198550
6095	NC_005835	AG	3	6	229211	229216	50 %	0 %	50 %	0 %	46198550
6096	NC_005835	GC	3	6	229295	229300	0 %	0 %	50 %	50 %	46198550
6097	NC_005835	CGG	2	6	229357	229362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198550
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6099	NC_005835	GGA	2	6	229502	229507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198550
6100	NC_005835	CGC	2	6	229649	229654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198551
6101	NC_005835	TCC	2	6	229661	229666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6102	NC_005835	GGC	2	6	229732	229737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198551
6103	NC_005835	GCC	2	6	229746	229751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198551
6104	NC_005835	CT	3	6	229790	229795	0 %	50 %	0 %	50 %	46198551
6105	NC_005835	GGC	2	6	229816	229821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198551
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6107	NC_005835	TCC	2	6	229844	229849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6108	NC_005835	TTC	2	6	229859	229864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46198551
6109	NC_005835	GGC	2	6	229933	229938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46198551
6110	NC_005835	GAG	2	6	229945	229950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198551
6111	NC_005835	CCA	2	6	229974	229979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198551
6112	NC_005835	GCGAGG	2	12	230051	230062	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46198551
6113	NC_005835	TCCAGG	2	12	230069	230080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46198551
6114	NC_005835	CTC	2	6	230164	230169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6115	NC_005835	G	6	6	230211	230216	0 %	0 %	100 %	0 %	46198551
6116	NC_005835	ACC	2	6	230270	230275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46198551
6117	NC_005835	CCT	2	6	230295	230300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6118	NC_005835	GAG	3	9	230311	230319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198551
6119	NC_005835	CCT	2	6	230329	230334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6120	NC_005835	CCT	2	6	230346	230351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6121	NC_005835	CCT	2	6	230367	230372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6122	NC_005835	TC	3	6	230406	230411	0 %	50 %	0 %	50 %	46198551
6123	NC_005835	GAG	2	6	230425	230430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198551
6124	NC_005835	CCT	2	6	230445	230450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6125	NC_005835	TCC	2	6	230453	230458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6126	NC_005835	GCC	2	6	230469	230474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46198551
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6129	NC_005835	TCC	2	6	230510	230515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
6130	NC_005835	G	6	6	230565	230570	0 %	0 %	100 %	0 %	46198551
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6132	NC_005835	CCT	2	6	230646	230651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46198551
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6246	NC_005835	AGT	2	6	234689	234694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46198555
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6500	NC_005835	GGA	2	6	244232	244237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46198561

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