MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	T	6	6	60	65	0 %	100 %	0 %	0 %	28492968
2	NC_004572	ATA	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492968
3	NC_004572	GAT	2	6	169	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492968
4	NC_004572	CAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492968
5	NC_004572	A	6	6	195	200	100 %	0 %	0 %	0 %	28492968
6	NC_004572	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
7	NC_004572	GGAAGA	2	12	309	320	50 %	0 %	50 %	0 %	28492968
8	NC_004572	CA	3	6	337	342	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
9	NC_004572	TTC	2	6	361	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492968
10	NC_004572	AC	3	6	374	379	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
11	NC_004572	AAC	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492968
12	NC_004572	CAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492968
13	NC_004572	TA	3	6	540	545	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
14	NC_004572	AC	3	6	568	573	50 %	0 %	0 %	50 %	28492968
15	NC_004572	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
16	NC_004572	TCT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492968
17	NC_004572	CTCC	2	8	798	805	0 %	25 %	0 %	75 %	28492968
18	NC_004572	GCAG	2	8	815	822	25 %	0 %	50 %	25 %	28492968
19	NC_004572	GT	3	6	904	909	0 %	50 %	50 %	0 %	28492968
20	NC_004572	TTC	2	6	947	952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492968
21	NC_004572	AGA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
22	NC_004572	A	6	6	973	978	100 %	0 %	0 %	0 %	28492968
23	NC_004572	AT	3	6	1002	1007	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
24	NC_004572	AGC	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492968
25	NC_004572	AGA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
26	NC_004572	AAT	2	6	1167	1172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492968
27	NC_004572	AT	3	6	1238	1243	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
28	NC_004572	AAT	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492968
29	NC_004572	GAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
30	NC_004572	AT	3	6	1400	1405	50 %	50 %	0 %	0 %	28492968
31	NC_004572	GAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492968
32	NC_004572	TTA	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492969
33	NC_004572	GTA	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492969
34	NC_004572	TGA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492969
35	NC_004572	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492969
36	NC_004572	A	6	6	2044	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	28492969
37	NC_004572	ACA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492969
38	NC_004572	GAT	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492969
39	NC_004572	CATC	2	8	2322	2329	25 %	25 %	0 %	50 %	28492969
40	NC_004572	GTC	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492969
41	NC_004572	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	28492969
42	NC_004572	AGA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492969
43	NC_004572	GA	4	8	2598	2605	50 %	0 %	50 %	0 %	28492969
44	NC_004572	A	6	6	2630	2635	100 %	0 %	0 %	0 %	28492969
45	NC_004572	TAT	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492969
46	NC_004572	A	6	6	2851	2856	100 %	0 %	0 %	0 %	28492969
47	NC_004572	ATTT	2	8	2884	2891	25 %	75 %	0 %	0 %	28492969
48	NC_004572	AAT	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492969
49	NC_004572	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
50	NC_004572	GAT	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492970
51	NC_004572	ATG	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492970
52	NC_004572	CT	3	6	3381	3386	0 %	50 %	0 %	50 %	28492970
53	NC_004572	ATC	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492970
54	NC_004572	CCT	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492970
55	NC_004572	TGG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492970
56	NC_004572	ATT	2	6	3561	3566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492970
57	NC_004572	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	28492970
58	NC_004572	AGA	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
59	NC_004572	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
60	NC_004572	TCAA	2	8	3699	3706	50 %	25 %	0 %	25 %	28492970
61	NC_004572	TGT	2	6	3798	3803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492970
62	NC_004572	GAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492970
63	NC_004572	AAC	3	9	3891	3899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492970
64	NC_004572	AGA	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
65	NC_004572	TG	3	6	4008	4013	0 %	50 %	50 %	0 %	28492971
66	NC_004572	CAG	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492971
67	NC_004572	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492971
68	NC_004572	GTT	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492971
69	NC_004572	A	7	7	4322	4328	100 %	0 %	0 %	0 %	28492971
70	NC_004572	AGG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492971
71	NC_004572	AC	3	6	4492	4497	50 %	0 %	0 %	50 %	28492972
72	NC_004572	TTG	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
73	NC_004572	AAAT	2	8	4666	4673	75 %	25 %	0 %	0 %	28492972
74	NC_004572	CGG	2	6	4691	4696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492972
75	NC_004572	GTT	2	6	4770	4775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
76	NC_004572	GGA	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492972
77	NC_004572	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492972
78	NC_004572	TGT	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
79	NC_004572	GTTTT	2	10	4906	4915	0 %	80 %	20 %	0 %	28492972
80	NC_004572	CTG	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492972
81	NC_004572	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
82	NC_004572	TGA	3	9	5006	5014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492972
83	NC_004572	GTTT	2	8	5028	5035	0 %	75 %	25 %	0 %	28492972
84	NC_004572	TGC	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492972
85	NC_004572	AAC	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492972
86	NC_004572	TATGT	2	10	5172	5181	20 %	60 %	20 %	0 %	28492972
87	NC_004572	GAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
88	NC_004572	AT	4	8	5305	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	28492972
89	NC_004572	AC	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	28492972
90	NC_004572	GCA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492972
91	NC_004572	AAAGGA	2	12	5420	5431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
92	NC_004572	CAAA	2	8	5514	5521	75 %	0 %	0 %	25 %	28492972
93	NC_004572	CAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492972
94	NC_004572	ATT	2	6	5622	5627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492972
95	NC_004572	CTT	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492972
96	NC_004572	GC	3	6	5669	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	28492972
97	NC_004572	AG	3	6	5676	5681	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
98	NC_004572	TTG	2	6	5776	5781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
99	NC_004572	CAGGG	2	10	5811	5820	20 %	0 %	60 %	20 %	28492972
100	NC_004572	AAGGC	2	10	5874	5883	40 %	0 %	40 %	20 %	28492972
101	NC_004572	AAT	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492972
102	NC_004572	AG	3	6	6074	6079	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
103	NC_004572	C	7	7	6101	6107	0 %	0 %	0 %	100 %	28492972
104	NC_004572	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
105	NC_004572	A	6	6	6200	6205	100 %	0 %	0 %	0 %	28492972
106	NC_004572	AG	3	6	6261	6266	50 %	0 %	50 %	0 %	28492972
107	NC_004572	ACC	2	6	6276	6281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492972
108	NC_004572	GAC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492972
109	NC_004572	TGA	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492972
110	NC_004572	T	6	6	6346	6351	0 %	100 %	0 %	0 %	28492972
111	NC_004572	GGA	2	6	6365	6370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492972
112	NC_004572	TCG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492972
113	NC_004572	AT	3	6	6427	6432	50 %	50 %	0 %	0 %	28492972
114	NC_004572	GAG	2	6	6474	6479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492973
115	NC_004572	ATG	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
116	NC_004572	GCC	2	6	6783	6788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492973
117	NC_004572	TGA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
118	NC_004572	ATG	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
119	NC_004572	TGCCG	2	10	6907	6916	0 %	20 %	40 %	40 %	28492973
120	NC_004572	CGC	2	6	6979	6984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492973
121	NC_004572	GTG	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492973
122	NC_004572	GAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492973
123	NC_004572	GTT	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
124	NC_004572	GAA	2	6	7188	7193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
125	NC_004572	TTG	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
126	NC_004572	CT	3	6	7271	7276	0 %	50 %	0 %	50 %	28492973
127	NC_004572	GGT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492973
128	NC_004572	TTG	2	6	7450	7455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
129	NC_004572	GTTC	2	8	7483	7490	0 %	50 %	25 %	25 %	28492973
130	NC_004572	AGC	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
131	NC_004572	GC	4	8	7565	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	28492973
132	NC_004572	CGA	2	6	7610	7615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
133	NC_004572	TCT	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492973
134	NC_004572	GAG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492973
135	NC_004572	GCG	2	6	7727	7732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492973
136	NC_004572	GCC	2	6	7737	7742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492973
137	NC_004572	AGA	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
138	NC_004572	TTCT	2	8	7810	7817	0 %	75 %	0 %	25 %	28492973
139	NC_004572	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
140	NC_004572	ACG	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
141	NC_004572	AAT	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492973
142	NC_004572	GTT	3	9	7959	7967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
143	NC_004572	TA	3	6	7983	7988	50 %	50 %	0 %	0 %	28492973
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145	NC_004572	TGA	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
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149	NC_004572	T	6	6	8115	8120	0 %	100 %	0 %	0 %	28492973
150	NC_004572	AGGG	2	8	8129	8136	25 %	0 %	75 %	0 %	28492973
151	NC_004572	TCT	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492973
152	NC_004572	A	7	7	8310	8316	100 %	0 %	0 %	0 %	28492973
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157	NC_004572	AGCTG	2	10	8546	8555	20 %	20 %	40 %	20 %	28492973
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162	NC_004572	TAC	2	6	8801	8806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492973
163	NC_004572	CTC	3	9	8917	8925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492974
164	NC_004572	CTTA	2	8	9016	9023	25 %	50 %	0 %	25 %	28492974
165	NC_004572	T	6	6	9150	9155	0 %	100 %	0 %	0 %	28492974
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249	NC_004572	CTC	2	6	14803	14808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492982
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254	NC_004572	TAT	2	6	15093	15098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492982
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258	NC_004572	CTGG	2	8	15167	15174	0 %	25 %	50 %	25 %	28492982
259	NC_004572	CT	3	6	15257	15262	0 %	50 %	0 %	50 %	28492982
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267	NC_004572	T	6	6	15652	15657	0 %	100 %	0 %	0 %	28492983
268	NC_004572	CAA	2	6	15662	15667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492983
269	NC_004572	GA	3	6	15696	15701	50 %	0 %	50 %	0 %	28492983
270	NC_004572	CCT	2	6	15723	15728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492983
271	NC_004572	CCG	2	6	15772	15777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492983
272	NC_004572	TA	3	6	15787	15792	50 %	50 %	0 %	0 %	28492983
273	NC_004572	GT	3	6	15848	15853	0 %	50 %	50 %	0 %	28492983
274	NC_004572	T	6	6	15858	15863	0 %	100 %	0 %	0 %	28492983
275	NC_004572	ATAAA	2	10	15878	15887	80 %	20 %	0 %	0 %	28492983
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277	NC_004572	ATG	2	6	15974	15979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492983
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279	NC_004572	AGCAA	2	10	16056	16065	60 %	0 %	20 %	20 %	28492983
280	NC_004572	TGT	2	6	16119	16124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492983
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282	NC_004572	TGACT	2	10	16182	16191	20 %	40 %	20 %	20 %	28492983
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302	NC_004572	TCT	2	6	17553	17558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492984
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399	NC_004572	ATA	2	6	24516	24521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492990
400	NC_004572	CAA	2	6	24676	24681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492990
401	NC_004572	GAT	2	6	24716	24721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492990
402	NC_004572	CAT	2	6	24763	24768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492990
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489	NC_004572	AAG	2	6	30100	30105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492996
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