MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004572	TTC	2	6	235307	235312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493152
3502	NC_004572	TCTT	2	8	235338	235345	0 %	75 %	0 %	25 %	28493152
3503	NC_004572	TGC	2	6	235421	235426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493152
3504	NC_004572	TGG	2	6	235453	235458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493152
3505	NC_004572	CAATTG	2	12	235579	235590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28493153
3506	NC_004572	TTTCCA	2	12	235713	235724	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28493153
3507	NC_004572	TACAA	2	10	235769	235778	60 %	20 %	0 %	20 %	28493153
3508	NC_004572	CCT	2	6	235831	235836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493153
3509	NC_004572	TC	3	6	235901	235906	0 %	50 %	0 %	50 %	28493153
3510	NC_004572	GA	3	6	235916	235921	50 %	0 %	50 %	0 %	28493153
3511	NC_004572	GCGGA	2	10	235960	235969	20 %	0 %	60 %	20 %	28493153
3512	NC_004572	AC	3	6	235975	235980	50 %	0 %	0 %	50 %	28493153
3513	NC_004572	AGT	2	6	236007	236012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493153
3514	NC_004572	TCA	2	6	236343	236348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493153
3515	NC_004572	TGC	2	6	236402	236407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493153
3516	NC_004572	TAT	2	6	236468	236473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493153
3517	NC_004572	TCA	2	6	236490	236495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493153
3518	NC_004572	ACGA	2	8	236513	236520	50 %	0 %	25 %	25 %	28493153
3519	NC_004572	TGT	2	6	236576	236581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493153
3520	NC_004572	GTT	2	6	236586	236591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493153
3521	NC_004572	TGGAC	2	10	236596	236605	20 %	20 %	40 %	20 %	28493153
3522	NC_004572	AC	3	6	236713	236718	50 %	0 %	0 %	50 %	28493153
3523	NC_004572	GTTA	2	8	236861	236868	25 %	50 %	25 %	0 %	28493154
3524	NC_004572	AGTC	2	8	237002	237009	25 %	25 %	25 %	25 %	28493154
3525	NC_004572	CAC	2	6	237029	237034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493154
3526	NC_004572	GCT	2	6	237079	237084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493154
3527	NC_004572	T	7	7	237105	237111	0 %	100 %	0 %	0 %	28493154
3528	NC_004572	GCT	2	6	237121	237126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493154
3529	NC_004572	GT	3	6	237134	237139	0 %	50 %	50 %	0 %	28493154
3530	NC_004572	ATCA	2	8	237147	237154	50 %	25 %	0 %	25 %	28493154
3531	NC_004572	TCA	2	6	237157	237162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493154
3532	NC_004572	ACC	2	6	237163	237168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493154
3533	NC_004572	AC	3	6	237171	237176	50 %	0 %	0 %	50 %	28493154
3534	NC_004572	CTG	2	6	237178	237183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493154
3535	NC_004572	CAA	2	6	237194	237199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493154
3536	NC_004572	ATT	2	6	237216	237221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493154
3537	NC_004572	CGT	2	6	237238	237243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493154
3538	NC_004572	AAT	2	6	237249	237254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493154
3539	NC_004572	CAG	2	6	237557	237562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493154
3540	NC_004572	TCAA	2	8	237595	237602	50 %	25 %	0 %	25 %	28493154
3541	NC_004572	CAA	2	6	237614	237619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493154
3542	NC_004572	AACA	2	8	237654	237661	75 %	0 %	0 %	25 %	28493154
3543	NC_004572	TTGAA	2	10	237680	237689	40 %	40 %	20 %	0 %	28493154
3544	NC_004572	GT	3	6	237692	237697	0 %	50 %	50 %	0 %	28493154
3545	NC_004572	ATT	2	6	237861	237866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493154
3546	NC_004572	AGTC	2	8	237899	237906	25 %	25 %	25 %	25 %	28493154
3547	NC_004572	T	6	6	237943	237948	0 %	100 %	0 %	0 %	28493155
3548	NC_004572	CTT	2	6	237976	237981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493155
3549	NC_004572	ATC	2	6	237986	237991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493155
3550	NC_004572	TAA	2	6	237994	237999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493155
3551	NC_004572	CAT	2	6	238111	238116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493155
3552	NC_004572	CTT	2	6	238309	238314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493155
3553	NC_004572	CTT	2	6	238408	238413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493155
3554	NC_004572	TTC	2	6	238423	238428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493155
3555	NC_004572	GAA	2	6	238447	238452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493155
3556	NC_004572	TCT	2	6	238461	238466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493155
3557	NC_004572	TGT	2	6	238493	238498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493155
3558	NC_004572	TAA	2	6	238540	238545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493155
3559	NC_004572	TCT	2	6	238561	238566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493155
3560	NC_004572	TTG	2	6	238650	238655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493155
3561	NC_004572	T	6	6	238766	238771	0 %	100 %	0 %	0 %	28493155
3562	NC_004572	ATA	2	6	238804	238809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493155
3563	NC_004572	CA	3	6	238835	238840	50 %	0 %	0 %	50 %	28493155
3564	NC_004572	CA	3	6	238853	238858	50 %	0 %	0 %	50 %	28493155
3565	NC_004572	CA	3	6	238871	238876	50 %	0 %	0 %	50 %	28493155
3566	NC_004572	CA	3	6	238889	238894	50 %	0 %	0 %	50 %	28493155
3567	NC_004572	CA	3	6	238907	238912	50 %	0 %	0 %	50 %	28493155
3568	NC_004572	TG	3	6	238927	238932	0 %	50 %	50 %	0 %	28493155
3569	NC_004572	AAC	2	6	238947	238952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493155
3570	NC_004572	TTA	2	6	238953	238958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493155
3571	NC_004572	ATT	2	6	239049	239054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493155
3572	NC_004572	GGT	2	6	239117	239122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493155
3573	NC_004572	TAT	2	6	239236	239241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493155
3574	NC_004572	CGTCA	2	10	239243	239252	20 %	20 %	20 %	40 %	28493155
3575	NC_004572	TG	3	6	239261	239266	0 %	50 %	50 %	0 %	28493155
3576	NC_004572	CCT	2	6	239277	239282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493155
3577	NC_004572	AGA	2	6	239431	239436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493155
3578	NC_004572	AT	3	6	239505	239510	50 %	50 %	0 %	0 %	28493155
3579	NC_004572	TAA	2	6	239558	239563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493155
3580	NC_004572	CGC	2	6	239657	239662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493155
3581	NC_004572	TCC	2	6	246293	246298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493156
3582	NC_004572	TGA	2	6	246464	246469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493156
3583	NC_004572	AGA	2	6	246473	246478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493156
3584	NC_004572	CAT	2	6	246533	246538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493156
3585	NC_004572	TGA	2	6	246539	246544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493156
3586	NC_004572	TGC	2	6	246667	246672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493156
3587	NC_004572	GCG	2	6	246683	246688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493156
3588	NC_004572	TTG	2	6	246709	246714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493156
3589	NC_004572	CTG	2	6	246850	246855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493156
3590	NC_004572	TCC	2	6	246858	246863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493156
3591	NC_004572	T	6	6	246899	246904	0 %	100 %	0 %	0 %	28493156
3592	NC_004572	ACA	2	6	246933	246938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493156
3593	NC_004572	TGC	2	6	246960	246965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493156
3594	NC_004572	CAA	2	6	247054	247059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493156
3595	NC_004572	AAAT	2	8	247075	247082	75 %	25 %	0 %	0 %	28493156
3596	NC_004572	TTG	2	6	247129	247134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493156
3597	NC_004572	TTG	2	6	247324	247329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493156
3598	NC_004572	CAA	2	6	247435	247440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493156
3599	NC_004572	ATGA	2	8	247491	247498	50 %	25 %	25 %	0 %	28493156
3600	NC_004572	CTTT	2	8	247549	247556	0 %	75 %	0 %	25 %	28493157
3601	NC_004572	CAG	2	6	247565	247570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493157
3602	NC_004572	TTCA	2	8	247631	247638	25 %	50 %	0 %	25 %	28493157
3603	NC_004572	ATT	2	6	247723	247728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493157
3604	NC_004572	AT	4	8	247744	247751	50 %	50 %	0 %	0 %	28493157
3605	NC_004572	T	6	6	247751	247756	0 %	100 %	0 %	0 %	28493157
3606	NC_004572	CTG	2	6	247874	247879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493157
3607	NC_004572	GGCA	2	8	247884	247891	25 %	0 %	50 %	25 %	28493157
3608	NC_004572	CT	3	6	247914	247919	0 %	50 %	0 %	50 %	28493157
3609	NC_004572	T	6	6	247952	247957	0 %	100 %	0 %	0 %	28493157
3610	NC_004572	GAAT	2	8	247968	247975	50 %	25 %	25 %	0 %	28493157
3611	NC_004572	CTG	2	6	248000	248005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493157
3612	NC_004572	TGG	2	6	248082	248087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493157
3613	NC_004572	TTC	2	6	248105	248110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493157
3614	NC_004572	GTCG	2	8	248161	248168	0 %	25 %	50 %	25 %	28493157
3615	NC_004572	GCA	2	6	248188	248193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493157
3616	NC_004572	TTGCTG	2	12	248198	248209	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28493157
3617	NC_004572	CAGG	2	8	248272	248279	25 %	0 %	50 %	25 %	28493157
3618	NC_004572	TGT	3	9	248280	248288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493157
3619	NC_004572	TAT	2	6	248289	248294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493157
3620	NC_004572	ATG	2	6	248332	248337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493157
3621	NC_004572	GTT	2	6	248338	248343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493157
3622	NC_004572	AG	3	6	248361	248366	50 %	0 %	50 %	0 %	28493157
3623	NC_004572	GAT	2	6	248375	248380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493157
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3625	NC_004572	TTAT	2	8	248489	248496	25 %	75 %	0 %	0 %	28493158
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3744	NC_004572	GACA	2	8	267647	267654	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
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3746	NC_004572	GACA	2	8	267702	267709	50 %	0 %	25 %	25 %	28493166
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