MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004572	AAGC	2	8	921339	921346	50 %	0 %	25 %	25 %	28493768
14502	NC_004572	CTT	2	6	921348	921353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493768
14503	NC_004572	GCCT	2	8	921395	921402	0 %	25 %	25 %	50 %	28493768
14504	NC_004572	TGT	2	6	921414	921419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493768
14505	NC_004572	GGC	2	6	921466	921471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493768
14506	NC_004572	TCT	2	6	921478	921483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493768
14507	NC_004572	ACA	2	6	921524	921529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493768
14508	NC_004572	TGAA	2	8	921536	921543	50 %	25 %	25 %	0 %	28493768
14509	NC_004572	GAAAC	2	10	921658	921667	60 %	0 %	20 %	20 %	28493768
14510	NC_004572	A	6	6	921682	921687	100 %	0 %	0 %	0 %	28493768
14511	NC_004572	GTC	2	6	921730	921735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493768
14512	NC_004572	T	7	7	921771	921777	0 %	100 %	0 %	0 %	28493768
14513	NC_004572	TTG	2	6	921907	921912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493769
14514	NC_004572	CAAA	2	8	921982	921989	75 %	0 %	0 %	25 %	28493769
14515	NC_004572	AAT	2	6	922081	922086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493769
14516	NC_004572	GCG	2	6	922119	922124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493769
14517	NC_004572	AAT	2	6	922169	922174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493769
14518	NC_004572	CG	3	6	922243	922248	0 %	0 %	50 %	50 %	28493769
14519	NC_004572	CGAGTT	2	12	922258	922269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28493769
14520	NC_004572	CGG	2	6	922270	922275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493769
14521	NC_004572	AGCAT	2	10	922350	922359	40 %	20 %	20 %	20 %	28493769
14522	NC_004572	TGC	2	6	922366	922371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493769
14523	NC_004572	GTT	2	6	922382	922387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493769
14524	NC_004572	TGC	2	6	922390	922395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493769
14525	NC_004572	GCC	2	6	922398	922403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493769
14526	NC_004572	ATCA	2	8	922430	922437	50 %	25 %	0 %	25 %	28493769
14527	NC_004572	GCG	2	6	922467	922472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493769
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14530	NC_004572	AAT	2	6	922529	922534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493769
14531	NC_004572	CGA	2	6	922581	922586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493769
14532	NC_004572	CAA	3	9	922899	922907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493770
14533	NC_004572	ATC	2	6	922940	922945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493770
14534	NC_004572	A	6	6	923004	923009	100 %	0 %	0 %	0 %	28493770
14535	NC_004572	ACC	2	6	923021	923026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493770
14536	NC_004572	TCTT	2	8	923034	923041	0 %	75 %	0 %	25 %	28493770
14537	NC_004572	CAA	2	6	923058	923063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493770
14538	NC_004572	CGG	2	6	923151	923156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493770
14539	NC_004572	GCA	2	6	923165	923170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493770
14540	NC_004572	CGGC	2	8	923244	923251	0 %	0 %	50 %	50 %	28493770
14541	NC_004572	ACG	2	6	923264	923269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493770
14542	NC_004572	GCA	2	6	923291	923296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493770
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14544	NC_004572	ACA	2	6	923355	923360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493770
14545	NC_004572	CAAAAA	2	12	923400	923411	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	28493770
14546	NC_004572	GGC	2	6	923514	923519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493770
14547	NC_004572	CGGC	2	8	923534	923541	0 %	0 %	50 %	50 %	28493770
14548	NC_004572	GGT	2	6	923568	923573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493770
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14555	NC_004572	GC	4	8	924048	924055	0 %	0 %	50 %	50 %	28493770
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14557	NC_004572	TGC	2	6	924183	924188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493770
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14559	NC_004572	ACC	2	6	924272	924277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493770
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14561	NC_004572	A	6	6	924498	924503	100 %	0 %	0 %	0 %	28493770
14562	NC_004572	GACC	2	8	924511	924518	25 %	0 %	25 %	50 %	28493770
14563	NC_004572	AC	4	8	924530	924537	50 %	0 %	0 %	50 %	28493770
14564	NC_004572	AGGCC	2	10	924607	924616	20 %	0 %	40 %	40 %	28493770
14565	NC_004572	AAG	2	6	924688	924693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493770
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14574	NC_004572	GC	4	8	925301	925308	0 %	0 %	50 %	50 %	28493771
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14579	NC_004572	GCG	2	6	925483	925488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493771
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14582	NC_004572	CTG	2	6	925705	925710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493772
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14588	NC_004572	AATAAC	2	12	926335	926346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	28493772
14589	NC_004572	CAA	2	6	926352	926357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493772
14590	NC_004572	A	8	8	926419	926426	100 %	0 %	0 %	0 %	28493772
14591	NC_004572	AT	3	6	926463	926468	50 %	50 %	0 %	0 %	28493772
14592	NC_004572	T	6	6	926499	926504	0 %	100 %	0 %	0 %	28493772
14593	NC_004572	TTA	2	6	926523	926528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493772
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14595	NC_004572	AAGA	2	8	926621	926628	75 %	0 %	25 %	0 %	28493773
14596	NC_004572	AAT	2	6	926708	926713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493773
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14599	NC_004572	CT	3	6	926814	926819	0 %	50 %	0 %	50 %	28493774
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14603	NC_004572	CAA	2	6	926981	926986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493774
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14605	NC_004572	T	8	8	927073	927080	0 %	100 %	0 %	0 %	28493774
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14607	NC_004572	ATT	2	6	927157	927162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493775
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14609	NC_004572	TCAA	2	8	927263	927270	50 %	25 %	0 %	25 %	28493775

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.