MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_004572	GTAT	2	8	890986	890993	25 %	50 %	25 %	0 %	28493742
14003	NC_004572	ATA	2	6	891054	891059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493742
14004	NC_004572	T	6	6	891151	891156	0 %	100 %	0 %	0 %	28493742
14005	NC_004572	CGC	2	6	891197	891202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493742
14006	NC_004572	TTG	2	6	891234	891239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493742
14007	NC_004572	GGT	2	6	891347	891352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493742
14008	NC_004572	TGC	2	6	891430	891435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493742
14009	NC_004572	T	6	6	891543	891548	0 %	100 %	0 %	0 %	28493742
14010	NC_004572	T	6	6	891637	891642	0 %	100 %	0 %	0 %	28493742
14011	NC_004572	TG	3	6	891655	891660	0 %	50 %	50 %	0 %	28493742
14012	NC_004572	TAT	2	6	891719	891724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493742
14013	NC_004572	GGC	2	6	891768	891773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493742
14014	NC_004572	TTGC	2	8	891780	891787	0 %	50 %	25 %	25 %	28493742
14015	NC_004572	T	6	6	891795	891800	0 %	100 %	0 %	0 %	28493742
14016	NC_004572	GCG	2	6	891801	891806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493742
14017	NC_004572	TGG	2	6	891884	891889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493742
14018	NC_004572	GAG	2	6	892017	892022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493742
14019	NC_004572	TAA	2	6	892045	892050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493742
14020	NC_004572	T	8	8	892069	892076	0 %	100 %	0 %	0 %	28493742
14021	NC_004572	ATG	2	6	892105	892110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493742
14022	NC_004572	CTC	2	6	892122	892127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493742
14023	NC_004572	CAT	2	6	892145	892150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493742
14024	NC_004572	CGG	2	6	892175	892180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493742
14025	NC_004572	TGAA	2	8	892315	892322	50 %	25 %	25 %	0 %	28493742
14026	NC_004572	A	8	8	892410	892417	100 %	0 %	0 %	0 %	28493743
14027	NC_004572	GC	3	6	892427	892432	0 %	0 %	50 %	50 %	28493743
14028	NC_004572	TTG	2	6	892600	892605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493743
14029	NC_004572	CAA	2	6	892700	892705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493743
14030	NC_004572	CAG	2	6	892775	892780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493743
14031	NC_004572	GAA	2	6	892804	892809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493743
14032	NC_004572	TTC	2	6	892813	892818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493743
14033	NC_004572	CTG	2	6	892879	892884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493743
14034	NC_004572	ATT	2	6	892887	892892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493743
14035	NC_004572	CAAA	2	8	892945	892952	75 %	0 %	0 %	25 %	28493743
14036	NC_004572	AGA	2	6	892973	892978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493743
14037	NC_004572	AAG	2	6	892986	892991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493743
14038	NC_004572	ATC	2	6	893041	893046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493743
14039	NC_004572	ATA	2	6	893064	893069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493743
14040	NC_004572	AAG	2	6	893113	893118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493743
14041	NC_004572	CCT	2	6	893132	893137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493743
14042	NC_004572	T	6	6	893157	893162	0 %	100 %	0 %	0 %	28493743
14043	NC_004572	GTG	2	6	893266	893271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493743
14044	NC_004572	A	7	7	893310	893316	100 %	0 %	0 %	0 %	28493743
14045	NC_004572	TGC	2	6	893441	893446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493743
14046	NC_004572	A	7	7	893570	893576	100 %	0 %	0 %	0 %	28493743
14047	NC_004572	GTG	2	6	893598	893603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493743
14048	NC_004572	TACGG	2	10	893607	893616	20 %	20 %	40 %	20 %	28493743
14049	NC_004572	AGG	2	6	893619	893624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493743
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14052	NC_004572	GAG	2	6	893754	893759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493743
14053	NC_004572	A	6	6	893799	893804	100 %	0 %	0 %	0 %	28493743
14054	NC_004572	AGA	2	6	893810	893815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493743
14055	NC_004572	ATG	2	6	893929	893934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493744
14056	NC_004572	GAA	2	6	893973	893978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493744
14057	NC_004572	CAGAA	2	10	894011	894020	60 %	0 %	20 %	20 %	28493744
14058	NC_004572	GCA	2	6	894030	894035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493744
14059	NC_004572	GAG	2	6	894078	894083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493744
14060	NC_004572	TGC	2	6	894157	894162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493744
14061	NC_004572	GAA	2	6	894168	894173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493744
14062	NC_004572	GCAG	2	8	894209	894216	25 %	0 %	50 %	25 %	28493744
14063	NC_004572	CTG	2	6	894223	894228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493744
14064	NC_004572	ACT	2	6	894339	894344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493744
14065	NC_004572	GGC	2	6	894386	894391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493744
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14067	NC_004572	TTG	2	6	894472	894477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493744
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14069	NC_004572	CAG	2	6	894610	894615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493744
14070	NC_004572	GCA	2	6	894630	894635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493744
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14087	NC_004572	AT	3	6	895607	895612	50 %	50 %	0 %	0 %	28493745
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14093	NC_004572	ATG	2	6	896099	896104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493745
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14095	NC_004572	CT	3	6	896220	896225	0 %	50 %	0 %	50 %	28493745
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14111	NC_004572	TTAT	2	8	897555	897562	25 %	75 %	0 %	0 %	28493746
14112	NC_004572	TCCT	2	8	897564	897571	0 %	50 %	0 %	50 %	28493746
14113	NC_004572	CTT	2	6	897672	897677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493747
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14119	NC_004572	CAGAC	2	10	898224	898233	40 %	0 %	20 %	40 %	28493747
14120	NC_004572	CGC	2	6	898380	898385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493747
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14493	NC_004572	AAG	2	6	920905	920910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493768
14494	NC_004572	GTA	2	6	920933	920938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493768
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