MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_004572	CCA	2	6	861208	861213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493717
13503	NC_004572	GCC	2	6	861274	861279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493717
13504	NC_004572	TC	3	6	861323	861328	0 %	50 %	0 %	50 %	28493717
13505	NC_004572	TGG	2	6	861338	861343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493717
13506	NC_004572	AGGC	2	8	861368	861375	25 %	0 %	50 %	25 %	28493717
13507	NC_004572	TTA	2	6	861380	861385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493717
13508	NC_004572	TTTGT	2	10	861488	861497	0 %	80 %	20 %	0 %	28493717
13509	NC_004572	CAA	2	6	861578	861583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493717
13510	NC_004572	CAA	2	6	861608	861613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493717
13511	NC_004572	GTT	2	6	861694	861699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493717
13512	NC_004572	AATC	2	8	861704	861711	50 %	25 %	0 %	25 %	28493717
13513	NC_004572	AC	3	6	862002	862007	50 %	0 %	0 %	50 %	28493718
13514	NC_004572	CGA	2	6	862009	862014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493718
13515	NC_004572	A	6	6	862014	862019	100 %	0 %	0 %	0 %	28493718
13516	NC_004572	CAA	2	6	862126	862131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493718
13517	NC_004572	GGA	2	6	862135	862140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493718
13518	NC_004572	TG	3	6	862257	862262	0 %	50 %	50 %	0 %	28493718
13519	NC_004572	TAG	2	6	862288	862293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493718
13520	NC_004572	GA	3	6	862354	862359	50 %	0 %	50 %	0 %	28493718
13521	NC_004572	T	6	6	862433	862438	0 %	100 %	0 %	0 %	28493718
13522	NC_004572	CGTT	2	8	862573	862580	0 %	50 %	25 %	25 %	28493719
13523	NC_004572	AGGA	2	8	862611	862618	50 %	0 %	50 %	0 %	28493719
13524	NC_004572	TGC	2	6	862650	862655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493719
13525	NC_004572	CGCA	2	8	862677	862684	25 %	0 %	25 %	50 %	28493719
13526	NC_004572	GAA	2	6	862696	862701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493719
13527	NC_004572	TTA	2	6	862760	862765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493719
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13529	NC_004572	CA	3	6	862821	862826	50 %	0 %	0 %	50 %	28493719
13530	NC_004572	AGAA	2	8	862906	862913	75 %	0 %	25 %	0 %	28493719
13531	NC_004572	AGTC	2	8	862920	862927	25 %	25 %	25 %	25 %	28493719
13532	NC_004572	TGC	2	6	862964	862969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493719
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13536	NC_004572	AT	3	6	863234	863239	50 %	50 %	0 %	0 %	28493719
13537	NC_004572	ACA	2	6	863299	863304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493719
13538	NC_004572	AAG	2	6	863340	863345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493719
13539	NC_004572	GTA	2	6	863350	863355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493719
13540	NC_004572	TAGA	2	8	863363	863370	50 %	25 %	25 %	0 %	28493719
13541	NC_004572	GCT	2	6	863430	863435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493719
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13543	NC_004572	TCG	2	6	863700	863705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493720
13544	NC_004572	ATCCT	2	10	863733	863742	20 %	40 %	0 %	40 %	28493720
13545	NC_004572	CTG	2	6	863776	863781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493720
13546	NC_004572	TGC	2	6	863817	863822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493720
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13549	NC_004572	TGA	2	6	864086	864091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493720
13550	NC_004572	CT	3	6	864237	864242	0 %	50 %	0 %	50 %	28493721
13551	NC_004572	A	7	7	864326	864332	100 %	0 %	0 %	0 %	28493721
13552	NC_004572	ATA	2	6	864338	864343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493721
13553	NC_004572	GA	3	6	864354	864359	50 %	0 %	50 %	0 %	28493721
13554	NC_004572	CTA	2	6	864385	864390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493721
13555	NC_004572	CAT	2	6	864394	864399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493721
13556	NC_004572	ATTTTC	2	12	864470	864481	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	28493721
13557	NC_004572	TAGT	2	8	864516	864523	25 %	50 %	25 %	0 %	28493721
13558	NC_004572	TCG	2	6	864572	864577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493721
13559	NC_004572	TGACC	2	10	864615	864624	20 %	20 %	20 %	40 %	28493721
13560	NC_004572	TGCT	2	8	864641	864648	0 %	50 %	25 %	25 %	28493721
13561	NC_004572	TGGG	2	8	864676	864683	0 %	25 %	75 %	0 %	28493721
13562	NC_004572	CAAAC	2	10	864692	864701	60 %	0 %	0 %	40 %	28493721
13563	NC_004572	CTT	2	6	864763	864768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493721
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13565	NC_004572	TGA	2	6	865004	865009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493721
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13571	NC_004572	GATA	2	8	865292	865299	50 %	25 %	25 %	0 %	28493721
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13575	NC_004572	ACCC	2	8	865425	865432	25 %	0 %	0 %	75 %	28493721
13576	NC_004572	TC	3	6	865522	865527	0 %	50 %	0 %	50 %	28493721
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13579	NC_004572	GATT	2	8	865802	865809	25 %	50 %	25 %	0 %	28493722
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13583	NC_004572	ATG	2	6	865982	865987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493722
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13588	NC_004572	CAGA	2	8	866321	866328	50 %	0 %	25 %	25 %	28493723
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13593	NC_004572	TACG	2	8	866716	866723	25 %	25 %	25 %	25 %	28493723
13594	NC_004572	A	6	6	866732	866737	100 %	0 %	0 %	0 %	28493723
13595	NC_004572	GGA	2	6	866763	866768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493723
13596	NC_004572	A	7	7	866825	866831	100 %	0 %	0 %	0 %	28493723
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13602	NC_004572	AAT	2	6	867318	867323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493724
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13607	NC_004572	TAAT	2	8	867638	867645	50 %	50 %	0 %	0 %	28493724
13608	NC_004572	GT	3	6	867695	867700	0 %	50 %	50 %	0 %	28493724
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13610	NC_004572	TA	3	6	867967	867972	50 %	50 %	0 %	0 %	28493725
13611	NC_004572	TA	3	6	868025	868030	50 %	50 %	0 %	0 %	28493725
13612	NC_004572	CA	3	6	868111	868116	50 %	0 %	0 %	50 %	28493725
13613	NC_004572	TGTCAT	2	12	868172	868183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28493725
13614	NC_004572	A	6	6	868226	868231	100 %	0 %	0 %	0 %	28493725
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13619	NC_004572	GAC	2	6	868443	868448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493725
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13622	NC_004572	AG	3	6	868597	868602	50 %	0 %	50 %	0 %	28493725
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