MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004572	GCC	2	6	830266	830271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493685
13002	NC_004572	T	6	6	830294	830299	0 %	100 %	0 %	0 %	28493685
13003	NC_004572	GC	3	6	830436	830441	0 %	0 %	50 %	50 %	28493685
13004	NC_004572	ATC	2	6	830515	830520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493685
13005	NC_004572	CGT	2	6	830562	830567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493685
13006	NC_004572	AAC	2	6	830599	830604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493685
13007	NC_004572	CAA	2	6	830631	830636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493685
13008	NC_004572	CCA	2	6	830648	830653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493685
13009	NC_004572	ATG	2	6	830665	830670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493685
13010	NC_004572	GC	3	6	830691	830696	0 %	0 %	50 %	50 %	28493685
13011	NC_004572	CAA	2	6	830700	830705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493685
13012	NC_004572	AACA	2	8	830947	830954	75 %	0 %	0 %	25 %	28493686
13013	NC_004572	TCA	2	6	831115	831120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493687
13014	NC_004572	AAT	2	6	831141	831146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493687
13015	NC_004572	TCC	2	6	831157	831162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493687
13016	NC_004572	TCA	2	6	831211	831216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493687
13017	NC_004572	TCA	2	6	831385	831390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493687
13018	NC_004572	GCA	3	9	831421	831429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493687
13019	NC_004572	TCG	2	6	831442	831447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493687
13020	NC_004572	CG	3	6	831446	831451	0 %	0 %	50 %	50 %	28493687
13021	NC_004572	CAT	2	6	831656	831661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493688
13022	NC_004572	CAT	3	9	831702	831710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493688
13023	NC_004572	GA	3	6	831722	831727	50 %	0 %	50 %	0 %	28493688
13024	NC_004572	TGC	2	6	831839	831844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493688
13025	NC_004572	TA	3	6	831892	831897	50 %	50 %	0 %	0 %	28493688
13026	NC_004572	GAT	2	6	831962	831967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493688
13027	NC_004572	GCT	2	6	831974	831979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493688
13028	NC_004572	GTC	2	6	832332	832337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493689
13029	NC_004572	CAC	2	6	832556	832561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493690
13030	NC_004572	CATG	2	8	832562	832569	25 %	25 %	25 %	25 %	28493690
13031	NC_004572	CG	3	6	832572	832577	0 %	0 %	50 %	50 %	28493690
13032	NC_004572	CAA	2	6	832658	832663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493690
13033	NC_004572	TTG	2	6	832673	832678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493690
13034	NC_004572	GGC	2	6	832714	832719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493690
13035	NC_004572	AAT	2	6	832770	832775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493690
13036	NC_004572	CAA	2	6	832811	832816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493690
13037	NC_004572	CGC	2	6	832980	832985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493690
13038	NC_004572	AAC	2	6	833013	833018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493690
13039	NC_004572	TGT	2	6	833041	833046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493690
13040	NC_004572	TAT	2	6	833289	833294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493690
13041	NC_004572	CAA	2	6	833399	833404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493690
13042	NC_004572	CG	3	6	833435	833440	0 %	0 %	50 %	50 %	28493690
13043	NC_004572	TTA	2	6	833516	833521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493690
13044	NC_004572	GCTT	2	8	833585	833592	0 %	50 %	25 %	25 %	28493690
13045	NC_004572	CTT	2	6	833663	833668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493690
13046	NC_004572	CAAG	2	8	833723	833730	50 %	0 %	25 %	25 %	28493690
13047	NC_004572	TGC	2	6	833839	833844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493690
13048	NC_004572	TA	3	6	833863	833868	50 %	50 %	0 %	0 %	28493690
13049	NC_004572	TGGC	2	8	833876	833883	0 %	25 %	50 %	25 %	28493690
13050	NC_004572	CA	3	6	833909	833914	50 %	0 %	0 %	50 %	28493690
13051	NC_004572	TCA	2	6	834099	834104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493691
13052	NC_004572	AAT	2	6	834137	834142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493691
13053	NC_004572	CAC	2	6	834295	834300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493691
13054	NC_004572	GCA	2	6	834315	834320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493691
13055	NC_004572	TACA	2	8	834359	834366	50 %	25 %	0 %	25 %	28493691
13056	NC_004572	AAG	2	6	834380	834385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493691
13057	NC_004572	CGT	2	6	834398	834403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493691
13058	NC_004572	TAA	2	6	834536	834541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493691
13059	NC_004572	CGA	2	6	834553	834558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493691
13060	NC_004572	CAAT	2	8	834642	834649	50 %	25 %	0 %	25 %	28493691
13061	NC_004572	CAA	2	6	834676	834681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493691
13062	NC_004572	GCC	2	6	834746	834751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493691
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13064	NC_004572	AT	3	6	834898	834903	50 %	50 %	0 %	0 %	28493691
13065	NC_004572	ACC	2	6	834920	834925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493691
13066	NC_004572	TG	3	6	834949	834954	0 %	50 %	50 %	0 %	28493691
13067	NC_004572	CAT	2	6	835034	835039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493691
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13070	NC_004572	TTG	2	6	835875	835880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493692
13071	NC_004572	CGG	2	6	835906	835911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493692
13072	NC_004572	GCT	2	6	835967	835972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493692
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13074	NC_004572	GAT	2	6	836060	836065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493692
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13077	NC_004572	T	8	8	836244	836251	0 %	100 %	0 %	0 %	28493692
13078	NC_004572	GAA	2	6	836387	836392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493692
13079	NC_004572	TAA	2	6	836418	836423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493692
13080	NC_004572	GCT	2	6	836458	836463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493692
13081	NC_004572	TGA	2	6	836485	836490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493692
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13088	NC_004572	TC	3	6	836822	836827	0 %	50 %	0 %	50 %	28493692
13089	NC_004572	AGA	2	6	836903	836908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493692
13090	NC_004572	TAA	2	6	836954	836959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493692
13091	NC_004572	TTG	2	6	837146	837151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493693
13092	NC_004572	AATA	2	8	837189	837196	75 %	25 %	0 %	0 %	28493693
13093	NC_004572	A	7	7	837235	837241	100 %	0 %	0 %	0 %	28493693
13094	NC_004572	AGA	2	6	837252	837257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493693
13095	NC_004572	AGTG	2	8	837343	837350	25 %	25 %	50 %	0 %	28493693
13096	NC_004572	A	6	6	837352	837357	100 %	0 %	0 %	0 %	28493693
13097	NC_004572	TTA	2	6	837358	837363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493693
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13101	NC_004572	TAT	2	6	837727	837732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493693
13102	NC_004572	CTC	2	6	837792	837797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493693
13103	NC_004572	GA	3	6	837837	837842	50 %	0 %	50 %	0 %	28493693
13104	NC_004572	CGGG	2	8	837855	837862	0 %	0 %	75 %	25 %	28493693
13105	NC_004572	AC	3	6	837863	837868	50 %	0 %	0 %	50 %	28493693
13106	NC_004572	GCA	2	6	837927	837932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493693
13107	NC_004572	TGC	2	6	838017	838022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493693
13108	NC_004572	GC	3	6	838132	838137	0 %	0 %	50 %	50 %	28493693
13109	NC_004572	AGGA	2	8	838167	838174	50 %	0 %	50 %	0 %	28493693
13110	NC_004572	ATC	2	6	838241	838246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493693
13111	NC_004572	AG	3	6	838311	838316	50 %	0 %	50 %	0 %	28493693
13112	NC_004572	CTT	2	6	838352	838357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493694
13113	NC_004572	ACG	2	6	838392	838397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493694
13114	NC_004572	AC	3	6	838399	838404	50 %	0 %	0 %	50 %	28493694
13115	NC_004572	GGCTC	2	10	838432	838441	0 %	20 %	40 %	40 %	28493694
13116	NC_004572	AC	3	6	838488	838493	50 %	0 %	0 %	50 %	28493694
13117	NC_004572	ATC	2	6	838544	838549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493694
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13119	NC_004572	GA	3	6	838679	838684	50 %	0 %	50 %	0 %	28493694
13120	NC_004572	CA	3	6	838703	838708	50 %	0 %	0 %	50 %	28493694
13121	NC_004572	CAA	2	6	838861	838866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493694
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13123	NC_004572	TGG	2	6	839020	839025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493694
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13247	NC_004572	ACA	2	6	846550	846555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493701
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13249	NC_004572	ATC	2	6	846910	846915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493702
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13265	NC_004572	CAGGT	2	10	848247	848256	20 %	20 %	40 %	20 %	28493703
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13267	NC_004572	CTG	2	6	848331	848336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493703
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13272	NC_004572	TTG	2	6	848619	848624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493703
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13278	NC_004572	CA	3	6	849193	849198	50 %	0 %	0 %	50 %	28493703
13279	NC_004572	ATCA	2	8	849201	849208	50 %	25 %	0 %	25 %	28493703
13280	NC_004572	CTGTT	2	10	849326	849335	0 %	60 %	20 %	20 %	28493704
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13301	NC_004572	A	6	6	850327	850332	100 %	0 %	0 %	0 %	28493704
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13353	NC_004572	CAAT	2	8	853156	853163	50 %	25 %	0 %	25 %	28493709
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13356	NC_004572	ATAC	2	8	853272	853279	50 %	25 %	0 %	25 %	28493709
13357	NC_004572	TGT	2	6	853302	853307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493709
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13364	NC_004572	TACA	2	8	853616	853623	50 %	25 %	0 %	25 %	28493709
13365	NC_004572	AGC	2	6	853718	853723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493709
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