MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004572	TGC	2	6	799271	799276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493651
12502	NC_004572	GCG	2	6	799294	799299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493651
12503	NC_004572	CGC	2	6	799310	799315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493651
12504	NC_004572	ACT	2	6	799343	799348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493651
12505	NC_004572	GTAAAT	2	12	799603	799614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28493652
12506	NC_004572	GCG	2	6	799624	799629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493652
12507	NC_004572	GA	3	6	799660	799665	50 %	0 %	50 %	0 %	28493652
12508	NC_004572	AT	3	6	799739	799744	50 %	50 %	0 %	0 %	28493652
12509	NC_004572	GTG	2	6	799933	799938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493652
12510	NC_004572	GGCGA	2	10	799957	799966	20 %	0 %	60 %	20 %	28493652
12511	NC_004572	AGG	2	6	799979	799984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493652
12512	NC_004572	A	6	6	799985	799990	100 %	0 %	0 %	0 %	28493652
12513	NC_004572	GAA	2	6	800137	800142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493652
12514	NC_004572	TGGT	2	8	800162	800169	0 %	50 %	50 %	0 %	28493652
12515	NC_004572	TGT	2	6	800220	800225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493652
12516	NC_004572	G	6	6	800239	800244	0 %	0 %	100 %	0 %	28493652
12517	NC_004572	TGG	2	6	800263	800268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493652
12518	NC_004572	GTT	2	6	800407	800412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493652
12519	NC_004572	GAT	2	6	800543	800548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493653
12520	NC_004572	TG	3	6	800737	800742	0 %	50 %	50 %	0 %	28493653
12521	NC_004572	GGC	2	6	800755	800760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493653
12522	NC_004572	TACC	2	8	800821	800828	25 %	25 %	0 %	50 %	28493653
12523	NC_004572	CTG	2	6	800852	800857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493653
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12526	NC_004572	CTG	2	6	801012	801017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493653
12527	NC_004572	CTTG	2	8	801183	801190	0 %	50 %	25 %	25 %	28493653
12528	NC_004572	A	6	6	801233	801238	100 %	0 %	0 %	0 %	28493653
12529	NC_004572	GAT	2	6	801320	801325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493653
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12532	NC_004572	GTG	2	6	801595	801600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493654
12533	NC_004572	GAGC	2	8	801614	801621	25 %	0 %	50 %	25 %	28493654
12534	NC_004572	TTA	2	6	801634	801639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493654
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12537	NC_004572	AAGT	2	8	801917	801924	50 %	25 %	25 %	0 %	28493654
12538	NC_004572	TGCAAT	2	12	801980	801991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28493654
12539	NC_004572	TTGTG	2	10	802005	802014	0 %	60 %	40 %	0 %	28493654
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12542	NC_004572	T	6	6	802081	802086	0 %	100 %	0 %	0 %	28493654
12543	NC_004572	CGGC	2	8	802111	802118	0 %	0 %	50 %	50 %	28493654
12544	NC_004572	A	6	6	802203	802208	100 %	0 %	0 %	0 %	28493654
12545	NC_004572	TA	4	8	802311	802318	50 %	50 %	0 %	0 %	28493654
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12555	NC_004572	GT	3	6	802717	802722	0 %	50 %	50 %	0 %	28493655
12556	NC_004572	TCAG	2	8	802768	802775	25 %	25 %	25 %	25 %	28493655
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12993	NC_004572	TAA	2	6	829800	829805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493685
12994	NC_004572	CGG	2	6	829827	829832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493685
12995	NC_004572	CAC	2	6	829839	829844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493685
12996	NC_004572	GTTGA	2	10	829869	829878	20 %	40 %	40 %	0 %	28493685
12997	NC_004572	CGC	2	6	829882	829887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493685
12998	NC_004572	TCA	2	6	829970	829975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493685
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13000	NC_004572	AAT	2	6	830258	830263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493685

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