MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_004572	ATT	2	6	767967	767972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493620
12003	NC_004572	GTT	2	6	767994	767999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493620
12004	NC_004572	TGT	2	6	768014	768019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493620
12005	NC_004572	TGT	2	6	768026	768031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493620
12006	NC_004572	AG	3	6	768060	768065	50 %	0 %	50 %	0 %	28493620
12007	NC_004572	AG	3	6	768074	768079	50 %	0 %	50 %	0 %	28493620
12008	NC_004572	GTT	2	6	768081	768086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493620
12009	NC_004572	CGG	2	6	768243	768248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486568
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12011	NC_004572	AAT	2	6	768412	768417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486568
12012	NC_004572	CAA	2	6	768454	768459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161486568
12013	NC_004572	CAT	2	6	768487	768492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486568
12014	NC_004572	ATG	2	6	768525	768530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486568
12015	NC_004572	TC	3	6	768543	768548	0 %	50 %	0 %	50 %	161486568
12016	NC_004572	GA	3	6	768626	768631	50 %	0 %	50 %	0 %	161486568
12017	NC_004572	GCA	2	6	768646	768651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486568
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12019	NC_004572	CGG	2	6	768703	768708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486568
12020	NC_004572	GC	3	6	768719	768724	0 %	0 %	50 %	50 %	161486568
12021	NC_004572	AACC	2	8	768739	768746	50 %	0 %	0 %	50 %	161486568
12022	NC_004572	AC	3	6	769002	769007	50 %	0 %	0 %	50 %	28493622
12023	NC_004572	AAC	2	6	769077	769082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493622
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12030	NC_004572	TC	3	6	769317	769322	0 %	50 %	0 %	50 %	28493622
12031	NC_004572	CGAT	2	8	769360	769367	25 %	25 %	25 %	25 %	28493622
12032	NC_004572	AG	3	6	769411	769416	50 %	0 %	50 %	0 %	28493622
12033	NC_004572	CCAG	2	8	769512	769519	25 %	0 %	25 %	50 %	28493622
12034	NC_004572	CAGAG	2	10	769695	769704	40 %	0 %	40 %	20 %	28493623
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12037	NC_004572	GGCG	2	8	769900	769907	0 %	0 %	75 %	25 %	28493623
12038	NC_004572	CAAC	2	8	769980	769987	50 %	0 %	0 %	50 %	28493623
12039	NC_004572	AGGC	2	8	769998	770005	25 %	0 %	50 %	25 %	28493623
12040	NC_004572	TCA	2	6	770011	770016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493623
12041	NC_004572	GGC	2	6	770033	770038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493623
12042	NC_004572	AGT	2	6	770059	770064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493623
12043	NC_004572	A	6	6	770109	770114	100 %	0 %	0 %	0 %	28493623
12044	NC_004572	TGG	2	6	770214	770219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493623
12045	NC_004572	A	7	7	770239	770245	100 %	0 %	0 %	0 %	28493623
12046	NC_004572	AAG	2	6	770292	770297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493623
12047	NC_004572	CCCTG	2	10	770387	770396	0 %	20 %	20 %	60 %	28493623
12048	NC_004572	A	7	7	770404	770410	100 %	0 %	0 %	0 %	28493623
12049	NC_004572	TGGGT	2	10	770429	770438	0 %	40 %	60 %	0 %	28493623
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12052	NC_004572	TAC	2	6	770609	770614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493623
12053	NC_004572	CAA	2	6	770628	770633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493623
12054	NC_004572	GCA	2	6	770754	770759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493624
12055	NC_004572	TAA	2	6	770776	770781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493624
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12057	NC_004572	ATTG	2	8	770865	770872	25 %	50 %	25 %	0 %	28493624
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12061	NC_004572	AAT	2	6	770959	770964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493624
12062	NC_004572	GCT	2	6	771055	771060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493625
12063	NC_004572	AC	3	6	771088	771093	50 %	0 %	0 %	50 %	28493625
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12071	NC_004572	CGA	2	6	771589	771594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493626
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12094	NC_004572	CAGG	2	8	772926	772933	25 %	0 %	50 %	25 %	28493627
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12101	NC_004572	TC	3	6	773925	773930	0 %	50 %	0 %	50 %	28493628
12102	NC_004572	GCA	2	6	774010	774015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493628
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12110	NC_004572	GCT	2	6	774825	774830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493629
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12118	NC_004572	A	6	6	775232	775237	100 %	0 %	0 %	0 %	28493629
12119	NC_004572	TGAG	2	8	775252	775259	25 %	25 %	50 %	0 %	28493629
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12238	NC_004572	T	7	7	782332	782338	0 %	100 %	0 %	0 %	28493636
12239	NC_004572	TAT	2	6	782619	782624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493636
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12242	NC_004572	TTGC	2	8	782797	782804	0 %	50 %	25 %	25 %	28493636
12243	NC_004572	CAAAC	2	10	782910	782919	60 %	0 %	0 %	40 %	28493636
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