MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_004572	AGA	2	6	669163	669168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493546
10502	NC_004572	ACGT	2	8	669215	669222	25 %	25 %	25 %	25 %	28493546
10503	NC_004572	CTAA	2	8	669247	669254	50 %	25 %	0 %	25 %	28493546
10504	NC_004572	TCT	2	6	669270	669275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493546
10505	NC_004572	GAA	2	6	669309	669314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493546
10506	NC_004572	AGG	2	6	669322	669327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493546
10507	NC_004572	GAT	2	6	669337	669342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493546
10508	NC_004572	CAG	2	6	669368	669373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493546
10509	NC_004572	AGGG	2	8	669473	669480	25 %	0 %	75 %	0 %	28493547
10510	NC_004572	GCG	2	6	669523	669528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493547
10511	NC_004572	GGC	2	6	669603	669608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493547
10512	NC_004572	GAAG	2	8	669630	669637	50 %	0 %	50 %	0 %	28493547
10513	NC_004572	GCA	2	6	669643	669648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493547
10514	NC_004572	TCA	2	6	669697	669702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493547
10515	NC_004572	TGTCTG	2	12	669717	669728	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28493547
10516	NC_004572	GTTACA	2	12	669748	669759	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28493547
10517	NC_004572	ATT	2	6	669841	669846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493547
10518	NC_004572	TGC	2	6	669892	669897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493547
10519	NC_004572	ATT	2	6	669943	669948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493547
10520	NC_004572	TCA	2	6	669983	669988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493547
10521	NC_004572	GGT	2	6	670358	670363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493548
10522	NC_004572	ACA	2	6	670432	670437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493548
10523	NC_004572	ATT	2	6	670605	670610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493548
10524	NC_004572	GAA	2	6	670800	670805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493548
10525	NC_004572	CG	3	6	670861	670866	0 %	0 %	50 %	50 %	28493548
10526	NC_004572	GCATC	2	10	670882	670891	20 %	20 %	20 %	40 %	28493548
10527	NC_004572	TCA	3	9	671004	671012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493548
10528	NC_004572	T	6	6	671102	671107	0 %	100 %	0 %	0 %	28493548
10529	NC_004572	AAAG	2	8	671108	671115	75 %	0 %	25 %	0 %	28493548
10530	NC_004572	TAC	2	6	671138	671143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493548
10531	NC_004572	CAA	2	6	671186	671191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493548
10532	NC_004572	CAAT	2	8	671333	671340	50 %	25 %	0 %	25 %	28493549
10533	NC_004572	TGCC	2	8	671492	671499	0 %	25 %	25 %	50 %	28493549
10534	NC_004572	TA	3	6	671711	671716	50 %	50 %	0 %	0 %	28493549
10535	NC_004572	GCAA	2	8	671907	671914	50 %	0 %	25 %	25 %	28493549
10536	NC_004572	CCA	2	6	672029	672034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493550
10537	NC_004572	TA	3	6	672103	672108	50 %	50 %	0 %	0 %	28493550
10538	NC_004572	AAG	2	6	672155	672160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493550
10539	NC_004572	AAG	2	6	672214	672219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493550
10540	NC_004572	CGA	2	6	672237	672242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493550
10541	NC_004572	ACA	2	6	672272	672277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493550
10542	NC_004572	CAA	2	6	672318	672323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493550
10543	NC_004572	AAG	2	6	672356	672361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493550
10544	NC_004572	ACTGA	2	10	672413	672422	40 %	20 %	20 %	20 %	28493550
10545	NC_004572	CAGA	2	8	672462	672469	50 %	0 %	25 %	25 %	28493550
10546	NC_004572	ACA	2	6	672470	672475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493550
10547	NC_004572	GAA	2	6	672534	672539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493550
10548	NC_004572	GA	3	6	672648	672653	50 %	0 %	50 %	0 %	28493550
10549	NC_004572	CCT	2	6	672656	672661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493550
10550	NC_004572	GA	3	6	672663	672668	50 %	0 %	50 %	0 %	28493550
10551	NC_004572	TAA	2	6	672670	672675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493550
10552	NC_004572	ATTG	2	8	672712	672719	25 %	50 %	25 %	0 %	28493550
10553	NC_004572	GA	3	6	672748	672753	50 %	0 %	50 %	0 %	28493550
10554	NC_004572	TA	3	6	672766	672771	50 %	50 %	0 %	0 %	28493550
10555	NC_004572	ATC	2	6	672806	672811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493550
10556	NC_004572	CCA	2	6	672843	672848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493550
10557	NC_004572	ATG	2	6	672932	672937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493551
10558	NC_004572	TCA	2	6	673038	673043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493551
10559	NC_004572	AGA	2	6	673071	673076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493551
10560	NC_004572	AAG	2	6	673082	673087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493551
10561	NC_004572	CTT	2	6	673127	673132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493551
10562	NC_004572	GCCTC	2	10	673198	673207	0 %	20 %	20 %	60 %	28493551
10563	NC_004572	GGA	2	6	673328	673333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493551
10564	NC_004572	ACC	3	9	673376	673384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493551
10565	NC_004572	GGC	2	6	673445	673450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493551
10566	NC_004572	T	7	7	673502	673508	0 %	100 %	0 %	0 %	28493551
10567	NC_004572	ATTC	2	8	673769	673776	25 %	50 %	0 %	25 %	28493552
10568	NC_004572	TAAA	2	8	673879	673886	75 %	25 %	0 %	0 %	28493552
10569	NC_004572	GCAAGA	2	12	673979	673990	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28493552
10570	NC_004572	AAT	2	6	674062	674067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493552
10571	NC_004572	CAAG	2	8	674086	674093	50 %	0 %	25 %	25 %	28493552
10572	NC_004572	ACG	2	6	674109	674114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493552
10573	NC_004572	AC	3	6	674121	674126	50 %	0 %	0 %	50 %	28493552
10574	NC_004572	AGAA	2	8	674140	674147	75 %	0 %	25 %	0 %	28493552
10575	NC_004572	CGA	2	6	674196	674201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493552
10576	NC_004572	TG	4	8	674255	674262	0 %	50 %	50 %	0 %	28493552
10577	NC_004572	TAT	2	6	674329	674334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493553
10578	NC_004572	AAT	2	6	674373	674378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493553
10579	NC_004572	CT	3	6	674515	674520	0 %	50 %	0 %	50 %	28493553
10580	NC_004572	TGG	2	6	674724	674729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493553
10581	NC_004572	TTC	2	6	674776	674781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493553
10582	NC_004572	GCAA	2	8	674811	674818	50 %	0 %	25 %	25 %	28493553
10583	NC_004572	CGATTG	2	12	674842	674853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28493553
10584	NC_004572	TCA	2	6	674880	674885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493553
10585	NC_004572	CAA	2	6	674896	674901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493553
10586	NC_004572	CGG	2	6	674902	674907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493553
10587	NC_004572	GAT	2	6	674950	674955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493553
10588	NC_004572	CG	3	6	674972	674977	0 %	0 %	50 %	50 %	28493553
10589	NC_004572	TA	3	6	675020	675025	50 %	50 %	0 %	0 %	28493553
10590	NC_004572	TG	3	6	675092	675097	0 %	50 %	50 %	0 %	28493553
10591	NC_004572	GGC	2	6	675146	675151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493553
10592	NC_004572	AGCG	2	8	675173	675180	25 %	0 %	50 %	25 %	28493553
10593	NC_004572	GAT	2	6	675282	675287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493553
10594	NC_004572	TCT	2	6	675351	675356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493553
10595	NC_004572	CTT	2	6	675453	675458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493553
10596	NC_004572	CGGG	2	8	675469	675476	0 %	0 %	75 %	25 %	28493553
10597	NC_004572	AAG	2	6	675514	675519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493553
10598	NC_004572	TTG	2	6	675534	675539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493553
10599	NC_004572	GTG	2	6	675558	675563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493553
10600	NC_004572	TCA	2	6	675564	675569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493553
10601	NC_004572	GCC	2	6	675612	675617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493553
10602	NC_004572	CAT	2	6	675691	675696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493553
10603	NC_004572	ACGC	2	8	675701	675708	25 %	0 %	25 %	50 %	28493553
10604	NC_004572	CG	3	6	675760	675765	0 %	0 %	50 %	50 %	28493553
10605	NC_004572	AAC	2	6	675915	675920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493553
10606	NC_004572	GAT	2	6	675968	675973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493553
10607	NC_004572	GAA	2	6	676030	676035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493553
10608	NC_004572	TCAC	2	8	676038	676045	25 %	25 %	0 %	50 %	28493553
10609	NC_004572	TCG	2	6	676050	676055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493553
10610	NC_004572	T	9	9	676288	676296	0 %	100 %	0 %	0 %	28493553
10611	NC_004572	CTT	2	6	676297	676302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493553
10612	NC_004572	ATT	2	6	676353	676358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493553
10613	NC_004572	GCA	2	6	676398	676403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493553
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10615	NC_004572	ATC	2	6	676439	676444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493553
10616	NC_004572	CATTA	2	10	676463	676472	40 %	40 %	0 %	20 %	28493553
10617	NC_004572	TCA	2	6	676507	676512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493553
10618	NC_004572	ATT	2	6	676557	676562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493554
10619	NC_004572	GAT	2	6	676574	676579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493554
10620	NC_004572	GCA	2	6	676659	676664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493554
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10622	NC_004572	GCA	2	6	676755	676760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493554
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10993	NC_004572	GTA	2	6	703496	703501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493570
10994	NC_004572	TG	3	6	703564	703569	0 %	50 %	50 %	0 %	28493570
10995	NC_004572	GT	3	6	703704	703709	0 %	50 %	50 %	0 %	28493570
10996	NC_004572	CAG	2	6	703755	703760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493570
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