MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004572	TTC	2	6	641066	641071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493505
10002	NC_004572	CCGTC	2	10	641139	641148	0 %	20 %	20 %	60 %	28493505
10003	NC_004572	CAA	3	9	641157	641165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493505
10004	NC_004572	ACC	2	6	641191	641196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493505
10005	NC_004572	GAA	2	6	641255	641260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493505
10006	NC_004572	TGAT	2	8	641362	641369	25 %	50 %	25 %	0 %	28493505
10007	NC_004572	GAC	2	6	641433	641438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493505
10008	NC_004572	GAA	2	6	641465	641470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493505
10009	NC_004572	CCG	2	6	641529	641534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493505
10010	NC_004572	TCA	2	6	641567	641572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493505
10011	NC_004572	ACC	2	6	641646	641651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493506
10012	NC_004572	AT	3	6	641798	641803	50 %	50 %	0 %	0 %	28493506
10013	NC_004572	ACG	2	6	641960	641965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486569
10014	NC_004572	TGC	2	6	642035	642040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486569
10015	NC_004572	GA	3	6	642142	642147	50 %	0 %	50 %	0 %	161486569
10016	NC_004572	CTT	2	6	642176	642181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161486569
10017	NC_004572	ATT	2	6	642248	642253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161486569
10018	NC_004572	TCAC	2	8	642333	642340	25 %	25 %	0 %	50 %	161486569
10019	NC_004572	TTC	2	6	642512	642517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493508
10020	NC_004572	AG	3	6	642553	642558	50 %	0 %	50 %	0 %	28493508
10021	NC_004572	CCG	2	6	642575	642580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493508
10022	NC_004572	GAT	2	6	642599	642604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493508
10023	NC_004572	CAA	2	6	642648	642653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493508
10024	NC_004572	TCA	2	6	642713	642718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493508
10025	NC_004572	GAG	2	6	642754	642759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493508
10026	NC_004572	CGA	2	6	642784	642789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493508
10027	NC_004572	CTT	2	6	642802	642807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493508
10028	NC_004572	GTCATA	2	12	642863	642874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28493508
10029	NC_004572	CTT	2	6	642906	642911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493509
10030	NC_004572	ATC	2	6	642951	642956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493509
10031	NC_004572	CGA	2	6	642960	642965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493509
10032	NC_004572	CAA	2	6	643131	643136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493509
10033	NC_004572	TTC	2	6	643157	643162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493509
10034	NC_004572	AGC	2	6	643311	643316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493509
10035	NC_004572	CACC	2	8	643319	643326	25 %	0 %	0 %	75 %	28493509
10036	NC_004572	CAA	2	6	643337	643342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493509
10037	NC_004572	GTT	2	6	643371	643376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493509
10038	NC_004572	TCA	2	6	643391	643396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493509
10039	NC_004572	CT	3	6	643413	643418	0 %	50 %	0 %	50 %	28493509
10040	NC_004572	AAG	2	6	643428	643433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493509
10041	NC_004572	AACC	2	8	643525	643532	50 %	0 %	0 %	50 %	28493510
10042	NC_004572	CAA	2	6	643558	643563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493510
10043	NC_004572	CT	3	6	643592	643597	0 %	50 %	0 %	50 %	28493510
10044	NC_004572	T	6	6	643597	643602	0 %	100 %	0 %	0 %	28493510
10045	NC_004572	AGA	2	6	643613	643618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493510
10046	NC_004572	AGT	2	6	643655	643660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493510
10047	NC_004572	T	6	6	643724	643729	0 %	100 %	0 %	0 %	28493510
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10049	NC_004572	TAA	2	6	643750	643755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493510
10050	NC_004572	ACC	2	6	643799	643804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493511
10051	NC_004572	ATC	2	6	643921	643926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493511
10052	NC_004572	AT	3	6	643934	643939	50 %	50 %	0 %	0 %	28493511
10053	NC_004572	CCGT	2	8	643943	643950	0 %	25 %	25 %	50 %	28493511
10054	NC_004572	TAG	2	6	643965	643970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493511
10055	NC_004572	ACA	2	6	643991	643996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493511
10056	NC_004572	CCA	2	6	644087	644092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493511
10057	NC_004572	TGT	2	6	644156	644161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493511
10058	NC_004572	TAG	2	6	644305	644310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493512
10059	NC_004572	TGC	2	6	644362	644367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493512
10060	NC_004572	ACA	2	6	644448	644453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493512
10061	NC_004572	GCT	2	6	644512	644517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493512
10062	NC_004572	CTT	2	6	644673	644678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493513
10063	NC_004572	ATC	2	6	644707	644712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493513
10064	NC_004572	CAT	2	6	644758	644763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493513
10065	NC_004572	CAA	2	6	644779	644784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493513
10066	NC_004572	GC	3	6	644790	644795	0 %	0 %	50 %	50 %	28493514
10067	NC_004572	CCA	2	6	644991	644996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493514
10068	NC_004572	CACC	2	8	645176	645183	25 %	0 %	0 %	75 %	28493514
10069	NC_004572	CTT	2	6	645211	645216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493515
10070	NC_004572	GAC	2	6	645357	645362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493515
10071	NC_004572	CG	3	6	645427	645432	0 %	0 %	50 %	50 %	28493515
10072	NC_004572	CAGC	2	8	645450	645457	25 %	0 %	25 %	50 %	28493515
10073	NC_004572	CGG	2	6	645587	645592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493515
10074	NC_004572	TC	3	6	645649	645654	0 %	50 %	0 %	50 %	28493515
10075	NC_004572	GC	3	6	645664	645669	0 %	0 %	50 %	50 %	28493515
10076	NC_004572	TGT	2	6	645790	645795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493515
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10078	NC_004572	CACGAG	2	12	645908	645919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493516
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10080	NC_004572	GAA	2	6	645961	645966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493516
10081	NC_004572	TCA	2	6	645976	645981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493516
10082	NC_004572	GA	3	6	646058	646063	50 %	0 %	50 %	0 %	28493516
10083	NC_004572	TCA	2	6	646084	646089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493516
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10085	NC_004572	CGC	2	6	646206	646211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493517
10086	NC_004572	ACCA	2	8	646277	646284	50 %	0 %	0 %	50 %	28493517
10087	NC_004572	CCT	2	6	646313	646318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493517
10088	NC_004572	TG	3	6	646337	646342	0 %	50 %	50 %	0 %	28493517
10089	NC_004572	ATC	2	6	646362	646367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493517
10090	NC_004572	CTT	2	6	646427	646432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493517
10091	NC_004572	CTT	2	6	646460	646465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493517
10092	NC_004572	CTT	2	6	646470	646475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493517
10093	NC_004572	ACG	2	6	646506	646511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493517
10094	NC_004572	AAT	2	6	646512	646517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493517
10095	NC_004572	CCG	2	6	646612	646617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493517
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10099	NC_004572	TC	3	6	646775	646780	0 %	50 %	0 %	50 %	28493518
10100	NC_004572	GCCG	2	8	646839	646846	0 %	0 %	50 %	50 %	28493518
10101	NC_004572	CAA	2	6	646967	646972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493518
10102	NC_004572	ACG	2	6	647136	647141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493518
10103	NC_004572	ATT	2	6	647184	647189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493518
10104	NC_004572	ACC	2	6	647193	647198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493518
10105	NC_004572	GC	3	6	647239	647244	0 %	0 %	50 %	50 %	28493518
10106	NC_004572	GAC	2	6	647362	647367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493519
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10108	NC_004572	TTA	2	6	647498	647503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493519
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10110	NC_004572	TCT	2	6	647537	647542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493519
10111	NC_004572	TCT	2	6	647556	647561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493519
10112	NC_004572	TGTT	2	8	647597	647604	0 %	75 %	25 %	0 %	28493519
10113	NC_004572	TTA	2	6	647607	647612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493519
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10117	NC_004572	ACGA	2	8	647663	647670	50 %	0 %	25 %	25 %	28493520
10118	NC_004572	CAA	2	6	647771	647776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493520
10119	NC_004572	CAT	2	6	647825	647830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493520
10120	NC_004572	CAA	2	6	647999	648004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493520
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10122	NC_004572	ACC	3	9	648117	648125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493520
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10232	NC_004572	AGC	2	6	653698	653703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493527
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10234	NC_004572	TGA	2	6	653836	653841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493527
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10236	NC_004572	CAA	2	6	653897	653902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493527
10237	NC_004572	TTTAC	2	10	653953	653962	20 %	60 %	0 %	20 %	28493528
10238	NC_004572	CCAA	2	8	653966	653973	50 %	0 %	0 %	50 %	28493528
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10240	NC_004572	TGC	2	6	654020	654025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493528
10241	NC_004572	CAT	2	6	654072	654077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493528
10242	NC_004572	CCAGT	2	10	654088	654097	20 %	20 %	20 %	40 %	28493528
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10356	NC_004572	TA	3	6	661456	661461	50 %	50 %	0 %	0 %	28493534
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10365	NC_004572	AGGG	2	8	662631	662638	25 %	0 %	75 %	0 %	28493536
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10492	NC_004572	A	7	7	668787	668793	100 %	0 %	0 %	0 %	28493546
10493	NC_004572	A	6	6	668801	668806	100 %	0 %	0 %	0 %	28493546
10494	NC_004572	GCAA	2	8	668808	668815	50 %	0 %	25 %	25 %	28493546
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