MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_004572	CT	3	6	548756	548761	0 %	50 %	0 %	50 %	28493423
8502	NC_004572	ATC	3	9	548813	548821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493423
8503	NC_004572	TA	3	6	548951	548956	50 %	50 %	0 %	0 %	28493423
8504	NC_004572	ACG	2	6	548988	548993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493423
8505	NC_004572	ACA	2	6	549003	549008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493423
8506	NC_004572	AGA	2	6	549056	549061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493423
8507	NC_004572	GTA	2	6	549130	549135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493424
8508	NC_004572	AAC	2	6	549166	549171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493424
8509	NC_004572	CACC	2	8	549219	549226	25 %	0 %	0 %	75 %	28493424
8510	NC_004572	CAA	2	6	549423	549428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493424
8511	NC_004572	AT	3	6	549531	549536	50 %	50 %	0 %	0 %	28493425
8512	NC_004572	GGTCT	2	10	549556	549565	0 %	40 %	40 %	20 %	28493425
8513	NC_004572	T	6	6	549585	549590	0 %	100 %	0 %	0 %	28493425
8514	NC_004572	CTC	2	6	549711	549716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493425
8515	NC_004572	AC	3	6	549740	549745	50 %	0 %	0 %	50 %	28493425
8516	NC_004572	CCA	2	6	549796	549801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493425
8517	NC_004572	AGA	2	6	549831	549836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493425
8518	NC_004572	TAT	2	6	549869	549874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493425
8519	NC_004572	CAA	2	6	549895	549900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493425
8520	NC_004572	A	6	6	549899	549904	100 %	0 %	0 %	0 %	28493425
8521	NC_004572	AAC	2	6	549975	549980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493425
8522	NC_004572	CAG	2	6	550122	550127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493425
8523	NC_004572	AT	3	6	550157	550162	50 %	50 %	0 %	0 %	28493425
8524	NC_004572	ACAA	2	8	550213	550220	75 %	0 %	0 %	25 %	28493425
8525	NC_004572	AGG	2	6	550255	550260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493426
8526	NC_004572	CCA	2	6	550287	550292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493426
8527	NC_004572	TAT	2	6	550304	550309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493426
8528	NC_004572	GAA	2	6	550351	550356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493426
8529	NC_004572	ACG	2	6	550380	550385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493426
8530	NC_004572	AGA	2	6	550386	550391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493426
8531	NC_004572	CAA	2	6	550417	550422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493426
8532	NC_004572	CCAA	2	8	550464	550471	50 %	0 %	0 %	50 %	28493426
8533	NC_004572	CTT	2	6	550570	550575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493426
8534	NC_004572	A	8	8	550577	550584	100 %	0 %	0 %	0 %	28493426
8535	NC_004572	CTT	2	6	550619	550624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493426
8536	NC_004572	GC	3	6	550632	550637	0 %	0 %	50 %	50 %	28493426
8537	NC_004572	GTCA	2	8	550667	550674	25 %	25 %	25 %	25 %	28493426
8538	NC_004572	CGT	2	6	550730	550735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493426
8539	NC_004572	GACA	2	8	550736	550743	50 %	0 %	25 %	25 %	28493426
8540	NC_004572	GAA	2	6	550774	550779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493426
8541	NC_004572	TTC	2	6	550804	550809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493427
8542	NC_004572	GCC	2	6	550890	550895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493427
8543	NC_004572	CAT	2	6	550965	550970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493427
8544	NC_004572	TGCC	2	8	551031	551038	0 %	25 %	25 %	50 %	28493427
8545	NC_004572	CGG	2	6	551143	551148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493428
8546	NC_004572	GCT	2	6	551189	551194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493428
8547	NC_004572	TTC	2	6	551214	551219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493428
8548	NC_004572	GTTGG	2	10	551270	551279	0 %	40 %	60 %	0 %	28493428
8549	NC_004572	GC	3	6	551306	551311	0 %	0 %	50 %	50 %	28493428
8550	NC_004572	AAGG	2	8	551332	551339	50 %	0 %	50 %	0 %	28493428
8551	NC_004572	CAA	2	6	551411	551416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493428
8552	NC_004572	ATAC	2	8	551817	551824	50 %	25 %	0 %	25 %	28493429
8553	NC_004572	TGT	2	6	551860	551865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493429
8554	NC_004572	GAA	2	6	552013	552018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493429
8555	NC_004572	T	6	6	552041	552046	0 %	100 %	0 %	0 %	28493429
8556	NC_004572	A	6	6	552065	552070	100 %	0 %	0 %	0 %	28493429
8557	NC_004572	TCG	2	6	552128	552133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493429
8558	NC_004572	CTC	2	6	552136	552141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493429
8559	NC_004572	ATC	2	6	552202	552207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493429
8560	NC_004572	A	6	6	552228	552233	100 %	0 %	0 %	0 %	28493429
8561	NC_004572	TGA	2	6	552247	552252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493429
8562	NC_004572	CCT	2	6	552354	552359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493429
8563	NC_004572	CAA	2	6	552375	552380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493429
8564	NC_004572	CAT	2	6	552433	552438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493429
8565	NC_004572	CGGC	2	8	552458	552465	0 %	0 %	50 %	50 %	28493429
8566	NC_004572	AAT	2	6	552472	552477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493429
8567	NC_004572	GAC	2	6	552511	552516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493429
8568	NC_004572	TAGC	2	8	552669	552676	25 %	25 %	25 %	25 %	28493429
8569	NC_004572	TCT	2	6	552762	552767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493429
8570	NC_004572	CTC	2	6	552790	552795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493429
8571	NC_004572	GATT	2	8	552825	552832	25 %	50 %	25 %	0 %	28493429
8572	NC_004572	AAG	2	6	552916	552921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493429
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8574	NC_004572	A	6	6	553004	553009	100 %	0 %	0 %	0 %	28493429
8575	NC_004572	AC	3	6	553029	553034	50 %	0 %	0 %	50 %	28493429
8576	NC_004572	TGGT	2	8	553139	553146	0 %	50 %	50 %	0 %	28493430
8577	NC_004572	AGGA	2	8	553209	553216	50 %	0 %	50 %	0 %	28493430
8578	NC_004572	CAA	2	6	553226	553231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493430
8579	NC_004572	CAAA	2	8	553259	553266	75 %	0 %	0 %	25 %	28493430
8580	NC_004572	T	6	6	553290	553295	0 %	100 %	0 %	0 %	28493430
8581	NC_004572	GAA	2	6	553481	553486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493430
8582	NC_004572	CAGT	2	8	553505	553512	25 %	25 %	25 %	25 %	28493430
8583	NC_004572	GGC	2	6	553585	553590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493430
8584	NC_004572	A	7	7	553608	553614	100 %	0 %	0 %	0 %	28493430
8585	NC_004572	A	6	6	553668	553673	100 %	0 %	0 %	0 %	28493430
8586	NC_004572	AAC	2	6	553705	553710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493430
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8588	NC_004572	AT	3	6	553792	553797	50 %	50 %	0 %	0 %	28493430
8589	NC_004572	AAG	2	6	554064	554069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486571
8590	NC_004572	AG	3	6	554105	554110	50 %	0 %	50 %	0 %	161486571
8591	NC_004572	GGA	2	6	554126	554131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161486571
8592	NC_004572	CGA	2	6	554272	554277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486571
8593	NC_004572	CA	3	6	554430	554435	50 %	0 %	0 %	50 %	161486571
8594	NC_004572	GAT	2	6	554530	554535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486571
8595	NC_004572	AAATC	2	10	554540	554549	60 %	20 %	0 %	20 %	161486571
8596	NC_004572	GA	3	6	554596	554601	50 %	0 %	50 %	0 %	161486571
8597	NC_004572	ATC	2	6	554767	554772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486571
8598	NC_004572	TTC	2	6	554957	554962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493432
8599	NC_004572	GAT	2	6	555012	555017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493432
8600	NC_004572	CTC	2	6	555287	555292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493432
8601	NC_004572	T	6	6	555336	555341	0 %	100 %	0 %	0 %	28493432
8602	NC_004572	AAT	2	6	555402	555407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493432
8603	NC_004572	CACT	2	8	555417	555424	25 %	25 %	0 %	50 %	28493432
8604	NC_004572	TGC	2	6	555759	555764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493433
8605	NC_004572	GGT	2	6	555773	555778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493433
8606	NC_004572	ACCA	2	8	555786	555793	50 %	0 %	0 %	50 %	28493433
8607	NC_004572	AACA	2	8	555831	555838	75 %	0 %	0 %	25 %	28493433
8608	NC_004572	CAA	2	6	555923	555928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493433
8609	NC_004572	GTT	2	6	556204	556209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493433
8610	NC_004572	CAG	2	6	556274	556279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493433
8611	NC_004572	GTT	2	6	556300	556305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493433
8612	NC_004572	GAA	2	6	556310	556315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493433
8613	NC_004572	GTC	2	6	556348	556353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493433
8614	NC_004572	TG	3	6	556363	556368	0 %	50 %	50 %	0 %	28493433
8615	NC_004572	CAA	2	6	556391	556396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493433
8616	NC_004572	TTG	2	6	556454	556459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493433
8617	NC_004572	CAG	2	6	556473	556478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493433
8618	NC_004572	TG	3	6	556504	556509	0 %	50 %	50 %	0 %	28493433
8619	NC_004572	GCA	2	6	556513	556518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493433
8620	NC_004572	GC	3	6	556539	556544	0 %	0 %	50 %	50 %	28493433
8621	NC_004572	A	6	6	556545	556550	100 %	0 %	0 %	0 %	28493433
8622	NC_004572	CAG	2	6	556692	556697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493433
8623	NC_004572	AG	3	6	556701	556706	50 %	0 %	50 %	0 %	28493433
8624	NC_004572	GAA	2	6	556724	556729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493433
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