MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_004572	AAC	2	6	520885	520890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161486573
8003	NC_004572	CT	3	6	521044	521049	0 %	50 %	0 %	50 %	161486573
8004	NC_004572	C	6	6	521088	521093	0 %	0 %	0 %	100 %	161486573
8005	NC_004572	GTT	2	6	521118	521123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486573
8006	NC_004572	AAAG	2	8	521166	521173	75 %	0 %	25 %	0 %	28493394
8007	NC_004572	ATC	2	6	521204	521209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493394
8008	NC_004572	TAA	2	6	521260	521265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493394
8009	NC_004572	TTC	2	6	521281	521286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493394
8010	NC_004572	AACT	2	8	521312	521319	50 %	25 %	0 %	25 %	28493394
8011	NC_004572	GTT	2	6	521352	521357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493394
8012	NC_004572	TCA	2	6	521382	521387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493394
8013	NC_004572	A	8	8	521405	521412	100 %	0 %	0 %	0 %	28493394
8014	NC_004572	CTTTT	2	10	521430	521439	0 %	80 %	0 %	20 %	28493394
8015	NC_004572	TTC	2	6	521517	521522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493394
8016	NC_004572	CG	3	6	521541	521546	0 %	0 %	50 %	50 %	28493394
8017	NC_004572	CAA	2	6	521578	521583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493394
8018	NC_004572	A	6	6	521610	521615	100 %	0 %	0 %	0 %	28493394
8019	NC_004572	AGA	2	6	521679	521684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493394
8020	NC_004572	TTTTG	2	10	521766	521775	0 %	80 %	20 %	0 %	28493394
8021	NC_004572	CACT	2	8	521871	521878	25 %	25 %	0 %	50 %	28493394
8022	NC_004572	GA	3	6	521900	521905	50 %	0 %	50 %	0 %	28493394
8023	NC_004572	TCA	2	6	521983	521988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493394
8024	NC_004572	CTG	2	6	522011	522016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493394
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8026	NC_004572	TC	3	6	522131	522136	0 %	50 %	0 %	50 %	28493395
8027	NC_004572	TTG	2	6	522141	522146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493395
8028	NC_004572	CAT	2	6	522161	522166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493395
8029	NC_004572	GCT	2	6	522215	522220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493395
8030	NC_004572	GC	3	6	522245	522250	0 %	0 %	50 %	50 %	28493395
8031	NC_004572	GATC	2	8	522298	522305	25 %	25 %	25 %	25 %	28493395
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8036	NC_004572	ACAT	2	8	522523	522530	50 %	25 %	0 %	25 %	28493396
8037	NC_004572	CAA	3	9	522590	522598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493396
8038	NC_004572	TACC	2	8	522599	522606	25 %	25 %	0 %	50 %	28493396
8039	NC_004572	GCA	2	6	522625	522630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493396
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8042	NC_004572	AT	3	6	522783	522788	50 %	50 %	0 %	0 %	28493397
8043	NC_004572	AAGC	2	8	522828	522835	50 %	0 %	25 %	25 %	28493397
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8055	NC_004572	GGAG	2	8	523350	523357	25 %	0 %	75 %	0 %	28493397
8056	NC_004572	A	8	8	523362	523369	100 %	0 %	0 %	0 %	28493397
8057	NC_004572	ATT	2	6	523373	523378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493397
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8060	NC_004572	CCTG	2	8	523490	523497	0 %	25 %	25 %	50 %	28493397
8061	NC_004572	AGAA	2	8	523507	523514	75 %	0 %	25 %	0 %	28493397
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8099	NC_004572	AC	3	6	525266	525271	50 %	0 %	0 %	50 %	28493400
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8127	NC_004572	T	6	6	526949	526954	0 %	100 %	0 %	0 %	28493402
8128	NC_004572	CTCG	2	8	526984	526991	0 %	25 %	25 %	50 %	28493402
8129	NC_004572	CTG	2	6	527084	527089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493402
8130	NC_004572	TGT	2	6	527094	527099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493402
8131	NC_004572	TCC	2	6	527112	527117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493402
8132	NC_004572	TGA	2	6	527124	527129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493402
8133	NC_004572	TCA	2	6	527152	527157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493402
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8135	NC_004572	CT	3	6	527255	527260	0 %	50 %	0 %	50 %	28493402
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8144	NC_004572	TTTCA	2	10	527712	527721	20 %	60 %	0 %	20 %	28493402
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8150	NC_004572	TGG	2	6	528207	528212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493403
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8168	NC_004572	CT	3	6	529075	529080	0 %	50 %	0 %	50 %	28493403
8169	NC_004572	GCG	2	6	529117	529122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493403
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8231	NC_004572	TA	3	6	532993	532998	50 %	50 %	0 %	0 %	28493407
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8234	NC_004572	AT	3	6	533086	533091	50 %	50 %	0 %	0 %	28493407
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8241	NC_004572	TTTTC	2	10	533471	533480	0 %	80 %	0 %	20 %	28493407
8242	NC_004572	CTGCA	2	10	533485	533494	20 %	20 %	20 %	40 %	28493407
8243	NC_004572	TA	3	6	533540	533545	50 %	50 %	0 %	0 %	28493407
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8248	NC_004572	CAA	2	6	533972	533977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493408
8249	NC_004572	AGC	2	6	534012	534017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493408
8250	NC_004572	AGAGC	2	10	534025	534034	40 %	0 %	40 %	20 %	28493408
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8252	NC_004572	CAA	3	9	534137	534145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493408
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