MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004572	TCA	2	6	430147	430152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493313
6502	NC_004572	T	7	7	430158	430164	0 %	100 %	0 %	0 %	28493313
6503	NC_004572	CAA	2	6	430196	430201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493313
6504	NC_004572	TCC	2	6	430222	430227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493313
6505	NC_004572	T	6	6	430228	430233	0 %	100 %	0 %	0 %	28493313
6506	NC_004572	A	7	7	430234	430240	100 %	0 %	0 %	0 %	28493313
6507	NC_004572	ACC	2	6	430290	430295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493313
6508	NC_004572	CT	3	6	430299	430304	0 %	50 %	0 %	50 %	28493313
6509	NC_004572	CCATA	2	10	430380	430389	40 %	20 %	0 %	40 %	28493313
6510	NC_004572	AGG	2	6	430512	430517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493313
6511	NC_004572	CG	3	6	430548	430553	0 %	0 %	50 %	50 %	28493313
6512	NC_004572	TGA	2	6	430591	430596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493313
6513	NC_004572	TGC	2	6	430622	430627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493313
6514	NC_004572	AT	3	6	430637	430642	50 %	50 %	0 %	0 %	28493313
6515	NC_004572	AAT	2	6	430655	430660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493313
6516	NC_004572	CAA	2	6	430769	430774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493313
6517	NC_004572	CTT	2	6	430810	430815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493313
6518	NC_004572	T	6	6	430837	430842	0 %	100 %	0 %	0 %	28493313
6519	NC_004572	TAA	2	6	430907	430912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493314
6520	NC_004572	GC	3	6	430952	430957	0 %	0 %	50 %	50 %	28493314
6521	NC_004572	TAT	2	6	430999	431004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493314
6522	NC_004572	TA	3	6	431274	431279	50 %	50 %	0 %	0 %	28493314
6523	NC_004572	AT	3	6	431485	431490	50 %	50 %	0 %	0 %	28493314
6524	NC_004572	ATG	2	6	431537	431542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493314
6525	NC_004572	T	8	8	431687	431694	0 %	100 %	0 %	0 %	28493314
6526	NC_004572	ATC	2	6	431744	431749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493314
6527	NC_004572	CCAT	2	8	431826	431833	25 %	25 %	0 %	50 %	28493314
6528	NC_004572	TAT	2	6	431879	431884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493314
6529	NC_004572	TGG	2	6	431921	431926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493314
6530	NC_004572	ACAA	2	8	431931	431938	75 %	0 %	0 %	25 %	28493314
6531	NC_004572	CCA	2	6	431987	431992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493314
6532	NC_004572	GC	3	6	432014	432019	0 %	0 %	50 %	50 %	28493314
6533	NC_004572	TACA	2	8	432059	432066	50 %	25 %	0 %	25 %	28493314
6534	NC_004572	ACC	2	6	432091	432096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493314
6535	NC_004572	GGT	2	6	432337	432342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493315
6536	NC_004572	GTT	2	6	432405	432410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493315
6537	NC_004572	AGA	2	6	432413	432418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493315
6538	NC_004572	CG	3	6	432429	432434	0 %	0 %	50 %	50 %	28493315
6539	NC_004572	TTG	2	6	432541	432546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493315
6540	NC_004572	A	6	6	432570	432575	100 %	0 %	0 %	0 %	28493315
6541	NC_004572	TTG	2	6	432595	432600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493315
6542	NC_004572	CAA	2	6	432679	432684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493315
6543	NC_004572	TCT	2	6	432710	432715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493315
6544	NC_004572	AAG	2	6	432741	432746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493315
6545	NC_004572	GAAT	2	8	432763	432770	50 %	25 %	25 %	0 %	28493315
6546	NC_004572	CGG	2	6	432827	432832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493315
6547	NC_004572	AG	3	6	432866	432871	50 %	0 %	50 %	0 %	28493315
6548	NC_004572	GC	3	6	432894	432899	0 %	0 %	50 %	50 %	28493315
6549	NC_004572	AGC	2	6	433041	433046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493315
6550	NC_004572	GC	3	6	433045	433050	0 %	0 %	50 %	50 %	28493315
6551	NC_004572	A	6	6	433079	433084	100 %	0 %	0 %	0 %	28493315
6552	NC_004572	TC	3	6	433086	433091	0 %	50 %	0 %	50 %	28493315
6553	NC_004572	CTT	2	6	433175	433180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493315
6554	NC_004572	TAA	2	6	433237	433242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493315
6555	NC_004572	GATA	2	8	433245	433252	50 %	25 %	25 %	0 %	28493315
6556	NC_004572	AGG	2	6	433259	433264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493315
6557	NC_004572	CAT	2	6	433282	433287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493315
6558	NC_004572	AAG	2	6	433292	433297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493315
6559	NC_004572	TTTC	2	8	433410	433417	0 %	75 %	0 %	25 %	28493315
6560	NC_004572	CAA	2	6	433426	433431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493315
6561	NC_004572	ACA	2	6	433449	433454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493315
6562	NC_004572	T	6	6	433485	433490	0 %	100 %	0 %	0 %	28493315
6563	NC_004572	ACC	2	6	433514	433519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493315
6564	NC_004572	AGA	3	9	433544	433552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493315
6565	NC_004572	CGC	2	6	433571	433576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493315
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6567	NC_004572	AGCA	2	8	433613	433620	50 %	0 %	25 %	25 %	28493316
6568	NC_004572	TCA	2	6	433623	433628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493316
6569	NC_004572	TG	3	6	433655	433660	0 %	50 %	50 %	0 %	28493316
6570	NC_004572	CGCGGG	2	12	433693	433704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493316
6571	NC_004572	TCT	2	6	433741	433746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493316
6572	NC_004572	TCG	2	6	433748	433753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493316
6573	NC_004572	T	6	6	433804	433809	0 %	100 %	0 %	0 %	28493316
6574	NC_004572	TTGG	2	8	433839	433846	0 %	50 %	50 %	0 %	28493316
6575	NC_004572	TCA	2	6	433848	433853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493316
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6580	NC_004572	ATG	2	6	434048	434053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493316
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6582	NC_004572	GGCT	2	8	434280	434287	0 %	25 %	50 %	25 %	28493317
6583	NC_004572	CAA	3	9	434309	434317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493317
6584	NC_004572	TTG	2	6	434384	434389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493317
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6590	NC_004572	A	6	6	434977	434982	100 %	0 %	0 %	0 %	28493318
6591	NC_004572	TGC	2	6	435092	435097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493318
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6593	NC_004572	ATTAC	2	10	435191	435200	40 %	40 %	0 %	20 %	28493318
6594	NC_004572	CCTC	2	8	435201	435208	0 %	25 %	0 %	75 %	28493318
6595	NC_004572	TTGA	2	8	435210	435217	25 %	50 %	25 %	0 %	28493318
6596	NC_004572	T	6	6	435263	435268	0 %	100 %	0 %	0 %	28493318
6597	NC_004572	ATG	2	6	435331	435336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493318
6598	NC_004572	CACC	2	8	435342	435349	25 %	0 %	0 %	75 %	28493318
6599	NC_004572	GCA	2	6	435407	435412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493318
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6603	NC_004572	CTC	2	6	435586	435591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493318
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6605	NC_004572	TTC	2	6	435735	435740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493318
6606	NC_004572	A	6	6	435822	435827	100 %	0 %	0 %	0 %	28493318
6607	NC_004572	ATT	2	6	435847	435852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493318
6608	NC_004572	CAC	2	6	435879	435884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493318
6609	NC_004572	ATTT	2	8	435982	435989	25 %	75 %	0 %	0 %	28493318
6610	NC_004572	T	7	7	435987	435993	0 %	100 %	0 %	0 %	28493318
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6619	NC_004572	AG	3	6	436892	436897	50 %	0 %	50 %	0 %	28493319
6620	NC_004572	TACGC	2	10	436946	436955	20 %	20 %	20 %	40 %	28493319
6621	NC_004572	GATG	2	8	436990	436997	25 %	25 %	50 %	0 %	28493319
6622	NC_004572	TTG	2	6	437047	437052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493319
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6624	NC_004572	GA	3	6	437167	437172	50 %	0 %	50 %	0 %	28493319
6625	NC_004572	TGCAAT	2	12	437415	437426	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28493320
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