MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 14609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004572	TAA	2	6	344161	344166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493227
5002	NC_004572	AAT	2	6	344207	344212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493227
5003	NC_004572	AGAC	2	8	344220	344227	50 %	0 %	25 %	25 %	28493227
5004	NC_004572	AGA	2	6	344280	344285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493227
5005	NC_004572	CCA	2	6	344344	344349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493227
5006	NC_004572	ATA	2	6	344437	344442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493228
5007	NC_004572	TTC	2	6	344492	344497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493228
5008	NC_004572	AATC	2	8	344505	344512	50 %	25 %	0 %	25 %	28493228
5009	NC_004572	AGG	2	6	344552	344557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493228
5010	NC_004572	TGAG	2	8	344595	344602	25 %	25 %	50 %	0 %	28493228
5011	NC_004572	TTG	2	6	344796	344801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493228
5012	NC_004572	G	6	6	344801	344806	0 %	0 %	100 %	0 %	28493228
5013	NC_004572	AGC	2	6	344815	344820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493228
5014	NC_004572	TGGT	2	8	344850	344857	0 %	50 %	50 %	0 %	28493228
5015	NC_004572	CAA	2	6	344871	344876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28493228
5016	NC_004572	TGC	2	6	344911	344916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493228
5017	NC_004572	TGA	2	6	345029	345034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493228
5018	NC_004572	GAC	2	6	345118	345123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493228
5019	NC_004572	ATC	2	6	345142	345147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493228
5020	NC_004572	TGC	2	6	345148	345153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493228
5021	NC_004572	GT	3	6	345162	345167	0 %	50 %	50 %	0 %	28493228
5022	NC_004572	ATG	2	6	345211	345216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493228
5023	NC_004572	CATT	2	8	345252	345259	25 %	50 %	0 %	25 %	28493228
5024	NC_004572	G	6	6	345300	345305	0 %	0 %	100 %	0 %	28493228
5025	NC_004572	TCC	2	6	345310	345315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28493228
5026	NC_004572	TGA	2	6	345361	345366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493228
5027	NC_004572	GAT	2	6	345401	345406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493228
5028	NC_004572	TCA	2	6	345434	345439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493228
5029	NC_004572	CGTG	2	8	345556	345563	0 %	25 %	50 %	25 %	28493228
5030	NC_004572	ATC	2	6	345581	345586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493228
5031	NC_004572	AAG	2	6	345643	345648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493228
5032	NC_004572	AG	3	6	345683	345688	50 %	0 %	50 %	0 %	28493228
5033	NC_004572	A	6	6	345715	345720	100 %	0 %	0 %	0 %	28493228
5034	NC_004572	TCA	2	6	345722	345727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493228
5035	NC_004572	ATG	2	6	345754	345759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493228
5036	NC_004572	TA	3	6	345817	345822	50 %	50 %	0 %	0 %	28493228
5037	NC_004572	AC	3	6	345849	345854	50 %	0 %	0 %	50 %	28493228
5038	NC_004572	T	7	7	345990	345996	0 %	100 %	0 %	0 %	28493229
5039	NC_004572	TGT	2	6	346010	346015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493229
5040	NC_004572	GAT	2	6	346029	346034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493229
5041	NC_004572	CGC	2	6	346099	346104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493229
5042	NC_004572	TTA	2	6	346214	346219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493229
5043	NC_004572	TTC	2	6	346244	346249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493229
5044	NC_004572	CAGT	2	8	346343	346350	25 %	25 %	25 %	25 %	28493229
5045	NC_004572	TGA	2	6	346355	346360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493229
5046	NC_004572	ATT	2	6	346377	346382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493229
5047	NC_004572	TGGA	2	8	346446	346453	25 %	25 %	50 %	0 %	28493229
5048	NC_004572	TTG	2	6	346639	346644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493229
5049	NC_004572	ATT	2	6	346734	346739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493229
5050	NC_004572	CG	3	6	346760	346765	0 %	0 %	50 %	50 %	28493229
5051	NC_004572	GAG	2	6	346779	346784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493229
5052	NC_004572	AAG	2	6	346835	346840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493229
5053	NC_004572	CCA	2	6	346875	346880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28493229
5054	NC_004572	ATT	2	6	346918	346923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493229
5055	NC_004572	AT	3	6	347095	347100	50 %	50 %	0 %	0 %	28493229
5056	NC_004572	AG	3	6	347109	347114	50 %	0 %	50 %	0 %	28493229
5057	NC_004572	CTT	2	6	347160	347165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493229
5058	NC_004572	GAC	2	6	347307	347312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493229
5059	NC_004572	GAAA	2	8	347454	347461	75 %	0 %	25 %	0 %	28493229
5060	NC_004572	C	6	6	347546	347551	0 %	0 %	0 %	100 %	28493229
5061	NC_004572	GGT	2	6	347570	347575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493229
5062	NC_004572	TCG	2	6	347634	347639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493229
5063	NC_004572	A	6	6	347710	347715	100 %	0 %	0 %	0 %	28493229
5064	NC_004572	A	6	6	347850	347855	100 %	0 %	0 %	0 %	28493229
5065	NC_004572	GGAT	2	8	347941	347948	25 %	25 %	50 %	0 %	28493230
5066	NC_004572	ATG	2	6	348000	348005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493230
5067	NC_004572	GAG	2	6	348053	348058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493230
5068	NC_004572	TGT	2	6	348091	348096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493230
5069	NC_004572	TG	3	6	348133	348138	0 %	50 %	50 %	0 %	28493230
5070	NC_004572	TGA	2	6	348178	348183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493230
5071	NC_004572	TGC	2	6	348204	348209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493230
5072	NC_004572	T	7	7	348349	348355	0 %	100 %	0 %	0 %	28493230
5073	NC_004572	ATT	2	6	348359	348364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493230
5074	NC_004572	GTGG	2	8	348420	348427	0 %	25 %	75 %	0 %	28493230
5075	NC_004572	AGGT	2	8	348474	348481	25 %	25 %	50 %	0 %	28493231
5076	NC_004572	TAA	2	6	348507	348512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493231
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5080	NC_004572	TGG	2	6	348610	348615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493231
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5083	NC_004572	TTTG	2	8	348818	348825	0 %	75 %	25 %	0 %	28493231
5084	NC_004572	CGT	2	6	348854	348859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493231
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5087	NC_004572	GA	3	6	349035	349040	50 %	0 %	50 %	0 %	28493231
5088	NC_004572	GTT	2	6	349064	349069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493231
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5094	NC_004572	GT	3	6	349311	349316	0 %	50 %	50 %	0 %	28493231
5095	NC_004572	TC	3	6	349332	349337	0 %	50 %	0 %	50 %	28493232
5096	NC_004572	GCTC	2	8	349470	349477	0 %	25 %	25 %	50 %	28493232
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5098	NC_004572	GA	3	6	349509	349514	50 %	0 %	50 %	0 %	28493232
5099	NC_004572	CAT	2	6	349518	349523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28493232
5100	NC_004572	AGA	2	6	349581	349586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493232
5101	NC_004572	TGTCT	2	10	349607	349616	0 %	60 %	20 %	20 %	28493232
5102	NC_004572	GTCTC	2	10	349758	349767	0 %	40 %	20 %	40 %	28493232
5103	NC_004572	T	6	6	349860	349865	0 %	100 %	0 %	0 %	28493232
5104	NC_004572	ATGT	2	8	349923	349930	25 %	50 %	25 %	0 %	28493233
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5106	NC_004572	ATG	2	6	349976	349981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493233
5107	NC_004572	CGC	2	6	350028	350033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28493233
5108	NC_004572	G	6	6	350041	350046	0 %	0 %	100 %	0 %	28493233
5109	NC_004572	A	8	8	350095	350102	100 %	0 %	0 %	0 %	28493233
5110	NC_004572	ATA	2	6	350117	350122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493233
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5112	NC_004572	TTG	2	6	350345	350350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28493233
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5115	NC_004572	CT	3	6	350383	350388	0 %	50 %	0 %	50 %	28493233
5116	NC_004572	TCTTG	2	10	350394	350403	0 %	60 %	20 %	20 %	28493233
5117	NC_004572	CGG	2	6	350405	350410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28493233
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5120	NC_004572	TACAG	2	10	350522	350531	40 %	20 %	20 %	20 %	28493233
5121	NC_004572	ATT	2	6	350596	350601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28493233
5122	NC_004572	GAG	2	6	350620	350625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28493233
5123	NC_004572	TGA	2	6	350628	350633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493233
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5125	NC_004572	TCT	2	6	350831	350836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28493234
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5128	NC_004572	GCA	2	6	350891	350896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28493234
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5130	NC_004572	CA	3	6	350982	350987	50 %	0 %	0 %	50 %	28493234
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5231	NC_004572	AT	3	6	356154	356159	50 %	50 %	0 %	0 %	28493240
5232	NC_004572	T	6	6	356166	356171	0 %	100 %	0 %	0 %	28493240
5233	NC_004572	TCTGC	2	10	356257	356266	0 %	40 %	20 %	40 %	28493240
5234	NC_004572	AT	3	6	356347	356352	50 %	50 %	0 %	0 %	28493241
5235	NC_004572	GGT	2	6	356399	356404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28493241
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5240	NC_004572	TGA	2	6	356716	356721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493241
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5242	NC_004572	ATA	2	6	357312	357317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28493242
5243	NC_004572	AGTG	2	8	357389	357396	25 %	25 %	50 %	0 %	28493242
5244	NC_004572	GAA	2	6	357425	357430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493242
5245	NC_004572	CTG	2	6	357498	357503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28493242
5246	NC_004572	GAT	2	6	357655	357660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28493242
5247	NC_004572	AT	3	6	357785	357790	50 %	50 %	0 %	0 %	28493242
5248	NC_004572	AGA	2	6	357838	357843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28493242
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