MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 14516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004551	T	6	6	60	65	0 %	100 %	0 %	0 %	28572176
2	NC_004551	ATA	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572176
3	NC_004551	GAT	2	6	169	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572176
4	NC_004551	CAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572176
5	NC_004551	A	6	6	195	200	100 %	0 %	0 %	0 %	28572176
6	NC_004551	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572176
7	NC_004551	GGAAGA	2	12	309	320	50 %	0 %	50 %	0 %	28572176
8	NC_004551	CA	3	6	337	342	50 %	0 %	0 %	50 %	28572176
9	NC_004551	TTC	2	6	361	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572176
10	NC_004551	AC	3	6	374	379	50 %	0 %	0 %	50 %	28572176
11	NC_004551	AAC	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572176
12	NC_004551	CAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572176
13	NC_004551	TA	3	6	540	545	50 %	50 %	0 %	0 %	28572176
14	NC_004551	AC	3	6	568	573	50 %	0 %	0 %	50 %	28572176
15	NC_004551	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572176
16	NC_004551	TCT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572176
17	NC_004551	CTCC	2	8	798	805	0 %	25 %	0 %	75 %	28572176
18	NC_004551	GCAG	2	8	815	822	25 %	0 %	50 %	25 %	28572176
19	NC_004551	GT	3	6	904	909	0 %	50 %	50 %	0 %	28572176
20	NC_004551	TTC	2	6	947	952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572176
21	NC_004551	AGA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572176
22	NC_004551	A	6	6	973	978	100 %	0 %	0 %	0 %	28572176
23	NC_004551	AT	3	6	1002	1007	50 %	50 %	0 %	0 %	28572176
24	NC_004551	AGC	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572176
25	NC_004551	AGA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572176
26	NC_004551	AAT	2	6	1167	1172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572176
27	NC_004551	AT	3	6	1238	1243	50 %	50 %	0 %	0 %	28572176
28	NC_004551	AAT	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572176
29	NC_004551	GAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572176
30	NC_004551	AT	3	6	1400	1405	50 %	50 %	0 %	0 %	28572176
31	NC_004551	GAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572176
32	NC_004551	TTA	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572177
33	NC_004551	GTA	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572177
34	NC_004551	TGA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572177
35	NC_004551	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572177
36	NC_004551	A	6	6	2044	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	28572177
37	NC_004551	ACA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572177
38	NC_004551	GAT	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572177
39	NC_004551	CATC	2	8	2322	2329	25 %	25 %	0 %	50 %	28572177
40	NC_004551	GTC	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572177
41	NC_004551	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	28572177
42	NC_004551	AGA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572177
43	NC_004551	GA	4	8	2598	2605	50 %	0 %	50 %	0 %	28572177
44	NC_004551	A	6	6	2630	2635	100 %	0 %	0 %	0 %	28572177
45	NC_004551	TAT	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572177
46	NC_004551	A	6	6	2851	2856	100 %	0 %	0 %	0 %	28572177
47	NC_004551	ATTT	2	8	2884	2891	25 %	75 %	0 %	0 %	28572177
48	NC_004551	AAT	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572177
49	NC_004551	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572178
50	NC_004551	GAT	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572178
51	NC_004551	ATG	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572178
52	NC_004551	CT	3	6	3381	3386	0 %	50 %	0 %	50 %	28572178
53	NC_004551	ATC	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572178
54	NC_004551	CCT	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572178
55	NC_004551	TGG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572178
56	NC_004551	ATT	2	6	3561	3566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572178
57	NC_004551	GA	3	6	3609	3614	50 %	0 %	50 %	0 %	28572178
58	NC_004551	AGA	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572178
59	NC_004551	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572178
60	NC_004551	TCAA	2	8	3699	3706	50 %	25 %	0 %	25 %	28572178
61	NC_004551	TGT	2	6	3798	3803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572178
62	NC_004551	GAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572178
63	NC_004551	AAC	3	9	3891	3899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572178
64	NC_004551	AGA	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572178
65	NC_004551	TG	3	6	4008	4013	0 %	50 %	50 %	0 %	28572179
66	NC_004551	CAG	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572179
67	NC_004551	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572179
68	NC_004551	GTT	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572179
69	NC_004551	A	7	7	4322	4328	100 %	0 %	0 %	0 %	28572179
70	NC_004551	AGG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572179
71	NC_004551	AC	3	6	4492	4497	50 %	0 %	0 %	50 %	28572180
72	NC_004551	TTG	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572180
73	NC_004551	AAAT	2	8	4666	4673	75 %	25 %	0 %	0 %	28572180
74	NC_004551	CGG	2	6	4691	4696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572180
75	NC_004551	GTT	2	6	4770	4775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572180
76	NC_004551	GGA	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572180
77	NC_004551	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572180
78	NC_004551	TGT	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572180
79	NC_004551	GTTTT	2	10	4906	4915	0 %	80 %	20 %	0 %	28572180
80	NC_004551	CTG	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572180
81	NC_004551	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572180
82	NC_004551	TGA	3	9	5006	5014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572180
83	NC_004551	GTTT	2	8	5028	5035	0 %	75 %	25 %	0 %	28572180
84	NC_004551	TGC	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572180
85	NC_004551	AAC	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572180
86	NC_004551	TATGT	2	10	5172	5181	20 %	60 %	20 %	0 %	28572180
87	NC_004551	GAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572180
88	NC_004551	AT	4	8	5305	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	28572180
89	NC_004551	AC	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	28572180
90	NC_004551	GCA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572180
91	NC_004551	AAAGGA	2	12	5420	5431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572180
92	NC_004551	CAAA	2	8	5514	5521	75 %	0 %	0 %	25 %	28572180
93	NC_004551	CAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572180
94	NC_004551	ATT	2	6	5622	5627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572180
95	NC_004551	CTT	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572180
96	NC_004551	GC	3	6	5669	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	28572180
97	NC_004551	AG	3	6	5676	5681	50 %	0 %	50 %	0 %	28572180
98	NC_004551	TTG	2	6	5776	5781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572180
99	NC_004551	CAGGG	2	10	5811	5820	20 %	0 %	60 %	20 %	28572180
100	NC_004551	AAGGC	2	10	5874	5883	40 %	0 %	40 %	20 %	28572180
101	NC_004551	TGA	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572180
102	NC_004551	AAT	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572180
103	NC_004551	AG	3	6	6074	6079	50 %	0 %	50 %	0 %	28572180
104	NC_004551	C	7	7	6101	6107	0 %	0 %	0 %	100 %	28572180
105	NC_004551	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572180
106	NC_004551	A	6	6	6200	6205	100 %	0 %	0 %	0 %	28572180
107	NC_004551	AG	3	6	6261	6266	50 %	0 %	50 %	0 %	28572180
108	NC_004551	ACC	2	6	6276	6281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572180
109	NC_004551	GAC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572180
110	NC_004551	TGA	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572180
111	NC_004551	T	6	6	6346	6351	0 %	100 %	0 %	0 %	28572180
112	NC_004551	GGA	2	6	6365	6370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572180
113	NC_004551	TCG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572180
114	NC_004551	AT	3	6	6427	6432	50 %	50 %	0 %	0 %	28572180
115	NC_004551	GAG	2	6	6474	6479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572181
116	NC_004551	ATG	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572181
117	NC_004551	GCC	2	6	6783	6788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572181
118	NC_004551	TGA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572181
119	NC_004551	ATG	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572181
120	NC_004551	TGCCG	2	10	6907	6916	0 %	20 %	40 %	40 %	28572181
121	NC_004551	CGC	2	6	6979	6984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572181
122	NC_004551	GTG	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572181
123	NC_004551	GAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572181
124	NC_004551	GTT	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572181
125	NC_004551	GAA	2	6	7188	7193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572181
126	NC_004551	TTG	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572181
127	NC_004551	CT	3	6	7271	7276	0 %	50 %	0 %	50 %	28572181
128	NC_004551	GGT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572181
129	NC_004551	TTG	2	6	7450	7455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572181
130	NC_004551	GTTC	2	8	7483	7490	0 %	50 %	25 %	25 %	28572181
131	NC_004551	AGC	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572181
132	NC_004551	GC	4	8	7565	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	28572181
133	NC_004551	CGA	2	6	7610	7615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572181
134	NC_004551	TCT	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572181
135	NC_004551	GAG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572181
136	NC_004551	GCG	2	6	7727	7732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572181
137	NC_004551	GCC	2	6	7737	7742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572181
138	NC_004551	AGA	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572181
139	NC_004551	TTCT	2	8	7810	7817	0 %	75 %	0 %	25 %	28572181
140	NC_004551	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572181
141	NC_004551	ACG	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572181
142	NC_004551	AAT	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572181
143	NC_004551	GTT	3	9	7959	7967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572181
144	NC_004551	TA	3	6	7983	7988	50 %	50 %	0 %	0 %	28572181
145	NC_004551	GGT	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572181
146	NC_004551	TGA	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572181
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149	NC_004551	CA	3	6	8098	8103	50 %	0 %	0 %	50 %	28572181
150	NC_004551	T	6	6	8115	8120	0 %	100 %	0 %	0 %	28572181
151	NC_004551	AGGG	2	8	8129	8136	25 %	0 %	75 %	0 %	28572181
152	NC_004551	TCT	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572181
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154	NC_004551	AAG	2	6	8408	8413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572181
155	NC_004551	CAT	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572181
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157	NC_004551	CTT	2	6	8538	8543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572181
158	NC_004551	AGCTG	2	10	8546	8555	20 %	20 %	40 %	20 %	28572181
159	NC_004551	GAC	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572181
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161	NC_004551	TGT	2	6	8582	8587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572181
162	NC_004551	GAT	2	6	8721	8726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572181
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166	NC_004551	ATT	2	6	9203	9208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572182
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168	NC_004551	GCC	2	6	9709	9714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572183
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171	NC_004551	CTC	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572183
172	NC_004551	CAC	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572183
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175	NC_004551	CTGC	2	8	10095	10102	0 %	25 %	25 %	50 %	28572183
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181	NC_004551	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	28572183
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241	NC_004551	GTTG	2	8	14127	14134	0 %	50 %	50 %	0 %	28572190
242	NC_004551	ACC	2	6	14297	14302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572190
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250	NC_004551	CTC	2	6	14805	14810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572190
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257	NC_004551	CTGG	2	8	15169	15176	0 %	25 %	50 %	25 %	28572190
258	NC_004551	GT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	50 %	0 %	28572190
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265	NC_004551	T	6	6	15654	15659	0 %	100 %	0 %	0 %	28572191
266	NC_004551	CAA	2	6	15664	15669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572191
267	NC_004551	GA	3	6	15698	15703	50 %	0 %	50 %	0 %	28572191
268	NC_004551	CCT	2	6	15725	15730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572191
269	NC_004551	CCG	2	6	15774	15779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572191
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271	NC_004551	GT	3	6	15850	15855	0 %	50 %	50 %	0 %	28572191
272	NC_004551	T	6	6	15860	15865	0 %	100 %	0 %	0 %	28572191
273	NC_004551	AATAA	2	10	15879	15888	80 %	20 %	0 %	0 %	28572191
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399	NC_004551	ATG	2	6	23795	23800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572199
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401	NC_004551	CT	3	6	24221	24226	0 %	50 %	0 %	50 %	28572200
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403	NC_004551	CTG	2	6	24380	24385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572200
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