MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 14516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004551	CATG	2	8	62349	62356	25 %	25 %	25 %	25 %	28572241
1002	NC_004551	TC	3	6	62505	62510	0 %	50 %	0 %	50 %	28572241
1003	NC_004551	ATA	2	6	62532	62537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572241
1004	NC_004551	TAT	2	6	62573	62578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572241
1005	NC_004551	TGT	2	6	62605	62610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572241
1006	NC_004551	T	6	6	63079	63084	0 %	100 %	0 %	0 %	28572242
1007	NC_004551	GAC	2	6	63126	63131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572242
1008	NC_004551	GCA	2	6	63206	63211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572242
1009	NC_004551	CTTG	2	8	63245	63252	0 %	50 %	25 %	25 %	28572242
1010	NC_004551	T	6	6	63288	63293	0 %	100 %	0 %	0 %	28572242
1011	NC_004551	ATC	2	6	63387	63392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572242
1012	NC_004551	GAAA	2	8	63429	63436	75 %	0 %	25 %	0 %	28572242
1013	NC_004551	GTT	2	6	63469	63474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572242
1014	NC_004551	TTGG	2	8	63588	63595	0 %	50 %	50 %	0 %	28572242
1015	NC_004551	CAT	2	6	63650	63655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572242
1016	NC_004551	AGG	2	6	63735	63740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572242
1017	NC_004551	ATTTG	2	10	63754	63763	20 %	60 %	20 %	0 %	28572242
1018	NC_004551	ACT	2	6	63771	63776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572242
1019	NC_004551	GTT	2	6	63888	63893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572242
1020	NC_004551	T	6	6	63984	63989	0 %	100 %	0 %	0 %	28572242
1021	NC_004551	ACA	2	6	64006	64011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572242
1022	NC_004551	TCT	2	6	64049	64054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572242
1023	NC_004551	TG	3	6	64118	64123	0 %	50 %	50 %	0 %	28572242
1024	NC_004551	T	8	8	64231	64238	0 %	100 %	0 %	0 %	28572242
1025	NC_004551	CA	3	6	64262	64267	50 %	0 %	0 %	50 %	28572242
1026	NC_004551	AT	3	6	64279	64284	50 %	50 %	0 %	0 %	28572242
1027	NC_004551	TCG	2	6	64384	64389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572242
1028	NC_004551	ACA	2	6	64465	64470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572242
1029	NC_004551	T	7	7	64472	64478	0 %	100 %	0 %	0 %	28572242
1030	NC_004551	CTT	2	6	64685	64690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572243
1031	NC_004551	CCA	2	6	64742	64747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572243
1032	NC_004551	TGT	3	9	64809	64817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572243
1033	NC_004551	GAA	2	6	64997	65002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572243
1034	NC_004551	TTG	2	6	65051	65056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572243
1035	NC_004551	ATT	2	6	65061	65066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572243
1036	NC_004551	T	8	8	65090	65097	0 %	100 %	0 %	0 %	28572243
1037	NC_004551	A	6	6	65101	65106	100 %	0 %	0 %	0 %	28572243
1038	NC_004551	GA	3	6	65244	65249	50 %	0 %	50 %	0 %	28572243
1039	NC_004551	CT	3	6	65278	65283	0 %	50 %	0 %	50 %	28572243
1040	NC_004551	AAT	2	6	65290	65295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572243
1041	NC_004551	TGCT	2	8	65474	65481	0 %	50 %	25 %	25 %	28572243
1042	NC_004551	GTT	2	6	65527	65532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572243
1043	NC_004551	GGC	2	6	65855	65860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572244
1044	NC_004551	TGT	2	6	65903	65908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572244
1045	NC_004551	TTCT	2	8	65958	65965	0 %	75 %	0 %	25 %	28572244
1046	NC_004551	T	7	7	65986	65992	0 %	100 %	0 %	0 %	28572244
1047	NC_004551	ATA	2	6	65994	65999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572244
1048	NC_004551	AAG	2	6	66023	66028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572244
1049	NC_004551	TTG	2	6	66055	66060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572244
1050	NC_004551	CCGC	2	8	66319	66326	0 %	0 %	25 %	75 %	28572244
1051	NC_004551	ATC	2	6	66484	66489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572244
1052	NC_004551	TGA	2	6	66506	66511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572244
1053	NC_004551	TTG	2	6	66523	66528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572244
1054	NC_004551	ATT	2	6	66540	66545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572244
1055	NC_004551	GATGC	2	10	66591	66600	20 %	20 %	40 %	20 %	28572244
1056	NC_004551	GA	3	6	66680	66685	50 %	0 %	50 %	0 %	28572244
1057	NC_004551	CA	3	6	66734	66739	50 %	0 %	0 %	50 %	28572244
1058	NC_004551	AGT	2	6	66791	66796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572244
1059	NC_004551	G	6	6	66943	66948	0 %	0 %	100 %	0 %	28572244
1060	NC_004551	A	6	6	66985	66990	100 %	0 %	0 %	0 %	28572244
1061	NC_004551	TAC	2	6	67014	67019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572244
1062	NC_004551	GCG	2	6	67036	67041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572244
1063	NC_004551	TGA	3	9	67097	67105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572244
1064	NC_004551	TTG	2	6	67192	67197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572244
1065	NC_004551	CTAG	2	8	67299	67306	25 %	25 %	25 %	25 %	28572244
1066	NC_004551	CCG	2	6	67418	67423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572245
1067	NC_004551	AGG	2	6	67441	67446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572245
1068	NC_004551	GC	3	6	67449	67454	0 %	0 %	50 %	50 %	28572245
1069	NC_004551	TTC	2	6	67489	67494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572245
1070	NC_004551	TTA	2	6	67501	67506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572245
1071	NC_004551	GCC	2	6	67524	67529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572245
1072	NC_004551	GC	3	6	67566	67571	0 %	0 %	50 %	50 %	28572245
1073	NC_004551	TTC	2	6	67726	67731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572245
1074	NC_004551	TGAGGG	2	12	67733	67744	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	28572245
1075	NC_004551	CTGC	2	8	67782	67789	0 %	25 %	25 %	50 %	28572245
1076	NC_004551	CAG	2	6	67794	67799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1077	NC_004551	AGA	2	6	67817	67822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572245
1078	NC_004551	GAA	2	6	68003	68008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572245
1079	NC_004551	CTG	2	6	68047	68052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1080	NC_004551	TCG	2	6	68053	68058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1081	NC_004551	CAA	2	6	68108	68113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572245
1082	NC_004551	AAG	2	6	68187	68192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572245
1083	NC_004551	TTG	2	6	68254	68259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572245
1084	NC_004551	CTG	2	6	68269	68274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1085	NC_004551	GCA	2	6	68289	68294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1086	NC_004551	GTG	2	6	68320	68325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572245
1087	NC_004551	CAA	2	6	68344	68349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572245
1088	NC_004551	TGA	2	6	68354	68359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572245
1089	NC_004551	CAT	2	6	68484	68489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572245
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1091	NC_004551	TA	3	6	68544	68549	50 %	50 %	0 %	0 %	28572245
1092	NC_004551	TTGA	2	8	68583	68590	25 %	50 %	25 %	0 %	28572245
1093	NC_004551	CTGT	2	8	68613	68620	0 %	50 %	25 %	25 %	28572245
1094	NC_004551	GC	3	6	68642	68647	0 %	0 %	50 %	50 %	28572245
1095	NC_004551	A	7	7	68655	68661	100 %	0 %	0 %	0 %	28572245
1096	NC_004551	TGT	2	6	68669	68674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572245
1097	NC_004551	GAAA	2	8	68735	68742	75 %	0 %	25 %	0 %	28572245
1098	NC_004551	TGA	3	9	68899	68907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572245
1099	NC_004551	AAG	2	6	68912	68917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572245
1100	NC_004551	CG	3	6	68983	68988	0 %	0 %	50 %	50 %	28572245
1101	NC_004551	CCCG	2	8	69170	69177	0 %	0 %	25 %	75 %	28572245
1102	NC_004551	TTG	2	6	69181	69186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572245
1103	NC_004551	GAA	2	6	69192	69197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572245
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1107	NC_004551	GAA	2	6	69306	69311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572245
1108	NC_004551	GTC	2	6	69313	69318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1109	NC_004551	T	6	6	69437	69442	0 %	100 %	0 %	0 %	28572245
1110	NC_004551	TGA	2	6	69518	69523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572245
1111	NC_004551	TGC	2	6	69638	69643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1112	NC_004551	CCA	2	6	69676	69681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572245
1113	NC_004551	AGGAT	2	10	69724	69733	40 %	20 %	40 %	0 %	28572245
1114	NC_004551	CTG	2	6	69747	69752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572245
1115	NC_004551	TGCT	2	8	70664	70671	0 %	50 %	25 %	25 %	28572246
1116	NC_004551	TTG	2	6	70704	70709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572246
1117	NC_004551	TGA	2	6	70795	70800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572246
1118	NC_004551	TGC	2	6	70807	70812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572246
1119	NC_004551	CTG	2	6	70851	70856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572246
1120	NC_004551	AAC	2	6	70864	70869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572246
1121	NC_004551	CTG	2	6	70899	70904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572246
1122	NC_004551	TTG	2	6	70905	70910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572246
1123	NC_004551	TCAT	2	8	70918	70925	25 %	50 %	0 %	25 %	28572246
1124	NC_004551	CCGC	2	8	70954	70961	0 %	0 %	25 %	75 %	28572246
1125	NC_004551	T	7	7	71009	71015	0 %	100 %	0 %	0 %	28572246
1126	NC_004551	T	7	7	71030	71036	0 %	100 %	0 %	0 %	28572246
1127	NC_004551	GCA	2	6	71090	71095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572246
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