MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 14516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004551	TGC	2	6	30410	30415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572206
502	NC_004551	GCA	2	6	30465	30470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572206
503	NC_004551	GCA	2	6	30501	30506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572206
504	NC_004551	AATT	2	8	30508	30515	50 %	50 %	0 %	0 %	28572206
505	NC_004551	GGC	2	6	30533	30538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572206
506	NC_004551	CT	3	6	30594	30599	0 %	50 %	0 %	50 %	28572206
507	NC_004551	ACC	2	6	30632	30637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572206
508	NC_004551	GCC	2	6	30671	30676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572207
509	NC_004551	CCA	2	6	30694	30699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572207
510	NC_004551	TAT	2	6	30705	30710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572207
511	NC_004551	ATTG	2	8	30721	30728	25 %	50 %	25 %	0 %	28572207
512	NC_004551	AC	3	6	30795	30800	50 %	0 %	0 %	50 %	28572207
513	NC_004551	AAT	2	6	30874	30879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572207
514	NC_004551	CTCAA	2	10	30899	30908	40 %	20 %	0 %	40 %	28572207
515	NC_004551	C	6	6	30910	30915	0 %	0 %	0 %	100 %	28572207
516	NC_004551	TCA	2	6	30980	30985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572207
517	NC_004551	TCT	2	6	31040	31045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572207
518	NC_004551	ATT	2	6	31102	31107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572207
519	NC_004551	GCC	2	6	31175	31180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572207
520	NC_004551	TCA	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572207
521	NC_004551	AT	3	6	31269	31274	50 %	50 %	0 %	0 %	28572207
522	NC_004551	GCA	2	6	31301	31306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572207
523	NC_004551	GCC	2	6	31317	31322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572207
524	NC_004551	TCA	2	6	31445	31450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572207
525	NC_004551	CGA	2	6	31483	31488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572207
526	NC_004551	CACTGT	2	12	31540	31551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28572207
527	NC_004551	AAG	2	6	32051	32056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572208
528	NC_004551	CT	3	6	32080	32085	0 %	50 %	0 %	50 %	28572208
529	NC_004551	TG	3	6	32115	32120	0 %	50 %	50 %	0 %	28572208
530	NC_004551	ACT	2	6	32283	32288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572208
531	NC_004551	GA	3	6	32316	32321	50 %	0 %	50 %	0 %	28572208
532	NC_004551	ACT	2	6	32369	32374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572208
533	NC_004551	TGC	3	9	32401	32409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572208
534	NC_004551	GGT	2	6	32435	32440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572208
535	NC_004551	AC	3	6	32495	32500	50 %	0 %	0 %	50 %	28572208
536	NC_004551	TAT	2	6	32579	32584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572209
537	NC_004551	TGG	2	6	32591	32596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28572209
538	NC_004551	GAT	2	6	32666	32671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572209
539	NC_004551	TAT	2	6	32673	32678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572209
540	NC_004551	ATG	2	6	32694	32699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572209
541	NC_004551	AAC	2	6	32726	32731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572209
542	NC_004551	AT	3	6	32896	32901	50 %	50 %	0 %	0 %	28572209
543	NC_004551	GTT	2	6	33000	33005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572209
544	NC_004551	GAA	2	6	33039	33044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572209
545	NC_004551	TTTA	2	8	33175	33182	25 %	75 %	0 %	0 %	28572209
546	NC_004551	GTTG	2	8	33309	33316	0 %	50 %	50 %	0 %	28572209
547	NC_004551	TGGA	2	8	33341	33348	25 %	25 %	50 %	0 %	28572209
548	NC_004551	GAT	3	9	33351	33359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572209
549	NC_004551	CCT	2	6	33419	33424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572209
550	NC_004551	ACT	2	6	33456	33461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572210
551	NC_004551	T	7	7	33535	33541	0 %	100 %	0 %	0 %	28572210
552	NC_004551	A	8	8	33583	33590	100 %	0 %	0 %	0 %	28572210
553	NC_004551	A	6	6	33709	33714	100 %	0 %	0 %	0 %	28572210
554	NC_004551	ATG	2	6	33758	33763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572210
555	NC_004551	AT	3	6	33852	33857	50 %	50 %	0 %	0 %	28572210
556	NC_004551	GGAT	2	8	33910	33917	25 %	25 %	50 %	0 %	28572210
557	NC_004551	AG	3	6	33990	33995	50 %	0 %	50 %	0 %	28572210
558	NC_004551	CAA	2	6	34185	34190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572210
559	NC_004551	ACTC	2	8	34198	34205	25 %	25 %	0 %	50 %	28572210
560	NC_004551	A	6	6	34235	34240	100 %	0 %	0 %	0 %	28572210
561	NC_004551	TC	3	6	34241	34246	0 %	50 %	0 %	50 %	28572210
562	NC_004551	TCATTG	2	12	34296	34307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28572210
563	NC_004551	TGT	2	6	34341	34346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572211
564	NC_004551	TAG	2	6	34351	34356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572211
565	NC_004551	T	7	7	34480	34486	0 %	100 %	0 %	0 %	28572211
566	NC_004551	TCA	2	6	34516	34521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572211
567	NC_004551	CAA	2	6	34524	34529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572211
568	NC_004551	GGTCTG	2	12	34532	34543	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28572211
569	NC_004551	ATAC	2	8	34575	34582	50 %	25 %	0 %	25 %	28572211
570	NC_004551	CAA	2	6	34637	34642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572211
571	NC_004551	TA	3	6	34702	34707	50 %	50 %	0 %	0 %	28572211
572	NC_004551	TC	3	6	34709	34714	0 %	50 %	0 %	50 %	28572211
573	NC_004551	CCGC	2	8	34767	34774	0 %	0 %	25 %	75 %	28572211
574	NC_004551	AGA	2	6	34825	34830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572211
575	NC_004551	T	6	6	34900	34905	0 %	100 %	0 %	0 %	28572211
576	NC_004551	CT	3	6	34920	34925	0 %	50 %	0 %	50 %	28572211
577	NC_004551	TC	3	6	34956	34961	0 %	50 %	0 %	50 %	28572211
578	NC_004551	TAT	2	6	34973	34978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572211
579	NC_004551	T	6	6	34992	34997	0 %	100 %	0 %	0 %	28572211
580	NC_004551	AAT	2	6	35244	35249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572212
581	NC_004551	GCT	2	6	35283	35288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572212
582	NC_004551	CAG	2	6	35291	35296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572212
583	NC_004551	T	6	6	35306	35311	0 %	100 %	0 %	0 %	28572212
584	NC_004551	AGA	2	6	35344	35349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572212
585	NC_004551	GAAT	2	8	35397	35404	50 %	25 %	25 %	0 %	28572212
586	NC_004551	TGT	2	6	35455	35460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572212
587	NC_004551	TC	3	6	35464	35469	0 %	50 %	0 %	50 %	28572212
588	NC_004551	TTG	2	6	35555	35560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572212
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590	NC_004551	ACA	2	6	35653	35658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572212
591	NC_004551	CT	3	6	35664	35669	0 %	50 %	0 %	50 %	28572212
592	NC_004551	TAAA	2	8	35673	35680	75 %	25 %	0 %	0 %	28572212
593	NC_004551	ATT	2	6	35700	35705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572212
594	NC_004551	ACA	2	6	35716	35721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572212
595	NC_004551	AAAT	2	8	35771	35778	75 %	25 %	0 %	0 %	28572212
596	NC_004551	ATA	2	6	35832	35837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572212
597	NC_004551	ATA	2	6	36008	36013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572212
598	NC_004551	GTT	2	6	36128	36133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572213
599	NC_004551	CGG	2	6	36148	36153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572213
600	NC_004551	AGC	2	6	36168	36173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572213
601	NC_004551	TGA	2	6	36174	36179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572213
602	NC_004551	TGA	2	6	36205	36210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572213
603	NC_004551	TGA	2	6	36223	36228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572213
604	NC_004551	TGA	2	6	36238	36243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572213
605	NC_004551	GA	3	6	36248	36253	50 %	0 %	50 %	0 %	28572213
606	NC_004551	ATT	2	6	36254	36259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572213
607	NC_004551	A	6	6	36328	36333	100 %	0 %	0 %	0 %	28572213
608	NC_004551	ATC	2	6	36355	36360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572213
609	NC_004551	ACA	2	6	36421	36426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572213
610	NC_004551	TGT	2	6	36595	36600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572213
611	NC_004551	ATG	2	6	36672	36677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572213
612	NC_004551	ACA	2	6	36742	36747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572213
613	NC_004551	GC	3	6	36765	36770	0 %	0 %	50 %	50 %	28572213
614	NC_004551	GGC	2	6	36771	36776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572213
615	NC_004551	CG	3	6	36903	36908	0 %	0 %	50 %	50 %	28572213
616	NC_004551	A	7	7	36925	36931	100 %	0 %	0 %	0 %	28572213
617	NC_004551	GA	3	6	36941	36946	50 %	0 %	50 %	0 %	28572213
618	NC_004551	GCA	2	6	36951	36956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572213
619	NC_004551	GCA	2	6	37069	37074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572213
620	NC_004551	AGG	2	6	37244	37249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572214
621	NC_004551	TCT	2	6	37253	37258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572214
622	NC_004551	CTG	2	6	37303	37308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572214
623	NC_004551	AGA	2	6	37325	37330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572214
624	NC_004551	GAACA	2	10	37342	37351	60 %	0 %	20 %	20 %	28572214
625	NC_004551	ATT	2	6	37367	37372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572214
626	NC_004551	AAG	2	6	37441	37446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572214
627	NC_004551	CCA	2	6	37447	37452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572214
628	NC_004551	A	6	6	37534	37539	100 %	0 %	0 %	0 %	28572214
629	NC_004551	ACT	2	6	37603	37608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572215
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631	NC_004551	CCTT	2	8	37658	37665	0 %	50 %	0 %	50 %	28572215
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889	NC_004551	GA	3	6	54725	54730	50 %	0 %	50 %	0 %	28572234
890	NC_004551	TTG	2	6	54752	54757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28572234
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