MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tropheryma whipplei TW08/27

Total Repeats: 14516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_004551	TCCA	2	8	539055	539062	25 %	25 %	0 %	50 %	28572648
8503	NC_004551	CAC	2	6	539132	539137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572648
8504	NC_004551	AT	3	6	539222	539227	50 %	50 %	0 %	0 %	28572648
8505	NC_004551	CA	4	8	539282	539289	50 %	0 %	0 %	50 %	28572648
8506	NC_004551	TG	3	6	539339	539344	0 %	50 %	50 %	0 %	28572648
8507	NC_004551	T	6	6	539395	539400	0 %	100 %	0 %	0 %	28572648
8508	NC_004551	GCTG	2	8	539514	539521	0 %	25 %	50 %	25 %	28572648
8509	NC_004551	TG	3	6	539533	539538	0 %	50 %	50 %	0 %	28572648
8510	NC_004551	TTCA	2	8	539544	539551	25 %	50 %	0 %	25 %	28572648
8511	NC_004551	AGC	2	6	539553	539558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572648
8512	NC_004551	GAA	2	6	539605	539610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572648
8513	NC_004551	CCT	2	6	539630	539635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572648
8514	NC_004551	AT	3	6	539663	539668	50 %	50 %	0 %	0 %	28572648
8515	NC_004551	AAT	2	6	539730	539735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572648
8516	NC_004551	CTGC	2	8	539741	539748	0 %	25 %	25 %	50 %	28572648
8517	NC_004551	AGAA	2	8	539880	539887	75 %	0 %	25 %	0 %	28572648
8518	NC_004551	CTTA	2	8	539981	539988	25 %	50 %	0 %	25 %	28572649
8519	NC_004551	GGC	2	6	540036	540041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28572649
8520	NC_004551	CGC	2	6	540066	540071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28572649
8521	NC_004551	ACACA	2	10	540263	540272	60 %	0 %	0 %	40 %	28572649
8522	NC_004551	GAG	2	6	540288	540293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28572649
8523	NC_004551	TTC	2	6	540313	540318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572649
8524	NC_004551	AAG	2	6	540338	540343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28572649
8525	NC_004551	AC	5	10	540349	540358	50 %	0 %	0 %	50 %	28572649
8526	NC_004551	AGC	2	6	540381	540386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572649
8527	NC_004551	TTTTC	2	10	540396	540405	0 %	80 %	0 %	20 %	28572649
8528	NC_004551	GAAAA	2	10	540412	540421	80 %	0 %	20 %	0 %	28572649
8529	NC_004551	A	6	6	540418	540423	100 %	0 %	0 %	0 %	28572649
8530	NC_004551	AGAT	2	8	540516	540523	50 %	25 %	25 %	0 %	28572650
8531	NC_004551	CCT	2	6	540641	540646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572650
8532	NC_004551	CCT	2	6	540685	540690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28572650
8533	NC_004551	GA	3	6	540793	540798	50 %	0 %	50 %	0 %	28572650
8534	NC_004551	TGA	2	6	540804	540809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28572650
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8537	NC_004551	ATA	2	6	541111	541116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572650
8538	NC_004551	TCG	2	6	541183	541188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572650
8539	NC_004551	AGC	2	6	541227	541232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572650
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8542	NC_004551	TGC	2	6	541380	541385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572650
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8545	NC_004551	GCA	2	6	541592	541597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572651
8546	NC_004551	CCCAA	2	10	541616	541625	40 %	0 %	0 %	60 %	28572651
8547	NC_004551	T	6	6	541739	541744	0 %	100 %	0 %	0 %	28572651
8548	NC_004551	CACT	2	8	541752	541759	25 %	25 %	0 %	50 %	28572651
8549	NC_004551	TCA	2	6	541775	541780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572651
8550	NC_004551	GCA	2	6	541796	541801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572651
8551	NC_004551	TTA	2	6	541866	541871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28572651
8552	NC_004551	TCT	2	6	541928	541933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572651
8553	NC_004551	CATG	2	8	542019	542026	25 %	25 %	25 %	25 %	28572651
8554	NC_004551	GCCTC	2	10	542174	542183	0 %	20 %	20 %	60 %	28572652
8555	NC_004551	CAT	2	6	542252	542257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572652
8556	NC_004551	A	7	7	542281	542287	100 %	0 %	0 %	0 %	28572652
8557	NC_004551	CTT	2	6	542316	542321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28572652
8558	NC_004551	GT	3	6	542363	542368	0 %	50 %	50 %	0 %	28572652
8559	NC_004551	CACT	2	8	542435	542442	25 %	25 %	0 %	50 %	28572652
8560	NC_004551	TGC	2	6	542455	542460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28572652
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8565	NC_004551	CAT	2	6	542716	542721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572653
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8590	NC_004551	ATAG	2	8	543981	543988	50 %	25 %	25 %	0 %	28572654
8591	NC_004551	GGAG	2	8	544009	544016	25 %	0 %	75 %	0 %	28572654
8592	NC_004551	AC	3	6	544035	544040	50 %	0 %	0 %	50 %	28572655
8593	NC_004551	CAT	2	6	544125	544130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28572655
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8598	NC_004551	AAACA	2	10	544276	544285	80 %	0 %	0 %	20 %	28572655
8599	NC_004551	TC	3	6	544311	544316	0 %	50 %	0 %	50 %	28572655
8600	NC_004551	GC	3	6	544332	544337	0 %	0 %	50 %	50 %	28572655
8601	NC_004551	CCCTGG	2	12	544344	544355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28572655
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8606	NC_004551	CCA	2	6	544736	544741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28572655
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8608	NC_004551	AACAGC	2	12	544780	544791	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	28572655
8609	NC_004551	AAC	2	6	544828	544833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572655
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8612	NC_004551	CCCA	2	8	544923	544930	25 %	0 %	0 %	75 %	28572656
8613	NC_004551	AAT	2	6	544987	544992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28572656
8614	NC_004551	A	7	7	544996	545002	100 %	0 %	0 %	0 %	28572656
8615	NC_004551	GCA	2	6	545142	545147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28572656
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8621	NC_004551	ACA	2	6	545372	545377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28572656
8622	NC_004551	ATCC	2	8	545403	545410	25 %	25 %	0 %	50 %	28572656
8623	NC_004551	T	6	6	545496	545501	0 %	100 %	0 %	0 %	28572657
8624	NC_004551	T	6	6	545636	545641	0 %	100 %	0 %	0 %	28572657
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