MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_004113	GGC	2	6	2514636	2514641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299944
42002	NC_004113	CCT	2	6	2514643	2514648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299944
42003	NC_004113	GCA	2	6	2514670	2514675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299944
42004	NC_004113	GTC	2	6	2514697	2514702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299944
42005	NC_004113	CTA	2	6	2514747	2514752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299944
42006	NC_004113	GATT	2	8	2514768	2514775	25 %	50 %	25 %	0 %	22299945
42007	NC_004113	TGG	3	9	2514781	2514789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299945
42008	NC_004113	TCC	2	6	2514866	2514871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299945
42009	NC_004113	AATAGC	2	12	2514907	2514918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22299945
42010	NC_004113	GGT	2	6	2514924	2514929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299945
42011	NC_004113	TTC	2	6	2514944	2514949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299945
42012	NC_004113	CCA	2	6	2515032	2515037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299945
42013	NC_004113	CAC	2	6	2515068	2515073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299945
42014	NC_004113	GCC	2	6	2515138	2515143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299945
42015	NC_004113	CAG	2	6	2515189	2515194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42016	NC_004113	CGG	2	6	2515261	2515266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299945
42017	NC_004113	C	7	7	2515297	2515303	0 %	0 %	0 %	100 %	22299945
42018	NC_004113	ACCC	2	8	2515352	2515359	25 %	0 %	0 %	75 %	22299945
42019	NC_004113	GCT	2	6	2515374	2515379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42020	NC_004113	GCA	2	6	2515391	2515396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42021	NC_004113	GCA	2	6	2515461	2515466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42022	NC_004113	C	9	9	2515514	2515522	0 %	0 %	0 %	100 %	22299945
42023	NC_004113	CAT	2	6	2515536	2515541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299945
42024	NC_004113	CAA	3	9	2515591	2515599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299945
42025	NC_004113	CCCATT	2	12	2515600	2515611	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	22299945
42026	NC_004113	CGC	2	6	2515614	2515619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299945
42027	NC_004113	GCT	2	6	2515687	2515692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42028	NC_004113	TGG	2	6	2515697	2515702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299945
42029	NC_004113	TGC	2	6	2515763	2515768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42030	NC_004113	T	6	6	2515858	2515863	0 %	100 %	0 %	0 %	22299945
42031	NC_004113	GCC	2	6	2515869	2515874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299945
42032	NC_004113	GCA	2	6	2515895	2515900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42033	NC_004113	GAT	2	6	2515918	2515923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299945
42034	NC_004113	C	6	6	2515931	2515936	0 %	0 %	0 %	100 %	22299945
42035	NC_004113	TCAT	2	8	2515946	2515953	25 %	50 %	0 %	25 %	22299945
42036	NC_004113	TGC	2	6	2515988	2515993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299945
42037	NC_004113	ACC	2	6	2516061	2516066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299945
42038	NC_004113	GAC	2	6	2516225	2516230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299946
42039	NC_004113	GGTG	2	8	2516266	2516273	0 %	25 %	75 %	0 %	22299946
42040	NC_004113	GCT	3	9	2516341	2516349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299946
42041	NC_004113	TGG	2	6	2516400	2516405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299946
42042	NC_004113	TGGG	2	8	2516447	2516454	0 %	25 %	75 %	0 %	22299946
42043	NC_004113	GCC	2	6	2516540	2516545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299946
42044	NC_004113	TGG	2	6	2516580	2516585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299946
42045	NC_004113	TG	3	6	2516630	2516635	0 %	50 %	50 %	0 %	22299946
42046	NC_004113	AGGCC	2	10	2516680	2516689	20 %	0 %	40 %	40 %	22299946
42047	NC_004113	GGC	2	6	2516708	2516713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299946
42048	NC_004113	CGC	2	6	2516745	2516750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299946
42049	NC_004113	CCT	2	6	2516763	2516768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299946
42050	NC_004113	TAT	2	6	2516803	2516808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299946
42051	NC_004113	CAC	2	6	2516857	2516862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299946
42052	NC_004113	GCC	2	6	2516871	2516876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299946
42053	NC_004113	GAA	2	6	2516969	2516974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299946
42054	NC_004113	AGG	2	6	2517003	2517008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299946
42055	NC_004113	GTG	2	6	2517069	2517074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299946
42056	NC_004113	CTG	2	6	2517200	2517205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299946
42057	NC_004113	G	6	6	2517238	2517243	0 %	0 %	100 %	0 %	22299946
42058	NC_004113	CTA	2	6	2517352	2517357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299946
42059	NC_004113	AGA	2	6	2517526	2517531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299947
42060	NC_004113	GGT	2	6	2517752	2517757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299947
42061	NC_004113	GCA	3	9	2517837	2517845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299947
42062	NC_004113	GGCT	2	8	2517886	2517893	0 %	25 %	50 %	25 %	22299947
42063	NC_004113	CTT	2	6	2517928	2517933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299947
42064	NC_004113	CCT	2	6	2517934	2517939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299947
42065	NC_004113	TGT	2	6	2517952	2517957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299947
42066	NC_004113	CAT	2	6	2517964	2517969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299947
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42068	NC_004113	TGC	2	6	2518053	2518058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299948
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42071	NC_004113	T	6	6	2518276	2518281	0 %	100 %	0 %	0 %	22299949
42072	NC_004113	CCG	2	6	2518294	2518299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299949
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42075	NC_004113	TTC	3	9	2518370	2518378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299949
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42084	NC_004113	CGT	2	6	2519070	2519075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299950
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42087	NC_004113	GC	4	8	2519151	2519158	0 %	0 %	50 %	50 %	22299950
42088	NC_004113	GGC	2	6	2519231	2519236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299950
42089	NC_004113	AGC	2	6	2519345	2519350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299950
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42091	NC_004113	GCG	2	6	2519442	2519447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299950
42092	NC_004113	GTG	2	6	2519511	2519516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299950
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42099	NC_004113	AGG	2	6	2520015	2520020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299950
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42101	NC_004113	CAT	2	6	2520092	2520097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299950
42102	NC_004113	GCT	2	6	2520167	2520172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299951
42103	NC_004113	ACC	2	6	2520250	2520255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299951
42104	NC_004113	AGT	2	6	2520375	2520380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299951
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42108	NC_004113	TGC	2	6	2520800	2520805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299951
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42114	NC_004113	G	7	7	2521170	2521176	0 %	0 %	100 %	0 %	22299951
42115	NC_004113	C	6	6	2521208	2521213	0 %	0 %	0 %	100 %	22299951
42116	NC_004113	AC	3	6	2521270	2521275	50 %	0 %	0 %	50 %	22299951
42117	NC_004113	GCA	2	6	2521346	2521351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299951
42118	NC_004113	GGT	2	6	2521390	2521395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299951
42119	NC_004113	GCA	2	6	2521565	2521570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299951
42120	NC_004113	C	6	6	2521628	2521633	0 %	0 %	0 %	100 %	22299951
42121	NC_004113	GCA	2	6	2521712	2521717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299951
42122	NC_004113	GCA	2	6	2521727	2521732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299951
42123	NC_004113	ACT	2	6	2521825	2521830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299952
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42126	NC_004113	GGC	2	6	2522039	2522044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299952
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42129	NC_004113	TTC	2	6	2522117	2522122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299952
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42146	NC_004113	G	6	6	2523458	2523463	0 %	0 %	100 %	0 %	22299953
42147	NC_004113	CGC	2	6	2523493	2523498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299953
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42154	NC_004113	GTCAG	2	10	2523615	2523624	20 %	20 %	40 %	20 %	22299953
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42156	NC_004113	C	6	6	2524029	2524034	0 %	0 %	0 %	100 %	22299954
42157	NC_004113	TGC	2	6	2524096	2524101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299954
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42220	NC_004113	CATA	2	8	2528395	2528402	50 %	25 %	0 %	25 %	22299959
42221	NC_004113	CTG	2	6	2528447	2528452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299959
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42224	NC_004113	TGC	2	6	2528665	2528670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299959
42225	NC_004113	GAG	2	6	2528738	2528743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299959
42226	NC_004113	GCGATC	2	12	2528750	2528761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299959
42227	NC_004113	AGG	2	6	2528804	2528809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299959
42228	NC_004113	ATG	2	6	2528853	2528858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299959
42229	NC_004113	A	6	6	2528880	2528885	100 %	0 %	0 %	0 %	22299959
42230	NC_004113	GTTG	2	8	2528921	2528928	0 %	50 %	50 %	0 %	22299959
42231	NC_004113	CA	3	6	2528982	2528987	50 %	0 %	0 %	50 %	22299959
42232	NC_004113	TAC	2	6	2529010	2529015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299959
42233	NC_004113	G	6	6	2529217	2529222	0 %	0 %	100 %	0 %	22299959
42234	NC_004113	AGC	2	6	2529233	2529238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299959
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42353	NC_004113	GACTC	2	10	2536104	2536113	20 %	20 %	20 %	40 %	22299965
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42474	NC_004113	GAT	2	6	2544008	2544013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299973
42475	NC_004113	CAG	2	6	2544014	2544019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
42476	NC_004113	AGC	2	6	2544035	2544040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
42477	NC_004113	CCT	2	6	2544115	2544120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299973
42478	NC_004113	CGG	2	6	2544143	2544148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299973
42479	NC_004113	GCA	2	6	2544301	2544306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
42480	NC_004113	GCA	2	6	2544383	2544388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
42481	NC_004113	GTT	2	6	2544398	2544403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299973
42482	NC_004113	GGC	2	6	2544455	2544460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299973
42483	NC_004113	G	7	7	2544481	2544487	0 %	0 %	100 %	0 %	22299973
42484	NC_004113	G	7	7	2544494	2544500	0 %	0 %	100 %	0 %	22299973
42485	NC_004113	GCA	2	6	2544529	2544534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
42486	NC_004113	GCA	2	6	2544583	2544588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
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42490	NC_004113	C	7	7	2544870	2544876	0 %	0 %	0 %	100 %	22299973
42491	NC_004113	AGGC	2	8	2544884	2544891	25 %	0 %	50 %	25 %	22299973
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42493	NC_004113	AAT	2	6	2544987	2544992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299973
42494	NC_004113	CCT	2	6	2545022	2545027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299973
42495	NC_004113	GAC	2	6	2545034	2545039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973
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42497	NC_004113	CTG	2	6	2545070	2545075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299973
42498	NC_004113	A	6	6	2545101	2545106	100 %	0 %	0 %	0 %	22299973
42499	NC_004113	TATCCC	2	12	2545142	2545153	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	22299973
42500	NC_004113	CAG	2	6	2545164	2545169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299973

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