MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_004113	GCT	2	6	2454234	2454239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299896
41003	NC_004113	AGGC	2	8	2454275	2454282	25 %	0 %	50 %	25 %	22299896
41004	NC_004113	AAT	2	6	2454284	2454289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299896
41005	NC_004113	TTC	2	6	2454332	2454337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299896
41006	NC_004113	TGA	2	6	2454375	2454380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299896
41007	NC_004113	C	6	6	2454407	2454412	0 %	0 %	0 %	100 %	22299896
41008	NC_004113	AGC	2	6	2454432	2454437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299896
41009	NC_004113	CAC	2	6	2454529	2454534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299896
41010	NC_004113	GCCC	2	8	2454556	2454563	0 %	0 %	25 %	75 %	22299896
41011	NC_004113	CAG	2	6	2454608	2454613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299896
41012	NC_004113	GCC	2	6	2454650	2454655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299896
41013	NC_004113	CCA	2	6	2454660	2454665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299896
41014	NC_004113	C	6	6	2454669	2454674	0 %	0 %	0 %	100 %	22299896
41015	NC_004113	C	6	6	2454680	2454685	0 %	0 %	0 %	100 %	22299896
41016	NC_004113	AAT	2	6	2454716	2454721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299896
41017	NC_004113	CGA	2	6	2455002	2455007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299897
41018	NC_004113	GAA	2	6	2455023	2455028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299897
41019	NC_004113	C	7	7	2455259	2455265	0 %	0 %	0 %	100 %	22299897
41020	NC_004113	TACC	2	8	2455277	2455284	25 %	25 %	0 %	50 %	22299897
41021	NC_004113	GCA	2	6	2455349	2455354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299897
41022	NC_004113	G	6	6	2455443	2455448	0 %	0 %	100 %	0 %	22299897
41023	NC_004113	GCA	2	6	2455458	2455463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299897
41024	NC_004113	GAC	2	6	2455633	2455638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299897
41025	NC_004113	ACC	2	6	2455639	2455644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299897
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41027	NC_004113	TAT	2	6	2455796	2455801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299897
41028	NC_004113	GAA	2	6	2455833	2455838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299897
41029	NC_004113	TGA	2	6	2455840	2455845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299897
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41031	NC_004113	CAC	2	6	2455919	2455924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299897
41032	NC_004113	TGAG	2	8	2456101	2456108	25 %	25 %	50 %	0 %	22299897
41033	NC_004113	CCG	2	6	2456119	2456124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299897
41034	NC_004113	TGG	2	6	2456140	2456145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299897
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41050	NC_004113	TGC	2	6	2457129	2457134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299898
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41053	NC_004113	TGGCA	2	10	2457210	2457219	20 %	20 %	40 %	20 %	22299898
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41055	NC_004113	CTG	2	6	2457723	2457728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299899
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41059	NC_004113	CAAA	2	8	2458035	2458042	75 %	0 %	0 %	25 %	22299900
41060	NC_004113	CATA	2	8	2458098	2458105	50 %	25 %	0 %	25 %	22299900
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41064	NC_004113	GCA	2	6	2458169	2458174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299900
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41099	NC_004113	GGCG	2	8	2460456	2460463	0 %	0 %	75 %	25 %	22299902
41100	NC_004113	AT	3	6	2460599	2460604	50 %	50 %	0 %	0 %	22299902
41101	NC_004113	AAC	2	6	2460613	2460618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299902
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41105	NC_004113	CCACTG	2	12	2461037	2461048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22299902
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41108	NC_004113	CCAC	2	8	2461154	2461161	25 %	0 %	0 %	75 %	22299902
41109	NC_004113	CCT	2	6	2461232	2461237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299902
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41120	NC_004113	GGC	2	6	2461680	2461685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299902
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41221	NC_004113	TTGC	2	8	2468205	2468212	0 %	50 %	25 %	25 %	22299907
41222	NC_004113	TCT	3	9	2468289	2468297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299907
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41233	NC_004113	TGGCT	2	10	2469195	2469204	0 %	40 %	40 %	20 %	22299908
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41472	NC_004113	GCA	2	6	2482531	2482536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299918
41473	NC_004113	GCGATC	2	12	2482595	2482606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299918
41474	NC_004113	CAT	2	6	2482669	2482674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299918
41475	NC_004113	TTG	2	6	2482748	2482753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299918
41476	NC_004113	TGA	2	6	2482780	2482785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299918
41477	NC_004113	CCA	2	6	2482834	2482839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299918
41478	NC_004113	GAACC	2	10	2482870	2482879	40 %	0 %	20 %	40 %	22299918
41479	NC_004113	TTGA	2	8	2482982	2482989	25 %	50 %	25 %	0 %	22299918
41480	NC_004113	CGC	2	6	2482997	2483002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299918
41481	NC_004113	GCT	2	6	2483029	2483034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299918
41482	NC_004113	ACCTT	2	10	2483067	2483076	20 %	40 %	0 %	40 %	22299918
41483	NC_004113	CGG	2	6	2483090	2483095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299918
41484	NC_004113	CCA	2	6	2483190	2483195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299918
41485	NC_004113	GTC	2	6	2483214	2483219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299918
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41487	NC_004113	GATT	2	8	2483347	2483354	25 %	50 %	25 %	0 %	22299918
41488	NC_004113	G	6	6	2483387	2483392	0 %	0 %	100 %	0 %	22299918
41489	NC_004113	AGT	2	6	2483394	2483399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299918
41490	NC_004113	GCC	2	6	2483404	2483409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299918
41491	NC_004113	GGC	2	6	2483452	2483457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299918
41492	NC_004113	GGTG	2	8	2483498	2483505	0 %	25 %	75 %	0 %	22299918
41493	NC_004113	AGTGA	2	10	2483639	2483648	40 %	20 %	40 %	0 %	22299918
41494	NC_004113	CAG	2	6	2483954	2483959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299918
41495	NC_004113	TGT	2	6	2484036	2484041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299918
41496	NC_004113	CAG	2	6	2484110	2484115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299918
41497	NC_004113	GA	3	6	2484231	2484236	50 %	0 %	50 %	0 %	22299918
41498	NC_004113	CCA	2	6	2484373	2484378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299918
41499	NC_004113	C	6	6	2484475	2484480	0 %	0 %	0 %	100 %	22299918
41500	NC_004113	GAC	2	6	2484484	2484489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299918

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