MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_004113	TGG	2	6	2269171	2269176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299727
38003	NC_004113	CCG	2	6	2269196	2269201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299727
38004	NC_004113	GGT	2	6	2269244	2269249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299727
38005	NC_004113	CAG	2	6	2269293	2269298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299727
38006	NC_004113	CTA	2	6	2269373	2269378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299727
38007	NC_004113	A	6	6	2269623	2269628	100 %	0 %	0 %	0 %	22299727
38008	NC_004113	TGC	2	6	2269631	2269636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299727
38009	NC_004113	AGC	2	6	2269664	2269669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299727
38010	NC_004113	GCG	2	6	2269710	2269715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299727
38011	NC_004113	GCC	2	6	2269731	2269736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299727
38012	NC_004113	AGCGGA	2	12	2269745	2269756	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22299727
38013	NC_004113	AGT	3	9	2269763	2269771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299727
38014	NC_004113	ATT	2	6	2269839	2269844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299727
38015	NC_004113	GCA	2	6	2269848	2269853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299727
38016	NC_004113	GAAG	2	8	2269874	2269881	50 %	0 %	50 %	0 %	22299727
38017	NC_004113	CAG	2	6	2269970	2269975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299727
38018	NC_004113	CGA	2	6	2269984	2269989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299727
38019	NC_004113	C	6	6	2270020	2270025	0 %	0 %	0 %	100 %	22299727
38020	NC_004113	TCA	2	6	2270123	2270128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299728
38021	NC_004113	TGG	2	6	2270324	2270329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299729
38022	NC_004113	GAT	2	6	2270330	2270335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299729
38023	NC_004113	CGGG	2	8	2270465	2270472	0 %	0 %	75 %	25 %	22299729
38024	NC_004113	GCT	2	6	2270620	2270625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299729
38025	NC_004113	GCT	2	6	2270860	2270865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299729
38026	NC_004113	TGATG	2	10	2270896	2270905	20 %	40 %	40 %	0 %	22299729
38027	NC_004113	TGAG	2	8	2270918	2270925	25 %	25 %	50 %	0 %	22299729
38028	NC_004113	TTG	2	6	2270942	2270947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299730
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38031	NC_004113	TGC	2	6	2271065	2271070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299730
38032	NC_004113	G	6	6	2271072	2271077	0 %	0 %	100 %	0 %	22299730
38033	NC_004113	ATT	2	6	2271092	2271097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299730
38034	NC_004113	CAT	2	6	2271129	2271134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299730
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38040	NC_004113	TGC	2	6	2271617	2271622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299730
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38042	NC_004113	GCC	2	6	2271736	2271741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299731
38043	NC_004113	CAAT	2	8	2271812	2271819	50 %	25 %	0 %	25 %	22299731
38044	NC_004113	TCT	2	6	2271842	2271847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299731
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38047	NC_004113	TTG	2	6	2272123	2272128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299731
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38050	NC_004113	ACT	2	6	2272541	2272546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299732
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38053	NC_004113	C	6	6	2272811	2272816	0 %	0 %	0 %	100 %	22299732
38054	NC_004113	GGGGCA	2	12	2272917	2272928	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	22299732
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38087	NC_004113	TTCA	2	8	2274866	2274873	25 %	50 %	0 %	25 %	22299734
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38115	NC_004113	C	6	6	2276617	2276622	0 %	0 %	0 %	100 %	22299735
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38472	NC_004113	GTG	2	6	2298388	2298393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299758
38473	NC_004113	GCT	2	6	2298431	2298436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299758
38474	NC_004113	GCA	3	9	2298470	2298478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299758
38475	NC_004113	TCA	2	6	2298511	2298516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299758
38476	NC_004113	GTGCG	2	10	2298575	2298584	0 %	20 %	60 %	20 %	22299758
38477	NC_004113	GTTG	2	8	2298590	2298597	0 %	50 %	50 %	0 %	22299758
38478	NC_004113	AATC	2	8	2298633	2298640	50 %	25 %	0 %	25 %	22299758
38479	NC_004113	CCA	2	6	2298677	2298682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299758
38480	NC_004113	GA	3	6	2298685	2298690	50 %	0 %	50 %	0 %	22299758
38481	NC_004113	C	6	6	2298699	2298704	0 %	0 %	0 %	100 %	22299758
38482	NC_004113	ATCA	2	8	2298711	2298718	50 %	25 %	0 %	25 %	22299758
38483	NC_004113	AC	3	6	2298810	2298815	50 %	0 %	0 %	50 %	22299758
38484	NC_004113	CGC	3	9	2298887	2298895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299758
38485	NC_004113	TG	3	6	2298897	2298902	0 %	50 %	50 %	0 %	22299758
38486	NC_004113	ACC	2	6	2298932	2298937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299758
38487	NC_004113	A	7	7	2299025	2299031	100 %	0 %	0 %	0 %	22299758
38488	NC_004113	CTG	2	6	2299071	2299076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299758
38489	NC_004113	CAC	3	9	2299080	2299088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299758
38490	NC_004113	TCC	2	6	2299105	2299110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299758
38491	NC_004113	GGCA	2	8	2299134	2299141	25 %	0 %	50 %	25 %	22299758
38492	NC_004113	GC	3	6	2299209	2299214	0 %	0 %	50 %	50 %	22299758
38493	NC_004113	TAC	2	6	2299396	2299401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299759
38494	NC_004113	G	6	6	2299413	2299418	0 %	0 %	100 %	0 %	22299759
38495	NC_004113	CCA	2	6	2299528	2299533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299759
38496	NC_004113	TGG	2	6	2299571	2299576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299759
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38499	NC_004113	GGA	2	6	2299694	2299699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299759
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