MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_004113	GGACA	2	10	2238499	2238508	40 %	0 %	40 %	20 %	22299699
37502	NC_004113	CGA	2	6	2238644	2238649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299699
37503	NC_004113	GAA	2	6	2238961	2238966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299700
37504	NC_004113	GGT	2	6	2239006	2239011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299700
37505	NC_004113	A	6	6	2239107	2239112	100 %	0 %	0 %	0 %	22299700
37506	NC_004113	CAA	2	6	2239156	2239161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299700
37507	NC_004113	ATA	2	6	2239319	2239324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299700
37508	NC_004113	CAA	2	6	2239454	2239459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299700
37509	NC_004113	ACC	2	6	2239465	2239470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299700
37510	NC_004113	TAA	2	6	2239477	2239482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299700
37511	NC_004113	GCG	2	6	2239518	2239523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299700
37512	NC_004113	T	6	6	2239639	2239644	0 %	100 %	0 %	0 %	22299701
37513	NC_004113	GCA	2	6	2239688	2239693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299701
37514	NC_004113	GCC	2	6	2239716	2239721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299701
37515	NC_004113	GCC	2	6	2239737	2239742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299701
37516	NC_004113	GAC	2	6	2239777	2239782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299701
37517	NC_004113	TGCCC	2	10	2239811	2239820	0 %	20 %	20 %	60 %	22299701
37518	NC_004113	T	7	7	2239845	2239851	0 %	100 %	0 %	0 %	22299701
37519	NC_004113	ATTA	2	8	2239928	2239935	50 %	50 %	0 %	0 %	22299702
37520	NC_004113	TTG	2	6	2240045	2240050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299702
37521	NC_004113	GCG	2	6	2240056	2240061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299702
37522	NC_004113	GCA	2	6	2240099	2240104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299702
37523	NC_004113	AGA	2	6	2240261	2240266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299703
37524	NC_004113	TGG	2	6	2240284	2240289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299703
37525	NC_004113	CAG	2	6	2240453	2240458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299703
37526	NC_004113	GGT	2	6	2240642	2240647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299704
37527	NC_004113	GTG	2	6	2240676	2240681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299704
37528	NC_004113	TGGCC	2	10	2240720	2240729	0 %	20 %	40 %	40 %	22299704
37529	NC_004113	C	7	7	2240805	2240811	0 %	0 %	0 %	100 %	22299704
37530	NC_004113	G	6	6	2240938	2240943	0 %	0 %	100 %	0 %	22299704
37531	NC_004113	CAT	2	6	2241091	2241096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299704
37532	NC_004113	GGT	2	6	2241191	2241196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299704
37533	NC_004113	GCA	2	6	2241197	2241202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299704
37534	NC_004113	AAGA	2	8	2241285	2241292	75 %	0 %	25 %	0 %	22299704
37535	NC_004113	TGC	2	6	2241353	2241358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299705
37536	NC_004113	CTG	2	6	2241364	2241369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299705
37537	NC_004113	GGC	2	6	2241438	2241443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299705
37538	NC_004113	GTT	2	6	2241571	2241576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299705
37539	NC_004113	CCTA	2	8	2241686	2241693	25 %	25 %	0 %	50 %	22299705
37540	NC_004113	G	6	6	2241703	2241708	0 %	0 %	100 %	0 %	22299705
37541	NC_004113	AGCA	2	8	2241737	2241744	50 %	0 %	25 %	25 %	22299705
37542	NC_004113	ACC	2	6	2241772	2241777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299705
37543	NC_004113	CTG	2	6	2241802	2241807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299705
37544	NC_004113	TACC	2	8	2241825	2241832	25 %	25 %	0 %	50 %	22299705
37545	NC_004113	CTT	2	6	2241856	2241861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299705
37546	NC_004113	CGC	2	6	2241937	2241942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299705
37547	NC_004113	GATG	2	8	2241948	2241955	25 %	25 %	50 %	0 %	22299705
37548	NC_004113	CGA	2	6	2241986	2241991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299705
37549	NC_004113	CG	3	6	2241993	2241998	0 %	0 %	50 %	50 %	22299705
37550	NC_004113	CAC	2	6	2242059	2242064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299705
37551	NC_004113	TCT	2	6	2242089	2242094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299705
37552	NC_004113	AG	3	6	2242121	2242126	50 %	0 %	50 %	0 %	22299705
37553	NC_004113	CA	3	6	2242133	2242138	50 %	0 %	0 %	50 %	22299706
37554	NC_004113	TTC	2	6	2242254	2242259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299706
37555	NC_004113	CCA	2	6	2242273	2242278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299706
37556	NC_004113	CAC	2	6	2242311	2242316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299706
37557	NC_004113	CGC	2	6	2242360	2242365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299706
37558	NC_004113	CAG	2	6	2242412	2242417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299706
37559	NC_004113	CGC	2	6	2242422	2242427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299706
37560	NC_004113	TCC	2	6	2242456	2242461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299706
37561	NC_004113	TTGA	3	12	2242476	2242487	25 %	50 %	25 %	0 %	22299706
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37563	NC_004113	ATA	2	6	2242770	2242775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299706
37564	NC_004113	AG	3	6	2242887	2242892	50 %	0 %	50 %	0 %	22299706
37565	NC_004113	CCCACG	2	12	2242894	2242905	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22299706
37566	NC_004113	GGAT	2	8	2242906	2242913	25 %	25 %	50 %	0 %	22299706
37567	NC_004113	ATGA	2	8	2242993	2243000	50 %	25 %	25 %	0 %	22299706
37568	NC_004113	ACT	2	6	2243235	2243240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299707
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37571	NC_004113	GGT	2	6	2243499	2243504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299707
37572	NC_004113	AAG	2	6	2243511	2243516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299707
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37576	NC_004113	CAA	2	6	2243723	2243728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299707
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37589	NC_004113	TAG	2	6	2244569	2244574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299708
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37592	NC_004113	ATCT	2	8	2244721	2244728	25 %	50 %	0 %	25 %	22299708
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37599	NC_004113	TGGT	2	8	2244947	2244954	0 %	50 %	50 %	0 %	22299708
37600	NC_004113	TTG	2	6	2245151	2245156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299708
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37603	NC_004113	GCC	2	6	2245349	2245354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299708
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37605	NC_004113	T	6	6	2245444	2245449	0 %	100 %	0 %	0 %	22299709
37606	NC_004113	T	6	6	2245463	2245468	0 %	100 %	0 %	0 %	22299709
37607	NC_004113	GCT	2	6	2245482	2245487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299709
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37611	NC_004113	GTAG	2	8	2245606	2245613	25 %	25 %	50 %	0 %	22299709
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