MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_004113	CAAA	2	8	2178804	2178811	75 %	0 %	0 %	25 %	22299639
36503	NC_004113	GCC	2	6	2178824	2178829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299639
36504	NC_004113	CGT	2	6	2178875	2178880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299639
36505	NC_004113	TGG	2	6	2178937	2178942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299639
36506	NC_004113	TGG	2	6	2178984	2178989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299639
36507	NC_004113	CTG	2	6	2179001	2179006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299639
36508	NC_004113	G	7	7	2179037	2179043	0 %	0 %	100 %	0 %	22299639
36509	NC_004113	CCT	2	6	2179048	2179053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299639
36510	NC_004113	GCG	2	6	2179138	2179143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299639
36511	NC_004113	CTG	2	6	2179162	2179167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299639
36512	NC_004113	CCA	2	6	2179209	2179214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299640
36513	NC_004113	CAC	2	6	2179254	2179259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299640
36514	NC_004113	CAG	3	9	2179308	2179316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299640
36515	NC_004113	TTG	2	6	2179344	2179349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299640
36516	NC_004113	CAA	2	6	2179539	2179544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299641
36517	NC_004113	T	7	7	2179548	2179554	0 %	100 %	0 %	0 %	22299641
36518	NC_004113	TCC	2	6	2179607	2179612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299641
36519	NC_004113	TGGC	2	8	2179622	2179629	0 %	25 %	50 %	25 %	22299641
36520	NC_004113	TGGC	2	8	2179632	2179639	0 %	25 %	50 %	25 %	22299641
36521	NC_004113	TGAAT	2	10	2179739	2179748	40 %	40 %	20 %	0 %	22299641
36522	NC_004113	C	6	6	2179754	2179759	0 %	0 %	0 %	100 %	22299641
36523	NC_004113	TTC	2	6	2179774	2179779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299641
36524	NC_004113	G	6	6	2179788	2179793	0 %	0 %	100 %	0 %	22299641
36525	NC_004113	AGG	2	6	2179805	2179810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299641
36526	NC_004113	CTG	2	6	2179865	2179870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299641
36527	NC_004113	TG	3	6	2179957	2179962	0 %	50 %	50 %	0 %	22299641
36528	NC_004113	C	6	6	2180027	2180032	0 %	0 %	0 %	100 %	22299641
36529	NC_004113	G	6	6	2180125	2180130	0 %	0 %	100 %	0 %	22299641
36530	NC_004113	CG	3	6	2180153	2180158	0 %	0 %	50 %	50 %	22299641
36531	NC_004113	ACC	2	6	2180234	2180239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299641
36532	NC_004113	GTTG	2	8	2180271	2180278	0 %	50 %	50 %	0 %	22299641
36533	NC_004113	TCAC	2	8	2180378	2180385	25 %	25 %	0 %	50 %	22299641
36534	NC_004113	A	6	6	2180419	2180424	100 %	0 %	0 %	0 %	22299641
36535	NC_004113	GAA	2	6	2180442	2180447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299641
36536	NC_004113	C	6	6	2180462	2180467	0 %	0 %	0 %	100 %	22299641
36537	NC_004113	AGT	2	6	2180550	2180555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299641
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36539	NC_004113	CAGC	2	8	2180643	2180650	25 %	0 %	25 %	50 %	22299641
36540	NC_004113	GAG	2	6	2180698	2180703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299641
36541	NC_004113	CGGCAC	2	12	2180722	2180733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	22299641
36542	NC_004113	ATG	2	6	2180756	2180761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299641
36543	NC_004113	CCATC	2	10	2180889	2180898	20 %	20 %	0 %	60 %	22299641
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36546	NC_004113	CCCGT	2	10	2181062	2181071	0 %	20 %	20 %	60 %	22299641
36547	NC_004113	TTC	2	6	2181109	2181114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299641
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36550	NC_004113	CGCC	2	8	2181171	2181178	0 %	0 %	25 %	75 %	22299641
36551	NC_004113	GCG	3	9	2181235	2181243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299641
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36553	NC_004113	GGT	2	6	2181322	2181327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299641
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36556	NC_004113	GTT	2	6	2181441	2181446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299641
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36560	NC_004113	GCA	2	6	2181800	2181805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299641
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36563	NC_004113	AGGG	2	8	2182212	2182219	25 %	0 %	75 %	0 %	22299642
36564	NC_004113	GCG	2	6	2182241	2182246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299642
36565	NC_004113	CAAT	2	8	2182315	2182322	50 %	25 %	0 %	25 %	22299642
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36571	NC_004113	GTGG	2	8	2182671	2182678	0 %	25 %	75 %	0 %	22299642
36572	NC_004113	ATCCA	2	10	2182686	2182695	40 %	20 %	0 %	40 %	22299642
36573	NC_004113	GGT	2	6	2182705	2182710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299642
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36579	NC_004113	TGC	2	6	2183028	2183033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299643
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36590	NC_004113	CAG	2	6	2183483	2183488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299643
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36602	NC_004113	TGA	2	6	2184579	2184584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299644
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36604	NC_004113	TGC	3	9	2184727	2184735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299644
36605	NC_004113	GA	3	6	2184795	2184800	50 %	0 %	50 %	0 %	22299644
36606	NC_004113	CTC	2	6	2184845	2184850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299644
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36609	NC_004113	G	7	7	2184979	2184985	0 %	0 %	100 %	0 %	22299644
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36615	NC_004113	GGGA	2	8	2185123	2185130	25 %	0 %	75 %	0 %	22299644
36616	NC_004113	TTGACC	2	12	2185132	2185143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22299644
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36973	NC_004113	TCA	2	6	2207308	2207313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299667
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36976	NC_004113	T	6	6	2207433	2207438	0 %	100 %	0 %	0 %	22299667
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36981	NC_004113	AGC	2	6	2207564	2207569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299667
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36991	NC_004113	CTA	2	6	2208269	2208274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299667
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