MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_004113	GCAC	2	8	2025966	2025973	25 %	0 %	25 %	50 %	22299478
34002	NC_004113	AGTC	2	8	2026030	2026037	25 %	25 %	25 %	25 %	22299478
34003	NC_004113	TCT	2	6	2026084	2026089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299479
34004	NC_004113	T	6	6	2026122	2026127	0 %	100 %	0 %	0 %	22299479
34005	NC_004113	CAG	2	6	2026216	2026221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299479
34006	NC_004113	AC	3	6	2026268	2026273	50 %	0 %	0 %	50 %	22299479
34007	NC_004113	GCG	2	6	2026275	2026280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299479
34008	NC_004113	TCA	2	6	2026292	2026297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299479
34009	NC_004113	TTC	2	6	2026316	2026321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299480
34010	NC_004113	AGC	2	6	2026325	2026330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299480
34011	NC_004113	TCC	2	6	2026344	2026349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299480
34012	NC_004113	CTT	2	6	2026429	2026434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299480
34013	NC_004113	TGA	2	6	2026498	2026503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299480
34014	NC_004113	CCT	2	6	2026510	2026515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299480
34015	NC_004113	T	6	6	2026585	2026590	0 %	100 %	0 %	0 %	22299480
34016	NC_004113	TTCA	2	8	2026601	2026608	25 %	50 %	0 %	25 %	22299480
34017	NC_004113	CAA	2	6	2026744	2026749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299480
34018	NC_004113	CAC	2	6	2026754	2026759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299480
34019	NC_004113	ACC	2	6	2026800	2026805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299480
34020	NC_004113	CTT	2	6	2026855	2026860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299480
34021	NC_004113	GTT	2	6	2026918	2026923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299480
34022	NC_004113	GGA	2	6	2027005	2027010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299480
34023	NC_004113	CAG	2	6	2027156	2027161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299480
34024	NC_004113	CAC	2	6	2027189	2027194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299480
34025	NC_004113	TGG	2	6	2027257	2027262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299480
34026	NC_004113	CCT	2	6	2027278	2027283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299480
34027	NC_004113	TCC	2	6	2027322	2027327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299480
34028	NC_004113	GCG	2	6	2027357	2027362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299480
34029	NC_004113	CTA	2	6	2027526	2027531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299481
34030	NC_004113	CTG	2	6	2027539	2027544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299481
34031	NC_004113	GGT	2	6	2027679	2027684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299481
34032	NC_004113	CTG	2	6	2027955	2027960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299481
34033	NC_004113	A	6	6	2028010	2028015	100 %	0 %	0 %	0 %	22299481
34034	NC_004113	CAC	2	6	2028030	2028035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299481
34035	NC_004113	TCA	2	6	2028237	2028242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299482
34036	NC_004113	CGT	2	6	2028244	2028249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299482
34037	NC_004113	TCC	2	6	2028273	2028278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299482
34038	NC_004113	TGG	2	6	2028315	2028320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299482
34039	NC_004113	GCGGG	2	10	2028350	2028359	0 %	0 %	80 %	20 %	22299482
34040	NC_004113	CGG	2	6	2028383	2028388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299482
34041	NC_004113	TAG	2	6	2028438	2028443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299482
34042	NC_004113	GAT	2	6	2028482	2028487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299482
34043	NC_004113	CAT	2	6	2028500	2028505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299482
34044	NC_004113	AGG	2	6	2028685	2028690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299483
34045	NC_004113	GCT	2	6	2028697	2028702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299483
34046	NC_004113	ATAA	2	8	2028797	2028804	75 %	25 %	0 %	0 %	22299483
34047	NC_004113	GTC	2	6	2028829	2028834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299483
34048	NC_004113	GTA	2	6	2028851	2028856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299483
34049	NC_004113	AAT	2	6	2028965	2028970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299483
34050	NC_004113	GTT	2	6	2029043	2029048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299483
34051	NC_004113	TGATC	2	10	2029091	2029100	20 %	40 %	20 %	20 %	22299483
34052	NC_004113	CTTGG	2	10	2029122	2029131	0 %	40 %	40 %	20 %	22299483
34053	NC_004113	CGC	2	6	2029245	2029250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299484
34054	NC_004113	AGC	2	6	2029441	2029446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299485
34055	NC_004113	GGC	2	6	2029447	2029452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299485
34056	NC_004113	A	6	6	2029548	2029553	100 %	0 %	0 %	0 %	22299485
34057	NC_004113	T	6	6	2029566	2029571	0 %	100 %	0 %	0 %	22299485
34058	NC_004113	CAC	2	6	2029637	2029642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299485
34059	NC_004113	TCA	2	6	2029796	2029801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299485
34060	NC_004113	TGG	2	6	2029803	2029808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299485
34061	NC_004113	TGC	2	6	2029846	2029851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299485
34062	NC_004113	CAC	2	6	2029966	2029971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299485
34063	NC_004113	AGG	2	6	2029995	2030000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299485
34064	NC_004113	CAT	2	6	2030001	2030006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299485
34065	NC_004113	GCA	2	6	2030030	2030035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299485
34066	NC_004113	CGA	2	6	2030036	2030041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299485
34067	NC_004113	CTG	4	12	2030203	2030214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299486
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34070	NC_004113	ACC	2	6	2030288	2030293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299486
34071	NC_004113	CTG	2	6	2030304	2030309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299486
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34073	NC_004113	CAG	2	6	2030353	2030358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299486
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34075	NC_004113	GAT	2	6	2030385	2030390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299486
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34078	NC_004113	CAG	2	6	2030494	2030499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299486
34079	NC_004113	CCGT	2	8	2030507	2030514	0 %	25 %	25 %	50 %	22299486
34080	NC_004113	GCT	2	6	2030757	2030762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299487
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34083	NC_004113	AGG	2	6	2030921	2030926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299487
34084	NC_004113	ACCA	2	8	2030934	2030941	50 %	0 %	0 %	50 %	22299487
34085	NC_004113	GCA	2	6	2030966	2030971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299487
34086	NC_004113	CCA	2	6	2031004	2031009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299487
34087	NC_004113	CTG	2	6	2031028	2031033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299487
34088	NC_004113	GCG	2	6	2031075	2031080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299487
34089	NC_004113	TCA	2	6	2031136	2031141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299487
34090	NC_004113	CTT	2	6	2031183	2031188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299487
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34098	NC_004113	TTCA	2	8	2031921	2031928	25 %	50 %	0 %	25 %	22299487
34099	NC_004113	TCT	2	6	2031937	2031942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299487
34100	NC_004113	TTG	2	6	2032024	2032029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299488
34101	NC_004113	TGT	2	6	2032037	2032042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299488
34102	NC_004113	TG	3	6	2032056	2032061	0 %	50 %	50 %	0 %	22299488
34103	NC_004113	CAACT	2	10	2032077	2032086	40 %	20 %	0 %	40 %	22299488
34104	NC_004113	TCA	2	6	2032102	2032107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299488
34105	NC_004113	A	6	6	2032137	2032142	100 %	0 %	0 %	0 %	22299488
34106	NC_004113	TCC	3	9	2032405	2032413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299489
34107	NC_004113	TGG	2	6	2032494	2032499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299489
34108	NC_004113	G	8	8	2032498	2032505	0 %	0 %	100 %	0 %	22299489
34109	NC_004113	GCG	3	9	2032592	2032600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299489
34110	NC_004113	G	8	8	2032603	2032610	0 %	0 %	100 %	0 %	22299489
34111	NC_004113	GGCA	2	8	2032635	2032642	25 %	0 %	50 %	25 %	22299489
34112	NC_004113	GCC	2	6	2032702	2032707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299489
34113	NC_004113	TCA	2	6	2032784	2032789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299489
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34116	NC_004113	GAG	2	6	2033052	2033057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299490
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34118	NC_004113	AAG	2	6	2033170	2033175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299490
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34348	NC_004113	GCTG	2	8	2045510	2045517	0 %	25 %	50 %	25 %	22299506
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34471	NC_004113	CGC	2	6	2053606	2053611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299516
34472	NC_004113	TGA	2	6	2053623	2053628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299516
34473	NC_004113	CAAA	2	8	2053636	2053643	75 %	0 %	0 %	25 %	22299516
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34485	NC_004113	CGC	2	6	2054336	2054341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299516
34486	NC_004113	CTT	2	6	2054351	2054356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299516
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34497	NC_004113	ACTGG	2	10	2054978	2054987	20 %	20 %	40 %	20 %	22299517
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34499	NC_004113	GC	3	6	2055018	2055023	0 %	0 %	50 %	50 %	22299517
34500	NC_004113	ACC	2	6	2055112	2055117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299517

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