MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_004113	ATG	2	6	1937811	1937816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299394
32503	NC_004113	AGT	2	6	1937818	1937823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299394
32504	NC_004113	CAC	2	6	1937837	1937842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32505	NC_004113	CCA	2	6	1937845	1937850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32506	NC_004113	TGG	2	6	1937899	1937904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299394
32507	NC_004113	TGC	2	6	1937955	1937960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32508	NC_004113	CCAT	2	8	1938004	1938011	25 %	25 %	0 %	50 %	22299394
32509	NC_004113	CCG	2	6	1938020	1938025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299394
32510	NC_004113	TTTCA	2	10	1938125	1938134	20 %	60 %	0 %	20 %	22299394
32511	NC_004113	CGT	2	6	1938204	1938209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32512	NC_004113	CAC	2	6	1938221	1938226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32513	NC_004113	GCA	2	6	1938241	1938246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32514	NC_004113	ATC	2	6	1938248	1938253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
32515	NC_004113	TCC	2	6	1938336	1938341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299394
32516	NC_004113	AGGT	2	8	1938568	1938575	25 %	25 %	50 %	0 %	22299395
32517	NC_004113	GC	3	6	1938580	1938585	0 %	0 %	50 %	50 %	22299395
32518	NC_004113	GCA	2	6	1938590	1938595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299395
32519	NC_004113	CAC	2	6	1938597	1938602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299395
32520	NC_004113	CTC	2	6	1938603	1938608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299395
32521	NC_004113	G	7	7	1938632	1938638	0 %	0 %	100 %	0 %	22299395
32522	NC_004113	CGT	2	6	1938732	1938737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299395
32523	NC_004113	ACT	2	6	1939121	1939126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299396
32524	NC_004113	AACC	2	8	1939215	1939222	50 %	0 %	0 %	50 %	22299396
32525	NC_004113	G	6	6	1939266	1939271	0 %	0 %	100 %	0 %	22299396
32526	NC_004113	GCT	2	6	1939278	1939283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299396
32527	NC_004113	TCA	2	6	1939331	1939336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299396
32528	NC_004113	CGT	2	6	1939369	1939374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299396
32529	NC_004113	GTG	2	6	1939393	1939398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299396
32530	NC_004113	TGC	2	6	1939431	1939436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299396
32531	NC_004113	TGG	2	6	1939478	1939483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299396
32532	NC_004113	GAA	2	6	1939695	1939700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299396
32533	NC_004113	GCA	2	6	1939726	1939731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299396
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32535	NC_004113	TGC	2	6	1939823	1939828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299396
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32538	NC_004113	CGC	2	6	1939918	1939923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299396
32539	NC_004113	GTG	2	6	1939962	1939967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299396
32540	NC_004113	CTT	2	6	1939983	1939988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299396
32541	NC_004113	CGA	2	6	1940083	1940088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299396
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32544	NC_004113	TCC	2	6	1940122	1940127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299397
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32547	NC_004113	TGA	2	6	1940253	1940258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299397
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32549	NC_004113	CAG	2	6	1940316	1940321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299397
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32551	NC_004113	A	6	6	1940392	1940397	100 %	0 %	0 %	0 %	22299397
32552	NC_004113	TGA	2	6	1940440	1940445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299397
32553	NC_004113	TGC	2	6	1940511	1940516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299397
32554	NC_004113	GGT	2	6	1940537	1940542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299397
32555	NC_004113	TCAA	2	8	1940556	1940563	50 %	25 %	0 %	25 %	22299397
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32558	NC_004113	GGT	2	6	1940641	1940646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299397
32559	NC_004113	GAT	2	6	1940743	1940748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299397
32560	NC_004113	CTA	2	6	1940758	1940763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299397
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32562	NC_004113	GGC	2	6	1940786	1940791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299397
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32565	NC_004113	CGA	2	6	1940875	1940880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299397
32566	NC_004113	TGA	2	6	1940931	1940936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299397
32567	NC_004113	CTG	2	6	1940969	1940974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299397
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32569	NC_004113	ACT	2	6	1941030	1941035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299397
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32589	NC_004113	CGAT	2	8	1941932	1941939	25 %	25 %	25 %	25 %	22299398
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32594	NC_004113	G	6	6	1942126	1942131	0 %	0 %	100 %	0 %	22299398
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32600	NC_004113	CAGTG	2	10	1942243	1942252	20 %	20 %	40 %	20 %	22299398
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32604	NC_004113	GACC	2	8	1942470	1942477	25 %	0 %	25 %	50 %	22299398
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32609	NC_004113	GCA	2	6	1942857	1942862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299399
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32615	NC_004113	TGGC	2	8	1943217	1943224	0 %	25 %	50 %	25 %	22299399
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32618	NC_004113	TGG	2	6	1943275	1943280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299399
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32854	NC_004113	TCC	2	6	1958436	1958441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299414
32855	NC_004113	C	6	6	1958454	1958459	0 %	0 %	0 %	100 %	22299414
32856	NC_004113	AAT	2	6	1958471	1958476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299414
32857	NC_004113	GCTT	2	8	1958532	1958539	0 %	50 %	25 %	25 %	22299414
32858	NC_004113	GGC	2	6	1958543	1958548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299414
32859	NC_004113	GAC	2	6	1958650	1958655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299414
32860	NC_004113	G	6	6	1958737	1958742	0 %	0 %	100 %	0 %	22299414
32861	NC_004113	TTG	2	6	1958815	1958820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299415
32862	NC_004113	CAA	2	6	1959002	1959007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299415
32863	NC_004113	GATT	2	8	1959034	1959041	25 %	50 %	25 %	0 %	22299415
32864	NC_004113	TTG	2	6	1959315	1959320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299416
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32866	NC_004113	TCA	2	6	1959417	1959422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299416
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32869	NC_004113	GCT	2	6	1959480	1959485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299416
32870	NC_004113	TTTGC	2	10	1959498	1959507	0 %	60 %	20 %	20 %	22299416
32871	NC_004113	AGA	2	6	1959529	1959534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299416
32872	NC_004113	GCC	2	6	1959609	1959614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299416
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32874	NC_004113	CGA	2	6	1959721	1959726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299416
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32877	NC_004113	G	6	6	1959829	1959834	0 %	0 %	100 %	0 %	22299416
32878	NC_004113	CTTGA	2	10	1959896	1959905	20 %	40 %	20 %	20 %	22299416
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32882	NC_004113	CTG	2	6	1960154	1960159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299416
32883	NC_004113	TGC	2	6	1960248	1960253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299416
32884	NC_004113	G	6	6	1960255	1960260	0 %	0 %	100 %	0 %	22299416
32885	NC_004113	GCT	2	6	1960279	1960284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299416
32886	NC_004113	GGC	2	6	1960375	1960380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299416
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32890	NC_004113	CGCA	2	8	1960637	1960644	25 %	0 %	25 %	50 %	22299416
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32923	NC_004113	GCTC	2	8	1962392	1962399	0 %	25 %	25 %	50 %	22299417
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32958	NC_004113	TGC	2	6	1964418	1964423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299419
32959	NC_004113	ATT	2	6	1964470	1964475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299419
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32961	NC_004113	TTCA	2	8	1964684	1964691	25 %	50 %	0 %	25 %	22299420
32962	NC_004113	GGA	2	6	1964715	1964720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299420
32963	NC_004113	TCG	2	6	1964864	1964869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299420
32964	NC_004113	A	6	6	1964956	1964961	100 %	0 %	0 %	0 %	22299420
32965	NC_004113	CAA	2	6	1965009	1965014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299420
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32967	NC_004113	CCAAAG	2	12	1965405	1965416	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22299421
32968	NC_004113	TGC	2	6	1965443	1965448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299421
32969	NC_004113	CAT	2	6	1965567	1965572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299421
32970	NC_004113	GTT	2	6	1965787	1965792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299421
32971	NC_004113	ATC	2	6	1965839	1965844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299421
32972	NC_004113	A	6	6	1965848	1965853	100 %	0 %	0 %	0 %	22299421
32973	NC_004113	TGG	2	6	1965884	1965889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299421
32974	NC_004113	ATC	2	6	1965954	1965959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299421
32975	NC_004113	GCGA	2	8	1965987	1965994	25 %	0 %	50 %	25 %	22299421
32976	NC_004113	CTGC	2	8	1966310	1966317	0 %	25 %	25 %	50 %	22299422
32977	NC_004113	TGG	2	6	1966364	1966369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299422
32978	NC_004113	AGC	2	6	1966474	1966479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299422
32979	NC_004113	CTT	2	6	1966605	1966610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299422
32980	NC_004113	TCGC	2	8	1966684	1966691	0 %	25 %	25 %	50 %	22299423
32981	NC_004113	GAT	2	6	1966696	1966701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299423
32982	NC_004113	TGC	2	6	1966737	1966742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299423
32983	NC_004113	AGG	2	6	1966843	1966848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299423
32984	NC_004113	T	6	6	1966973	1966978	0 %	100 %	0 %	0 %	22299423
32985	NC_004113	CAC	2	6	1967019	1967024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299423
32986	NC_004113	TAC	2	6	1967056	1967061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299423
32987	NC_004113	T	7	7	1967092	1967098	0 %	100 %	0 %	0 %	22299423
32988	NC_004113	CATCGG	2	12	1967131	1967142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299423
32989	NC_004113	CCA	2	6	1967158	1967163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299423
32990	NC_004113	GCA	2	6	1967211	1967216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299423
32991	NC_004113	TTG	2	6	1967244	1967249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299423
32992	NC_004113	TCAA	2	8	1967409	1967416	50 %	25 %	0 %	25 %	22299423
32993	NC_004113	CAC	2	6	1967585	1967590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299423
32994	NC_004113	CCA	2	6	1967593	1967598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299423
32995	NC_004113	GCG	2	6	1967616	1967621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299423
32996	NC_004113	G	6	6	1967623	1967628	0 %	0 %	100 %	0 %	22299423
32997	NC_004113	ACC	2	6	1967631	1967636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299423
32998	NC_004113	CGG	2	6	1967684	1967689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299423
32999	NC_004113	GCA	2	6	1967814	1967819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299423
33000	NC_004113	AG	3	6	1967857	1967862	50 %	0 %	50 %	0 %	22299423

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