MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_004113	CGCC	2	8	1908428	1908435	0 %	0 %	25 %	75 %	22299370
32003	NC_004113	GAG	2	6	1908538	1908543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299370
32004	NC_004113	GCC	2	6	1908571	1908576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299370
32005	NC_004113	GCCAA	2	10	1908578	1908587	40 %	0 %	20 %	40 %	22299370
32006	NC_004113	TGG	2	6	1908644	1908649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299370
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32009	NC_004113	A	6	6	1908808	1908813	100 %	0 %	0 %	0 %	22299371
32010	NC_004113	TAC	2	6	1908819	1908824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299371
32011	NC_004113	CTT	2	6	1908881	1908886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299371
32012	NC_004113	GGCGGT	2	12	1908905	1908916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22299371
32013	NC_004113	GGCAG	2	10	1908977	1908986	20 %	0 %	60 %	20 %	22299371
32014	NC_004113	AGC	2	6	1908992	1908997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299371
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32016	NC_004113	G	7	7	1909106	1909112	0 %	0 %	100 %	0 %	22299371
32017	NC_004113	TGAA	2	8	1909159	1909166	50 %	25 %	25 %	0 %	22299371
32018	NC_004113	GAG	2	6	1909195	1909200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299371
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32026	NC_004113	AGTC	2	8	1909588	1909595	25 %	25 %	25 %	25 %	22299372
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32033	NC_004113	CCACTG	2	12	1910044	1910055	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22299372
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32093	NC_004113	GA	3	6	1913485	1913490	50 %	0 %	50 %	0 %	22299374
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32102	NC_004113	CAGG	2	8	1913974	1913981	25 %	0 %	50 %	25 %	22299375
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32117	NC_004113	CGG	2	6	1914726	1914731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299375
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32119	NC_004113	TGC	2	6	1914893	1914898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299375
32120	NC_004113	AAT	2	6	1914905	1914910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299375
32121	NC_004113	CCAT	2	8	1914930	1914937	25 %	25 %	0 %	50 %	22299375
32122	NC_004113	GTTG	2	8	1914949	1914956	0 %	50 %	50 %	0 %	22299375
32123	NC_004113	TCA	2	6	1914972	1914977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299375
32124	NC_004113	TCA	2	6	1915026	1915031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299375
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32353	NC_004113	GCG	2	6	1929896	1929901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299389
32354	NC_004113	CCA	2	6	1929922	1929927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299389
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32454	NC_004113	CATC	2	8	1935826	1935833	25 %	25 %	0 %	50 %	22299394
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32456	NC_004113	TGC	2	6	1935867	1935872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299394
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32461	NC_004113	T	6	6	1936132	1936137	0 %	100 %	0 %	0 %	22299394
32462	NC_004113	CGC	3	9	1936185	1936193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299394
32463	NC_004113	GC	3	6	1936206	1936211	0 %	0 %	50 %	50 %	22299394
32464	NC_004113	TCA	2	6	1936222	1936227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
32465	NC_004113	TCG	2	6	1936230	1936235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32466	NC_004113	CTTG	2	8	1936246	1936253	0 %	50 %	25 %	25 %	22299394
32467	NC_004113	GTA	3	9	1936262	1936270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299394
32468	NC_004113	GCG	2	6	1936315	1936320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299394
32469	NC_004113	TCA	2	6	1936338	1936343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
32470	NC_004113	GCA	2	6	1936393	1936398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32471	NC_004113	TCC	2	6	1936404	1936409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299394
32472	NC_004113	CCG	2	6	1936481	1936486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299394
32473	NC_004113	CCA	2	6	1936531	1936536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32474	NC_004113	TTCT	2	8	1936547	1936554	0 %	75 %	0 %	25 %	22299394
32475	NC_004113	ACC	2	6	1936560	1936565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32476	NC_004113	TTC	2	6	1936571	1936576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299394
32477	NC_004113	TCGG	2	8	1936623	1936630	0 %	25 %	50 %	25 %	22299394
32478	NC_004113	CTGC	2	8	1936663	1936670	0 %	25 %	25 %	50 %	22299394
32479	NC_004113	GCA	2	6	1936726	1936731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32480	NC_004113	CCT	2	6	1936741	1936746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299394
32481	NC_004113	ACC	2	6	1936817	1936822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32482	NC_004113	CAT	2	6	1936850	1936855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
32483	NC_004113	TCA	2	6	1936860	1936865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
32484	NC_004113	G	6	6	1936868	1936873	0 %	0 %	100 %	0 %	22299394
32485	NC_004113	C	7	7	1936934	1936940	0 %	0 %	0 %	100 %	22299394
32486	NC_004113	AAT	2	6	1936943	1936948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299394
32487	NC_004113	GTTG	2	8	1936970	1936977	0 %	50 %	50 %	0 %	22299394
32488	NC_004113	GCA	2	6	1937083	1937088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299394
32489	NC_004113	TGG	2	6	1937119	1937124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299394
32490	NC_004113	GCCA	2	8	1937181	1937188	25 %	0 %	25 %	50 %	22299394
32491	NC_004113	CGC	2	6	1937229	1937234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299394
32492	NC_004113	TGG	2	6	1937248	1937253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299394
32493	NC_004113	CAC	2	6	1937255	1937260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32494	NC_004113	GGTA	2	8	1937359	1937366	25 %	25 %	50 %	0 %	22299394
32495	NC_004113	CTT	2	6	1937407	1937412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299394
32496	NC_004113	GCG	2	6	1937447	1937452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299394
32497	NC_004113	CCA	2	6	1937455	1937460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299394
32498	NC_004113	TCA	2	6	1937644	1937649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299394
32499	NC_004113	GC	3	6	1937657	1937662	0 %	0 %	50 %	50 %	22299394
32500	NC_004113	AGG	2	6	1937697	1937702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299394

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