MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_004113	GTC	2	6	1878812	1878817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299338
31502	NC_004113	CTG	2	6	1878839	1878844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299338
31503	NC_004113	GT	3	6	1878848	1878853	0 %	50 %	50 %	0 %	22299338
31504	NC_004113	TGG	2	6	1878858	1878863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299338
31505	NC_004113	GCG	2	6	1878880	1878885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299338
31506	NC_004113	CTT	2	6	1878895	1878900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299338
31507	NC_004113	ATTG	2	8	1878919	1878926	25 %	50 %	25 %	0 %	22299338
31508	NC_004113	GAA	2	6	1878968	1878973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299338
31509	NC_004113	GTCA	2	8	1879017	1879024	25 %	25 %	25 %	25 %	22299338
31510	NC_004113	TCA	2	6	1879059	1879064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299338
31511	NC_004113	GCA	2	6	1879113	1879118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299338
31512	NC_004113	TC	3	6	1879150	1879155	0 %	50 %	0 %	50 %	22299338
31513	NC_004113	CAA	2	6	1879169	1879174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299338
31514	NC_004113	CTG	2	6	1879256	1879261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299338
31515	NC_004113	AG	3	6	1879291	1879296	50 %	0 %	50 %	0 %	22299338
31516	NC_004113	TGC	2	6	1879354	1879359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299339
31517	NC_004113	GCA	2	6	1879389	1879394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299339
31518	NC_004113	TGGGG	2	10	1879554	1879563	0 %	20 %	80 %	0 %	22299339
31519	NC_004113	CGC	2	6	1879654	1879659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299339
31520	NC_004113	TGGC	2	8	1879670	1879677	0 %	25 %	50 %	25 %	22299339
31521	NC_004113	AG	3	6	1879699	1879704	50 %	0 %	50 %	0 %	22299339
31522	NC_004113	GTT	2	6	1879715	1879720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299339
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31524	NC_004113	GGGA	2	8	1879791	1879798	25 %	0 %	75 %	0 %	22299339
31525	NC_004113	CAT	2	6	1879834	1879839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299339
31526	NC_004113	TGGG	2	8	1879859	1879866	0 %	25 %	75 %	0 %	22299339
31527	NC_004113	T	6	6	1879948	1879953	0 %	100 %	0 %	0 %	22299339
31528	NC_004113	CA	3	6	1879958	1879963	50 %	0 %	0 %	50 %	22299339
31529	NC_004113	CGG	2	6	1879971	1879976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299339
31530	NC_004113	C	6	6	1879994	1879999	0 %	0 %	0 %	100 %	22299339
31531	NC_004113	CAA	2	6	1880013	1880018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299339
31532	NC_004113	ATC	2	6	1880072	1880077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299339
31533	NC_004113	CCT	2	6	1880099	1880104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299339
31534	NC_004113	CAA	2	6	1880346	1880351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299339
31535	NC_004113	TCA	2	6	1880381	1880386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299339
31536	NC_004113	GTT	2	6	1880390	1880395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299339
31537	NC_004113	TAA	2	6	1880451	1880456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299339
31538	NC_004113	TTG	2	6	1880770	1880775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299340
31539	NC_004113	GCT	2	6	1880808	1880813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299340
31540	NC_004113	C	7	7	1880848	1880854	0 %	0 %	0 %	100 %	22299340
31541	NC_004113	AAAT	2	8	1880946	1880953	75 %	25 %	0 %	0 %	22299340
31542	NC_004113	GCG	2	6	1880957	1880962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299340
31543	NC_004113	TCG	2	6	1881083	1881088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299340
31544	NC_004113	GGC	2	6	1881115	1881120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299340
31545	NC_004113	GGC	2	6	1881181	1881186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299340
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31547	NC_004113	TGGC	2	8	1881257	1881264	0 %	25 %	50 %	25 %	22299340
31548	NC_004113	GAC	2	6	1881300	1881305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299341
31549	NC_004113	GAA	2	6	1881351	1881356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299341
31550	NC_004113	GCA	2	6	1881462	1881467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299341
31551	NC_004113	GAT	2	6	1881498	1881503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299341
31552	NC_004113	CCA	2	6	1881504	1881509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299341
31553	NC_004113	CCA	2	6	1881579	1881584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299341
31554	NC_004113	TCCC	2	8	1881633	1881640	0 %	25 %	0 %	75 %	22299341
31555	NC_004113	GTT	2	6	1881717	1881722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299341
31556	NC_004113	TTGG	2	8	1881823	1881830	0 %	50 %	50 %	0 %	22299341
31557	NC_004113	TGCC	2	8	1881903	1881910	0 %	25 %	25 %	50 %	22299341
31558	NC_004113	CGC	2	6	1882061	1882066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299342
31559	NC_004113	AT	3	6	1882138	1882143	50 %	50 %	0 %	0 %	22299342
31560	NC_004113	GTC	2	6	1882229	1882234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299342
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31562	NC_004113	CTTG	2	8	1882349	1882356	0 %	50 %	25 %	25 %	22299342
31563	NC_004113	CT	3	6	1882369	1882374	0 %	50 %	0 %	50 %	22299342
31564	NC_004113	CGC	2	6	1882462	1882467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299342
31565	NC_004113	TCG	2	6	1882485	1882490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299342
31566	NC_004113	C	7	7	1882526	1882532	0 %	0 %	0 %	100 %	22299342
31567	NC_004113	AGA	2	6	1882533	1882538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299342
31568	NC_004113	TGGC	2	8	1882560	1882567	0 %	25 %	50 %	25 %	22299342
31569	NC_004113	TCAA	2	8	1882617	1882624	50 %	25 %	0 %	25 %	22299343
31570	NC_004113	TG	3	6	1882630	1882635	0 %	50 %	50 %	0 %	22299343
31571	NC_004113	AC	3	6	1882661	1882666	50 %	0 %	0 %	50 %	22299343
31572	NC_004113	AACGGG	2	12	1882683	1882694	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22299343
31573	NC_004113	TGGA	2	8	1882717	1882724	25 %	25 %	50 %	0 %	22299343
31574	NC_004113	TCA	2	6	1882784	1882789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299343
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31577	NC_004113	GGTA	2	8	1882965	1882972	25 %	25 %	50 %	0 %	22299343
31578	NC_004113	TGAA	2	8	1883502	1883509	50 %	25 %	25 %	0 %	22299344
31579	NC_004113	GGC	2	6	1883617	1883622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299344
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31583	NC_004113	GTA	2	6	1883882	1883887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299344
31584	NC_004113	AGGT	2	8	1883931	1883938	25 %	25 %	50 %	0 %	22299344
31585	NC_004113	TTGA	2	8	1883942	1883949	25 %	50 %	25 %	0 %	22299344
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31587	NC_004113	GTT	2	6	1884032	1884037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299344
31588	NC_004113	GGGATG	2	12	1884137	1884148	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	22299344
31589	NC_004113	GCAG	2	8	1884237	1884244	25 %	0 %	50 %	25 %	22299344
31590	NC_004113	GCG	2	6	1884302	1884307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299344
31591	NC_004113	G	7	7	1884324	1884330	0 %	0 %	100 %	0 %	22299344
31592	NC_004113	TGGG	2	8	1884385	1884392	0 %	25 %	75 %	0 %	22299344
31593	NC_004113	TGA	2	6	1884483	1884488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299344
31594	NC_004113	CGTGG	2	10	1884492	1884501	0 %	20 %	60 %	20 %	22299344
31595	NC_004113	CTTG	2	8	1884528	1884535	0 %	50 %	25 %	25 %	22299344
31596	NC_004113	GGC	2	6	1884540	1884545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299344
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31600	NC_004113	CAAA	2	8	1884669	1884676	75 %	0 %	0 %	25 %	22299344
31601	NC_004113	G	6	6	1884693	1884698	0 %	0 %	100 %	0 %	22299344
31602	NC_004113	CGC	2	6	1884707	1884712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299344
31603	NC_004113	CGC	3	9	1884741	1884749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299344
31604	NC_004113	GC	3	6	1884756	1884761	0 %	0 %	50 %	50 %	22299344
31605	NC_004113	CTTGG	2	10	1884767	1884776	0 %	40 %	40 %	20 %	22299344
31606	NC_004113	CTG	2	6	1884827	1884832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299344
31607	NC_004113	CAAAT	2	10	1884834	1884843	60 %	20 %	0 %	20 %	22299344
31608	NC_004113	GGC	2	6	1885011	1885016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299345
31609	NC_004113	ATG	2	6	1885019	1885024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299345
31610	NC_004113	CCA	2	6	1885026	1885031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299345
31611	NC_004113	TGA	2	6	1885184	1885189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299345
31612	NC_004113	ATG	2	6	1885214	1885219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299345
31613	NC_004113	CGG	2	6	1885243	1885248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299345
31614	NC_004113	CCA	2	6	1885296	1885301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299345
31615	NC_004113	ATC	2	6	1885312	1885317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299345
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31617	NC_004113	TTC	2	6	1885345	1885350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299345
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