MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_004113	ATT	2	6	1640392	1640397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299120
27502	NC_004113	TGGG	2	8	1640398	1640405	0 %	25 %	75 %	0 %	22299120
27503	NC_004113	GCA	2	6	1640439	1640444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299120
27504	NC_004113	TGT	2	6	1640450	1640455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299120
27505	NC_004113	G	6	6	1640525	1640530	0 %	0 %	100 %	0 %	22299121
27506	NC_004113	CAG	2	6	1640664	1640669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299121
27507	NC_004113	CAA	2	6	1640745	1640750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299121
27508	NC_004113	ACA	2	6	1640765	1640770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299121
27509	NC_004113	TAC	2	6	1640787	1640792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299121
27510	NC_004113	CGCT	2	8	1640840	1640847	0 %	25 %	25 %	50 %	22299121
27511	NC_004113	ATCT	2	8	1640850	1640857	25 %	50 %	0 %	25 %	22299121
27512	NC_004113	CGG	2	6	1641037	1641042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299121
27513	NC_004113	TTA	2	6	1641068	1641073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299121
27514	NC_004113	CAGC	2	8	1641088	1641095	25 %	0 %	25 %	50 %	22299121
27515	NC_004113	GCAGA	2	10	1641129	1641138	40 %	0 %	40 %	20 %	22299121
27516	NC_004113	TGC	2	6	1641217	1641222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299121
27517	NC_004113	TCA	2	6	1641268	1641273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299121
27518	NC_004113	GTTG	2	8	1641311	1641318	0 %	50 %	50 %	0 %	22299121
27519	NC_004113	GGC	2	6	1641423	1641428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299122
27520	NC_004113	A	6	6	1641447	1641452	100 %	0 %	0 %	0 %	22299122
27521	NC_004113	CTTCTG	2	12	1641512	1641523	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22299122
27522	NC_004113	ATT	2	6	1641609	1641614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299122
27523	NC_004113	GCAGGG	2	12	1641617	1641628	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	22299122
27524	NC_004113	CAC	2	6	1641684	1641689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299122
27525	NC_004113	GTT	2	6	1641755	1641760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299122
27526	NC_004113	GCA	2	6	1641787	1641792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299122
27527	NC_004113	AGCT	2	8	1641813	1641820	25 %	25 %	25 %	25 %	22299122
27528	NC_004113	TTC	2	6	1641903	1641908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
27529	NC_004113	TTC	2	6	1641915	1641920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
27530	NC_004113	TCC	2	6	1641946	1641951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299122
27531	NC_004113	CTC	2	6	1641957	1641962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299122
27532	NC_004113	TTC	2	6	1641999	1642004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
27533	NC_004113	TTGGGC	2	12	1642014	1642025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22299122
27534	NC_004113	TTGGGC	2	12	1642056	1642067	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22299122
27535	NC_004113	ACA	2	6	1642156	1642161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299122
27536	NC_004113	TCA	2	6	1642162	1642167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299122
27537	NC_004113	CCA	2	6	1642187	1642192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299122
27538	NC_004113	TTC	2	6	1642233	1642238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299122
27539	NC_004113	CAA	2	6	1642490	1642495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299123
27540	NC_004113	GC	3	6	1642573	1642578	0 %	0 %	50 %	50 %	22299123
27541	NC_004113	CCCG	2	8	1642599	1642606	0 %	0 %	25 %	75 %	22299123
27542	NC_004113	ACG	2	6	1642619	1642624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299123
27543	NC_004113	TGC	2	6	1642674	1642679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299123
27544	NC_004113	TGA	2	6	1642684	1642689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299123
27545	NC_004113	CTGC	2	8	1642750	1642757	0 %	25 %	25 %	50 %	22299123
27546	NC_004113	CAC	2	6	1642828	1642833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299123
27547	NC_004113	GAG	2	6	1642904	1642909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299123
27548	NC_004113	GAG	2	6	1642973	1642978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299123
27549	NC_004113	GTG	2	6	1643036	1643041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299123
27550	NC_004113	CTGA	2	8	1643051	1643058	25 %	25 %	25 %	25 %	22299123
27551	NC_004113	ACCG	2	8	1643075	1643082	25 %	0 %	25 %	50 %	22299123
27552	NC_004113	TCC	2	6	1643087	1643092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299123
27553	NC_004113	TGG	2	6	1643199	1643204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299123
27554	NC_004113	GC	3	6	1643236	1643241	0 %	0 %	50 %	50 %	22299123
27555	NC_004113	TGG	2	6	1643360	1643365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299123
27556	NC_004113	ATG	2	6	1643428	1643433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299123
27557	NC_004113	CAG	2	6	1643469	1643474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299124
27558	NC_004113	AAG	2	6	1643482	1643487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299124
27559	NC_004113	TGG	2	6	1643498	1643503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299124
27560	NC_004113	TTGA	2	8	1643586	1643593	25 %	50 %	25 %	0 %	22299124
27561	NC_004113	G	7	7	1643618	1643624	0 %	0 %	100 %	0 %	22299124
27562	NC_004113	GTC	2	6	1643629	1643634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299124
27563	NC_004113	GCT	2	6	1643724	1643729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299125
27564	NC_004113	CGC	2	6	1643736	1643741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299125
27565	NC_004113	CAG	2	6	1643753	1643758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299125
27566	NC_004113	TGAG	3	12	1643766	1643777	25 %	25 %	50 %	0 %	22299125
27567	NC_004113	GGC	2	6	1643848	1643853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299125
27568	NC_004113	CTG	2	6	1643900	1643905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299125
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27570	NC_004113	ACC	2	6	1644512	1644517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299126
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27572	NC_004113	GGAT	2	8	1644616	1644623	25 %	25 %	50 %	0 %	22299126
27573	NC_004113	TCC	2	6	1644757	1644762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299126
27574	NC_004113	TGG	2	6	1644801	1644806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299126
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27577	NC_004113	CTC	2	6	1644954	1644959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299126
27578	NC_004113	TGC	2	6	1645070	1645075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299126
27579	NC_004113	TGG	2	6	1645144	1645149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299126
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27583	NC_004113	TGA	2	6	1645619	1645624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299126
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27585	NC_004113	GGT	2	6	1645676	1645681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299126
27586	NC_004113	TTGGG	2	10	1645774	1645783	0 %	40 %	60 %	0 %	22299126
27587	NC_004113	ATC	2	6	1645804	1645809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299126
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27589	NC_004113	CAC	2	6	1645997	1646002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299127
27590	NC_004113	CTG	2	6	1646010	1646015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299127
27591	NC_004113	TGG	2	6	1646023	1646028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299127
27592	NC_004113	TCTA	2	8	1646083	1646090	25 %	50 %	0 %	25 %	22299128
27593	NC_004113	GGT	2	6	1646143	1646148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299128
27594	NC_004113	CAAGG	2	10	1646181	1646190	40 %	0 %	40 %	20 %	22299128
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27596	NC_004113	ATCGCG	2	12	1646251	1646262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299128
27597	NC_004113	CCCCTT	2	12	1646310	1646321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299128
27598	NC_004113	CAT	2	6	1646345	1646350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299128
27599	NC_004113	TCG	2	6	1646369	1646374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299128
27600	NC_004113	CT	4	8	1646398	1646405	0 %	50 %	0 %	50 %	22299128
27601	NC_004113	CTGG	2	8	1646417	1646424	0 %	25 %	50 %	25 %	22299128
27602	NC_004113	CCT	2	6	1646435	1646440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299128
27603	NC_004113	CCT	2	6	1646444	1646449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299128
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27605	NC_004113	CCT	2	6	1646532	1646537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299128
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27607	NC_004113	CTG	2	6	1646776	1646781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299129
27608	NC_004113	CA	3	6	1646848	1646853	50 %	0 %	0 %	50 %	22299129
27609	NC_004113	GTG	2	6	1646938	1646943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299129
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27613	NC_004113	CCT	2	6	1647204	1647209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299130
27614	NC_004113	ATGA	2	8	1647337	1647344	50 %	25 %	25 %	0 %	22299130
27615	NC_004113	CGC	2	6	1647349	1647354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299130
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