MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_004113	TTG	2	6	1614313	1614318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299090
27003	NC_004113	TGC	2	6	1614395	1614400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299090
27004	NC_004113	GGC	2	6	1614407	1614412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299090
27005	NC_004113	G	7	7	1614415	1614421	0 %	0 %	100 %	0 %	22299090
27006	NC_004113	TGC	2	6	1614488	1614493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299090
27007	NC_004113	ATT	2	6	1614495	1614500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299090
27008	NC_004113	G	6	6	1614506	1614511	0 %	0 %	100 %	0 %	22299090
27009	NC_004113	GGC	2	6	1614539	1614544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299090
27010	NC_004113	ACCA	2	8	1614573	1614580	50 %	0 %	0 %	50 %	22299090
27011	NC_004113	AGC	2	6	1614719	1614724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299091
27012	NC_004113	CTG	2	6	1614759	1614764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299091
27013	NC_004113	ACC	2	6	1614802	1614807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299091
27014	NC_004113	GCTG	2	8	1614808	1614815	0 %	25 %	50 %	25 %	22299091
27015	NC_004113	CCGCTA	2	12	1614876	1614887	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22299091
27016	NC_004113	GGCTG	2	10	1614906	1614915	0 %	20 %	60 %	20 %	22299091
27017	NC_004113	TAC	2	6	1614966	1614971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299091
27018	NC_004113	CCAA	2	8	1615015	1615022	50 %	0 %	0 %	50 %	22299091
27019	NC_004113	ACA	2	6	1615037	1615042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299091
27020	NC_004113	GTC	2	6	1615050	1615055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299091
27021	NC_004113	GGC	2	6	1615079	1615084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299091
27022	NC_004113	CAC	2	6	1615128	1615133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299091
27023	NC_004113	CAG	2	6	1615155	1615160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299091
27024	NC_004113	TTG	2	6	1615218	1615223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299091
27025	NC_004113	CGG	2	6	1615228	1615233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299091
27026	NC_004113	TCG	2	6	1615340	1615345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299091
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27028	NC_004113	GCGCG	2	10	1615463	1615472	0 %	0 %	60 %	40 %	22299091
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27034	NC_004113	GT	3	6	1615827	1615832	0 %	50 %	50 %	0 %	22299092
27035	NC_004113	GGT	2	6	1615883	1615888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299092
27036	NC_004113	GGGC	2	8	1615947	1615954	0 %	0 %	75 %	25 %	22299092
27037	NC_004113	ATC	2	6	1615986	1615991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299092
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27041	NC_004113	AGG	2	6	1616029	1616034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299092
27042	NC_004113	GCA	2	6	1616036	1616041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299092
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27044	NC_004113	T	6	6	1616105	1616110	0 %	100 %	0 %	0 %	22299092
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27048	NC_004113	GAT	2	6	1616138	1616143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299092
27049	NC_004113	CTTTG	2	10	1616198	1616207	0 %	60 %	20 %	20 %	22299092
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27052	NC_004113	TGG	2	6	1616404	1616409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299092
27053	NC_004113	CGT	2	6	1616417	1616422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299092
27054	NC_004113	GCCCT	2	10	1616512	1616521	0 %	20 %	20 %	60 %	22299092
27055	NC_004113	ATT	2	6	1616541	1616546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299092
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27059	NC_004113	CTTT	2	8	1616701	1616708	0 %	75 %	0 %	25 %	22299092
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27083	NC_004113	CCAC	2	8	1617753	1617760	25 %	0 %	0 %	75 %	22299093
27084	NC_004113	CA	3	6	1617793	1617798	50 %	0 %	0 %	50 %	22299093
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27091	NC_004113	GCG	2	6	1617961	1617966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299093
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27098	NC_004113	C	6	6	1618457	1618462	0 %	0 %	0 %	100 %	22299094
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27103	NC_004113	TGAT	2	8	1618876	1618883	25 %	50 %	25 %	0 %	22299095
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27118	NC_004113	GAG	2	6	1619529	1619534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299095
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27233	NC_004113	GAT	2	6	1626059	1626064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299102
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27471	NC_004113	GC	3	6	1639031	1639036	0 %	0 %	50 %	50 %	22299117
27472	NC_004113	GCA	2	6	1639068	1639073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299117
27473	NC_004113	CCA	2	6	1639099	1639104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299117
27474	NC_004113	CCAA	2	8	1639120	1639127	50 %	0 %	0 %	50 %	22299117
27475	NC_004113	A	6	6	1639126	1639131	100 %	0 %	0 %	0 %	22299117
27476	NC_004113	GCT	3	9	1639427	1639435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299118
27477	NC_004113	ATGG	2	8	1639447	1639454	25 %	25 %	50 %	0 %	22299118
27478	NC_004113	CAAT	2	8	1639493	1639500	50 %	25 %	0 %	25 %	22299118
27479	NC_004113	AACG	2	8	1639502	1639509	50 %	0 %	25 %	25 %	22299118
27480	NC_004113	GCT	2	6	1639589	1639594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299118
27481	NC_004113	CAG	2	6	1639631	1639636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299118
27482	NC_004113	TGC	2	6	1639638	1639643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299118
27483	NC_004113	GCT	2	6	1639661	1639666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299118
27484	NC_004113	CAA	2	6	1639703	1639708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299118
27485	NC_004113	TCCCAT	2	12	1639846	1639857	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	22299119
27486	NC_004113	CCCATC	2	12	1639877	1639888	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	22299119
27487	NC_004113	GAA	2	6	1639897	1639902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299119
27488	NC_004113	GTC	2	6	1639979	1639984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299119
27489	NC_004113	CGC	2	6	1640010	1640015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299119
27490	NC_004113	GATT	2	8	1640045	1640052	25 %	50 %	25 %	0 %	22299119
27491	NC_004113	GT	3	6	1640073	1640078	0 %	50 %	50 %	0 %	22299119
27492	NC_004113	T	6	6	1640145	1640150	0 %	100 %	0 %	0 %	22299119
27493	NC_004113	ATA	2	6	1640154	1640159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299119
27494	NC_004113	CAATGC	2	12	1640177	1640188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22299120
27495	NC_004113	CTG	2	6	1640189	1640194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299120
27496	NC_004113	TTG	2	6	1640195	1640200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299120
27497	NC_004113	ATC	2	6	1640221	1640226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299120
27498	NC_004113	CACC	2	8	1640342	1640349	25 %	0 %	0 %	75 %	22299120
27499	NC_004113	CGC	2	6	1640350	1640355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299120
27500	NC_004113	GCC	2	6	1640361	1640366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299120

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