MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_004113	CA	3	6	1585455	1585460	50 %	0 %	0 %	50 %	22299061
26502	NC_004113	TTC	2	6	1585540	1585545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299061
26503	NC_004113	GCA	2	6	1585581	1585586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299061
26504	NC_004113	GTT	3	9	1585650	1585658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299061
26505	NC_004113	CAT	2	6	1585705	1585710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299061
26506	NC_004113	GGC	2	6	1585824	1585829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299061
26507	NC_004113	TGA	2	6	1585847	1585852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299061
26508	NC_004113	ATCGCG	2	12	1585864	1585875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299061
26509	NC_004113	GTA	2	6	1585909	1585914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299061
26510	NC_004113	AGC	2	6	1585924	1585929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299061
26511	NC_004113	GCC	2	6	1586177	1586182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299062
26512	NC_004113	CAA	2	6	1586193	1586198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299062
26513	NC_004113	GAC	2	6	1586244	1586249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299062
26514	NC_004113	TAG	2	6	1586267	1586272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299062
26515	NC_004113	CGC	2	6	1586407	1586412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299062
26516	NC_004113	TCG	2	6	1586438	1586443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299062
26517	NC_004113	CAC	2	6	1586493	1586498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299062
26518	NC_004113	AGA	2	6	1586523	1586528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299062
26519	NC_004113	TTG	2	6	1586555	1586560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299062
26520	NC_004113	GCA	2	6	1586576	1586581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299062
26521	NC_004113	AAGGG	2	10	1586744	1586753	40 %	0 %	60 %	0 %	22299062
26522	NC_004113	GCA	2	6	1586923	1586928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299063
26523	NC_004113	AGA	2	6	1586939	1586944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299063
26524	NC_004113	TGGT	2	8	1586965	1586972	0 %	50 %	50 %	0 %	22299063
26525	NC_004113	CAT	2	6	1587047	1587052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299063
26526	NC_004113	CTG	2	6	1587078	1587083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299063
26527	NC_004113	GCG	2	6	1587099	1587104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299063
26528	NC_004113	CGC	2	6	1587139	1587144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299063
26529	NC_004113	AAT	2	6	1587146	1587151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299063
26530	NC_004113	GGAG	2	8	1587287	1587294	25 %	0 %	75 %	0 %	22299063
26531	NC_004113	TGG	2	6	1587299	1587304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299063
26532	NC_004113	TGG	2	6	1587368	1587373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299063
26533	NC_004113	GCC	2	6	1587428	1587433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299063
26534	NC_004113	GCG	2	6	1587492	1587497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299063
26535	NC_004113	CATG	2	8	1587572	1587579	25 %	25 %	25 %	25 %	22299063
26536	NC_004113	TGC	2	6	1587584	1587589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299063
26537	NC_004113	AGA	2	6	1587623	1587628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299063
26538	NC_004113	GCGATC	2	12	1587637	1587648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22299063
26539	NC_004113	GCG	2	6	1587661	1587666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299063
26540	NC_004113	TTGA	2	8	1587831	1587838	25 %	50 %	25 %	0 %	22299063
26541	NC_004113	AGCAC	2	10	1587845	1587854	40 %	0 %	20 %	40 %	22299063
26542	NC_004113	G	6	6	1587865	1587870	0 %	0 %	100 %	0 %	22299063
26543	NC_004113	TGG	2	6	1587901	1587906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299063
26544	NC_004113	CCA	2	6	1587920	1587925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299063
26545	NC_004113	GAA	2	6	1588011	1588016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299063
26546	NC_004113	CCA	2	6	1588037	1588042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299063
26547	NC_004113	CTG	2	6	1588062	1588067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299063
26548	NC_004113	CCT	2	6	1588079	1588084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299063
26549	NC_004113	CAG	2	6	1588128	1588133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299063
26550	NC_004113	GGTT	2	8	1588314	1588321	0 %	50 %	50 %	0 %	22299063
26551	NC_004113	GCAGTT	2	12	1588422	1588433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22299063
26552	NC_004113	CAT	2	6	1588472	1588477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299064
26553	NC_004113	CTCC	2	8	1588522	1588529	0 %	25 %	0 %	75 %	22299064
26554	NC_004113	ATGA	2	8	1588692	1588699	50 %	25 %	25 %	0 %	22299064
26555	NC_004113	ATC	2	6	1588704	1588709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299064
26556	NC_004113	CGC	2	6	1588749	1588754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299064
26557	NC_004113	GAT	2	6	1588763	1588768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299064
26558	NC_004113	T	6	6	1588796	1588801	0 %	100 %	0 %	0 %	22299064
26559	NC_004113	TGG	2	6	1588809	1588814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299064
26560	NC_004113	ACG	2	6	1588821	1588826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299064
26561	NC_004113	CTA	2	6	1588847	1588852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299064
26562	NC_004113	AACG	2	8	1588941	1588948	50 %	0 %	25 %	25 %	22299064
26563	NC_004113	CAC	2	6	1588949	1588954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299064
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26566	NC_004113	GCA	2	6	1589126	1589131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299064
26567	NC_004113	CTTT	2	8	1589222	1589229	0 %	75 %	0 %	25 %	22299064
26568	NC_004113	TGGC	2	8	1589256	1589263	0 %	25 %	50 %	25 %	22299064
26569	NC_004113	T	6	6	1589292	1589297	0 %	100 %	0 %	0 %	22299064
26570	NC_004113	CCG	2	6	1589320	1589325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299064
26571	NC_004113	GTC	2	6	1589398	1589403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299064
26572	NC_004113	AAG	2	6	1589412	1589417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299064
26573	NC_004113	TTG	2	6	1589472	1589477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299064
26574	NC_004113	GACA	2	8	1589485	1589492	50 %	0 %	25 %	25 %	22299064
26575	NC_004113	CTTAT	2	10	1589542	1589551	20 %	60 %	0 %	20 %	22299064
26576	NC_004113	TGAT	2	8	1589575	1589582	25 %	50 %	25 %	0 %	22299064
26577	NC_004113	GCG	2	6	1589606	1589611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299064
26578	NC_004113	TGC	3	9	1589638	1589646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299064
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26580	NC_004113	CCTC	2	8	1589745	1589752	0 %	25 %	0 %	75 %	22299064
26581	NC_004113	TGG	2	6	1589806	1589811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299064
26582	NC_004113	AGG	2	6	1589891	1589896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299064
26583	NC_004113	TG	3	6	1589938	1589943	0 %	50 %	50 %	0 %	22299065
26584	NC_004113	TGG	2	6	1590001	1590006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299065
26585	NC_004113	T	6	6	1590011	1590016	0 %	100 %	0 %	0 %	22299065
26586	NC_004113	GCC	2	6	1590056	1590061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299065
26587	NC_004113	G	7	7	1590083	1590089	0 %	0 %	100 %	0 %	22299065
26588	NC_004113	CAG	2	6	1590170	1590175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299065
26589	NC_004113	ACC	2	6	1590200	1590205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299065
26590	NC_004113	GGT	2	6	1590211	1590216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299065
26591	NC_004113	CGG	2	6	1590335	1590340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299065
26592	NC_004113	GCA	2	6	1590358	1590363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299065
26593	NC_004113	TCC	2	6	1590445	1590450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299065
26594	NC_004113	TGA	2	6	1590459	1590464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299065
26595	NC_004113	TCC	2	6	1590555	1590560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299065
26596	NC_004113	GCA	2	6	1590635	1590640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299065
26597	NC_004113	CTG	2	6	1590643	1590648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299065
26598	NC_004113	ATG	2	6	1590687	1590692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299065
26599	NC_004113	GT	3	6	1590710	1590715	0 %	50 %	50 %	0 %	22299065
26600	NC_004113	TGCCC	2	10	1591351	1591360	0 %	20 %	20 %	60 %	22299066
26601	NC_004113	GCAC	2	8	1591369	1591376	25 %	0 %	25 %	50 %	22299066
26602	NC_004113	CCT	2	6	1591444	1591449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299066
26603	NC_004113	GAC	2	6	1591507	1591512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299066
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26605	NC_004113	AGGTGG	2	12	1591537	1591548	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	22299066
26606	NC_004113	ATGA	2	8	1591589	1591596	50 %	25 %	25 %	0 %	22299066
26607	NC_004113	AGT	2	6	1591621	1591626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299066
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26611	NC_004113	CGC	3	9	1591800	1591808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22299066
26612	NC_004113	TCC	2	6	1591883	1591888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299067
26613	NC_004113	GTT	2	6	1591949	1591954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299067
26614	NC_004113	TCA	2	6	1592045	1592050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299067
26615	NC_004113	GGCGA	2	10	1592053	1592062	20 %	0 %	60 %	20 %	22299067
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