MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_004113	GGC	2	6	1347721	1347726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298840
22503	NC_004113	GCC	2	6	1347804	1347809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298840
22504	NC_004113	CCA	2	6	1347820	1347825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298840
22505	NC_004113	GGA	2	6	1347898	1347903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298840
22506	NC_004113	CTG	2	6	1347920	1347925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298840
22507	NC_004113	GA	3	6	1347936	1347941	50 %	0 %	50 %	0 %	22298840
22508	NC_004113	TCA	2	6	1347969	1347974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298840
22509	NC_004113	A	6	6	1348054	1348059	100 %	0 %	0 %	0 %	22298840
22510	NC_004113	GTC	2	6	1348208	1348213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298840
22511	NC_004113	GAT	2	6	1348240	1348245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298840
22512	NC_004113	GCC	2	6	1348356	1348361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298840
22513	NC_004113	CTG	2	6	1348493	1348498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298840
22514	NC_004113	GCA	2	6	1348537	1348542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298840
22515	NC_004113	GTA	2	6	1348572	1348577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298840
22516	NC_004113	CCA	2	6	1348660	1348665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298840
22517	NC_004113	AGA	2	6	1348777	1348782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298840
22518	NC_004113	AAC	3	9	1348788	1348796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298840
22519	NC_004113	CGA	2	6	1348803	1348808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298840
22520	NC_004113	GCA	2	6	1348810	1348815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298840
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22524	NC_004113	GCT	2	6	1349125	1349130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298841
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22526	NC_004113	GTC	2	6	1349190	1349195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298841
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22531	NC_004113	ATG	2	6	1349358	1349363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298841
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22533	NC_004113	CAG	2	6	1349453	1349458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298841
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22538	NC_004113	CCA	2	6	1349779	1349784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298842
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22541	NC_004113	ACG	2	6	1349897	1349902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298842
22542	NC_004113	GTA	2	6	1349924	1349929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298842
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22552	NC_004113	GCCTCC	2	12	1350489	1350500	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	22298842
22553	NC_004113	TGG	2	6	1350535	1350540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298842
22554	NC_004113	CAG	2	6	1350562	1350567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298842
22555	NC_004113	CGT	2	6	1350592	1350597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298842
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22584	NC_004113	TCAGGC	2	12	1352235	1352246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298844
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22586	NC_004113	TA	3	6	1352269	1352274	50 %	50 %	0 %	0 %	22298844
22587	NC_004113	CGC	2	6	1352309	1352314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298844
22588	NC_004113	CCGC	2	8	1352673	1352680	0 %	0 %	25 %	75 %	22298844
22589	NC_004113	CAC	2	6	1352773	1352778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298844
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22597	NC_004113	GTGTAG	2	12	1353227	1353238	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22298844
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22602	NC_004113	ATT	2	6	1353439	1353444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298845
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22614	NC_004113	ATT	2	6	1354040	1354045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298846
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22737	NC_004113	GAT	2	6	1362110	1362115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298855
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22971	NC_004113	TGG	2	6	1375514	1375519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298868
22972	NC_004113	CTTT	2	8	1375523	1375530	0 %	75 %	0 %	25 %	22298868
22973	NC_004113	ATC	2	6	1375585	1375590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298868
22974	NC_004113	ATGA	2	8	1375596	1375603	50 %	25 %	25 %	0 %	22298868
22975	NC_004113	ATCA	2	8	1375614	1375621	50 %	25 %	0 %	25 %	22298868
22976	NC_004113	CCT	2	6	1375658	1375663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298868
22977	NC_004113	CCCCG	2	10	1375714	1375723	0 %	0 %	20 %	80 %	22298868
22978	NC_004113	GCT	2	6	1375801	1375806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298868
22979	NC_004113	TCA	2	6	1375816	1375821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298868
22980	NC_004113	TTG	2	6	1375833	1375838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298868
22981	NC_004113	CCA	2	6	1375844	1375849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298868
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22983	NC_004113	CG	3	6	1375989	1375994	0 %	0 %	50 %	50 %	22298868
22984	NC_004113	GTG	2	6	1376010	1376015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298868
22985	NC_004113	TGT	2	6	1376056	1376061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298868
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22990	NC_004113	TG	3	6	1376635	1376640	0 %	50 %	50 %	0 %	22298869
22991	NC_004113	CGC	2	6	1376658	1376663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298869
22992	NC_004113	GCT	2	6	1376757	1376762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298869
22993	NC_004113	TGAAAA	2	12	1376772	1376783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22298869
22994	NC_004113	GTGG	2	8	1376809	1376816	0 %	25 %	75 %	0 %	22298869
22995	NC_004113	AGG	2	6	1376831	1376836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298869
22996	NC_004113	GAA	2	6	1376860	1376865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298869
22997	NC_004113	TGC	2	6	1376891	1376896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298869
22998	NC_004113	CGT	2	6	1376962	1376967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298869
22999	NC_004113	AAG	2	6	1376977	1376982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298869
23000	NC_004113	TGG	2	6	1377032	1377037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298869

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