MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_004113	ACCCC	2	10	1317787	1317796	20 %	0 %	0 %	80 %	22298813
22002	NC_004113	TAT	2	6	1317840	1317845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298813
22003	NC_004113	TCA	2	6	1317858	1317863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298813
22004	NC_004113	CTA	2	6	1317902	1317907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298814
22005	NC_004113	A	6	6	1317907	1317912	100 %	0 %	0 %	0 %	22298814
22006	NC_004113	CAA	2	6	1317929	1317934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298814
22007	NC_004113	CAG	2	6	1317953	1317958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22008	NC_004113	CGC	2	6	1317984	1317989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298814
22009	NC_004113	CTA	2	6	1318000	1318005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298814
22010	NC_004113	AAC	2	6	1318026	1318031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298814
22011	NC_004113	GCT	2	6	1318132	1318137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22012	NC_004113	GCA	2	6	1318138	1318143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22013	NC_004113	CGG	3	9	1318146	1318154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298814
22014	NC_004113	ACG	2	6	1318304	1318309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22015	NC_004113	CTGC	2	8	1318362	1318369	0 %	25 %	25 %	50 %	22298814
22016	NC_004113	CAA	2	6	1318414	1318419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298814
22017	NC_004113	AAG	2	6	1318578	1318583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298814
22018	NC_004113	GAA	2	6	1318646	1318651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298814
22019	NC_004113	TAC	2	6	1318673	1318678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298814
22020	NC_004113	GCG	2	6	1318749	1318754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298814
22021	NC_004113	GCA	2	6	1318894	1318899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22022	NC_004113	CCT	2	6	1319017	1319022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298814
22023	NC_004113	GAG	2	6	1319123	1319128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298814
22024	NC_004113	CTC	2	6	1319130	1319135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298814
22025	NC_004113	C	6	6	1319135	1319140	0 %	0 %	0 %	100 %	22298814
22026	NC_004113	C	6	6	1319154	1319159	0 %	0 %	0 %	100 %	22298814
22027	NC_004113	CCCAC	2	10	1319239	1319248	20 %	0 %	0 %	80 %	22298814
22028	NC_004113	GCCA	2	8	1319291	1319298	25 %	0 %	25 %	50 %	22298814
22029	NC_004113	AAC	2	6	1319418	1319423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298814
22030	NC_004113	CAG	2	6	1319492	1319497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22031	NC_004113	CCG	2	6	1319523	1319528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298814
22032	NC_004113	CTG	2	6	1319570	1319575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22033	NC_004113	GGT	2	6	1319595	1319600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298814
22034	NC_004113	GGC	2	6	1319604	1319609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298814
22035	NC_004113	GATCGC	2	12	1319610	1319621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298814
22036	NC_004113	A	8	8	1319746	1319753	100 %	0 %	0 %	0 %	22298814
22037	NC_004113	ATG	2	6	1319863	1319868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298815
22038	NC_004113	CCG	2	6	1319900	1319905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298815
22039	NC_004113	GGT	2	6	1319951	1319956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298815
22040	NC_004113	TCT	2	6	1319995	1320000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298815
22041	NC_004113	ATTCA	2	10	1320001	1320010	40 %	40 %	0 %	20 %	22298815
22042	NC_004113	CGC	2	6	1320035	1320040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298815
22043	NC_004113	GGC	2	6	1320048	1320053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298815
22044	NC_004113	TTTC	2	8	1320096	1320103	0 %	75 %	0 %	25 %	22298815
22045	NC_004113	GCA	2	6	1320122	1320127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298815
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22047	NC_004113	CTTTGA	2	12	1320212	1320223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22298815
22048	NC_004113	GAT	2	6	1320237	1320242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298815
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22050	NC_004113	GTG	2	6	1320465	1320470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298815
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22052	NC_004113	G	6	6	1320487	1320492	0 %	0 %	100 %	0 %	22298815
22053	NC_004113	TTC	2	6	1320541	1320546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298815
22054	NC_004113	CGA	2	6	1320572	1320577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298815
22055	NC_004113	GCA	2	6	1320600	1320605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298815
22056	NC_004113	ATG	2	6	1320646	1320651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298815
22057	NC_004113	TGT	2	6	1321024	1321029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298816
22058	NC_004113	CGG	2	6	1321048	1321053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298816
22059	NC_004113	ATC	2	6	1321064	1321069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298816
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22061	NC_004113	T	6	6	1321121	1321126	0 %	100 %	0 %	0 %	22298816
22062	NC_004113	C	6	6	1321152	1321157	0 %	0 %	0 %	100 %	22298816
22063	NC_004113	TGC	2	6	1321249	1321254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298816
22064	NC_004113	ACC	3	9	1321260	1321268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298816
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22067	NC_004113	TCA	2	6	1321356	1321361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298816
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22070	NC_004113	GCA	2	6	1321578	1321583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298816
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22074	NC_004113	TTAT	2	8	1321893	1321900	25 %	75 %	0 %	0 %	22298817
22075	NC_004113	C	6	6	1321901	1321906	0 %	0 %	0 %	100 %	22298817
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22090	NC_004113	CGG	2	6	1322826	1322831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298817
22091	NC_004113	G	7	7	1322830	1322836	0 %	0 %	100 %	0 %	22298817
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22102	NC_004113	GCA	2	6	1323394	1323399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298817
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22118	NC_004113	GC	3	6	1324358	1324363	0 %	0 %	50 %	50 %	22298819
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22233	NC_004113	CTT	2	6	1331070	1331075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298824
22234	NC_004113	TGCCC	2	10	1331119	1331128	0 %	20 %	20 %	60 %	22298824
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22237	NC_004113	CTG	2	6	1331361	1331366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298824
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22354	NC_004113	CCA	2	6	1338610	1338615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298830
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22472	NC_004113	ATG	2	6	1345939	1345944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298839
22473	NC_004113	CAT	2	6	1345970	1345975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298839
22474	NC_004113	TGC	2	6	1346015	1346020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298839
22475	NC_004113	CAGGT	2	10	1346041	1346050	20 %	20 %	40 %	20 %	22298839
22476	NC_004113	GT	3	6	1346055	1346060	0 %	50 %	50 %	0 %	22298839
22477	NC_004113	CAA	2	6	1346083	1346088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298839
22478	NC_004113	CTG	2	6	1346133	1346138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298839
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22482	NC_004113	GAG	2	6	1346517	1346522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298839
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22484	NC_004113	CT	3	6	1346604	1346609	0 %	50 %	0 %	50 %	22298839
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22487	NC_004113	CTG	2	6	1346767	1346772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298839
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22490	NC_004113	GTG	2	6	1346950	1346955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298839
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22497	NC_004113	CTG	2	6	1347456	1347461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298839
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22499	NC_004113	GCA	2	6	1347637	1347642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298839
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