MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_004113	GCCATA	2	12	1288474	1288485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22298786
21502	NC_004113	AGG	2	6	1288514	1288519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298786
21503	NC_004113	CTG	2	6	1288726	1288731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298786
21504	NC_004113	CTG	2	6	1288768	1288773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298786
21505	NC_004113	C	6	6	1289014	1289019	0 %	0 %	0 %	100 %	22298786
21506	NC_004113	GCA	2	6	1289297	1289302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298786
21507	NC_004113	GGTT	2	8	1289322	1289329	0 %	50 %	50 %	0 %	22298786
21508	NC_004113	CAA	2	6	1289380	1289385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298786
21509	NC_004113	AGA	2	6	1289530	1289535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298786
21510	NC_004113	GCG	2	6	1289569	1289574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298786
21511	NC_004113	GCC	2	6	1289649	1289654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298786
21512	NC_004113	G	6	6	1289735	1289740	0 %	0 %	100 %	0 %	22298786
21513	NC_004113	GCG	2	6	1289781	1289786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298786
21514	NC_004113	GTG	2	6	1289794	1289799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298786
21515	NC_004113	GCA	2	6	1289855	1289860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298786
21516	NC_004113	GCA	2	6	1290084	1290089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298786
21517	NC_004113	CGC	2	6	1290194	1290199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298786
21518	NC_004113	AAAT	2	8	1290200	1290207	75 %	25 %	0 %	0 %	22298786
21519	NC_004113	GAA	2	6	1290297	1290302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298786
21520	NC_004113	ATG	2	6	1290308	1290313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298786
21521	NC_004113	G	6	6	1290318	1290323	0 %	0 %	100 %	0 %	22298786
21522	NC_004113	GTC	2	6	1290359	1290364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298786
21523	NC_004113	CAG	2	6	1290404	1290409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298787
21524	NC_004113	AAG	2	6	1290416	1290421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298787
21525	NC_004113	A	6	6	1290472	1290477	100 %	0 %	0 %	0 %	22298787
21526	NC_004113	CTG	2	6	1290689	1290694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298788
21527	NC_004113	GCC	2	6	1290785	1290790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298788
21528	NC_004113	GAT	2	6	1290836	1290841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298788
21529	NC_004113	TCG	2	6	1290861	1290866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298788
21530	NC_004113	TTC	2	6	1290933	1290938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298788
21531	NC_004113	TGA	2	6	1291006	1291011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298788
21532	NC_004113	C	7	7	1291035	1291041	0 %	0 %	0 %	100 %	22298788
21533	NC_004113	CAG	2	6	1291379	1291384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298789
21534	NC_004113	GGC	3	9	1291581	1291589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298789
21535	NC_004113	CCA	2	6	1291628	1291633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298789
21536	NC_004113	GCC	2	6	1291729	1291734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298789
21537	NC_004113	ACC	3	9	1291756	1291764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298789
21538	NC_004113	CAC	2	6	1291944	1291949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298789
21539	NC_004113	CAA	2	6	1291962	1291967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298789
21540	NC_004113	GGA	2	6	1292002	1292007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298789
21541	NC_004113	CTA	2	6	1292070	1292075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298789
21542	NC_004113	GC	3	6	1292114	1292119	0 %	0 %	50 %	50 %	22298789
21543	NC_004113	AAC	2	6	1292200	1292205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298789
21544	NC_004113	GGC	2	6	1292239	1292244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298789
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21546	NC_004113	GCA	2	6	1292405	1292410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298789
21547	NC_004113	CAA	2	6	1292614	1292619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298789
21548	NC_004113	TTGC	2	8	1292662	1292669	0 %	50 %	25 %	25 %	22298789
21549	NC_004113	GCA	3	9	1292686	1292694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298789
21550	NC_004113	CTG	2	6	1292726	1292731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298789
21551	NC_004113	ATG	2	6	1292741	1292746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298789
21552	NC_004113	TCCTG	2	10	1292808	1292817	0 %	40 %	20 %	40 %	22298789
21553	NC_004113	ACG	2	6	1292881	1292886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298789
21554	NC_004113	AAACA	2	10	1292897	1292906	80 %	0 %	0 %	20 %	22298789
21555	NC_004113	TGG	2	6	1292974	1292979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298790
21556	NC_004113	GCT	2	6	1293047	1293052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298790
21557	NC_004113	GCA	2	6	1293103	1293108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298790
21558	NC_004113	GCA	2	6	1293153	1293158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298790
21559	NC_004113	GCC	2	6	1293285	1293290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298790
21560	NC_004113	CGT	2	6	1293449	1293454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298791
21561	NC_004113	TGC	2	6	1293480	1293485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298791
21562	NC_004113	TCA	2	6	1293489	1293494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298791
21563	NC_004113	ACC	2	6	1293581	1293586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298791
21564	NC_004113	TGA	2	6	1293602	1293607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298791
21565	NC_004113	AGC	2	6	1293881	1293886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298792
21566	NC_004113	GTTCT	2	10	1293887	1293896	0 %	60 %	20 %	20 %	22298792
21567	NC_004113	CAA	2	6	1293915	1293920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298792
21568	NC_004113	GATCGC	2	12	1293925	1293936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298792
21569	NC_004113	GCGG	2	8	1293939	1293946	0 %	0 %	75 %	25 %	22298792
21570	NC_004113	GCC	2	6	1293955	1293960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298792
21571	NC_004113	TGC	2	6	1293990	1293995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298792
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21574	NC_004113	TGG	2	6	1294103	1294108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298792
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21576	NC_004113	TGC	2	6	1294196	1294201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298792
21577	NC_004113	CAA	2	6	1294249	1294254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298792
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21583	NC_004113	CGGTGC	2	12	1294409	1294420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22298792
21584	NC_004113	TG	3	6	1294421	1294426	0 %	50 %	50 %	0 %	22298792
21585	NC_004113	CGC	2	6	1294464	1294469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298792
21586	NC_004113	GGTT	2	8	1294488	1294495	0 %	50 %	50 %	0 %	22298792
21587	NC_004113	CAAC	2	8	1294503	1294510	50 %	0 %	0 %	50 %	22298792
21588	NC_004113	TGG	2	6	1294529	1294534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298792
21589	NC_004113	GTGC	2	8	1294540	1294547	0 %	25 %	50 %	25 %	22298792
21590	NC_004113	GGC	2	6	1294645	1294650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
21591	NC_004113	TCC	2	6	1294668	1294673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298793
21592	NC_004113	C	7	7	1294686	1294692	0 %	0 %	0 %	100 %	22298793
21593	NC_004113	GCT	2	6	1294730	1294735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
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21596	NC_004113	TTG	2	6	1294794	1294799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298793
21597	NC_004113	TAT	2	6	1294844	1294849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298793
21598	NC_004113	GCG	2	6	1294874	1294879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
21599	NC_004113	TG	4	8	1294924	1294931	0 %	50 %	50 %	0 %	22298793
21600	NC_004113	GCTG	2	8	1295089	1295096	0 %	25 %	50 %	25 %	22298793
21601	NC_004113	GTC	2	6	1295120	1295125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
21602	NC_004113	CTG	2	6	1295156	1295161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
21603	NC_004113	GCT	2	6	1295184	1295189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
21604	NC_004113	CAAC	2	8	1295212	1295219	50 %	0 %	0 %	50 %	22298793
21605	NC_004113	GCG	2	6	1295240	1295245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
21606	NC_004113	ACC	2	6	1295249	1295254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298793
21607	NC_004113	G	6	6	1295266	1295271	0 %	0 %	100 %	0 %	22298793
21608	NC_004113	GCT	2	6	1295275	1295280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
21609	NC_004113	GCACCT	2	12	1295286	1295297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298793
21610	NC_004113	GCT	2	6	1295324	1295329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298793
21611	NC_004113	GGC	2	6	1295380	1295385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298793
21612	NC_004113	AGC	2	6	1295401	1295406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298793
21613	NC_004113	AAGGGG	2	12	1295436	1295447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298793
21614	NC_004113	AATCC	2	10	1295490	1295499	40 %	20 %	0 %	40 %	22298793
21615	NC_004113	CGCTGG	2	12	1295537	1295548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22298793
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21972	NC_004113	TCA	2	6	1315846	1315851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298811
21973	NC_004113	GCA	2	6	1315858	1315863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298811
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21976	NC_004113	TCA	2	6	1316161	1316166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298812
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21978	NC_004113	TCA	2	6	1316280	1316285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298812
21979	NC_004113	AGC	2	6	1316310	1316315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298812
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21998	NC_004113	T	6	6	1317735	1317740	0 %	100 %	0 %	0 %	22298813
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22000	NC_004113	GCC	2	6	1317776	1317781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298813

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