MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_004113	CAGC	2	8	1256872	1256879	25 %	0 %	25 %	50 %	22298756
21002	NC_004113	GCT	2	6	1256892	1256897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298756
21003	NC_004113	CTC	2	6	1256941	1256946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298756
21004	NC_004113	TCAG	2	8	1256996	1257003	25 %	25 %	25 %	25 %	22298756
21005	NC_004113	GTG	2	6	1257027	1257032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298756
21006	NC_004113	G	6	6	1257037	1257042	0 %	0 %	100 %	0 %	22298756
21007	NC_004113	GGC	2	6	1257264	1257269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298756
21008	NC_004113	TCG	2	6	1257330	1257335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298756
21009	NC_004113	CAC	2	6	1257342	1257347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298756
21010	NC_004113	GCA	2	6	1257350	1257355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298756
21011	NC_004113	CTG	2	6	1257484	1257489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298756
21012	NC_004113	TGC	2	6	1257490	1257495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298756
21013	NC_004113	GC	3	6	1257788	1257793	0 %	0 %	50 %	50 %	22298757
21014	NC_004113	GCT	2	6	1257802	1257807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298757
21015	NC_004113	CTG	2	6	1257845	1257850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298757
21016	NC_004113	CAA	2	6	1257929	1257934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298757
21017	NC_004113	CATGG	2	10	1257960	1257969	20 %	20 %	40 %	20 %	22298757
21018	NC_004113	TG	3	6	1257985	1257990	0 %	50 %	50 %	0 %	22298757
21019	NC_004113	GCCC	2	8	1258030	1258037	0 %	0 %	25 %	75 %	22298757
21020	NC_004113	C	6	6	1258035	1258040	0 %	0 %	0 %	100 %	22298757
21021	NC_004113	GCC	2	6	1258095	1258100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298757
21022	NC_004113	AAC	2	6	1258122	1258127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298758
21023	NC_004113	GCG	2	6	1258162	1258167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298758
21024	NC_004113	GAG	2	6	1258193	1258198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298758
21025	NC_004113	TC	3	6	1258213	1258218	0 %	50 %	0 %	50 %	22298758
21026	NC_004113	CAG	2	6	1258280	1258285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21027	NC_004113	TG	3	6	1258292	1258297	0 %	50 %	50 %	0 %	22298758
21028	NC_004113	CGG	2	6	1258329	1258334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298758
21029	NC_004113	AGG	2	6	1258383	1258388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298758
21030	NC_004113	GCT	2	6	1258477	1258482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21031	NC_004113	TGA	2	6	1258509	1258514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298758
21032	NC_004113	CCGCC	2	10	1258544	1258553	0 %	0 %	20 %	80 %	22298758
21033	NC_004113	GGA	2	6	1258567	1258572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298758
21034	NC_004113	CTT	2	6	1258678	1258683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298758
21035	NC_004113	GTC	2	6	1258703	1258708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21036	NC_004113	CAG	2	6	1258847	1258852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21037	NC_004113	GTG	2	6	1258893	1258898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298758
21038	NC_004113	TTG	2	6	1258908	1258913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298758
21039	NC_004113	GTG	2	6	1258958	1258963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298758
21040	NC_004113	ACGCA	2	10	1258979	1258988	40 %	0 %	20 %	40 %	22298758
21041	NC_004113	CAG	2	6	1259024	1259029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21042	NC_004113	ACT	2	6	1259032	1259037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298758
21043	NC_004113	ACG	2	6	1259093	1259098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21044	NC_004113	GTG	2	6	1259099	1259104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298758
21045	NC_004113	GTG	2	6	1259177	1259182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298758
21046	NC_004113	GCT	2	6	1259254	1259259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21047	NC_004113	GAC	2	6	1259260	1259265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
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21049	NC_004113	CCA	2	6	1259401	1259406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298758
21050	NC_004113	ACC	2	6	1259412	1259417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298758
21051	NC_004113	ACGA	2	8	1259436	1259443	50 %	0 %	25 %	25 %	22298758
21052	NC_004113	GCA	2	6	1259485	1259490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21053	NC_004113	CAA	2	6	1259504	1259509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298758
21054	NC_004113	GGC	2	6	1259512	1259517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298758
21055	NC_004113	CAG	2	6	1259537	1259542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21056	NC_004113	GCA	2	6	1259566	1259571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21057	NC_004113	GGA	2	6	1259587	1259592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298758
21058	NC_004113	TCT	2	6	1259613	1259618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298758
21059	NC_004113	GCA	2	6	1259721	1259726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21060	NC_004113	CAGC	2	8	1259746	1259753	25 %	0 %	25 %	50 %	22298758
21061	NC_004113	CTG	2	6	1259780	1259785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21062	NC_004113	CT	3	6	1259813	1259818	0 %	50 %	0 %	50 %	22298758
21063	NC_004113	CCT	2	6	1259835	1259840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298758
21064	NC_004113	TCCC	2	8	1259919	1259926	0 %	25 %	0 %	75 %	22298758
21065	NC_004113	CGA	2	6	1259963	1259968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298758
21066	NC_004113	CAT	3	9	1260016	1260024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298758
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21069	NC_004113	C	6	6	1260091	1260096	0 %	0 %	0 %	100 %	22298758
21070	NC_004113	TAT	2	6	1260125	1260130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298758
21071	NC_004113	CCA	2	6	1260145	1260150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298758
21072	NC_004113	GCCG	2	8	1260868	1260875	0 %	0 %	50 %	50 %	22298759
21073	NC_004113	TGG	2	6	1260877	1260882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298759
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21075	NC_004113	TTG	2	6	1261025	1261030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298759
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21078	NC_004113	C	7	7	1261160	1261166	0 %	0 %	0 %	100 %	22298759
21079	NC_004113	CAA	2	6	1261189	1261194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298759
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21082	NC_004113	CCG	2	6	1261386	1261391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298760
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21084	NC_004113	GGTG	2	8	1261576	1261583	0 %	25 %	75 %	0 %	22298760
21085	NC_004113	TTG	2	6	1261649	1261654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298760
21086	NC_004113	GGT	2	6	1261669	1261674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298760
21087	NC_004113	TCTGGC	2	12	1261715	1261726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298760
21088	NC_004113	TTG	2	6	1261734	1261739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298760
21089	NC_004113	CT	3	6	1261755	1261760	0 %	50 %	0 %	50 %	22298760
21090	NC_004113	C	6	6	1262039	1262044	0 %	0 %	0 %	100 %	22298761
21091	NC_004113	GGT	2	6	1262068	1262073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298761
21092	NC_004113	TAC	2	6	1262081	1262086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298761
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21094	NC_004113	AGTG	2	8	1262293	1262300	25 %	25 %	50 %	0 %	22298761
21095	NC_004113	C	6	6	1262331	1262336	0 %	0 %	0 %	100 %	22298761
21096	NC_004113	ATC	2	6	1262357	1262362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298761
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21100	NC_004113	CAC	2	6	1262583	1262588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298762
21101	NC_004113	GCA	2	6	1262643	1262648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298762
21102	NC_004113	ATT	2	6	1262671	1262676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298762
21103	NC_004113	CTA	2	6	1262769	1262774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298762
21104	NC_004113	AAG	2	6	1262789	1262794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298762
21105	NC_004113	ACA	2	6	1262855	1262860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298762
21106	NC_004113	TTG	2	6	1262927	1262932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298762
21107	NC_004113	AAG	2	6	1262939	1262944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298762
21108	NC_004113	TGC	2	6	1262979	1262984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298762
21109	NC_004113	CCG	2	6	1262989	1262994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298762
21110	NC_004113	GAT	2	6	1263016	1263021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298762
21111	NC_004113	TGG	2	6	1263048	1263053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298762
21112	NC_004113	GAT	2	6	1263105	1263110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298762
21113	NC_004113	GAC	2	6	1263192	1263197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298762
21114	NC_004113	CTG	2	6	1263424	1263429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298763
21115	NC_004113	ATT	2	6	1263438	1263443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298763
21116	NC_004113	ATT	2	6	1263504	1263509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298763
21117	NC_004113	GAT	2	6	1263614	1263619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298763
21118	NC_004113	TGG	2	6	1263647	1263652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298763
21119	NC_004113	TGC	2	6	1263718	1263723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298763
21120	NC_004113	AGA	2	6	1263734	1263739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298763
21121	NC_004113	CA	3	6	1263894	1263899	50 %	0 %	0 %	50 %	22298763
21122	NC_004113	CCA	2	6	1264003	1264008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298763
21123	NC_004113	ATT	2	6	1264092	1264097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298763
21124	NC_004113	ACC	2	6	1264101	1264106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298763
21125	NC_004113	AGT	2	6	1264166	1264171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298763
21126	NC_004113	GAT	2	6	1264242	1264247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298763
21127	NC_004113	ATG	2	6	1264266	1264271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298763
21128	NC_004113	ATC	2	6	1264285	1264290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298763
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21130	NC_004113	CT	3	6	1264329	1264334	0 %	50 %	0 %	50 %	22298763
21131	NC_004113	ACA	2	6	1264363	1264368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298763
21132	NC_004113	TC	3	6	1264400	1264405	0 %	50 %	0 %	50 %	22298763
21133	NC_004113	GTG	2	6	1264437	1264442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298763
21134	NC_004113	GATC	2	8	1264448	1264455	25 %	25 %	25 %	25 %	22298763
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21136	NC_004113	ATT	2	6	1264659	1264664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298763
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21138	NC_004113	TGC	2	6	1264771	1264776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298763
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21140	NC_004113	CTGGG	2	10	1264985	1264994	0 %	20 %	60 %	20 %	22298763
21141	NC_004113	ACA	2	6	1265103	1265108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298763
21142	NC_004113	CCG	2	6	1265114	1265119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298763
21143	NC_004113	GCA	2	6	1265125	1265130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298763
21144	NC_004113	GTAGAT	2	12	1265768	1265779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298764
21145	NC_004113	CGC	2	6	1265839	1265844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298764
21146	NC_004113	TGA	2	6	1265848	1265853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298764
21147	NC_004113	GCT	2	6	1265861	1265866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298764
21148	NC_004113	TCGCC	2	10	1265889	1265898	0 %	20 %	20 %	60 %	22298764
21149	NC_004113	TCG	2	6	1265910	1265915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298764
21150	NC_004113	CAAGGG	2	12	1265956	1265967	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22298764
21151	NC_004113	GCC	2	6	1265970	1265975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298764
21152	NC_004113	TGAATC	2	12	1265976	1265987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22298764
21153	NC_004113	AATC	2	8	1266004	1266011	50 %	25 %	0 %	25 %	22298764
21154	NC_004113	CGCC	2	8	1266046	1266053	0 %	0 %	25 %	75 %	22298764
21155	NC_004113	GCC	2	6	1266138	1266143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298764
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21158	NC_004113	GGT	2	6	1266279	1266284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298764
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21160	NC_004113	TAGA	2	8	1266317	1266324	50 %	25 %	25 %	0 %	22298764
21161	NC_004113	GCA	2	6	1266349	1266354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298764
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21165	NC_004113	TGC	2	6	1266612	1266617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298764
21166	NC_004113	TGC	2	6	1266674	1266679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298764
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21168	NC_004113	GA	3	6	1266926	1266931	50 %	0 %	50 %	0 %	22298765
21169	NC_004113	GCC	2	6	1267012	1267017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298765
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21173	NC_004113	GCCAAC	2	12	1267163	1267174	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22298765
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21189	NC_004113	TGG	3	9	1268621	1268629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298767
21190	NC_004113	TGG	3	9	1268711	1268719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298767
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21211	NC_004113	AGCGG	2	10	1269738	1269747	20 %	0 %	60 %	20 %	22298767
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21217	NC_004113	TTGG	2	8	1270062	1270069	0 %	50 %	50 %	0 %	22298767
21218	NC_004113	TGG	2	6	1270073	1270078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298767
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21220	NC_004113	ATC	2	6	1270166	1270171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298767
21221	NC_004113	ACTG	2	8	1270173	1270180	25 %	25 %	25 %	25 %	22298767
21222	NC_004113	A	6	6	1270250	1270255	100 %	0 %	0 %	0 %	22298767
21223	NC_004113	ATG	2	6	1270391	1270396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298767
21224	NC_004113	GAT	2	6	1270486	1270491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298767
21225	NC_004113	CCA	2	6	1270499	1270504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298767
21226	NC_004113	GCT	2	6	1270510	1270515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298767
21227	NC_004113	TTA	2	6	1270556	1270561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298767
21228	NC_004113	CCT	2	6	1270614	1270619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298767
21229	NC_004113	AGG	2	6	1270626	1270631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298767
21230	NC_004113	GCCT	2	8	1270682	1270689	0 %	25 %	25 %	50 %	22298767
21231	NC_004113	GCCCTT	2	12	1270690	1270701	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22298767
21232	NC_004113	G	6	6	1270872	1270877	0 %	0 %	100 %	0 %	22298767
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21353	NC_004113	TTG	2	6	1279272	1279277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298777
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21470	NC_004113	ACG	2	6	1286349	1286354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298783
21471	NC_004113	CGG	2	6	1286443	1286448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298783
21472	NC_004113	GCG	2	6	1286453	1286458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298783
21473	NC_004113	GGC	2	6	1286549	1286554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298783
21474	NC_004113	GAC	2	6	1286582	1286587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298783
21475	NC_004113	GAC	2	6	1286678	1286683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298783
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21480	NC_004113	CGG	2	6	1286853	1286858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298783
21481	NC_004113	GTA	2	6	1287133	1287138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298784
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21485	NC_004113	ATC	2	6	1287355	1287360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298784
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