MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_004113	TGC	3	9	1163919	1163927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298674
19502	NC_004113	TTG	2	6	1163933	1163938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298674
19503	NC_004113	GCC	2	6	1163951	1163956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298674
19504	NC_004113	TTGA	2	8	1163978	1163985	25 %	50 %	25 %	0 %	22298674
19505	NC_004113	TGC	2	6	1164037	1164042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298674
19506	NC_004113	A	6	6	1164044	1164049	100 %	0 %	0 %	0 %	22298674
19507	NC_004113	CCA	2	6	1164266	1164271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
19508	NC_004113	GAG	2	6	1164387	1164392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298675
19509	NC_004113	CAGC	2	8	1164482	1164489	25 %	0 %	25 %	50 %	22298675
19510	NC_004113	CAGTG	2	10	1164542	1164551	20 %	20 %	40 %	20 %	22298675
19511	NC_004113	GT	3	6	1164593	1164598	0 %	50 %	50 %	0 %	22298675
19512	NC_004113	CTC	2	6	1164613	1164618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298675
19513	NC_004113	GCC	3	9	1164633	1164641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298675
19514	NC_004113	GGT	2	6	1164645	1164650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298675
19515	NC_004113	TGC	2	6	1164683	1164688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298675
19516	NC_004113	CCA	2	6	1164689	1164694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
19517	NC_004113	CGG	2	6	1164724	1164729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298675
19518	NC_004113	TGG	2	6	1164812	1164817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298675
19519	NC_004113	ACT	2	6	1165005	1165010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298675
19520	NC_004113	CGG	2	6	1165096	1165101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298675
19521	NC_004113	GGA	2	6	1165167	1165172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298675
19522	NC_004113	TGA	2	6	1165268	1165273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298675
19523	NC_004113	CTG	2	6	1165313	1165318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298675
19524	NC_004113	ACC	2	6	1165333	1165338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
19525	NC_004113	GCC	2	6	1165375	1165380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298675
19526	NC_004113	ACC	2	6	1165424	1165429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
19527	NC_004113	GCT	2	6	1165447	1165452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298675
19528	NC_004113	GCA	2	6	1165530	1165535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298675
19529	NC_004113	GCT	2	6	1165557	1165562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298675
19530	NC_004113	GCC	2	6	1165691	1165696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298675
19531	NC_004113	CCA	2	6	1165697	1165702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
19532	NC_004113	TGT	2	6	1165779	1165784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298675
19533	NC_004113	GCC	2	6	1165794	1165799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298675
19534	NC_004113	CACC	2	8	1165811	1165818	25 %	0 %	0 %	75 %	22298675
19535	NC_004113	C	7	7	1165817	1165823	0 %	0 %	0 %	100 %	22298675
19536	NC_004113	CAC	2	6	1165860	1165865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298675
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19538	NC_004113	CAGCAA	2	12	1166038	1166049	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22298676
19539	NC_004113	AGG	2	6	1166121	1166126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298676
19540	NC_004113	GCT	2	6	1166127	1166132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298676
19541	NC_004113	C	6	6	1166203	1166208	0 %	0 %	0 %	100 %	22298676
19542	NC_004113	GCA	2	6	1166251	1166256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298676
19543	NC_004113	GGCA	2	8	1166320	1166327	25 %	0 %	50 %	25 %	22298676
19544	NC_004113	CGC	2	6	1166335	1166340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298676
19545	NC_004113	CAT	2	6	1166378	1166383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298676
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19548	NC_004113	AGG	2	6	1166729	1166734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298677
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19551	NC_004113	TGA	2	6	1166784	1166789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298677
19552	NC_004113	C	6	6	1166813	1166818	0 %	0 %	0 %	100 %	22298677
19553	NC_004113	GCC	2	6	1166849	1166854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298677
19554	NC_004113	ATCA	2	8	1167010	1167017	50 %	25 %	0 %	25 %	22298677
19555	NC_004113	TGA	2	6	1167029	1167034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298677
19556	NC_004113	TGG	2	6	1167041	1167046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298677
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19559	NC_004113	CTT	2	6	1167253	1167258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298678
19560	NC_004113	C	6	6	1167278	1167283	0 %	0 %	0 %	100 %	22298678
19561	NC_004113	GGT	2	6	1167333	1167338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298678
19562	NC_004113	CGC	2	6	1167365	1167370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298678
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19568	NC_004113	GAG	2	6	1167695	1167700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298678
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19572	NC_004113	GCT	2	6	1168065	1168070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298679
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19586	NC_004113	GCG	2	6	1168944	1168949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298679
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19589	NC_004113	ACC	2	6	1169160	1169165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298680
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19599	NC_004113	ATC	2	6	1169595	1169600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298681
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19602	NC_004113	CAC	2	6	1169943	1169948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298682
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19604	NC_004113	GC	3	6	1170107	1170112	0 %	0 %	50 %	50 %	22298682
19605	NC_004113	CGG	2	6	1170129	1170134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298682
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19608	NC_004113	CCTA	2	8	1170375	1170382	25 %	25 %	0 %	50 %	22298682
19609	NC_004113	GTC	2	6	1170414	1170419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298682
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19616	NC_004113	CG	3	6	1171009	1171014	0 %	0 %	50 %	50 %	22298682
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19972	NC_004113	AGCA	2	8	1192449	1192456	50 %	0 %	25 %	25 %	22298701
19973	NC_004113	TCTGGC	2	12	1192459	1192470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298701
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19975	NC_004113	GGC	2	6	1192654	1192659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298701
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19977	NC_004113	TGT	2	6	1192731	1192736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298701
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19980	NC_004113	AGCC	2	8	1192799	1192806	25 %	0 %	25 %	50 %	22298701
19981	NC_004113	G	7	7	1192871	1192877	0 %	0 %	100 %	0 %	22298701
19982	NC_004113	G	6	6	1192937	1192942	0 %	0 %	100 %	0 %	22298701
19983	NC_004113	TACC	2	8	1193206	1193213	25 %	25 %	0 %	50 %	22298702
19984	NC_004113	GTG	2	6	1193246	1193251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298702
19985	NC_004113	GAG	2	6	1193267	1193272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298702
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19987	NC_004113	T	6	6	1193366	1193371	0 %	100 %	0 %	0 %	22298702
19988	NC_004113	CGC	2	6	1193460	1193465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298702
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19993	NC_004113	GGGGT	2	10	1193675	1193684	0 %	20 %	80 %	0 %	22298702
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19999	NC_004113	TCCTG	2	10	1194043	1194052	0 %	40 %	20 %	40 %	22298702
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