MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_004113	GAT	2	6	1129518	1129523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298639
19002	NC_004113	ACCCC	2	10	1129753	1129762	20 %	0 %	0 %	80 %	22298640
19003	NC_004113	C	6	6	1129759	1129764	0 %	0 %	0 %	100 %	22298640
19004	NC_004113	GCA	2	6	1129769	1129774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640
19005	NC_004113	CAG	2	6	1129818	1129823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640
19006	NC_004113	GAATCG	2	12	1129844	1129855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22298640
19007	NC_004113	CAAT	2	8	1129916	1129923	50 %	25 %	0 %	25 %	22298640
19008	NC_004113	TGA	2	6	1129975	1129980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298640
19009	NC_004113	GGA	2	6	1129991	1129996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298640
19010	NC_004113	AGC	2	6	1130091	1130096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640
19011	NC_004113	AGC	2	6	1130107	1130112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298640
19012	NC_004113	GTA	2	6	1130193	1130198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298640
19013	NC_004113	GAATGC	2	12	1130228	1130239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22298640
19014	NC_004113	TAA	2	6	1130255	1130260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298640
19015	NC_004113	GGCT	2	8	1130379	1130386	0 %	25 %	50 %	25 %	22298640
19016	NC_004113	GGC	2	6	1130478	1130483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298640
19017	NC_004113	ATC	2	6	1130499	1130504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298640
19018	NC_004113	AGATA	2	10	1130528	1130537	60 %	20 %	20 %	0 %	22298640
19019	NC_004113	GGA	2	6	1130570	1130575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298640
19020	NC_004113	G	6	6	1130683	1130688	0 %	0 %	100 %	0 %	22298640
19021	NC_004113	CCTTGT	2	12	1131189	1131200	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22298641
19022	NC_004113	ACA	2	6	1131228	1131233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298641
19023	NC_004113	ATG	2	6	1131256	1131261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298641
19024	NC_004113	GGC	2	6	1131358	1131363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298641
19025	NC_004113	GAT	2	6	1131373	1131378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298641
19026	NC_004113	AC	3	6	1131426	1131431	50 %	0 %	0 %	50 %	22298641
19027	NC_004113	TTA	2	6	1131451	1131456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298641
19028	NC_004113	A	6	6	1131526	1131531	100 %	0 %	0 %	0 %	22298641
19029	NC_004113	G	6	6	1131551	1131556	0 %	0 %	100 %	0 %	22298641
19030	NC_004113	GGT	2	6	1131561	1131566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298641
19031	NC_004113	CTG	2	6	1131586	1131591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298641
19032	NC_004113	GGT	2	6	1131612	1131617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298641
19033	NC_004113	GCA	2	6	1131742	1131747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298641
19034	NC_004113	ACTC	2	8	1131816	1131823	25 %	25 %	0 %	50 %	22298641
19035	NC_004113	GCG	2	6	1131940	1131945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298642
19036	NC_004113	GGT	2	6	1131982	1131987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298642
19037	NC_004113	TGG	2	6	1132006	1132011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298642
19038	NC_004113	GAC	2	6	1132025	1132030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298642
19039	NC_004113	ATCT	2	8	1132253	1132260	25 %	50 %	0 %	25 %	22298642
19040	NC_004113	GCA	2	6	1132392	1132397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298642
19041	NC_004113	C	6	6	1132517	1132522	0 %	0 %	0 %	100 %	22298642
19042	NC_004113	A	6	6	1132602	1132607	100 %	0 %	0 %	0 %	22298642
19043	NC_004113	GAG	2	6	1132625	1132630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298642
19044	NC_004113	GCT	2	6	1132649	1132654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298642
19045	NC_004113	TCA	2	6	1132701	1132706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298642
19046	NC_004113	C	6	6	1132715	1132720	0 %	0 %	0 %	100 %	22298642
19047	NC_004113	CTG	2	6	1132760	1132765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298642
19048	NC_004113	TTC	2	6	1132802	1132807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298642
19049	NC_004113	T	6	6	1132837	1132842	0 %	100 %	0 %	0 %	22298642
19050	NC_004113	GGT	2	6	1132843	1132848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298642
19051	NC_004113	GGTT	2	8	1132915	1132922	0 %	50 %	50 %	0 %	22298642
19052	NC_004113	GCC	2	6	1133091	1133096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298642
19053	NC_004113	AGG	2	6	1133100	1133105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298642
19054	NC_004113	CAC	2	6	1133288	1133293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298643
19055	NC_004113	GGC	2	6	1133297	1133302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298643
19056	NC_004113	ACAA	2	8	1133476	1133483	75 %	0 %	0 %	25 %	22298643
19057	NC_004113	GGT	2	6	1133526	1133531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298643
19058	NC_004113	A	6	6	1133532	1133537	100 %	0 %	0 %	0 %	22298643
19059	NC_004113	AGG	2	6	1133575	1133580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298643
19060	NC_004113	G	6	6	1133590	1133595	0 %	0 %	100 %	0 %	22298643
19061	NC_004113	AAAT	2	8	1133604	1133611	75 %	25 %	0 %	0 %	22298643
19062	NC_004113	GGC	2	6	1133664	1133669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298643
19063	NC_004113	TCC	2	6	1133704	1133709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298643
19064	NC_004113	ACA	2	6	1133804	1133809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298644
19065	NC_004113	CTG	2	6	1133945	1133950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298644
19066	NC_004113	T	6	6	1133975	1133980	0 %	100 %	0 %	0 %	22298644
19067	NC_004113	CAC	2	6	1134156	1134161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298645
19068	NC_004113	TGG	2	6	1134245	1134250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298645
19069	NC_004113	AGA	2	6	1134273	1134278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298645
19070	NC_004113	GCC	2	6	1134280	1134285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298645
19071	NC_004113	TGA	2	6	1134360	1134365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298645
19072	NC_004113	A	6	6	1134411	1134416	100 %	0 %	0 %	0 %	22298645
19073	NC_004113	GGCT	2	8	1134453	1134460	0 %	25 %	50 %	25 %	22298646
19074	NC_004113	TAG	2	6	1134478	1134483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298646
19075	NC_004113	TGGT	2	8	1134489	1134496	0 %	50 %	50 %	0 %	22298646
19076	NC_004113	GGT	2	6	1134572	1134577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298646
19077	NC_004113	TTG	2	6	1134610	1134615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298646
19078	NC_004113	GGT	2	6	1134792	1134797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298646
19079	NC_004113	GCG	2	6	1134800	1134805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298646
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19081	NC_004113	G	6	6	1134841	1134846	0 %	0 %	100 %	0 %	22298646
19082	NC_004113	C	6	6	1134861	1134866	0 %	0 %	0 %	100 %	22298646
19083	NC_004113	GTG	2	6	1134957	1134962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298647
19084	NC_004113	TGA	2	6	1135018	1135023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298647
19085	NC_004113	GA	3	6	1135113	1135118	50 %	0 %	50 %	0 %	22298647
19086	NC_004113	GAG	2	6	1135179	1135184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298647
19087	NC_004113	TTG	2	6	1135188	1135193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
19088	NC_004113	CT	3	6	1135198	1135203	0 %	50 %	0 %	50 %	22298647
19089	NC_004113	TGG	2	6	1135209	1135214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298647
19090	NC_004113	CAG	2	6	1135277	1135282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298647
19091	NC_004113	CCCTT	2	10	1135360	1135369	0 %	40 %	0 %	60 %	22298647
19092	NC_004113	ATT	2	6	1135439	1135444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298647
19093	NC_004113	GGGA	2	8	1135509	1135516	25 %	0 %	75 %	0 %	22298647
19094	NC_004113	TTTA	2	8	1135558	1135565	25 %	75 %	0 %	0 %	22298647
19095	NC_004113	TTG	2	6	1135566	1135571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
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19097	NC_004113	CGTG	2	8	1135675	1135682	0 %	25 %	50 %	25 %	22298647
19098	NC_004113	AAG	2	6	1135710	1135715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298647
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19101	NC_004113	CCA	2	6	1135872	1135877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298647
19102	NC_004113	CTC	2	6	1135887	1135892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298647
19103	NC_004113	CCT	2	6	1135995	1136000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298647
19104	NC_004113	G	7	7	1136002	1136008	0 %	0 %	100 %	0 %	22298647
19105	NC_004113	TGT	2	6	1136053	1136058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298647
19106	NC_004113	TC	3	6	1136139	1136144	0 %	50 %	0 %	50 %	22298647
19107	NC_004113	ATT	2	6	1136195	1136200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298647
19108	NC_004113	AAGCC	2	10	1136206	1136215	40 %	0 %	20 %	40 %	22298647
19109	NC_004113	TGG	2	6	1136367	1136372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298648
19110	NC_004113	TCA	2	6	1136413	1136418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298648
19111	NC_004113	TTGC	2	8	1136569	1136576	0 %	50 %	25 %	25 %	22298648
19112	NC_004113	GC	3	6	1136635	1136640	0 %	0 %	50 %	50 %	22298648
19113	NC_004113	GGC	2	6	1136649	1136654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298648
19114	NC_004113	GCC	2	6	1136670	1136675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298648
19115	NC_004113	GCG	2	6	1136714	1136719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298648
19116	NC_004113	GTT	2	6	1136797	1136802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298648
19117	NC_004113	ATG	2	6	1136880	1136885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298648
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19119	NC_004113	CCA	2	6	1137000	1137005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298649
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19133	NC_004113	G	8	8	1137579	1137586	0 %	0 %	100 %	0 %	22298649
19134	NC_004113	CCCA	2	8	1137694	1137701	25 %	0 %	0 %	75 %	22298649
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19241	NC_004113	GAA	2	6	1144495	1144500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298657
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19352	NC_004113	CTTGGC	2	12	1154694	1154705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298665
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19356	NC_004113	CTT	2	6	1154865	1154870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298665
19357	NC_004113	CAT	2	6	1154886	1154891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298665
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19361	NC_004113	GCTG	2	8	1155104	1155111	0 %	25 %	50 %	25 %	22298665
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19472	NC_004113	GAAG	2	8	1162324	1162331	50 %	0 %	50 %	0 %	22298671
19473	NC_004113	CTG	2	6	1162377	1162382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298671
19474	NC_004113	AGGC	2	8	1162403	1162410	25 %	0 %	50 %	25 %	22298671
19475	NC_004113	GTC	2	6	1162432	1162437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298671
19476	NC_004113	CCTG	2	8	1162486	1162493	0 %	25 %	25 %	50 %	22298672
19477	NC_004113	TGC	3	9	1162512	1162520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298672
19478	NC_004113	TGGC	2	8	1162541	1162548	0 %	25 %	50 %	25 %	22298672
19479	NC_004113	CTG	2	6	1162602	1162607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298672
19480	NC_004113	CTG	2	6	1162619	1162624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298672
19481	NC_004113	GAA	2	6	1162700	1162705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298672
19482	NC_004113	A	6	6	1162752	1162757	100 %	0 %	0 %	0 %	22298672
19483	NC_004113	CTA	2	6	1162876	1162881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298672
19484	NC_004113	TGGCAT	2	12	1162900	1162911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22298672
19485	NC_004113	C	6	6	1162932	1162937	0 %	0 %	0 %	100 %	22298672
19486	NC_004113	CAG	2	6	1162941	1162946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298672
19487	NC_004113	GCA	2	6	1162982	1162987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298672
19488	NC_004113	TAC	2	6	1163037	1163042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298672
19489	NC_004113	TGG	2	6	1163086	1163091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298672
19490	NC_004113	CTG	2	6	1163225	1163230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298673
19491	NC_004113	AGC	2	6	1163383	1163388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298673
19492	NC_004113	AGA	2	6	1163434	1163439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298673
19493	NC_004113	GCC	2	6	1163458	1163463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298673
19494	NC_004113	C	6	6	1163492	1163497	0 %	0 %	0 %	100 %	22298673
19495	NC_004113	TGAT	2	8	1163523	1163530	25 %	50 %	25 %	0 %	22298673
19496	NC_004113	GGT	3	9	1163599	1163607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298673
19497	NC_004113	G	6	6	1163614	1163619	0 %	0 %	100 %	0 %	22298673
19498	NC_004113	TGC	3	9	1163659	1163667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298673
19499	NC_004113	A	6	6	1163828	1163833	100 %	0 %	0 %	0 %	22298674
19500	NC_004113	ACA	2	6	1163898	1163903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298674

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