MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_004113	A	6	6	1100850	1100855	100 %	0 %	0 %	0 %	22298607
18502	NC_004113	TGAT	2	8	1101163	1101170	25 %	50 %	25 %	0 %	22298608
18503	NC_004113	GCTG	2	8	1101176	1101183	0 %	25 %	50 %	25 %	22298608
18504	NC_004113	TGC	2	6	1101308	1101313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298608
18505	NC_004113	TGG	2	6	1101328	1101333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298608
18506	NC_004113	GCT	2	6	1101356	1101361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298608
18507	NC_004113	CAG	2	6	1101426	1101431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298608
18508	NC_004113	ACG	2	6	1101470	1101475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298608
18509	NC_004113	TAG	2	6	1101500	1101505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298608
18510	NC_004113	CCT	2	6	1101527	1101532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298608
18511	NC_004113	TGG	2	6	1101538	1101543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298608
18512	NC_004113	ATT	2	6	1101570	1101575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298608
18513	NC_004113	C	7	7	1101596	1101602	0 %	0 %	0 %	100 %	22298608
18514	NC_004113	G	6	6	1101659	1101664	0 %	0 %	100 %	0 %	22298608
18515	NC_004113	GTGA	2	8	1101742	1101749	25 %	25 %	50 %	0 %	22298609
18516	NC_004113	GTTG	2	8	1101854	1101861	0 %	50 %	50 %	0 %	22298609
18517	NC_004113	CTC	2	6	1101898	1101903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298609
18518	NC_004113	ACC	2	6	1102043	1102048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298609
18519	NC_004113	C	6	6	1102169	1102174	0 %	0 %	0 %	100 %	22298609
18520	NC_004113	GCCA	2	8	1102197	1102204	25 %	0 %	25 %	50 %	22298609
18521	NC_004113	GGT	2	6	1102212	1102217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298609
18522	NC_004113	GAA	2	6	1102232	1102237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298609
18523	NC_004113	C	6	6	1102249	1102254	0 %	0 %	0 %	100 %	22298609
18524	NC_004113	GCT	2	6	1102260	1102265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298609
18525	NC_004113	CAG	2	6	1102578	1102583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298610
18526	NC_004113	CCGATG	2	12	1102592	1102603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298610
18527	NC_004113	C	7	7	1102676	1102682	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18528	NC_004113	GAA	2	6	1102686	1102691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298610
18529	NC_004113	AGCCCC	2	12	1102692	1102703	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22298610
18530	NC_004113	C	6	6	1102700	1102705	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18531	NC_004113	A	6	6	1102706	1102711	100 %	0 %	0 %	0 %	22298610
18532	NC_004113	GCA	2	6	1102713	1102718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298610
18533	NC_004113	TTG	2	6	1102721	1102726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298610
18534	NC_004113	ACC	2	6	1102803	1102808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298610
18535	NC_004113	C	7	7	1102829	1102835	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18536	NC_004113	C	6	6	1102888	1102893	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18537	NC_004113	CACC	2	8	1102943	1102950	25 %	0 %	0 %	75 %	22298610
18538	NC_004113	AAGA	2	8	1102960	1102967	75 %	0 %	25 %	0 %	22298610
18539	NC_004113	C	6	6	1103014	1103019	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18540	NC_004113	A	6	6	1103020	1103025	100 %	0 %	0 %	0 %	22298610
18541	NC_004113	GCC	2	6	1103044	1103049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
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18543	NC_004113	ACC	2	6	1103154	1103159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298610
18544	NC_004113	C	6	6	1103158	1103163	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18545	NC_004113	TCA	2	6	1103243	1103248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298610
18546	NC_004113	TGA	2	6	1103274	1103279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298610
18547	NC_004113	AG	3	6	1103283	1103288	50 %	0 %	50 %	0 %	22298610
18548	NC_004113	TCC	2	6	1103299	1103304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298610
18549	NC_004113	GTC	2	6	1103308	1103313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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18552	NC_004113	C	6	6	1103419	1103424	0 %	0 %	0 %	100 %	22298610
18553	NC_004113	GCCC	2	8	1103446	1103453	0 %	0 %	25 %	75 %	22298610
18554	NC_004113	A	6	6	1103477	1103482	100 %	0 %	0 %	0 %	22298610
18555	NC_004113	A	6	6	1103491	1103496	100 %	0 %	0 %	0 %	22298610
18556	NC_004113	GAA	2	6	1103524	1103529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298610
18557	NC_004113	CT	3	6	1103633	1103638	0 %	50 %	0 %	50 %	22298610
18558	NC_004113	GCC	2	6	1103653	1103658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298610
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18565	NC_004113	TCG	2	6	1104047	1104052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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18572	NC_004113	TGG	2	6	1104437	1104442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298610
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18574	NC_004113	GCA	2	6	1104502	1104507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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18584	NC_004113	GGC	2	6	1104822	1104827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298610
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18587	NC_004113	TCA	2	6	1104881	1104886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298610
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18589	NC_004113	GCG	2	6	1104925	1104930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298610
18590	NC_004113	AGC	2	6	1104932	1104937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298610
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18592	NC_004113	TGA	2	6	1104981	1104986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298610
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18601	NC_004113	AAACT	2	10	1105338	1105347	60 %	20 %	0 %	20 %	22298610
18602	NC_004113	CGT	2	6	1105420	1105425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298611
18603	NC_004113	GCGATC	2	12	1105459	1105470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298611
18604	NC_004113	TGG	2	6	1105605	1105610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298611
18605	NC_004113	T	6	6	1105622	1105627	0 %	100 %	0 %	0 %	22298611
18606	NC_004113	TGA	2	6	1105635	1105640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298611
18607	NC_004113	AGTT	2	8	1105649	1105656	25 %	50 %	25 %	0 %	22298611
18608	NC_004113	CTG	2	6	1105742	1105747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298611
18609	NC_004113	TAT	2	6	1105834	1105839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298611
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18611	NC_004113	T	6	6	1106026	1106031	0 %	100 %	0 %	0 %	22298611
18612	NC_004113	TTG	2	6	1106039	1106044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298611
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18617	NC_004113	AAC	2	6	1106164	1106169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298611
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18854	NC_004113	AGC	2	6	1119685	1119690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298629
18855	NC_004113	AGC	2	6	1119697	1119702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298629
18856	NC_004113	GAG	2	6	1119711	1119716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298629
18857	NC_004113	AGAT	2	8	1119742	1119749	50 %	25 %	25 %	0 %	22298629
18858	NC_004113	TCG	2	6	1119759	1119764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298629
18859	NC_004113	CTT	2	6	1119787	1119792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298629
18860	NC_004113	G	6	6	1119812	1119817	0 %	0 %	100 %	0 %	22298629
18861	NC_004113	CCT	2	6	1119926	1119931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298629
18862	NC_004113	CAGGTG	2	12	1119963	1119974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	22298629
18863	NC_004113	TGGC	2	8	1120003	1120010	0 %	25 %	50 %	25 %	22298629
18864	NC_004113	GGC	2	6	1120026	1120031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298629
18865	NC_004113	CGC	2	6	1120049	1120054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298629
18866	NC_004113	ACC	2	6	1120155	1120160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298630
18867	NC_004113	CA	3	6	1120277	1120282	50 %	0 %	0 %	50 %	22298630
18868	NC_004113	CAG	2	6	1120474	1120479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298630
18869	NC_004113	CATT	2	8	1120502	1120509	25 %	50 %	0 %	25 %	22298630
18870	NC_004113	GTC	2	6	1120510	1120515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298630
18871	NC_004113	ATC	2	6	1120516	1120521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298630
18872	NC_004113	GTT	2	6	1120669	1120674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298631
18873	NC_004113	TGA	2	6	1120775	1120780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298631
18874	NC_004113	AGC	2	6	1120895	1120900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298631
18875	NC_004113	GC	3	6	1120905	1120910	0 %	0 %	50 %	50 %	22298631
18876	NC_004113	GAC	2	6	1121119	1121124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298632
18877	NC_004113	GATCGC	2	12	1121147	1121158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298632
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18879	NC_004113	C	6	6	1121376	1121381	0 %	0 %	0 %	100 %	22298632
18880	NC_004113	GTG	2	6	1121390	1121395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298632
18881	NC_004113	CAG	3	9	1121450	1121458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298632
18882	NC_004113	GAT	2	6	1121612	1121617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298632
18883	NC_004113	CTG	2	6	1121639	1121644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298632
18884	NC_004113	CTA	2	6	1121662	1121667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298632
18885	NC_004113	TC	3	6	1121701	1121706	0 %	50 %	0 %	50 %	22298632
18886	NC_004113	GCC	2	6	1121731	1121736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298632
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18888	NC_004113	CAT	2	6	1121777	1121782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298632
18889	NC_004113	GCC	2	6	1121834	1121839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298632
18890	NC_004113	TGC	2	6	1121860	1121865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298632
18891	NC_004113	GTG	2	6	1121927	1121932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298632
18892	NC_004113	A	6	6	1121937	1121942	100 %	0 %	0 %	0 %	22298632
18893	NC_004113	ATT	2	6	1122002	1122007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298632
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18910	NC_004113	TCCG	2	8	1122896	1122903	0 %	25 %	25 %	50 %	22298633
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18913	NC_004113	TGT	2	6	1122969	1122974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298633
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18927	NC_004113	TGA	2	6	1124706	1124711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298634
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18944	NC_004113	CAT	2	6	1125939	1125944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298634
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18946	NC_004113	ATG	2	6	1126064	1126069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298634
18947	NC_004113	CGG	2	6	1126079	1126084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298634
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18953	NC_004113	TGC	2	6	1126599	1126604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298635
18954	NC_004113	GCA	2	6	1126609	1126614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298635
18955	NC_004113	GCT	2	6	1126796	1126801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298635
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18957	NC_004113	CGC	2	6	1126947	1126952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298635
18958	NC_004113	AGCT	2	8	1126995	1127002	25 %	25 %	25 %	25 %	22298635
18959	NC_004113	AGC	2	6	1127239	1127244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298636
18960	NC_004113	AACG	2	8	1127278	1127285	50 %	0 %	25 %	25 %	22298636
18961	NC_004113	AAAT	2	8	1127394	1127401	75 %	25 %	0 %	0 %	22298636
18962	NC_004113	GCT	2	6	1127407	1127412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298636
18963	NC_004113	TGA	2	6	1127462	1127467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298636
18964	NC_004113	AAAGCG	2	12	1127601	1127612	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22298636
18965	NC_004113	TGCC	2	8	1127672	1127679	0 %	25 %	25 %	50 %	22298636
18966	NC_004113	ACT	2	6	1127716	1127721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298636
18967	NC_004113	TCC	2	6	1127724	1127729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298637
18968	NC_004113	TTG	2	6	1127765	1127770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298637
18969	NC_004113	CG	3	6	1127777	1127782	0 %	0 %	50 %	50 %	22298637
18970	NC_004113	TCA	2	6	1127890	1127895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298637
18971	NC_004113	CCA	2	6	1127911	1127916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298637
18972	NC_004113	CTG	2	6	1127968	1127973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298637
18973	NC_004113	ATCGCG	2	12	1127979	1127990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298637
18974	NC_004113	TGA	2	6	1128019	1128024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298637
18975	NC_004113	CTG	2	6	1128035	1128040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298637
18976	NC_004113	AATC	2	8	1128064	1128071	50 %	25 %	0 %	25 %	22298637
18977	NC_004113	AGG	2	6	1128082	1128087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298637
18978	NC_004113	CTG	2	6	1128167	1128172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298637
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18980	NC_004113	ATT	2	6	1128408	1128413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298638
18981	NC_004113	AGC	2	6	1128433	1128438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298638
18982	NC_004113	CCG	3	9	1128440	1128448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298638
18983	NC_004113	CCGC	2	8	1128491	1128498	0 %	0 %	25 %	75 %	22298638
18984	NC_004113	AGGG	2	8	1128506	1128513	25 %	0 %	75 %	0 %	22298638
18985	NC_004113	GCC	2	6	1128538	1128543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298638
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18991	NC_004113	TCAA	2	8	1128754	1128761	50 %	25 %	0 %	25 %	22298639
18992	NC_004113	CAA	2	6	1128807	1128812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298639
18993	NC_004113	CAC	2	6	1128849	1128854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298639
18994	NC_004113	GC	3	6	1129026	1129031	0 %	0 %	50 %	50 %	22298639
18995	NC_004113	CGT	2	6	1129242	1129247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298639
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18999	NC_004113	GGC	2	6	1129494	1129499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298639
19000	NC_004113	CGG	2	6	1129510	1129515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298639

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