MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_004113	ATTT	2	8	1040446	1040453	25 %	75 %	0 %	0 %	22298558
17502	NC_004113	ATTC	2	8	1040538	1040545	25 %	50 %	0 %	25 %	22298558
17503	NC_004113	GAT	2	6	1040569	1040574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298558
17504	NC_004113	CAA	2	6	1040588	1040593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298558
17505	NC_004113	GAG	2	6	1040716	1040721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298558
17506	NC_004113	AAGTG	2	10	1040780	1040789	40 %	20 %	40 %	0 %	22298558
17507	NC_004113	CAG	2	6	1040812	1040817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298558
17508	NC_004113	CAC	2	6	1040915	1040920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298558
17509	NC_004113	CAT	2	6	1041103	1041108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298558
17510	NC_004113	CCA	2	6	1041231	1041236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298558
17511	NC_004113	AGGC	2	8	1041242	1041249	25 %	0 %	50 %	25 %	22298558
17512	NC_004113	AC	3	6	1041275	1041280	50 %	0 %	0 %	50 %	22298558
17513	NC_004113	G	6	6	1041309	1041314	0 %	0 %	100 %	0 %	22298558
17514	NC_004113	C	6	6	1041376	1041381	0 %	0 %	0 %	100 %	22298558
17515	NC_004113	CTG	3	9	1041483	1041491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298558
17516	NC_004113	AT	3	6	1041589	1041594	50 %	50 %	0 %	0 %	22298558
17517	NC_004113	AAAT	2	8	1041604	1041611	75 %	25 %	0 %	0 %	22298558
17518	NC_004113	T	6	6	1041675	1041680	0 %	100 %	0 %	0 %	22298558
17519	NC_004113	GAT	2	6	1041737	1041742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298558
17520	NC_004113	TAGA	2	8	1041755	1041762	50 %	25 %	25 %	0 %	22298558
17521	NC_004113	GAATAG	2	12	1041779	1041790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22298558
17522	NC_004113	CAA	2	6	1041806	1041811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298558
17523	NC_004113	TGAT	2	8	1041838	1041845	25 %	50 %	25 %	0 %	22298558
17524	NC_004113	AAT	2	6	1041875	1041880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298558
17525	NC_004113	AATC	2	8	1041941	1041948	50 %	25 %	0 %	25 %	22298559
17526	NC_004113	TAA	2	6	1041959	1041964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298559
17527	NC_004113	A	6	6	1041983	1041988	100 %	0 %	0 %	0 %	22298559
17528	NC_004113	AGA	2	6	1042017	1042022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298559
17529	NC_004113	GTATT	2	10	1042053	1042062	20 %	60 %	20 %	0 %	22298559
17530	NC_004113	TAA	2	6	1042146	1042151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298559
17531	NC_004113	AGT	2	6	1042211	1042216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298559
17532	NC_004113	ATG	2	6	1042235	1042240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298559
17533	NC_004113	CTC	2	6	1042249	1042254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298559
17534	NC_004113	TGA	2	6	1042264	1042269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298559
17535	NC_004113	T	6	6	1042274	1042279	0 %	100 %	0 %	0 %	22298559
17536	NC_004113	AGC	2	6	1042322	1042327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298559
17537	NC_004113	TTGT	2	8	1042331	1042338	0 %	75 %	25 %	0 %	22298559
17538	NC_004113	ATC	2	6	1042367	1042372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298559
17539	NC_004113	CTCA	2	8	1042451	1042458	25 %	25 %	0 %	50 %	22298559
17540	NC_004113	TGA	2	6	1042489	1042494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298559
17541	NC_004113	ATCA	2	8	1042523	1042530	50 %	25 %	0 %	25 %	22298559
17542	NC_004113	AGCCAC	2	12	1042763	1042774	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22298560
17543	NC_004113	CATTT	2	10	1042903	1042912	20 %	60 %	0 %	20 %	22298560
17544	NC_004113	CAA	2	6	1043197	1043202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298561
17545	NC_004113	GC	3	6	1043280	1043285	0 %	0 %	50 %	50 %	22298561
17546	NC_004113	CCCG	2	8	1043306	1043313	0 %	0 %	25 %	75 %	22298561
17547	NC_004113	ACG	2	6	1043326	1043331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298561
17548	NC_004113	TGC	2	6	1043381	1043386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298561
17549	NC_004113	TGA	2	6	1043391	1043396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298561
17550	NC_004113	CTGC	2	8	1043457	1043464	0 %	25 %	25 %	50 %	22298561
17551	NC_004113	CAC	2	6	1043535	1043540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298561
17552	NC_004113	GAG	2	6	1043611	1043616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298561
17553	NC_004113	GAG	2	6	1043680	1043685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298561
17554	NC_004113	GTG	2	6	1043743	1043748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298561
17555	NC_004113	CTGA	2	8	1043758	1043765	25 %	25 %	25 %	25 %	22298561
17556	NC_004113	ACCG	2	8	1043782	1043789	25 %	0 %	25 %	50 %	22298561
17557	NC_004113	TCC	2	6	1043794	1043799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298561
17558	NC_004113	TGG	2	6	1043906	1043911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298561
17559	NC_004113	GC	3	6	1043943	1043948	0 %	0 %	50 %	50 %	22298561
17560	NC_004113	TGG	2	6	1044067	1044072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298561
17561	NC_004113	ATG	2	6	1044141	1044146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298562
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17564	NC_004113	CCT	2	6	1044286	1044291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298562
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17568	NC_004113	GCTC	2	8	1044629	1044636	0 %	25 %	25 %	50 %	22298563
17569	NC_004113	GGAGG	2	10	1044844	1044853	20 %	0 %	80 %	0 %	22298563
17570	NC_004113	ATA	2	6	1044875	1044880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298563
17571	NC_004113	ACG	2	6	1044887	1044892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298563
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17573	NC_004113	AGGC	2	8	1044946	1044953	25 %	0 %	50 %	25 %	22298563
17574	NC_004113	CAG	2	6	1045058	1045063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298564
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17576	NC_004113	CTG	2	6	1045106	1045111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298564
17577	NC_004113	TGC	2	6	1045157	1045162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298564
17578	NC_004113	CAGGGG	2	12	1045207	1045218	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	22298564
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17583	NC_004113	CTGC	2	8	1045585	1045592	0 %	25 %	25 %	50 %	22298564
17584	NC_004113	G	6	6	1045667	1045672	0 %	0 %	100 %	0 %	22298564
17585	NC_004113	C	6	6	1045815	1045820	0 %	0 %	0 %	100 %	22298564
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17587	NC_004113	GAG	2	6	1045919	1045924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298564
17588	NC_004113	T	6	6	1045934	1045939	0 %	100 %	0 %	0 %	22298564
17589	NC_004113	GGT	2	6	1045952	1045957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298564
17590	NC_004113	C	6	6	1045965	1045970	0 %	0 %	0 %	100 %	22298564
17591	NC_004113	TCA	2	6	1046023	1046028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298564
17592	NC_004113	GAG	3	9	1046039	1046047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298564
17593	NC_004113	AGGCG	2	10	1046068	1046077	20 %	0 %	60 %	20 %	22298564
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17600	NC_004113	GAG	2	6	1046528	1046533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298564
17601	NC_004113	TTGA	2	8	1046537	1046544	25 %	50 %	25 %	0 %	22298564
17602	NC_004113	CTC	2	6	1046579	1046584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298564
17603	NC_004113	TCA	2	6	1046593	1046598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298564
17604	NC_004113	ATG	2	6	1046631	1046636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298564
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17606	NC_004113	TCC	2	6	1046682	1046687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298564
17607	NC_004113	TGCT	2	8	1046693	1046700	0 %	50 %	25 %	25 %	22298564
17608	NC_004113	GCA	2	6	1046848	1046853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298564
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