MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004113	GCT	2	6	1009830	1009835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298528
17002	NC_004113	TTGGC	2	10	1009855	1009864	0 %	40 %	40 %	20 %	22298528
17003	NC_004113	GGCT	2	8	1009977	1009984	0 %	25 %	50 %	25 %	22298528
17004	NC_004113	C	6	6	1010046	1010051	0 %	0 %	0 %	100 %	22298528
17005	NC_004113	GA	3	6	1010100	1010105	50 %	0 %	50 %	0 %	22298528
17006	NC_004113	GAT	2	6	1010237	1010242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298528
17007	NC_004113	AGC	2	6	1010244	1010249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298528
17008	NC_004113	CTAT	2	8	1010680	1010687	25 %	50 %	0 %	25 %	22298529
17009	NC_004113	C	7	7	1010721	1010727	0 %	0 %	0 %	100 %	22298529
17010	NC_004113	GAC	2	6	1010740	1010745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298529
17011	NC_004113	TCA	2	6	1010761	1010766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298529
17012	NC_004113	C	6	6	1010860	1010865	0 %	0 %	0 %	100 %	22298529
17013	NC_004113	C	6	6	1010874	1010879	0 %	0 %	0 %	100 %	22298529
17014	NC_004113	CAAGGG	2	12	1010920	1010931	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	22298529
17015	NC_004113	GCG	2	6	1010983	1010988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298529
17016	NC_004113	CCA	2	6	1011019	1011024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298529
17017	NC_004113	GTG	2	6	1011069	1011074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298529
17018	NC_004113	CCAA	2	8	1011085	1011092	50 %	0 %	0 %	50 %	22298529
17019	NC_004113	GGC	2	6	1011119	1011124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298529
17020	NC_004113	CCAC	2	8	1011168	1011175	25 %	0 %	0 %	75 %	22298529
17021	NC_004113	CAC	2	6	1011185	1011190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298529
17022	NC_004113	ATCA	2	8	1011194	1011201	50 %	25 %	0 %	25 %	22298529
17023	NC_004113	ACC	2	6	1011209	1011214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298529
17024	NC_004113	GGC	2	6	1011215	1011220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298529
17025	NC_004113	AGC	2	6	1011429	1011434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298529
17026	NC_004113	G	7	7	1011506	1011512	0 %	0 %	100 %	0 %	22298529
17027	NC_004113	GAG	2	6	1011527	1011532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298529
17028	NC_004113	CCG	2	6	1011562	1011567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298529
17029	NC_004113	CCA	2	6	1011610	1011615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298529
17030	NC_004113	CCG	2	6	1011679	1011684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298529
17031	NC_004113	C	6	6	1011738	1011743	0 %	0 %	0 %	100 %	22298529
17032	NC_004113	AGG	2	6	1011804	1011809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298529
17033	NC_004113	GA	3	6	1011833	1011838	50 %	0 %	50 %	0 %	22298529
17034	NC_004113	TCA	2	6	1011859	1011864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298529
17035	NC_004113	CTT	2	6	1011882	1011887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298530
17036	NC_004113	TGC	2	6	1011914	1011919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17037	NC_004113	CGA	2	6	1011932	1011937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17038	NC_004113	T	6	6	1011940	1011945	0 %	100 %	0 %	0 %	22298530
17039	NC_004113	GCT	2	6	1011969	1011974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17040	NC_004113	CAG	2	6	1012103	1012108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17041	NC_004113	GCC	2	6	1012187	1012192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298530
17042	NC_004113	G	6	6	1012207	1012212	0 %	0 %	100 %	0 %	22298530
17043	NC_004113	GGTT	2	8	1012220	1012227	0 %	50 %	50 %	0 %	22298530
17044	NC_004113	C	6	6	1012253	1012258	0 %	0 %	0 %	100 %	22298530
17045	NC_004113	CGTGT	2	10	1012286	1012295	0 %	40 %	40 %	20 %	22298530
17046	NC_004113	TCC	2	6	1012340	1012345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298530
17047	NC_004113	GAC	2	6	1012399	1012404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17048	NC_004113	TTG	2	6	1012412	1012417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298530
17049	NC_004113	TGC	2	6	1012490	1012495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17050	NC_004113	CTG	2	6	1012510	1012515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17051	NC_004113	ACC	2	6	1012553	1012558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298530
17052	NC_004113	CGG	2	6	1012581	1012586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298530
17053	NC_004113	TGGA	2	8	1012606	1012613	25 %	25 %	50 %	0 %	22298530
17054	NC_004113	G	6	6	1012622	1012627	0 %	0 %	100 %	0 %	22298530
17055	NC_004113	AGC	2	6	1012643	1012648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298530
17056	NC_004113	ATTG	2	8	1012686	1012693	25 %	50 %	25 %	0 %	22298530
17057	NC_004113	C	6	6	1012719	1012724	0 %	0 %	0 %	100 %	22298530
17058	NC_004113	CAC	3	9	1012750	1012758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298530
17059	NC_004113	CA	3	6	1012768	1012773	50 %	0 %	0 %	50 %	22298530
17060	NC_004113	TCT	2	6	1012788	1012793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298530
17061	NC_004113	GCG	2	6	1012804	1012809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298530
17062	NC_004113	CCA	2	6	1012893	1012898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298530
17063	NC_004113	GCT	2	6	1013039	1013044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298531
17064	NC_004113	G	7	7	1013045	1013051	0 %	0 %	100 %	0 %	22298531
17065	NC_004113	AGGGC	2	10	1013091	1013100	20 %	0 %	60 %	20 %	22298531
17066	NC_004113	ACC	2	6	1013170	1013175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298532
17067	NC_004113	A	7	7	1013418	1013424	100 %	0 %	0 %	0 %	22298532
17068	NC_004113	GCT	2	6	1013437	1013442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298532
17069	NC_004113	CCG	2	6	1013475	1013480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298532
17070	NC_004113	GATA	2	8	1013552	1013559	50 %	25 %	25 %	0 %	22298532
17071	NC_004113	C	6	6	1013628	1013633	0 %	0 %	0 %	100 %	22298532
17072	NC_004113	ACC	2	6	1013647	1013652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298532
17073	NC_004113	CT	3	6	1013668	1013673	0 %	50 %	0 %	50 %	22298532
17074	NC_004113	GAC	2	6	1013694	1013699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298532
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17076	NC_004113	GGA	2	6	1013849	1013854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298532
17077	NC_004113	CGCC	2	8	1013870	1013877	0 %	0 %	25 %	75 %	22298532
17078	NC_004113	ACC	2	6	1013935	1013940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298532
17079	NC_004113	A	6	6	1013943	1013948	100 %	0 %	0 %	0 %	22298532
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17084	NC_004113	TTCA	2	8	1014516	1014523	25 %	50 %	0 %	25 %	22298533
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17086	NC_004113	CCACA	2	10	1014698	1014707	40 %	0 %	0 %	60 %	22298533
17087	NC_004113	CCAA	2	8	1014818	1014825	50 %	0 %	0 %	50 %	22298533
17088	NC_004113	CAT	2	6	1014828	1014833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298533
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17090	NC_004113	GT	3	6	1014869	1014874	0 %	50 %	50 %	0 %	22298533
17091	NC_004113	CTG	2	6	1014906	1014911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298533
17092	NC_004113	AGG	2	6	1014949	1014954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298533
17093	NC_004113	TTTG	2	8	1014992	1014999	0 %	75 %	25 %	0 %	22298533
17094	NC_004113	GCA	2	6	1015020	1015025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298533
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17096	NC_004113	AGA	2	6	1015292	1015297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298533
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17101	NC_004113	AAT	2	6	1015728	1015733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298533
17102	NC_004113	CCGACC	2	12	1015734	1015745	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22298533
17103	NC_004113	GCG	2	6	1015788	1015793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298533
17104	NC_004113	GT	3	6	1015802	1015807	0 %	50 %	50 %	0 %	22298533
17105	NC_004113	CAT	2	6	1015823	1015828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298533
17106	NC_004113	CCA	2	6	1015907	1015912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298533
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17108	NC_004113	CGAT	2	8	1015990	1015997	25 %	25 %	25 %	25 %	22298533
17109	NC_004113	GGTG	2	8	1016005	1016012	0 %	25 %	75 %	0 %	22298533
17110	NC_004113	AGGC	2	8	1016028	1016035	25 %	0 %	50 %	25 %	22298533
17111	NC_004113	AGGA	2	8	1016131	1016138	50 %	0 %	50 %	0 %	22298533
17112	NC_004113	TGAA	2	8	1016170	1016177	50 %	25 %	25 %	0 %	22298533
17113	NC_004113	GTGTA	2	10	1016255	1016264	20 %	40 %	40 %	0 %	22298533
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17118	NC_004113	ACC	2	6	1016820	1016825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298534
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17120	NC_004113	AAG	2	6	1016880	1016885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298534
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17233	NC_004113	ACCA	2	8	1024119	1024126	50 %	0 %	0 %	50 %	22298541
17234	NC_004113	GAAG	2	8	1024211	1024218	50 %	0 %	50 %	0 %	22298541
17235	NC_004113	CA	3	6	1024349	1024354	50 %	0 %	0 %	50 %	22298541
17236	NC_004113	AACCCC	2	12	1024402	1024413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298541
17237	NC_004113	GCCCTA	2	12	1024503	1024514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22298541
17238	NC_004113	G	7	7	1024668	1024674	0 %	0 %	100 %	0 %	22298542
17239	NC_004113	TCA	2	6	1024698	1024703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298542
17240	NC_004113	GAA	2	6	1024771	1024776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298542
17241	NC_004113	CGA	2	6	1024843	1024848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298542
17242	NC_004113	ATC	2	6	1024868	1024873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298542
17243	NC_004113	GGC	2	6	1024919	1024924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298542
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17245	NC_004113	T	6	6	1025232	1025237	0 %	100 %	0 %	0 %	22298543
17246	NC_004113	CTT	2	6	1025288	1025293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298543
17247	NC_004113	TGC	2	6	1025298	1025303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298543
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17250	NC_004113	GCA	3	9	1025785	1025793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298544
17251	NC_004113	GAA	2	6	1025863	1025868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298544
17252	NC_004113	ATG	2	6	1025903	1025908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298544
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17254	NC_004113	GAA	3	9	1025931	1025939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298544
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17256	NC_004113	ATC	2	6	1026028	1026033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298544
17257	NC_004113	ACTA	2	8	1026043	1026050	50 %	25 %	0 %	25 %	22298544
17258	NC_004113	TCG	2	6	1026080	1026085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298544
17259	NC_004113	ACC	2	6	1026092	1026097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298544
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17261	NC_004113	AGC	2	6	1026344	1026349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298544
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17266	NC_004113	GAC	2	6	1026505	1026510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298544
17267	NC_004113	GGC	2	6	1026723	1026728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298545
17268	NC_004113	TTG	2	6	1026797	1026802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298545
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17275	NC_004113	CAAT	2	8	1026975	1026982	50 %	25 %	0 %	25 %	22298546
17276	NC_004113	TCA	2	6	1027065	1027070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298546
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17304	NC_004113	CTG	3	9	1028826	1028834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298547
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17307	NC_004113	G	7	7	1029112	1029118	0 %	0 %	100 %	0 %	22298548
17308	NC_004113	CTTT	2	8	1029129	1029136	0 %	75 %	0 %	25 %	22298548
17309	NC_004113	CTAT	2	8	1029139	1029146	25 %	50 %	0 %	25 %	22298548
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17340	NC_004113	TGA	2	6	1030693	1030698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298549
17341	NC_004113	CT	3	6	1030704	1030709	0 %	50 %	0 %	50 %	22298549
17342	NC_004113	CAGC	2	8	1030754	1030761	25 %	0 %	25 %	50 %	22298549
17343	NC_004113	G	7	7	1030762	1030768	0 %	0 %	100 %	0 %	22298549
17344	NC_004113	CAG	2	6	1030848	1030853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298549
17345	NC_004113	A	6	6	1030861	1030866	100 %	0 %	0 %	0 %	22298549
17346	NC_004113	T	6	6	1031040	1031045	0 %	100 %	0 %	0 %	22298549
17347	NC_004113	C	6	6	1031089	1031094	0 %	0 %	0 %	100 %	22298549
17348	NC_004113	CTG	2	6	1031118	1031123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298549
17349	NC_004113	GT	3	6	1031130	1031135	0 %	50 %	50 %	0 %	22298549
17350	NC_004113	GGCT	2	8	1031178	1031185	0 %	25 %	50 %	25 %	22298549
17351	NC_004113	GTC	2	6	1031242	1031247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298549
17352	NC_004113	TCA	2	6	1031275	1031280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298549
17353	NC_004113	CTC	2	6	1031310	1031315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298549
17354	NC_004113	AGC	2	6	1031384	1031389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298549
17355	NC_004113	TCA	2	6	1031552	1031557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298549
17356	NC_004113	CCAA	2	8	1031670	1031677	50 %	0 %	0 %	50 %	22298549
17357	NC_004113	TGG	2	6	1031701	1031706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298549
17358	NC_004113	CAGC	2	8	1031798	1031805	25 %	0 %	25 %	50 %	22298549
17359	NC_004113	ACG	2	6	1031933	1031938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298549
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17362	NC_004113	GTG	2	6	1032029	1032034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298549
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17367	NC_004113	TGG	2	6	1032245	1032250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298550
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17370	NC_004113	TGA	2	6	1032298	1032303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298550
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17375	NC_004113	GCT	2	6	1032737	1032742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298550
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17377	NC_004113	GGA	2	6	1032894	1032899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298551
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17386	NC_004113	GCAA	2	8	1033499	1033506	50 %	0 %	25 %	25 %	22298551
17387	NC_004113	TGC	2	6	1033720	1033725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298551
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17392	NC_004113	ATC	2	6	1033999	1034004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298551
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17463	NC_004113	CCAA	2	8	1037952	1037959	50 %	0 %	0 %	50 %	22298553
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17471	NC_004113	T	6	6	1038523	1038528	0 %	100 %	0 %	0 %	22298554
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17478	NC_004113	GA	3	6	1038850	1038855	50 %	0 %	50 %	0 %	22298555
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