MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_004113	CGGTG	2	10	982443	982452	0 %	20 %	60 %	20 %	22298503
16502	NC_004113	TGC	2	6	982457	982462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298503
16503	NC_004113	C	6	6	982483	982488	0 %	0 %	0 %	100 %	22298503
16504	NC_004113	GAG	2	6	982501	982506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298503
16505	NC_004113	TAC	2	6	982531	982536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298503
16506	NC_004113	ATT	2	6	982564	982569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298503
16507	NC_004113	CAA	3	9	982728	982736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298503
16508	NC_004113	GCA	2	6	982793	982798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298503
16509	NC_004113	CGG	2	6	982799	982804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298503
16510	NC_004113	GGT	2	6	982887	982892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298503
16511	NC_004113	CAA	2	6	982911	982916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298503
16512	NC_004113	GGT	2	6	982927	982932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298503
16513	NC_004113	TCT	2	6	982994	982999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298503
16514	NC_004113	GCC	2	6	983002	983007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298503
16515	NC_004113	GAA	3	9	983037	983045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298503
16516	NC_004113	AGC	2	6	983064	983069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298503
16517	NC_004113	GCG	2	6	983131	983136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298504
16518	NC_004113	TC	3	6	983184	983189	0 %	50 %	0 %	50 %	22298504
16519	NC_004113	AGC	2	6	983240	983245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298504
16520	NC_004113	TGCT	2	8	983330	983337	0 %	50 %	25 %	25 %	22298504
16521	NC_004113	TGG	2	6	983363	983368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298504
16522	NC_004113	TGG	2	6	983382	983387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298504
16523	NC_004113	TGC	2	6	983408	983413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298504
16524	NC_004113	TG	3	6	983419	983424	0 %	50 %	50 %	0 %	22298504
16525	NC_004113	GCC	2	6	983425	983430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298504
16526	NC_004113	TGG	2	6	983522	983527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298504
16527	NC_004113	CCA	2	6	983537	983542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298504
16528	NC_004113	CCG	2	6	983543	983548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298504
16529	NC_004113	CAG	2	6	983596	983601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298504
16530	NC_004113	ACA	2	6	983712	983717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298504
16531	NC_004113	TTG	2	6	983786	983791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298504
16532	NC_004113	CAC	2	6	983871	983876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298504
16533	NC_004113	TTG	2	6	983885	983890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298504
16534	NC_004113	TGGG	2	8	983906	983913	0 %	25 %	75 %	0 %	22298504
16535	NC_004113	TCCAA	2	10	983916	983925	40 %	20 %	0 %	40 %	22298504
16536	NC_004113	GCC	2	6	983998	984003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298504
16537	NC_004113	CCG	3	9	984053	984061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298504
16538	NC_004113	GCG	2	6	984096	984101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298504
16539	NC_004113	GCA	2	6	984102	984107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298504
16540	NC_004113	TCAG	2	8	984114	984121	25 %	25 %	25 %	25 %	22298504
16541	NC_004113	GTT	2	6	984127	984132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298504
16542	NC_004113	AGC	2	6	984242	984247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298504
16543	NC_004113	GCC	2	6	984292	984297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298504
16544	NC_004113	CAAC	2	8	984315	984322	50 %	0 %	0 %	50 %	22298504
16545	NC_004113	CCA	2	6	984348	984353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298504
16546	NC_004113	AGTC	2	8	984470	984477	25 %	25 %	25 %	25 %	22298504
16547	NC_004113	TCT	2	6	984546	984551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298505
16548	NC_004113	CTG	2	6	984592	984597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298505
16549	NC_004113	GCT	2	6	984631	984636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298505
16550	NC_004113	TTA	2	6	984688	984693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298505
16551	NC_004113	TGC	2	6	984771	984776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298505
16552	NC_004113	GGT	2	6	984783	984788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298505
16553	NC_004113	T	7	7	984840	984846	0 %	100 %	0 %	0 %	22298505
16554	NC_004113	GTG	2	6	984860	984865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298505
16555	NC_004113	TCA	2	6	984911	984916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298505
16556	NC_004113	CAA	2	6	984928	984933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298505
16557	NC_004113	ATC	2	6	985015	985020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298505
16558	NC_004113	TGG	2	6	985031	985036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298505
16559	NC_004113	TTGGT	2	10	985047	985056	0 %	60 %	40 %	0 %	22298505
16560	NC_004113	TCC	2	6	985108	985113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298505
16561	NC_004113	GGA	2	6	985164	985169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298505
16562	NC_004113	CCG	2	6	985209	985214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298505
16563	NC_004113	TGG	2	6	985259	985264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298505
16564	NC_004113	GCCGCT	2	12	985363	985374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	22298505
16565	NC_004113	TCAA	2	8	985391	985398	50 %	25 %	0 %	25 %	22298505
16566	NC_004113	CAG	2	6	985404	985409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298505
16567	NC_004113	C	6	6	985510	985515	0 %	0 %	0 %	100 %	22298505
16568	NC_004113	TG	3	6	985542	985547	0 %	50 %	50 %	0 %	22298505
16569	NC_004113	TGC	2	6	985574	985579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298505
16570	NC_004113	GTG	2	6	985612	985617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298505
16571	NC_004113	GGCA	2	8	985638	985645	25 %	0 %	50 %	25 %	22298505
16572	NC_004113	CCT	2	6	985662	985667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298505
16573	NC_004113	CGG	2	6	985747	985752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298505
16574	NC_004113	TGGG	2	8	985915	985922	0 %	25 %	75 %	0 %	22298505
16575	NC_004113	TCG	2	6	986124	986129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298505
16576	NC_004113	CTG	2	6	986191	986196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298505
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16579	NC_004113	ATCT	2	8	986650	986657	25 %	50 %	0 %	25 %	22298506
16580	NC_004113	TGC	2	6	986696	986701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298506
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16585	NC_004113	ACCC	2	8	986785	986792	25 %	0 %	0 %	75 %	22298506
16586	NC_004113	TGG	2	6	986933	986938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298506
16587	NC_004113	TCA	2	6	986961	986966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298506
16588	NC_004113	AGC	2	6	986978	986983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298506
16589	NC_004113	GAC	2	6	986991	986996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298506
16590	NC_004113	CCTG	2	8	987021	987028	0 %	25 %	25 %	50 %	22298506
16591	NC_004113	AGC	2	6	987055	987060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298506
16592	NC_004113	TGG	2	6	987101	987106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298506
16593	NC_004113	AGG	2	6	987109	987114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298506
16594	NC_004113	GCA	2	6	987120	987125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298506
16595	NC_004113	TTG	2	6	987127	987132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298506
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16597	NC_004113	GT	3	6	987351	987356	0 %	50 %	50 %	0 %	22298507
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16600	NC_004113	GTC	2	6	987672	987677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298507
16601	NC_004113	TTTG	2	8	987769	987776	0 %	75 %	25 %	0 %	22298507
16602	NC_004113	GTA	2	6	987812	987817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298507
16603	NC_004113	GCT	2	6	987872	987877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298507
16604	NC_004113	AACC	2	8	987892	987899	50 %	0 %	0 %	50 %	22298507
16605	NC_004113	CT	3	6	987926	987931	0 %	50 %	0 %	50 %	22298507
16606	NC_004113	TCA	2	6	987936	987941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298507
16607	NC_004113	CAG	2	6	987967	987972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298507
16608	NC_004113	AAG	2	6	988164	988169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298507
16609	NC_004113	CTG	2	6	988202	988207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298507
16610	NC_004113	CTT	2	6	988253	988258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298507
16611	NC_004113	CT	3	6	988299	988304	0 %	50 %	0 %	50 %	22298507
16612	NC_004113	AACC	2	8	988352	988359	50 %	0 %	0 %	50 %	22298507
16613	NC_004113	CAG	2	6	988566	988571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298508
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16618	NC_004113	CCAAG	2	10	988809	988818	40 %	0 %	20 %	40 %	22298508
16619	NC_004113	CGG	2	6	988838	988843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298508
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16865	NC_004113	ACC	2	6	1001961	1001966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298521
16866	NC_004113	TCA	2	6	1002109	1002114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298521
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16982	NC_004113	ACA	2	6	1008893	1008898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298527
16983	NC_004113	CGT	2	6	1008939	1008944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298527
16984	NC_004113	CAT	2	6	1008982	1008987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298528
16985	NC_004113	CCAT	2	8	1009029	1009036	25 %	25 %	0 %	50 %	22298528
16986	NC_004113	CCA	2	6	1009039	1009044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298528
16987	NC_004113	ATG	2	6	1009110	1009115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298528
16988	NC_004113	TCC	3	9	1009146	1009154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298528
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16990	NC_004113	TCC	2	6	1009227	1009232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298528
16991	NC_004113	AAT	2	6	1009238	1009243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298528
16992	NC_004113	TCC	3	9	1009251	1009259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298528
16993	NC_004113	AAT	2	6	1009280	1009285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298528
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