MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004113	TGGC	2	8	953677	953684	0 %	25 %	50 %	25 %	22298473
16002	NC_004113	ATGT	2	8	953708	953715	25 %	50 %	25 %	0 %	22298473
16003	NC_004113	G	6	6	953821	953826	0 %	0 %	100 %	0 %	22298473
16004	NC_004113	GCC	2	6	954144	954149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298474
16005	NC_004113	TCAGC	2	10	954175	954184	20 %	20 %	20 %	40 %	22298474
16006	NC_004113	CGC	2	6	954188	954193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298474
16007	NC_004113	TGC	2	6	954209	954214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298474
16008	NC_004113	GCC	2	6	954231	954236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298474
16009	NC_004113	AAT	2	6	954254	954259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298474
16010	NC_004113	AGGA	2	8	954263	954270	50 %	0 %	50 %	0 %	22298474
16011	NC_004113	CTG	2	6	954334	954339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298474
16012	NC_004113	GCA	2	6	954345	954350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298474
16013	NC_004113	CAGC	2	8	954358	954365	25 %	0 %	25 %	50 %	22298474
16014	NC_004113	AAG	2	6	954459	954464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298474
16015	NC_004113	GTC	2	6	954465	954470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298474
16016	NC_004113	CTG	2	6	954491	954496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298474
16017	NC_004113	CCAC	2	8	954540	954547	25 %	0 %	0 %	75 %	22298474
16018	NC_004113	GCT	2	6	954591	954596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298474
16019	NC_004113	CCG	3	9	954649	954657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298474
16020	NC_004113	CAC	2	6	954740	954745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298474
16021	NC_004113	C	6	6	954758	954763	0 %	0 %	0 %	100 %	22298474
16022	NC_004113	CAA	2	6	954882	954887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298475
16023	NC_004113	ACTC	2	8	954910	954917	25 %	25 %	0 %	50 %	22298475
16024	NC_004113	GGTGT	2	10	955063	955072	0 %	40 %	60 %	0 %	22298475
16025	NC_004113	A	8	8	955144	955151	100 %	0 %	0 %	0 %	22298475
16026	NC_004113	TG	3	6	955166	955171	0 %	50 %	50 %	0 %	22298475
16027	NC_004113	ACC	2	6	955199	955204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298475
16028	NC_004113	TGC	2	6	955211	955216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298475
16029	NC_004113	GCT	2	6	955220	955225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298475
16030	NC_004113	CTG	2	6	955245	955250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298475
16031	NC_004113	CAG	2	6	955333	955338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298475
16032	NC_004113	GAC	2	6	955395	955400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298475
16033	NC_004113	TGC	2	6	955411	955416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298475
16034	NC_004113	AGT	2	6	955603	955608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298476
16035	NC_004113	AGT	2	6	955612	955617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298476
16036	NC_004113	CTG	2	6	955859	955864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16037	NC_004113	CAC	2	6	955916	955921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298476
16038	NC_004113	GGC	2	6	956105	956110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298476
16039	NC_004113	GCA	2	6	956128	956133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16040	NC_004113	CCT	2	6	956248	956253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298476
16041	NC_004113	CGCC	2	8	956326	956333	0 %	0 %	25 %	75 %	22298476
16042	NC_004113	GCT	2	6	956344	956349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16043	NC_004113	TAG	2	6	956409	956414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298476
16044	NC_004113	GGC	2	6	956504	956509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298476
16045	NC_004113	GCA	2	6	956514	956519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298476
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16048	NC_004113	GCT	2	6	956633	956638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16049	NC_004113	GTT	2	6	956659	956664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298476
16050	NC_004113	TGT	2	6	956673	956678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298476
16051	NC_004113	GGC	2	6	956846	956851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298476
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16053	NC_004113	CTG	2	6	956986	956991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16054	NC_004113	T	6	6	957007	957012	0 %	100 %	0 %	0 %	22298476
16055	NC_004113	AGGT	2	8	957087	957094	25 %	25 %	50 %	0 %	22298476
16056	NC_004113	GAA	2	6	957106	957111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298476
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16060	NC_004113	AGCG	2	8	957211	957218	25 %	0 %	50 %	25 %	22298476
16061	NC_004113	GCC	2	6	957258	957263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298476
16062	NC_004113	GCA	2	6	957286	957291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16063	NC_004113	TGC	2	6	957368	957373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298476
16064	NC_004113	G	7	7	957529	957535	0 %	0 %	100 %	0 %	22298476
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16067	NC_004113	TGA	2	6	957940	957945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298477
16068	NC_004113	CTCC	2	8	957946	957953	0 %	25 %	0 %	75 %	22298477
16069	NC_004113	CCA	2	6	958148	958153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298478
16070	NC_004113	AGAT	2	8	958160	958167	50 %	25 %	25 %	0 %	22298478
16071	NC_004113	CAT	2	6	958170	958175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298478
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16088	NC_004113	TGA	2	6	959221	959226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298480
16089	NC_004113	GGA	2	6	959227	959232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298480
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16094	NC_004113	GAAGC	2	10	959590	959599	40 %	0 %	40 %	20 %	22298481
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16098	NC_004113	C	6	6	959735	959740	0 %	0 %	0 %	100 %	22298481
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16105	NC_004113	A	6	6	960022	960027	100 %	0 %	0 %	0 %	22298481
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16108	NC_004113	CT	3	6	960145	960150	0 %	50 %	0 %	50 %	22298481
16109	NC_004113	ATT	2	6	960220	960225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298481
16110	NC_004113	CCG	2	6	960256	960261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298481
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16112	NC_004113	CGG	3	9	960303	960311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298481
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16116	NC_004113	CA	3	6	960453	960458	50 %	0 %	0 %	50 %	22298481
16117	NC_004113	T	6	6	960496	960501	0 %	100 %	0 %	0 %	22298482
16118	NC_004113	TGG	2	6	960509	960514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298482
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16122	NC_004113	GTG	2	6	960805	960810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298482
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16486	NC_004113	GCG	2	6	981628	981633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298502
16487	NC_004113	CTG	2	6	981647	981652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298502
16488	NC_004113	GTC	2	6	981698	981703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298502
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