MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004113	CCG	2	6	925116	925121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298449
15502	NC_004113	TGC	2	6	925138	925143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298449
15503	NC_004113	CTA	2	6	925147	925152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298449
15504	NC_004113	GAT	2	6	925160	925165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298449
15505	NC_004113	CTT	2	6	925198	925203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298449
15506	NC_004113	ATT	2	6	925284	925289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298449
15507	NC_004113	CTG	2	6	925388	925393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298450
15508	NC_004113	GGC	2	6	925585	925590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298450
15509	NC_004113	TAT	2	6	925670	925675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298451
15510	NC_004113	CTG	2	6	925779	925784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298451
15511	NC_004113	GCG	2	6	925806	925811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298451
15512	NC_004113	TGG	2	6	925843	925848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298451
15513	NC_004113	CTAC	2	8	925972	925979	25 %	25 %	0 %	50 %	22298451
15514	NC_004113	ACC	2	6	926004	926009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298451
15515	NC_004113	AGC	2	6	926110	926115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298451
15516	NC_004113	GCA	3	9	926132	926140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298451
15517	NC_004113	G	6	6	926165	926170	0 %	0 %	100 %	0 %	22298451
15518	NC_004113	GGCG	2	8	926201	926208	0 %	0 %	75 %	25 %	22298451
15519	NC_004113	TGC	2	6	926266	926271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298451
15520	NC_004113	TACC	2	8	926277	926284	25 %	25 %	0 %	50 %	22298451
15521	NC_004113	CGC	2	6	926285	926290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298451
15522	NC_004113	AGG	2	6	926293	926298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298451
15523	NC_004113	ATT	2	6	926310	926315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298451
15524	NC_004113	GCG	2	6	926462	926467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298451
15525	NC_004113	GGC	2	6	926502	926507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298451
15526	NC_004113	TGGCT	2	10	926593	926602	0 %	40 %	40 %	20 %	22298451
15527	NC_004113	CA	3	6	927086	927091	50 %	0 %	0 %	50 %	22298452
15528	NC_004113	AACTC	2	10	927115	927124	40 %	20 %	0 %	40 %	22298452
15529	NC_004113	TGC	2	6	927177	927182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298452
15530	NC_004113	TGC	2	6	927294	927299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298452
15531	NC_004113	T	6	6	927338	927343	0 %	100 %	0 %	0 %	22298452
15532	NC_004113	GTC	2	6	927357	927362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298452
15533	NC_004113	GCG	2	6	927426	927431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298452
15534	NC_004113	GTG	2	6	927633	927638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298452
15535	NC_004113	GAA	2	6	927689	927694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298452
15536	NC_004113	GAGG	2	8	927722	927729	25 %	0 %	75 %	0 %	22298452
15537	NC_004113	ACC	2	6	927761	927766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298452
15538	NC_004113	C	6	6	927795	927800	0 %	0 %	0 %	100 %	22298452
15539	NC_004113	TGG	2	6	927830	927835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298452
15540	NC_004113	GAT	2	6	927869	927874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298452
15541	NC_004113	AG	3	6	927970	927975	50 %	0 %	50 %	0 %	22298452
15542	NC_004113	CGC	2	6	928000	928005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298452
15543	NC_004113	GGC	2	6	928117	928122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298452
15544	NC_004113	GTT	2	6	928127	928132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298452
15545	NC_004113	CCT	3	9	928320	928328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298452
15546	NC_004113	CTC	2	6	928376	928381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298452
15547	NC_004113	TGG	2	6	928395	928400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298452
15548	NC_004113	CAG	2	6	928401	928406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298452
15549	NC_004113	T	6	6	928819	928824	0 %	100 %	0 %	0 %	22298453
15550	NC_004113	GCGATC	2	12	928826	928837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298453
15551	NC_004113	GTG	2	6	928859	928864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298453
15552	NC_004113	GGC	2	6	928918	928923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298453
15553	NC_004113	ATT	2	6	929160	929165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298454
15554	NC_004113	GAT	2	6	929179	929184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298454
15555	NC_004113	CTCC	2	8	929228	929235	0 %	25 %	0 %	75 %	22298454
15556	NC_004113	CGCCCT	2	12	929337	929348	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	22298454
15557	NC_004113	GTG	2	6	929396	929401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298454
15558	NC_004113	CTCA	2	8	929422	929429	25 %	25 %	0 %	50 %	22298454
15559	NC_004113	GAC	2	6	929469	929474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15560	NC_004113	TCG	2	6	929490	929495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15561	NC_004113	GAACTA	2	12	929506	929517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22298454
15562	NC_004113	CCAA	2	8	929522	929529	50 %	0 %	0 %	50 %	22298454
15563	NC_004113	T	6	6	929545	929550	0 %	100 %	0 %	0 %	22298454
15564	NC_004113	CAG	2	6	929551	929556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15565	NC_004113	CTT	2	6	929571	929576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298454
15566	NC_004113	ATG	2	6	929578	929583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298454
15567	NC_004113	CAA	2	6	929670	929675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298454
15568	NC_004113	AGG	2	6	929744	929749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298454
15569	NC_004113	GC	3	6	929775	929780	0 %	0 %	50 %	50 %	22298454
15570	NC_004113	ATT	2	6	929890	929895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298454
15571	NC_004113	GCG	2	6	930033	930038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298454
15572	NC_004113	GCA	2	6	930147	930152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15573	NC_004113	CA	3	6	930184	930189	50 %	0 %	0 %	50 %	22298454
15574	NC_004113	ACT	2	6	930240	930245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298454
15575	NC_004113	GCG	2	6	930268	930273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298454
15576	NC_004113	AGC	2	6	930287	930292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
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15578	NC_004113	CTT	2	6	930363	930368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298454
15579	NC_004113	TTAT	2	8	930392	930399	25 %	75 %	0 %	0 %	22298454
15580	NC_004113	A	6	6	930453	930458	100 %	0 %	0 %	0 %	22298454
15581	NC_004113	GAG	2	6	930499	930504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298454
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15583	NC_004113	CAG	2	6	930526	930531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15584	NC_004113	CCA	2	6	930596	930601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298454
15585	NC_004113	CGG	2	6	930667	930672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298454
15586	NC_004113	CTC	2	6	930688	930693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298454
15587	NC_004113	CGC	2	6	930715	930720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298454
15588	NC_004113	GTG	2	6	930829	930834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298454
15589	NC_004113	CCG	2	6	930853	930858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298454
15590	NC_004113	GCACC	2	10	930870	930879	20 %	0 %	20 %	60 %	22298454
15591	NC_004113	CTG	2	6	930908	930913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15592	NC_004113	GTGC	2	8	931006	931013	0 %	25 %	50 %	25 %	22298454
15593	NC_004113	ATT	2	6	931030	931035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298454
15594	NC_004113	AGG	2	6	931037	931042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298454
15595	NC_004113	ATT	2	6	931056	931061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22298454
15596	NC_004113	CAC	2	6	931069	931074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298454
15597	NC_004113	ATG	2	6	931100	931105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298454
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15599	NC_004113	AGTG	2	8	931167	931174	25 %	25 %	50 %	0 %	22298454
15600	NC_004113	CGG	2	6	931201	931206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298454
15601	NC_004113	CAGA	2	8	931219	931226	50 %	0 %	25 %	25 %	22298454
15602	NC_004113	CTT	2	6	931278	931283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298454
15603	NC_004113	GCA	2	6	931356	931361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15604	NC_004113	CG	3	6	931469	931474	0 %	0 %	50 %	50 %	22298454
15605	NC_004113	T	6	6	931477	931482	0 %	100 %	0 %	0 %	22298454
15606	NC_004113	TG	3	6	931498	931503	0 %	50 %	50 %	0 %	22298454
15607	NC_004113	TG	3	6	931513	931518	0 %	50 %	50 %	0 %	22298454
15608	NC_004113	GCAA	2	8	931538	931545	50 %	0 %	25 %	25 %	22298454
15609	NC_004113	GGA	2	6	931548	931553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298454
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15611	NC_004113	TGT	2	6	931674	931679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298454
15612	NC_004113	TATTGA	2	12	931683	931694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22298454
15613	NC_004113	TCA	2	6	931748	931753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298454
15614	NC_004113	GTC	2	6	931825	931830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15615	NC_004113	CAG	2	6	931852	931857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298454
15616	NC_004113	TGG	2	6	931859	931864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298454
15617	NC_004113	A	7	7	932034	932040	100 %	0 %	0 %	0 %	22298454
15618	NC_004113	GTG	2	6	932055	932060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298454
15619	NC_004113	TTG	2	6	932168	932173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298454
15620	NC_004113	TCA	2	6	932258	932263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298454
15621	NC_004113	GCAG	2	8	932274	932281	25 %	0 %	50 %	25 %	22298454
15622	NC_004113	CG	3	6	932317	932322	0 %	0 %	50 %	50 %	22298454
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15983	NC_004113	CGT	2	6	952630	952635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298472
15984	NC_004113	GCGG	2	8	952647	952654	0 %	0 %	75 %	25 %	22298472
15985	NC_004113	GC	3	6	952676	952681	0 %	0 %	50 %	50 %	22298472
15986	NC_004113	TTG	2	6	952759	952764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298472
15987	NC_004113	TGA	2	6	953079	953084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298473
15988	NC_004113	TCCC	2	8	953122	953129	0 %	25 %	0 %	75 %	22298473
15989	NC_004113	TGGG	2	8	953133	953140	0 %	25 %	75 %	0 %	22298473
15990	NC_004113	GGC	2	6	953209	953214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298473
15991	NC_004113	CAC	2	6	953275	953280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298473
15992	NC_004113	CGG	2	6	953310	953315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298473
15993	NC_004113	GATCGC	2	12	953414	953425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22298473
15994	NC_004113	CAT	2	6	953509	953514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298473
15995	NC_004113	GCC	2	6	953516	953521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298473
15996	NC_004113	TCAAA	2	10	953527	953536	60 %	20 %	0 %	20 %	22298473
15997	NC_004113	G	6	6	953574	953579	0 %	0 %	100 %	0 %	22298473
15998	NC_004113	GCC	2	6	953585	953590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298473
15999	NC_004113	CAG	2	6	953615	953620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298473
16000	NC_004113	GCG	2	6	953641	953646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298473

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