MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004113	AGT	2	6	897312	897317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298424
15002	NC_004113	GGGTT	2	10	897350	897359	0 %	40 %	60 %	0 %	22298424
15003	NC_004113	GCG	2	6	897394	897399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298424
15004	NC_004113	AGGT	2	8	897410	897417	25 %	25 %	50 %	0 %	22298424
15005	NC_004113	TCA	3	9	897437	897445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298424
15006	NC_004113	GCA	2	6	897455	897460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298424
15007	NC_004113	CTG	2	6	897472	897477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298424
15008	NC_004113	AAT	2	6	897502	897507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298424
15009	NC_004113	GCCA	2	8	897533	897540	25 %	0 %	25 %	50 %	22298424
15010	NC_004113	CAT	2	6	897618	897623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298424
15011	NC_004113	CCG	2	6	897628	897633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298424
15012	NC_004113	GGC	2	6	897661	897666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298424
15013	NC_004113	GCC	2	6	897674	897679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298424
15014	NC_004113	GGC	2	6	897748	897753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298424
15015	NC_004113	ATCT	2	8	897922	897929	25 %	50 %	0 %	25 %	22298425
15016	NC_004113	ATG	2	6	897937	897942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298425
15017	NC_004113	ACC	2	6	897955	897960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298425
15018	NC_004113	CCT	2	6	897969	897974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22298425
15019	NC_004113	GCCT	2	8	898071	898078	0 %	25 %	25 %	50 %	22298425
15020	NC_004113	GTG	2	6	898132	898137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298425
15021	NC_004113	AGC	2	6	898274	898279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298425
15022	NC_004113	CTG	2	6	898303	898308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298425
15023	NC_004113	ACCCT	2	10	898402	898411	20 %	20 %	0 %	60 %	22298425
15024	NC_004113	GCA	2	6	898467	898472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298426
15025	NC_004113	AAC	2	6	898525	898530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298426
15026	NC_004113	TTG	2	6	898548	898553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298426
15027	NC_004113	GCTG	2	8	898586	898593	0 %	25 %	50 %	25 %	22298426
15028	NC_004113	TCTT	2	8	898612	898619	0 %	75 %	0 %	25 %	22298426
15029	NC_004113	GGTT	2	8	898788	898795	0 %	50 %	50 %	0 %	22298426
15030	NC_004113	TG	3	6	898846	898851	0 %	50 %	50 %	0 %	22298426
15031	NC_004113	TGT	2	6	898912	898917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298426
15032	NC_004113	GCA	2	6	898946	898951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298426
15033	NC_004113	CGC	3	9	898971	898979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298426
15034	NC_004113	ATG	2	6	899065	899070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298427
15035	NC_004113	TGCC	2	8	899105	899112	0 %	25 %	25 %	50 %	22298427
15036	NC_004113	CAA	2	6	899119	899124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22298427
15037	NC_004113	TGG	2	6	899252	899257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298427
15038	NC_004113	CCG	2	6	899297	899302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298427
15039	NC_004113	AGA	2	6	899325	899330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298427
15040	NC_004113	GTG	2	6	899342	899347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298427
15041	NC_004113	CAGCAA	2	12	899400	899411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22298427
15042	NC_004113	CGC	2	6	899446	899451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298427
15043	NC_004113	TGG	2	6	899670	899675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298428
15044	NC_004113	GTG	2	6	899718	899723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298428
15045	NC_004113	GCT	2	6	899751	899756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298428
15046	NC_004113	TAG	3	9	899805	899813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298428
15047	NC_004113	CAT	2	6	899839	899844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298428
15048	NC_004113	TGGG	2	8	899862	899869	0 %	25 %	75 %	0 %	22298428
15049	NC_004113	ACC	2	6	899931	899936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298428
15050	NC_004113	GCC	2	6	900002	900007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298428
15051	NC_004113	CAG	2	6	900019	900024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298428
15052	NC_004113	C	6	6	900064	900069	0 %	0 %	0 %	100 %	22298428
15053	NC_004113	AGC	2	6	900073	900078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298428
15054	NC_004113	AGGG	2	8	900115	900122	25 %	0 %	75 %	0 %	22298428
15055	NC_004113	TTTTTG	2	12	900216	900227	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	22298428
15056	NC_004113	GAA	2	6	900233	900238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298428
15057	NC_004113	TGAT	2	8	900244	900251	25 %	50 %	25 %	0 %	22298428
15058	NC_004113	GCT	2	6	900341	900346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298429
15059	NC_004113	T	6	6	900420	900425	0 %	100 %	0 %	0 %	22298429
15060	NC_004113	GTG	2	6	900429	900434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298429
15061	NC_004113	GGT	2	6	900478	900483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298429
15062	NC_004113	TGC	2	6	900503	900508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298429
15063	NC_004113	G	6	6	900544	900549	0 %	0 %	100 %	0 %	22298429
15064	NC_004113	TAA	2	6	900625	900630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22298429
15065	NC_004113	ATCA	2	8	900673	900680	50 %	25 %	0 %	25 %	22298429
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15071	NC_004113	GCC	2	6	900854	900859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22298429
15072	NC_004113	GTT	2	6	900860	900865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298429
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15085	NC_004113	TGA	2	6	901796	901801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298430
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15087	NC_004113	GTG	2	6	901912	901917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298430
15088	NC_004113	CGG	2	6	901976	901981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298430
15089	NC_004113	GTG	2	6	902026	902031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298430
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15092	NC_004113	CCA	2	6	902181	902186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298430
15093	NC_004113	GCT	2	6	902216	902221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298430
15094	NC_004113	CAC	2	6	902232	902237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298430
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15101	NC_004113	CTG	2	6	902748	902753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298430
15102	NC_004113	GCG	2	6	902773	902778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22298430
15103	NC_004113	GAAT	2	8	902824	902831	50 %	25 %	25 %	0 %	22298430
15104	NC_004113	ATC	2	6	902850	902855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298430
15105	NC_004113	G	6	6	902856	902861	0 %	0 %	100 %	0 %	22298430
15106	NC_004113	A	6	6	902864	902869	100 %	0 %	0 %	0 %	22298430
15107	NC_004113	GAA	2	6	902882	902887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298430
15108	NC_004113	AATCC	2	10	902980	902989	40 %	20 %	0 %	40 %	22298431
15109	NC_004113	CAT	2	6	903007	903012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22298431
15110	NC_004113	GCT	2	6	903014	903019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298431
15111	NC_004113	AAG	2	6	903020	903025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22298431
15112	NC_004113	TCG	2	6	903147	903152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298431
15113	NC_004113	ATAA	2	8	903179	903186	75 %	25 %	0 %	0 %	22298431
15114	NC_004113	GCA	2	6	903284	903289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298431
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15118	NC_004113	CTT	2	6	903623	903628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298432
15119	NC_004113	G	6	6	903637	903642	0 %	0 %	100 %	0 %	22298432
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15121	NC_004113	CCA	2	6	903722	903727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22298432
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15151	NC_004113	GGTCA	2	10	905745	905754	20 %	20 %	40 %	20 %	22298435
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15244	NC_004113	ATCCA	2	10	911053	911062	40 %	20 %	0 %	40 %	22298440
15245	NC_004113	GGT	2	6	911073	911078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298440
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15251	NC_004113	GTG	2	6	911294	911299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298441
15252	NC_004113	GGT	2	6	911362	911367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22298441
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15270	NC_004113	TTG	2	6	912401	912406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22298442
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15278	NC_004113	GA	3	6	912747	912752	50 %	0 %	50 %	0 %	22298442
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15356	NC_004113	G	6	6	917198	917203	0 %	0 %	100 %	0 %	22298443
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15361	NC_004113	GCA	2	6	917418	917423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22298443
15362	NC_004113	TCAC	2	8	917445	917452	25 %	25 %	0 %	50 %	22298443
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15487	NC_004113	ATG	2	6	924422	924427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22298449
15488	NC_004113	GAG	2	6	924470	924475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22298449
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15490	NC_004113	TCT	2	6	924633	924638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298449
15491	NC_004113	CTT	2	6	924697	924702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22298449
15492	NC_004113	GTC	2	6	924729	924734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22298449
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